EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-08224 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr2:54803640-54809590 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10180713chr254804693hg19
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr2:54808583-54808600TGCTTTCCAGGGAATCA+6.22
Foxq1MA0040.1chr2:54807773-54807784CATTGTTTATT+6.02
HNF1AMA0046.2chr2:54807149-54807164TGTAAATAATTAACA-6.03
HNF1AMA0046.2chr2:54807149-54807164TGTAAATAATTAACA+6.62
HNF1BMA0153.2chr2:54807150-54807163GTAAATAATTAAC-6.13
HNF1BMA0153.2chr2:54807150-54807163GTAAATAATTAAC+6.59
LHX6MA0658.1chr2:54808871-54808881ACTAATTAGC+6.02
NR2F1MA0017.2chr2:54806824-54806837CTGTTGACCTTTG-6.78
POU6F1MA0628.1chr2:54809012-54809022ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:54809012-54809022ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr2:54805504-54805524TGTTTGTTGGTGTTTTTGGG-6.57
RUNX1MA0002.2chr2:54805746-54805757AAACCACAAAC-6.02
RUNX1MA0002.2chr2:54809103-54809114CTCTGTGGTTT+6.14
SPI1MA0080.4chr2:54808948-54808962AAAAAGAGGAAGCT+6.24
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54802657-54804663Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54806325-54806984Adrenal_Gland
SE_04102chr2:54803461-54804376Brain_Anterior_Caudate
SE_10400chr2:54805714-54810968CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_11903chr2:54805104-54808137CD3
SE_12885chr2:54806626-54807961CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54808458-54809294CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54804541-54808139CD34_Primary_RO01536
SE_13387chr2:54808493-54809312CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54806403-54807663CD34_Primary_RO01549
SE_14098chr2:54808471-54809646CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14488chr2:54805070-54807930CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14488chr2:54808210-54809640CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54806491-54807991CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54805479-54807711CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54805988-54807944CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54805321-54807943CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54804469-54808160CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54806095-54808244CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54803372-54804830CD8_Naive_7pool
SE_21502chr2:54805963-54808154CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_21966chr2:54805854-54819252CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54803525-54806250Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54806279-54807871Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54806299-54806908Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54807139-54807736Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54803569-54807926Colon_Crypt_3
