EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-10770 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr3:186739790-186742180 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4012172chr3186741511hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:186740699-186740710TTTTATGGCCT-6.02
Foxd3MA0041.1chr3:186741885-186741897GTTTGTTTGTTT+6.32
ZfxMA0146.2chr3:186742124-186742138CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_07435chr3:186739687-186741423Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_10196chr3:186736640-186741414CD19_Primary
SE_10196chr3:186741534-186744707CD19_Primary
SE_10855chr3:186691104-186754774CD20
SE_15246chr3:186739661-186741441CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18374chr3:186739346-186741712CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18374chr3:186741832-186751994CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19966chr3:186740525-186741220CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_32534chr3:186738128-186741443GM12878
SE_50921chr3:186739555-186740595Sigmoid_Colon
SE_58288chr3:186627032-186791622Ly1
SE_59164chr3:186703252-186764260Ly3
SE_60441chr3:186703232-186762793DHL6
SE_61008chr3:186703204-186764166HBL1
SE_62186chr3:186703447-186763111Toledo
SE_62245chr3:186702797-186764702Tonsil
Enhancer Sequence
ATGTAAGTAG GGTGTTTCCC TGAGTTCTGT GAGCCGCTCC AGCAAATTAA TTGAACCCAC 60
GGAGAGGGGA ACCCCAATGG AAGCTGGTTG GTCAGAAAGA AGTTCTGGAG GCCTGGACTT 120
GTGACTGGTG GAGGGGGGAT GTCTTGGACA CTAAGCCCTC AATCTGTAGG ATCTGACACT 180
ATTTCCAGGT AGATAGTGTT GGAACTGAAT TAGAGGACAC CAAGCTGGTG TCGCTGCTTG 240
GTGTTGGGGT GGGACCCCCA CACATATGGT CACATAAGTC ATCTTCTGTG TTGATTGTTG 300
TGGTGTGAGA GCAGAGGAAA GATGGCTACA GAGAGTTTTC CCTACACAGG GACTTGGGGG 360
GTAGAGGGTT AGGGGAGGGC TGAGGGGCCT TACAAGTCTT AAGTGCGTTT TAGGGATTCT 420
TTAGCTAACA GTAGCTGAGA GAGTCAAGTT ATTGTCTAGT GACTTGAAGT CAGTAGGAAG 480
GAATGCCTGA GTAAGATAAG GAGGTTGTGG GGGCCTAGGT CCTTGGAGCC TCATAGATAG 540
CAGCCCTCTG GGTGAATAGA TAGTGATTGT CTCTTCTCAG ACCTTTGGGT GTCTGACTCT 600
CAGTTAGAAT CTCTCCTAGA TCTGGGAAAG GCCTAGCAAG GGAAGAGACA TTAATATCGA 660
TTCTCTGGAG ATGCACGTTT CCCCCACCAA AGATGGCTTT GCAGTCCAAA GGCTGTCTGG 720
CAGCCTTTTC CAAATATGTC AAAGAAATGT ATTTTGGGGC AAAATATTTT AATTTCCTTC 780
AGAGTCTGCT GTCTGTCATG TGATACTATA CCAGAGTCAG GTTGGAGAGT AAGCCACATT 840
TTACTGGGTT AATTAAAAAA CCCATTTAAT GAGACTGTAT TGTTTCTAGG GTATGACTTA 900
ATCTTTGCCT TTTATGGCCT TAGGTATTGT GTATAGTTTG GTATCTTATT GTCATAAAGG 960
GTCTGTTTGG TCAGTCTTAT AATCTCTATT TTACCTTAAT GCTGGTCACT TGTACCTAAA 1020
CCCCAAAAGG GAGGGGTATG ATGAGGGTGT AACCTCCTTT CTGTCATGGC TGGGAATTCA 1080
GTTTTTCAGG TTTCTCTGGG GTGCCCATGG CCAAAAAGGA GTCCATTCAG TTGGTTAGTG 1140
GGGGGCTTAG GATTTTATTT TTGGTTTACA CCTCCTTCCA ACCCTTGCTC AAATGTCTTC 1200
TTCTCAGTGA GGCTTTCTCT GATCATCTGA TTTAAATCTC CACCTCACCC ACTCCAAGCT 1260
GTCCCTATTT CTCTTCCCTA CTCTAATTGT CTGCATATCA GTTATCTCCT TGCAAAGCAC 1320
CACGGATTTA TGTTGTTTGA CTCTTTATTT ATCCTCACTA TAAGGTGAGT GCTGGAGGGG 1380
TTAGGGATTT CTGGCTGGCT TCTCTACTGC TGTGTCTGCA GTCTGGTTCA CAGTAGGCAA 1440
TCAGCATTTG CTGAAAGAAT GAACCTATAG CTTGGAACCA ACCCAAATGT CCAACAATGA 1500
TAGACTGGAT TAGGAAAATG TGCACATATA CACCATGGAA TACTATGCAG CCATGAAAAA 1560
TGATGAGTTC ACGTCCTTTG TAGGGACATG GATGAAGCTG GAAACTATCA TTCTCAGCAA 1620
ACTATGGCAA GGACAAAAAG CCAAACACCA CATGTTCTCA CTCATAGGTG GGAATTGAAC 1680
AGTGAGAACA CATGGACACA GGAAGGGGAA CATCACACAC CGGGACTGTT GTGGGGTGGG 1740
GGGAACGGGG AGGGATAGCA TTAGGAGATA TACCTAATGC TAAATGATGA GTTAATGGGT 1800
GCAGCACACC AACATGGCAC ATGTATACAT ATGTAACAAA CCTGCACGTT GTGCACATGT 1860
ACCCTAAAAC TTAAAGTATA ATAATAATTA AAAAAAAAAA AAAGAATGAA CCTATCGCAT 1920
GAGTATTGGT GTAAGTTTTC TTACAGGCCC CGGGGCCACC ACAAAGTAGA AGAACTCAAC 1980
CTTCCCTATT CATTTCCTCA CCTCCAACTC CCTTAGACTA CCAGGACTTA GATCCTTTTG 2040
GGTATATATA TACATATATA TGTTTTATAT ATATACATAT ATACATGTTT TGCTTGTTTG 2100
TTTGTTTTTT GAGACAAAGT CTCGCTGTGT CACCCAGGAT GGAGTACAGT GGCATGATCT 2160
CTGCTCACTG CAATCTCCGC CTCCAGGTTC AAGTGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCTGAGT 2220
AGCTGGGACT ACAGGTGCAT GCCTCCACGC CTGGCTAATT TTTTGTATTT TTAGTAGAGA 2280
CGGGGGTTTC ACCATGTTAG CCAGATGGTC TTGATCTCCT GACCTCGTGA TCTGCCCGCC 2340
TCGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGGC ATGAGCCACC GCGCCCAGCC 2390