EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-09083 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr20:30273210-30275050 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MSCMA0665.1chr20:30273270-30273280AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr20:30273270-30273280AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr20:30273270-30273280AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr20:30273270-30273280AACAGCTGTT-6.02
NFICMA0161.2chr20:30273583-30273594TTCTTGGCAGA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03156chr20:30273283-30274200Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30273172-30274168Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30251012-30278616Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30271691-30275988Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30271693-30273990Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30271528-30275994Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30273042-30273790CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30274125-30274793CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30271413-30275094CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30270368-30274693CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30273059-30273901CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30271576-30274938CD56
SE_20764chr20:30273249-30275050CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30271605-30275067CD8_primiary
SE_25330chr20:30259962-30278833DND41
SE_27731chr20:30274014-30274975Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30274198-30274992Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30265155-30280569Fetal_Thymus
SE_33407chr20:30271530-30276155H2171
SE_36989chr20:30271579-30274681HSMMtube
SE_39443chr20:30273160-30275277Jurkat
SE_39853chr20:30273186-30274905K562
SE_43515chr20:30270419-30275165MM1S
SE_45708chr20:30273192-30273833Osteoblasts
SE_48182chr20:30273738-30274468Psoas_Muscle
SE_49886chr20:30273183-30275341RPMI-8402
SE_51884chr20:30273204-30273971Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30273149-30274791Small_Intestine
SE_55108chr20:30273144-30275074Thymus
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63683chr20:30273204-30274009HSMM
SE_65412chr20:30271774-30273581Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30273160-30275277Jurkat
SE_67146chr20:30270419-30275165MM1S
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031683chr203027175230276493
Enhancer Sequence
AAAAAGAATT GAGAAAGAGA GAAAAAGAAG ATTCTATTTG GAAAAATGTT CCCCAAACTA 60
AACAGCTGTT CTTATTGTAA ACCACTGGTA TTTTCAGTGA GGCTCTAGTT CCGCACAGAA 120
AAAAGGCAAT TTGAAAGTTC CACATGGTCA GGTTCAAGAA ACGTGAGCTT ACTCCTGCTT 180
TGTGGTGGCT CTATTTGGCT ATGGTCCTGT CAATTAAGCA CCACGGGCCT CACTTTTCTC 240
ATCTGAAAAG TGTGGAGGAT GGATCAGATG ATCTCTAAGG CTTTCTCTCC AGTTCCAAAG 300
CACTAAGATC CTATCTCCGG GCCCTTTTTT TTTCCCCTCA AGGGAGCAGT GGAGTGTAAG 360
GGAAAAGTAA GCTTTCTTGG CAGACAAAAG ACTGAGTTCT AATCTCAGCA ATGCCATTTA 420
TTAACTTACT GTGTAACAAT GGCAACCCAC TTCCCCTCTG GGGGCACCTC ATTTTCTTCA 480
TATATAAACC AAAGACCCAA AAGTGCAGTG AACAGGTACT CTAGGAGGCC TTTGGCATTA 540
TTATTATGCC TCCCTTACAT TGTTCACCCA TTAGCATATC CTGGCCTCCC AAAGAACCTG 600
TTCTTTACTT GACATTGCTC TGACTTGCAA ACCCCTGTCC TTGAAAATTA ACACGTTCCA 660
AGAGCTATGC CATAGGAGCC CAAATAGCCT CTGGGTCCCC AACCCCCTTC TGATGTCAAT 720
AAAAAGATCA CTGCTATTTA TTCAATGTTT TGTATATGCC AGGCCCTCAT GTGTGTTTAA 780
AATTCTTATT TTATGAAGAC ATGGATGGTC ACAAAGGTGA ATTCACTTGC TCAAGATCCA 840
ACACACACAA AATGGAGGTG GTTCAAACCC AGGTGTGTCT GACTGCAGAG CCTGTGTTCT 900
TCCCAGTAGA GATGTGGATG CAGCACAAAT GGTAGAAAGG ACCTGAGACT TAGTCAGAAG 960
ACCTCAGTTC ACCCAAGGTA AGAGGAAAAC CCTATTTACC TCCTCCTAGC ATCGTCAGAG 1020
GTTCAATGAG ATAATGTGTG AACACAAGGA AGCACTAGAC AAACTTTAGT TAATGATCCT 1080
ATGCTATTAT TTTATGACTC CAGCCTGGGT TTCACCACAT TTGCAAAGAG AGTGGAAGTA 1140
GCAAGCTGTA ATATCTTAGA GATGTTACAG CCCCACTTCT CTGTTTTGTG TCCTACTCAG 1200
GCTTTCTTTT GTTCACATCT GGTCCATCCT TCTAGATTCC TGTTACTTGG ACCCTCCAGG 1260
CCACCCAGCA TGATACCCAC AGTGTTCTCC CTGAAAGGCC ATGGAGCGGA GGGAGTAAGG 1320
GGTAAATGGA AACCACAAGT CTTCTCTAAA ACAGTGTGAA GTAGATAATC CAGACTTACC 1380
TTCCAGAAAG GGCCTCAAGC AATAAGAAAA AATAAAAAAA GGCAGAGAGA GCCAAGGGAA 1440
GCCCATGGAG ACCATAGTTA AGTGAGGGCT TTTGAGTCCA ATATATTGGA CTTGTATTCT 1500
GTCTTTATTA GCATTCAACC TTAGGACTAT AATTTAACTT ACTTTACACT CAGTTTTCTA 1560
ATCTGGACAA TGAGGACAAT AACATGTTTC CCAAGAAGGA TTATTGTGAA GATTAAAAAT 1620
ACTACACTGG CCGAGTCTGG TGGCTCACAC CTGTAATCCC AGAACTTTGG GAGGTCCAGG 1680
AGGGAGGATC ATATGAAGTC AGGAGTTTGA GACCAACCTG GTCAAGACAA CAAGACCTCC 1740
ATCTCTACAA AAACAAAACA AAACAAAACA AACTACACTG TACCTTACAG CATCTTGCAC 1800
ATGGCAGGCA CTCAATAAAT AGCAGCAACT ATACTGTCAT 1840