SE_25070chr2:54808294-54809145Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54804084-54808059Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54806258-54807572Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54804536-54807845Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54805683-54808040Fetal_Thymus
SE_31160chr2:54808248-54809658Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54802687-54805201Gastric
SE_31545chr2:54805344-54806156Gastric
SE_31545chr2:54806192-54807558Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54803941-54807936HUVEC
SE_39396chr2:54803412-54807973Jurkat
SE_39396chr2:54808243-54809665Jurkat
SE_40773chr2:54803413-54806814Left_Ventricle
SE_40773chr2:54806843-54807511Left_Ventricle
SE_42137chr2:54803569-54804912Lung
SE_42137chr2:54805064-54805813Lung
SE_42137chr2:54806257-54807405Lung
SE_43945chr2:54806647-54807844MM1S
SE_46220chr2:54804531-54807869Osteoblasts
SE_49907chr2:54803392-54808037RPMI-8402
SE_49907chr2:54808121-54809650RPMI-8402
SE_50115chr2:54803395-54807898Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54808260-54810694Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54803599-54807890Small_Intestine
SE_52386chr2:54808375-54809439Small_Intestine
SE_53342chr2:54804076-54805887Spleen
SE_53342chr2:54806289-54807792Spleen
SE_53342chr2:54808283-54809502Spleen
SE_55277chr2:54806481-54807552Thymus
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54803412-54807973Jurkat
SE_66257chr2:54808243-54809665Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 9             
ChromosomeStartEnd
chr25480465654804744
chr25480506954806177
chr25480630754807716
chr25480649054806642
chr25480666254807722
chr25480697854807402
chr25480808654808165
chr25480846654808535
chr25480875254809210
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
TAGAACTTGT ACTCAAAACT CAACTGACAA ATCCTGGAAG GCCGTTGCTT ATACGCTCTA 60
GTTGATGCGC CACAGCTGCC TGGCTGTGAG AATGGAGTAG CATGTACCTC TTAATTAGCC 120
AAGAATAAGT GCCGTGGAAG AAGGCAGGAT GACTTTTTAG AACCCATTTT TAGCTTGAAG 180
ATCACTGAGG GAGCCATCAA ATCCATCCAC CTGTTCAATC AATATTCAGC CAGCAAGTGG 240
GTGTCAAGGT GAGCAGCTTA CAGTGCTGAG CACACTGGAA ACACAGGTGT GTAAGGGACA 300
GCCACGGTCT CAAATTACAT TCTGAAAGGG AATACTAGGT AAGTGATCCC AAACATGCAA 360
ATATCATTCC TTGGTCCTGG GATGTGGGGG AAGCATTTTG GAGGAATTGA CATTGATTGC 420
AAGTTTTTAA ATATGACCTG GATTAGATTA TGAGATGATG GGTGCTTGGG GGTAGGGGTG 480
TACAGAGGGA GTCATGAAAC CATGGAGGAT GTTGGGGAAT GGCTAGAATT CTACTTGGGA 540
CATCATGCAA GTTTTTTTTC CCCTTCCATT TCATTTGTTA ATGCTTATTA TTAGTTGGGG 600
GTTTTGCCTC CTTTTTGTTA GCCAACAGCC AGCTAATCTT GGCACAGGTC CCGGGAATCA 660
GGTGCTGCTT AGCAGCTGAT GTTGGTTAAA TGACCTTGGA CAAGTGACTT GCATTTCAGT 720
TCTCTAACCT GTTAGGGTTG TAGATTGTCT GATACAGATT TGAAGGCCCC TGCAAATAAA 780
TGCATGGCCG TTTACTCTGG TCACTTTCAT TTTACCGAAT GTGCTCCCCC AAGGCTCTTC 840
TGGGTAGATG CCCACTGCCA AAACATTAAG CATTTTTGGC TTCTCATGCT TTGAGCTCAC 900
AAAATCAGTC CTGTGGGAAA CCTAACAAGC TACAAAGGAG AGGGAAAGCA AAAGAAAAGG 960
TATATGGATT CTCATGCAAA GAGAGAAGGA AAGTAGGTCC CTACCTAAAG TCTAGCCCTG 1020
