EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-10449 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr3:98283000-98285980 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:98284256-98284268GATTGTTTGTTT+6.92
IRF1MA0050.2chr3:98284052-98284073CTAGAGAAAGTGAAAGGCAAT-6.16
SOX10MA0442.2chr3:98283807-98283818AAAACAAAGAA+6.62
Stat6MA0520.1chr3:98285705-98285720GTTTCTCTGGAAAAC-6.42
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12274chr3:98280661-98287787CD3
SE_16806chr3:98280646-98285423CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16806chr3:98285523-98287477CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18542chr3:98280476-98287998CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19727chr3:98281638-98285649CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_32460chr3:98267879-98287753GM12878
SE_60631chr3:98248377-98293492DHL6
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr39828412498284483
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I098560chr39827959098287995
Enhancer Sequence
TTTTTTTTTT TGTGGCAGGG TCCCTCTCTG TCGCCCGGGC TGGAGTGCAG TTGTGTGATC 60
TCAGCTCACT GCAACCTCCA CCTCCCAGGC TCAAGTGATT CTCGTGCCTC AGCCTCCCAA 120
GTAGCTGGGA TTACAGGCAC ATGCCACCAC ACCTGGCTAA CTTTTGTATT TTTAGCAGAG 180
ACTAAACAGG GTTTCACCAT GTTGGCCAGG CTGGTCTCAA ACTCCTGGTC GCAAGTGATC 240
TGCCTGCCTT GGCCTCCCAA AGTGTTGGGA TTGCAGGTGT GAGCCACGGC ACCCAGCCCA 300
GACTACCTTT TGCTCAGCAC TTGGCTCTGT GGGGGTGAGC AAAAACTTCA ACCCTCCACA 360
CCTCAATTTT CTCAGGCATG CAATGAGAAT AACTTCCTCG GGGTTATTTC AGATATTGAC 420
TAAGTTAACT TAAGTAATGT TAGAACACTG TCTGGCACCC TCAGTGTTGG GTATTAGCAC 480
TAGCTGGTGT GAAGAGAGAT GGAGCATATA AATGTAAATT TAAGTTTACA AAGAGATAAA 540
TAATTTGACT GTTATGTGAG AGTCAGGTGA GAGTTACAGA TACCAAATAT ACCTGGGTTT 600
AAAGAGAGGT GTGACTGTTA TGGGTGGCAG TGTTGTGGCC CACAGGGGCA GACTCTCAGG 660
GTGAGGATAC TTGAGCAGGG CCAGGAAATG AATTATTTTG TTCACCTTTG ATGTGGCCCA 720
CATTCAAATG CTTCACAAGT ACAACGTTCT CAGCTAAGCT AAGGTGGTCT TCGATACGCA 780
CTTGACCACA ACGGAAAAAA AAAAAAAAAA ACAAAGAATG AAAAAGTTAA ACAACAGGTG 840
GGAAGTCAAT GCTGAATAAA AAATTAAGAT ACGCAAAAGT TAACATGTTA TTTCCTTCCT 900
AAATAAAACA CATGTGCATA CAAAAATACA TGTATAATAT TCTGATATAT TTATAAATAC 960
CTATCCTTGA ATTGTTTTTC ACTTTTCCAG CCAAATTCCC TCATCAAATT ACTGAATTTT 1020
CCTAGCTTAA AAATTATTAT TTTTGATTTT GACTAGAGAA AGTGAAAGGC AATTTACTGC 1080
