EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-10760 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr3:186236680-186240110 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EN2MA0642.1chr3:186237331-186237341CCCAATTAGC+6.02
Foxd3MA0041.1chr3:186236708-186236720AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:186236712-186236724AAACAAACAAAC-6.32
KLF14MA0740.1chr3:186239527-186239541GGCCACGCCCCCTC+7.52
KLF16MA0741.1chr3:186239528-186239539GCCACGCCCCC+6.62
SP1MA0079.4chr3:186239525-186239540AAGGCCACGCCCCCT+7.14
SP3MA0746.2chr3:186239527-186239540GGCCACGCCCCCT+6.82
SP4MA0685.1chr3:186239525-186239542AAGGCCACGCCCCCTCA+7.41
SP8MA0747.1chr3:186239528-186239540GCCACGCCCCCT+6.92
STAT3MA0144.2chr3:186239366-186239377CTTCTGGGAAA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_50044chr3:186230766-186240084RPMI-8402
SE_58489chr3:186226464-186259066Ly1
SE_59569chr3:186226808-186258781Ly3
SE_61064chr3:186220385-186259146HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr3186236800186237782
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I186520chr3186238605186239974
GH03I186518chr3186235925186238076
Enhancer Sequence
GTCTTTTGTG TTGATCGTTA TACTTTTAAA ACAAACAAAC AAACAAAAAA ACAAAAAAAG 60
CAAATTAATG TCTGAATACT TGAATTTATA CAGAGAATGA CTTTCACACA GACCAAGAGG 120
AAAACAGGTT ACTGTGCAAC CTATACAAAC GCTTTCCCCT CTCTGGGCCT CAGTTTCCTG 180
GCCTGCAGTT TGCACCAGAA GAGCTGCAAG GCCTCTTGCA GCCCCACACT CTGATTCCTG 240
GCTCACATGA CACCACTTTT ATGAGACTAG TTATGCAAAT GTTATCCAGT ACGTTTCTCT 300
TGGTGAGGAG TCAGGGCCAA GCAAGCTCTG AGACAAGCTG TCTCACCTCC TCATCTCCTG 360
AGCACAACTC ACCCACAGCT CTGCCCTCGC CTCCACCTAC ATCATGCCTT CCTGCATGCC 420
AACTTCCCTC TGAGGTTCCC TTCACCCACT TACAACCACA GCCTCCTTCC GGACCTCCCC 480
TACACGATGA ACAGTCTGCC AGTTAATATA CATCAAGCTG CCACCATGAA ACAGCTCGGA 540
AAGCCCCATT TGTTCTCAAT AGCATTCCAG CTAGAAAGAC CATCCACCAC CCATGGCCAC 600
TGAAGAAGGT CCTCCCCTGA GTGCCAGGCA GTGGGGCTCC TAACTCTGGG CCCCAATTAG 660
CTTAGCTTGG GGGAGCAAAG GACAGGAGCA CTGTTCACCC AGTTGGACTA ACAGCTCCAC 720
ACTGTGCCTA ATAGGAACCT CCTTCTCACA GGTGGCACCT TTGTGAATCA GGGTCTGTCC 780
TGAGCCACCC TCCCTTGGAG AGATCTGAGC ACTGAGAACC ACAGAGCCTG GGACACCAGC 840
ACAGGGTTTG AAAAACTCCA CTCCCAGTCA GCTGCGGTGG CTCATGCCTG TAATCCCAGC 900
ACTTTGGGAG GCTGAGGTGG GTGGATCACA AGGTCAGGAG TTCGAGACAG CTTGACCAGC 960
ATGGTAAAAC CCCATCTCTA CTAAAAGTAC AAAAATTAGC CAGGCATGGT GTTGGGCACC 1020
TATAATCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC AGGGGAATTG TTTGAACCTG GGAGCTGGAG 1080
GTTGCAGTGA GCCGAGATCG CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGCGGCTGAG CGAGATTCTG 1140
TCTCAAAAAA ATGGGAAAAA CATCATTCCC ATGTGTGTCC TGGTTGCTTG TCTCTTTCAA 1200
AGTACTGCAT ACTAAATGCT ACCACCCACT GCTCCTTGTG TGCTGGGAGC TGCTTCAGAC 1260