TATTGGTGGT GGTACTGATA ATGGTAATAG CCACCAAAAC TTCTTGATAC TCCCCTTGTG 1080
CAGGCATTGT CCTAAGTACT TTGCAGTATT GATTCATATG CTCCTCATAG CGTCCTTGTG 1140
TGATGTGTTA TTTCCATTTT GAAGATGAGG AAACTGAGGC ACAAAGGAAG CTGTGCCCAA 1200
GGACACTTAA CTAGTAAATG GAGCCAGGAT TCCAACCCAC GCAGTGCGCT TTGGGACTCA 1260
ATTTTTAACC ATCTTGCTGT GCTGCCTGTT GAGCATTTTT CACCTGGTGC TTTTGTAGAT 1320
CCCACATTAG GATTTTGTTA GGACCCTGGG CAACCTTGAT TTAGTGAAAG CAGTTGTTGA 1380
GAGGTAGAAA TTCCTGATCC TTTTTTCAAT CTTAAAGGAT TTGCTGAGAC TCTCACTCTT 1440
CATTGGTGAT GGTAACAAGG AGCAGCATGG TGAATGCCAT GTAAAATTCA AGCCTTGCCT 1500
TATCTTGGAG GACTTTATTC CCTTTTCTTT GATGGTACTT TGGAGATTCC AGACTATAAA 1560
GGACTCAGCT GACAGTACAG ACTCTCTTGA TCTGTATTTT CCCAGTATAT GAAATTATTT 1620
GTAATGTACC CGTGAGAACC TGGAATAAAC TGTACTGGCA CTGAAGTAGA ATCTTGGATT 1680
TAAAAGTACA GTGTTCACTG CTGCATCGTT GAGCATTTGC TACACAGAGA ATAACCTTGG 1740
AGCAATGTTC AAAGGTGATG GCATTACCCA GAAACATGGA GTTAGGCCAG GAAACCACAT 1800
CTGAAGTTCA GATTATTGGA GATTGCTGAT TTTTCTTGAC TTTAAATATT TTCGACTGGT 1860
TGAGTGTTTG TTGGTGTTTT TGGGCTAAGT GTTAGCCTTT TGTTCTGTGA TGTCCCTGTG 1920
TGAATAAAAT GGATAATCCC TGTTTCCGGT TAGCTGCTGC TGCTGCTGCT GCTGCCAAGT 1980
ATAAGTGAAG ACTTCCAGCT GCGATTTGCA TTGTGTTTTC AGGCCACCTT TTGAGTTTCC 2040
CCATAGCAGA TATAAAAACT GTTTCTAAGA GTTCATCCTT ACGTGTTCAG CCTTACTTGT 2100
ATCCTAAAAC CACAAACTTG ATTTTGTTCC CATTCATTAT GATCTATATT TGGCATCAGT 2160
GAGGCAAGTT ATTTATATTT ATTATTTATA CCCTGCCCAC TTCCAGAAAT GATTTAATTT 2220
GGCCTAGGCA AGTGTCTTCT GATGGGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGATGAT 2280
AATTCTGATG TGTGTGTGTA TGATGCTACT TCTGCCACTT CAAGAGTCCA GAATCATAAG 2340
ATTCCTAATA GGATTGTTGG GTTGGTGAAT GCTGGGTTTG TTCTCTTCTA TGCCCTCTCT 2400
GTCCAGGAGA AATCTGAGTA TCTTTCTTAG GAATGCCTAA CACTGCTAGA CTGAAAGGTG 2460
CCATGTCACC ATTTTTCCCA AGAAATTTTC TTTTGAGGGT GCTATAGAGA AGCCCTCTGG 2520
TATGAATGTA TTAGGCTGGT GCAAAAGTAA TTGTGGCTTT TGCAATTAAA AGTAATGACA 2580
AAACTACAAT TACTTCTGCA CCAACCTAAT ATATATTATA TATTCCCATT TTGTTCTTTT 2640
CAGAATAAAG CTTCCTAGGA GTTTCTCTAG CTCATGACCT CTTTTACCTT TACTTTCAGT 2700
TGCAGTGTTC TTAGCTCATA GAAGGAGCTT TGACGGCACA TAGAATGAAG TATAACAGCT 2760
TCCGTTTGAC CTGAGGCATC CCTCAGGTAT GAGAATGTCA CCCAGAGATC GAATACAGTG 2820
CCAGGTTATC AACTACCATT TTTTGGGACT GATTCTCTGC TCATGTGTGA CCATTATTTG 2880
GGGAAATCAT ACAGTACCAC AAACCAGAAG TTTCTGAAAA CACCTAAACT CCCCATCTTT 2940
CACACTCACC CATAGGGACC GTGGCCCCCA ATGAGGGGTA GTTCGTCTCT GTATTGGTAG 3000
CATTAGCGCA CGTGCTATAT AGCTCTCTTA ATACCTGAAC TGTGGACAGA CCAGATCCTC 3060
ACTGAGCTGA AGCACATTGG CATATTAAGG GAGCCCAGCA TTGCTGTTTG GCCCTGCTTT 3120
TGAACTGGGA AGATATATTG CTGCATGGAG TTCTGAAAAG TACCTTTGTA AGTCCCGAGA 3180
ACTCCTGTTG ACCTTTGGAT TTAGGTAAAA TGTAAGTCTT AGGAGAATTG ATGAGAATGT 3240
AGGAACCAGT TTTAGCCAAT GCATTAAGAC TAAAATGACT CTATTGTTTG TCAGGCTTTG 3300
CCAGAAAGTA TAGTGAGAGA GAGAGATCCT AAAACTCTGA AAGCAAATAG CCCACAGCAG 3360
TTAACTGTAT TGACTTTGGA AACAGGTTAT AAACCCAAAC CTCTGTGCTG AACTTGAATG 3420
GGTGTTTCTT CTCTCCTTTC TGAGGGTAAA AGCTGCTGGT GAGAACGGCT CTCTGGTGTT 3480
