EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-10671 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr3:151961250-151964300 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr3:151961995-151962007TGCTGTGATTTC-6.22
Gfi1bMA0483.1chr3:151961995-151962006TGCTGTGATTT-6.62
IRF9MA0653.1chr3:151962936-151962951AACTAAACTGAAACT+6.63
Lhx3MA0135.1chr3:151962765-151962778GAAAAATTAATTT-6.11
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:151961812-151961827TGAACTCCTGACCTC-6.22
POU2F2MA0507.1chr3:151962814-151962827ATATGCAAATCTA-6.24
SPI1MA0080.4chr3:151962076-151962090AACTTCCTCTTTTG-6.89
SPICMA0687.1chr3:151962076-151962090AACTTCCTCTTTTG-6.45
Number of super-enhancer constituents: 34             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11923chr3:151957245-151962463CD3
SE_11923chr3:151962896-151963877CD3
SE_12878chr3:151960678-151964436CD34_Primary_RO01480
SE_13321chr3:151958128-151965411CD34_Primary_RO01536
SE_14133chr3:151960784-151965201CD34_Primary_RO01549
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SE_17003chr3:151960840-151962672CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17003chr3:151962842-151964037CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17840chr3:151957450-151964884CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19211chr3:151958274-151962708CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19211chr3:151962831-151964886CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20191chr3:151958287-151962633CD56
SE_20191chr3:151962745-151964956CD56
SE_20806chr3:151957941-151964299CD8_Memory_7pool
SE_21582chr3:151959622-151962821CD8_Naive_7pool
SE_21582chr3:151963025-151964054CD8_Naive_7pool
SE_22068chr3:151957402-151964704CD8_Naive_8pool
SE_25603chr3:151957103-151965352DND41
SE_25790chr3:151960160-151962407Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25790chr3:151962893-151964191Duodenum_Smooth_Muscle
SE_31371chr3:151958627-151964060Fetal_Thymus
SE_39578chr3:151960642-151964950Jurkat
SE_49950chr3:151955426-151966435RPMI-8402
SE_50676chr3:151961353-151961994Sigmoid_Colon
SE_52702chr3:151961416-151962000Small_Intestine
SE_58341chr3:151941277-152022461Ly1
SE_59872chr3:151959817-152042932Ly4
SE_60773chr3:151960393-152021075DHL6
SE_61480chr3:151938720-152020942Toledo
SE_62311chr3:151957212-152047090Tonsil
SE_66395chr3:151960642-151964950Jurkat
Enhancer Sequence
TTTCAGTTTT GCAGTGCTTT ATCTATATGT AACAGGCAAC TATTCATGAG AAAGGAAGTT 60
TGAGACTTGT AGGTAAAAAA CCGCTACCCA AATTCCAGGA AAATGTCTGT TTACTGGAGG 120
TTTTTTTTTT TTCTTCCTTT AATAAGATGC CTGTAGTCAG ATTAGCATTT GTGTCATACT 180
TCAAAGACTT TAAATTAATT AGACTTGTAA AAGCAAGTTA ATTCCCATAT ATCAGCTGGA 240
CAGTTTTCTT CTGCATAGAG CAATGTTTTC TGTGATCATT GAGCCACACA GGAGATGCTT 300
CCTTATGTAA ACGAGCACTA CTTAATCAAG TATAGGTTTC TTTTCTTTTC TTTTCTTTTT 360
TGAAATGGAG TCTCACTGTG TCTCCCAGCC TGGAAAGCAA TGGCCGCGAT CTCAGCTCAC 420
TGCAACCTCC GCCTCCTGAG TTCAAGCGAT TCTCCTGCCT CAGTCTCCTG AGTAAGTGGG 480
ATTCAGACGC CTGCCACCAT GCCAGGCTAA CTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACGGAGTTTC 540