CACATCTATC TATATTACAT AAACATACAT GCTCATATAT ACTTTCCACT GGGAAGGGAA 1140
GAATCATGAT ATGAAAATGA CTAAACTCTT TCTCTCTGAC TGATCTAGTC TCCTCTTCTT 1200
CCTACCTTTA AAGTGCTGAA CAGTCATTTG CCCAGCTTTC TATGTATCAA ATATCTGATT 1260
GTTTGTTTTA ATGTCTTCAG TGCGGCTTTA ACTGATTTCC TGAATACCTA ATGTCCACAT 1320
AACACTTAAA AGCTTGTAAA ACTCTTTCCC ATATGTTATT TTATTGACTT CCCACAGTAA 1380
TTTTTGGAGG TACACATTAC TCATTCTCTT TTACAGAGGA GTTAAGAGTA GAGTCTGTGT 1440
GACGTCCCCT AAATCACACA GCTATGACCG GTCTGAAATA TGGGCTCAGG TTGTATGGGA 1500
ATACTACCAA AGATTTCAGA AATGATCATT ATGCATTCAC GGGTCCTCTG GTGCCTGGTT 1560
ATAAAGTAAA AGGGTGAACA ATTCAGATTT ATATTTGAAT CTCTGTCTAT AAAGTTTTTT 1620
TGTGTTACAG CCACTTGTCT TACTTTTATT TCATTTTTGT TTTTTTTTTT TTTCTTCTAT 1680
CTGAAAGAAA GCTAGAGAGT TATTTCCCCT CACAAGCTTC AAAAACCTGC CAGGCAGAGA 1740
CTGATTCCCA CAACCCCTCT CTGTGGTCTG GGCTTCAGGG AACAAGAAGT AGAGTGGCGG 1800
ACCACATTCT TCCTCTAGTA GCAGAGACAC ACTGGACCAC TGGGTCCTGG GAAACTTTTC 1860
CCAGGGACTG TCTTTATTGC TCCACTCTCA CGACAATAAC ACACACTCAA ACAAGCACTC 1920
ACGTAACCCT GTATACAGCT GCATCAGCAC CCAGAAAACG TGGCCTAATG TAGCAAAGGT 1980
AATTCCTACC GTAAAGTCCT TTAGCAGAAA TGGTTCACGA TGGGCCTGTA ACAATGTAAG 2040
GAGTTTTTAC AAAGAGCCAG GGGTAGGGCA CAGGGAGAGG GTGGGGAAGG GCCATTAGGG 2100
GAGATGTAAG CGGGACACTC AAGATGGACC AGGAACTTAT TTGAAAGCGG TAGTTAACAA 2160
CCAGAAGGGA GAAGAATTTC ACCCAACCCA GGAAATAGGA ACCCGTGGCC TAACGACCCC 2220
TTGGGAATCC TGTGTCTTTA GCGGAAGGCG TGAGAAAAAA GGAGTAAAGT GAAGTATAAC 2280
TGAAGCTTCA GGAATTAGAG AAAATGGAAA GGGTGCATGT AGGAAGGAAA AGAAAGACAA 2340
GGTGGAGGTT AAAGGCAAGT TGCAGGTTTT AGTGGCATGG TGATTAATTT TATGTCAACA 2400
TGGTGGGGCC ATAGTGCCCA GATATGTGGT CAAACGTTAT TCTGGATGTT TCTGTAAGAG 2460
TGTTTTGGGT GAGACTAACA TTTAAATAAG TGGACTTTGA GGAAAGCAGT TTGCCCTTTA 2520
TAAAGTGGGT GGGCCTCATC CAGTCAGTGG ATGTTCTAAA TAGAACAAAA GACTGACCTT 2580
CCTGAGCAAG AGAGAATTCT GGCAGCAGGC ATGAACTGCA GATTTGGGAC TTGCCAGTCT 2640
CTATATTCAC CAATTCCTTA AATAAAGCTA TATACAGACA TACACACATG CATCCTATTG 2700
GTTCTGTTTC TCTGGAAAAC CCTAACTATC ACAAGCAGGC TGTGGTCATC AAGCTACATA 2760
GGGAGGGATA TGAAGCTGGT GAACAAAAAA CAGGGATATA GCAGGAAGCC AAACTGCGGC 2820
TCTATTAGGC AGGCATTTGA ACACTGACCT TGCTCTTGGC CTCATCTTAA TTTCCCACCA 2880
TTAGTTTCCC TTTGTCAACT TTTCTTATTT TCAATTGAAT TCATCTCACT ATATTTTATG 2940
CATTATTATA TATGTCACCT TAAGTCCTTT CTGGGACAAA 2980