GCTAGGACAG ACCTGTATGA CCTTCTTTAT GTAAATAATT AACAGGGGAA TATTTTCATT 3540
TACGTTAAAG CCATATATGA GAGAGATTTC CGGGCTGGCT CTGACAGCCT CTGGCCCCAC 3600
TGGAGAAGGA AGCCAGCACT GAAAAAATTC AAGCTTCCGG CCACACGGAA CCTGAGAATA 3660
TTCTCTATGA CAGCAGTGGC TGTGAAGCTG TTTCTTTAAA GTAAAACCCC TTTTGAAGGT 3720
TAGTCTGGGG TGACTTTACT GTTACATAGG GAGTAGATTT TGTTTCTTGA TGGTTCGTTG 3780
AGTGGTAGAG AGGTTAAAGG TAGAACTAAC ATATGTAGAA CTAAAAAGCA TCTGAAACTT 3840
TTAGCAAACC AGTAATATTT AGAGGCTTCT GCCCACTCTG GGTAGGCATT TTTATCTTGT 3900
ATACCCATAC CAGCTTTTCA CATCCTGTTT CTTGAGAATA CATAAAGAGC ACATTTCTCC 3960
ACATTATCAG GAAAACAATT TGAAGCACAG GTCTTGTGAA TTGGGAAGAC CACTAGTATT 4020
GCCATTAGCT GCTTATTTGT GTGTGTGTTG GAGGATGGAT TATAATCCAA GTGTATTCAT 4080
ATTCTCACAC TTTAACCAAA AAAAAAAAAA AATCTCCAAA ATCTTCTCTC TTGCATTGTT 4140
TATTGATAGA ATGGGAAACT TACTGCTGGT AACTAGTTAA TTCTGAAAGG GTTAGGGTTT 4200
CTACTGTATA CTTCCAAAAG TACAGGCCTG GGGGAGCCAA TATGAGAGAC ACACATAACC 4260
AAAAATTTGT AAAAACTTTA TTTTTTAATA AAAATTATAA ATAAAAATTA TAGGCCGGGT 4320
GCACTAGCTC ATCCCTGTAA TTCCAGCATT TTGGGAGGCT GAGGCGGACT GATCACTTGA 4380
GGTCAGGAGT TTGAAACCAG CCTGGGCAAC ATGTTGAAAC CCTGTCTCTA CTAAAAATAC 4440
AAAAATTAGC CATGCATAGT GGCACACACG TGTAATCCCA GCTACTTGGG TGGCTGAGGC 4500
ACGAGAGTCG CTTGAGTCCG GGTGGTGGAG GTTGCAGTGA GCCACGATCA CGCCACTGCA 4560
CTCCAGCCTG GGCAAAAGAG CAAGACTTAG TCTTAAAAAA AAAGAAAAAA TATATAAATA 4620
TATACACACA CACTTTATAT ATTTTTATAT ATAATCTCAT ACAACATGTT TTGAAATACA 4680
CGTGCATTGT GGAATGGCTA TATTGAAAGC TAATACATAA CAAATTTAAT GATAATACAA 4740
GTGTAGAATG GACAACAAAG GGGTTGTGCA TAATCATCAA GTACTTCTCA TTAGTAAAAA 4800
CCCTTTTCAT TTGCTTAGAA TTGAGGAGGA GGGGATGCTC TAAATTGAGG ATTCTCCATA 4860
GGGTCGTCCG TGAGACACAA GATGTTGACT GTCCCACTTA CCCAGGACAT GGGTATCCTT 4920
TTGATGCTGA CAGCATTTGC TGCTGCTTTC CAGGGAATCA TGGCTGACAT TGAACTTCCA 4980
CTGCCTCTGG GCTGCTTTGC TCACTCCTCC TAGGCAGGCA AGCCGACCCT TGGGAAGCTC 5040
AGCATTTAGC CTTCATGCTT TGGTTTCTTT GCCCTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTGAA 5100
ACTTTTATTT GCTCTGGGAC CACTTTGAGG TTGAAGGTAC AGCCCACAGT TTAAGAAAAC 5160
TGTCCCAAAC CTGAGCTAAT AAACAAGAGT AAAAGCCTTT TTCTCTTGTC ATTACTACTT 5220
CCTCCTCACT GACTAATTAG CCAGCTGCTG CAGGTCTCAT TAAACTTCAT TAATCCTAAG 5280
CATCTGTCTG TAGGAACTGC CTCAAGATAA AAAGAGGAAG CTCCGCTAAA CATTTTTGTT 5340
GCTGCTGCTA ATTACCACAA GCTATGCTTT TTATTAATTA ATGGCTCTAC TTGCCTCCAA 5400
ATCCTACTGA AGAACTTTGC GAGACAACAG GCACTTCATT CTTCTGTAGC TGCAGACATG 5460
CTGCTCTGTG GTTTGGTGCA TGGGGTACCT GTAAATTATC AGCACCGAGA ATACGCTAGC 5520
TCTGGAAACC AAGGTAGAGA AAAAAATACA TCTGGAAGTC TGGTTATGTG TAACTTGAAC 5580
TTGCTCAAAG CCTTCAGCTG ACACTGATGC TTTTTAAAAA CATGGCAGTG ATAAATTATT 5640
TCATCACTTT GCTCAAATAC ATTAATGCAA AACATTACAA AACTAGTTTT CTTGACTCAG 5700
CTTCCAGGGT CTAAGAAAGC ATTTTATTGG GGGGTTGTGA TGCCAGAGCA TAAGGGATGT 5760
TAAAGGTGAC ACTTAAAAAG GAAGGTGTCG ATCTTGGTTC TGGTCTGGTG GTGCCTGAGA 5820
GCAGGGACTC CTTGAAGGTG CAAGATGAAT TACACTCCTC CCAGGTGTCA GGCAGGGGAG 5880
AGAAGCACCC TCCATTTAGA AATATGGAGG ATTAGCCAGG CATAGTGGCG GGCGCCTGTA 5940
GTCCCAGCTA 5950