ACTATGTTGG CCAGGCTGGT CTTGAACTCC TGACCTCAGG TAATCTGCCC GCTTCAGCCT 600
CCCAAAGTGC TGGGATTACA GGCGTCAGCC ACCGTGCCAG GCCAACTATA GGTTTCAATA 660
GCTTAACTTT TCTAAAATTT GCTTACACAT ATAAACATGC ATATACTTTA ATTATATATG 720
TGTACAGGCA CCAATTATAG CCTGTTGCTG TGATTTCAAG TGTAAGCTTT ATGAATAATT 780
TTCCATGCCC CATAAAATGG ATAAAGCATA ATGACTGTTA TTTCATAACT TCCTCTTTTG 840
GTGGACTATC CTTTTGCAGA GGAAAAAAAA TAATGTAACT AGAGAAGAGA GTTGAGCAGA 900
GAACTGAGCT CTTTGAAGTG CTGGTAGTTT GTCTCAACCC ATGAAGCAGC TTAACAAGCA 960
ACTATAACTA AGCATAGAGG TAAGAACAAT TATTTGCTAT TTTTCATTTT ATTATTTGGA 1020
TTGCTATTTA TATAGCAACA ATTTAAATGC TGGCCACATT ACAGTGTAGA TTAGATAAAC 1080
CTGATAACTC TTTCAAGTAA GTAACCGACA TTTTAAATAA AAAGTTTAAT ACATTTACAA 1140
AGCTTCAGCT TCACATACAA GCTTTTAAAA ACCTGGAAAA ATTTAAAGTT TTCATTGATC 1200
TCCAAATTAT TTTACCTGCA AAATAAAACG TTATCTTTCT TGTGTATTTG TAATTTTGCA 1260
CACAATTTAG TGCTGAAGAG GCATTTGGAT TATTAACAAA TTTGATAACT TTTCTTCTTT 1320
CCCAGCTCTA GATTATTTCT AATATTCTCT CACAGATATA CTTTTGTTCA TTTTGCATAT 1380
TATTAGTTGA GCACTTTCCA GAAAAAAAAG CATTCTTACA TTTGTTTTTA CCCACCGTGA 1440
AAATATATTG TATCATTTAA AATATGACAT TTCAGTATTA TTTTTATATC ATCACTTTAT 1500
GATGATATTT GTTTAGAAAA ATTAATTTGT AGTGTAGACA GCATGACTTA AAATTTTAAA 1560
TGAAATATGC AAATCTAATT TTTAAAATGT ATTGTTTTCT AAATAAGTTT AATTTGTATT 1620
TATAATGCTT AAAATATAGT AAGAATGAAA ACAAAGTAAG ACATTTGGTT TGATAATTGG 1680
AAATCAAACT AAACTGAAAC TGATCTTATT AGTGAAATTC TAAAATAATC TAGATCCTAG 1740
AAACTTTTAT TCAAATTTGC ACTAATCCAG AATAATACCT ACACATATTA ACTGTATTTA 1800
ATACAATTGT ATTCATAATA TAGCAATTTT TAAATCTTCC TTTTAAAAGC TGTTGGTTTC 1860
TTTATACTTT GGTAAAAACA TTAAGGAGTG TTTAATACAG CTTTGAGAAG AAAAATCTGT 1920
TTAAGTGAAC TACTCTGGCT ATATATACAT ATGGAGGTTT GAAGAGTTTG CCTCTGAGCA 1980
TTTTCATAAT TGAATCCTTT TGAGAAAGTT TCATACATCA CACATTTACC GTGTGAGATT 2040
TGGTAAGTAT AAATATCCCA AGATGTATTT GAAGCTTTCT TAATTTGGTT TGAAAAAATT 2100
AGACTAATCT CATGGCTTCC AAAAAAGAAA GTCCACACTA TCCCATCAAT TAATAGATTT 2160
AATTTTTGAT AAATTTTGGT AAATGGTGCT GTTATTACTG GTTCTAGTAT GTTACCTAGT 2220
ACCTAGTTGG TTTTTTGTTG GTTTGTTTTA CGTATTTTCA TGCACTACAC CAATAAGTTG 2280
CACCAATAGT TGCTGTCTTC TTATTATAGG GAGAAGGAAA GCAGAGTGTT ACTGTTACAA 2340
ACTCAGATGT GAATTGTTGA ATCAAATTTG ACATACTTAA CTCGATGAAA ATTTTAAAAT 2400
TAAGTTGATG GTTGTTAGAA ATCCGTTACA ATTGTGCTTC TTCATCTTTA TCACACACTA 2460
ATTAAACACA ACTGCTTGTC AGGTCTAGGG GCTCAAGCCT GTAGTCCCAG CTACTTTGGA 2520
GGCTGAGGCA AGAGAATGGC TTAAGTCAGA AGATCAAGGC TGCAGTGAGC TGTGATTGCA 2580
CCACTACACT CCAGCCTAAG TGACAGAGCC AGATTCTGTC TCTAAAAATA TAAAAATAAA 2640
GAAACCTTAA AAATAAACAC AACTACTTCC ATCAGAAGTT CAAATGTCCA CAATTTTAAC 2700
TATGAGATAT TTTGATATCA TGAGCTATTA AGTGTTATAT GTAGTATGGT AATATACTAA 2760
ATAATGGCTA ACAATCACAA GGAAACATAG CCCAAGGAGA TTACAATATA AATTGGTCAT 2820
AAGTGTAATT CAGAACAGCA AATGAAGGCT AAAGCAGCAG AGAAGATACT ATCTTTCTGG 2880
CAAGACAGAT TTGTTGTTGT TGTTGTTGTT GTCAATAATT AGTAAAGTCT GAATGAACAT 2940
CCTAGTTCTA GATTATGGAA AATAAGTTTT TAAGTTGTTC TCTCTTTGAT AAAATTGTCT 3000
TTACATAAGA AAAAAATGAG TGCTCATCTG AGTTTCCATG ATAATATTAA 3050