TTACTATCCC ATTGAATGTT TTCAACAACC AAAATGGTAG GTACTATTAT TTATAACCAT 1320
GTTTTCAGAT AAGGAAATTG AAGCTTAGAC AAGTTAAATA ATTTCCCCCA AACACACAGC 1380
TAAGTGGTAG GACAATTGGT TCTGAATTCA ACCTGCTTGG ATTTGAAGTC TGGCTCTGTC 1440
ACTTACAAAG TGTGTGATTT TGAATGAATT ATTAATCTCT CTGAACATTA GCTTGCTCTT 1500
CTATTAAATG AAGGTATTTA TTTCTATTTA TCAGGATGGA AGTGTAAGGA TTAAATGACA 1560
TAATCCATGT GAAATGCTTG GTACAATGTT TGGCACAGAA TGTGAGTCCA ATAAATGCAA 1620
ACTATGGTTT TAGCCAGATG CATATCCCTC TTCCAGGCAC TCAGAAATGA CTTTCTGTAA 1680
GTGTTGACTT CATCTGGATG TGCCCCTTCA CATGGGCTTC TGGCGTGCTG GGCTCCAGCT 1740
GTCACCATTT GTCTTCAAAA GTCCAGGCTT GAAGAAAGGA AATGACCAAA CGCATGCACC 1800
AAATGCATCT CATTTTAAAG CCCACCAGCC CCGTGGACTT CGACTTCCAG ATATATTACC 1860
TCCTTTTGTA TTATTAGAAA CTTGGTTGCC CCACACCAGT GGGGTGAGGT GGAATGCGGA 1920
GAGCAGACAG AATATTTATA AGAGATGAAA TGAGATCACC TACCTAGAGA CACACCCCAG 1980
AGGAAAGTAG GATAGTTCTA GAGCTTTGTG GATCAAACAG GCACTCTTTA ATCCCTTCTG 2040
ACACCTCCTT CTCCCCATGC TACCCAGTCC CTTGCTCCAG TCAGACAGAG ACGGGAAACA 2100
TTTTTTGCAC AGCCAAAACA AAGCCACTCG GGATGTAAAT AAAATAGTCT GAACACCCAG 2160
TTGATCCCTC TGCCTTTGAG ACCGGAATCA TCTGGAGGGT GGATAAACAC TTTCCCTGCT 2220
CCAGCACTCG GAGAAATAAG GGAGCAATAG ATTGCAGCAA TGGCTGCTGG GAGTGTTCCG 2280
AACTCTGTGA ACAATATGGA GACTGCTCAG TAGATTATGG AGGGGTAAGA GCTGAAGTGT 2340
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTATGT CTGTGTGTGT GTGAGAGAGT GTTTGTGTGT 2400
GTGATGTTAG TGATGTTAGT GATTTCAGAA TCCAGGCCAC TGATAAACCA ATTGAGGTGT 2460
GGGTGACATG CAGAAGGGCC CCAGAGGTGT ACTGCCCATC ACATCCTTCT CCAGGGCACT 2520
GCTTGCTGAG TTCATGTCTT TGTCACTCAG CACTGCTGTG CCCACAATCT GTGGCTTCTT 2580
GGAGATTCTC TTTGTCTGTG TGGTCCTTGT CTGTGTGGGC AGCCCTGGGG GACCGCTGAG 2640
GTAACTCTTA CCAGTAACTT TGACTCCAGA GTCCCCGGGG CCTGGGCTTC TGGGAAAACA 2700
AGGCTGTGTG AGTGTGAAAC TCAAACTGAA AGGACTTTCT TCTTTTTTGG TTGCATTGCA 2760
CTCTGAACAA AACTCACTGG CTTGTGACGA GCAGGTGCTG TGCAAAGGGA GGCATACCTC 2820
CTGCTACTAT TCCTTCTCCT GGTGAAAGGC CACGCCCCCT CACTTGGCTC TCTGGGACAT 2880
TTCTTCTGTC AGGAGGCCTC TGCAGCTGGA ATGTTCGTCA CTCTTTGAGG TTAGGCATCT 2940
TTTCCTTTCC TTTTCCTTTG GAAATCTGTG GTCCTCCCTT TGCTGTGACA AATTGCACGG 3000
TGTGGCCAGT CAACTCCATT CTGCCTCCTG GGAAGGCTCA CGTGGCCCGG CCTCCATGAG 3060
GGCCCAGGGC CAGTGCAGGA GTCCTCGACT TGCAATTCTG CCCTTTTCCA TCCAGGCTTT 3120
GTCCAGCTCT CCGTTCTGTT CTCCCATTCG GTGTCCCCTC CAGCCCCTTA GCCCCTTTCC 3180
AGCACATCAT GCTCCTGCTT GAGGACTGAA GAGGAAAGAA AGCCCATCTG GGGAGGCAAT 3240
TAGGGAAAGA GAAACAGAGG CAGAGAGAAG TAGAGACAAA AGATGAAGAG AAGGCTTCTG 3300
CCTGGGTACT GTTGCTCCTC AAGGGCCTGA TTCTGGAATT TCCCAAATCC AGCTGTAATC 3360
CCATTAGTTA AAGTTAACTA ACTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGACT GAGCCTCGCT 3420
CTGTCTCCAG 3430