EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-02478 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr11:65243060-65246410 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
EHD1ENSG00000110047
ARL2ENSG00000213465
SAC3D1ENSG00000168061
NAALADL1ENSG00000168060
CDCA5ENSG00000146670
ZFPL1ENSG00000162300
C11orf2ENSG00000149823
AP003068.6ENSG00000187066
AP003068.9ENSG00000254501
TM7SF2ENSG00000149809
ZNHIT2ENSG00000174276
MRPL49ENSG00000149792
FAUENSG00000149806
SYVN1ENSG00000162298
HIGD1AP10ENSG00000254455
AP003068.18ENSG00000255200
CAPN1ENSG00000014216
AP003068.23ENSG00000254614
SLC22A20ENSG00000197847
POLA2ENSG00000014138
CDC42EP2ENSG00000149798
DPF2ENSG00000133884
TIGD3ENSG00000173825
SLC25A45ENSG00000162241
FRMD8ENSG00000126391
NEAT1ENSG00000245532
AP000769.1ENSG00000173727
MALAT1ENSG00000251562
SCYL1ENSG00000142186
LTBP3ENSG00000168056
RP11ENSG00000260233
SSSCA1ENSG00000173465
FAM89BENSG00000176973
EHBP1L1ENSG00000173442
PCNXL3ENSG00000197136
RELAENSG00000173039
RNASEH2CENSG00000172922
AP5B1ENSG00000254470
MUS81ENSG00000172732
CFL1ENSG00000172757
FIBPENSG00000172500
CCDC85BENSG00000175602
BANF1ENSG00000175334
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs686320chr1165244538hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246290-65246308GCATCCTTTCCTCCTTCC-6.19
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246294-65246312CCTTTCCTCCTTCCCTCC-6.56
HNF4GMA0484.1chr11:65246233-65246248TGACCTTTGCTCTCC-6.09
RREB1MA0073.1chr11:65245283-65245303ACACCACACACCCCACCCCA+6.78
TFAP2AMA0003.3chr11:65245431-65245442TGCCTGAGGCG-6.62
ZNF263MA0528.1chr11:65245371-65245392CTCTCCGTCCCCTTTTCCTCC-6.05
ZNF263MA0528.1chr11:65244555-65244576AGAGGATGAAGGGCGAGAAGG+6.15
Number of super-enhancer constituents: 103             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00783chr11:65244461-65245009Adipose_Tissue
SE_00879chr11:65243737-65247689Adrenal_Gland
SE_01577chr11:65243681-65245828Aorta
SE_01577chr11:65245864-65247837Aorta
SE_02242chr11:65243690-65245837Astrocytes
SE_02242chr11:65245846-65247850Astrocytes
SE_02898chr11:65243900-65245721Bladder
SE_02898chr11:65245861-65247649Bladder
SE_03165chr11:65243833-65245629Brain_Angular_Gyrus
SE_03165chr11:65245855-65247985Brain_Angular_Gyrus
SE_03882chr11:65243488-65248309Brain_Anterior_Caudate
SE_04846chr11:65243590-65248492Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06693chr11:65243625-65248376Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07762chr11:65243485-65248309Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08788chr11:65243930-65244325Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65244350-65245047Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65245100-65245564Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65246013-65247878Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09268chr11:65243462-65246742CD14
SE_11317chr11:65243218-65247007CD20
SE_12675chr11:65244377-65244982CD34_adult
SE_12675chr11:65245163-65245544CD34_adult
SE_12859chr11:65243747-65246162CD34_Primary_RO01480
SE_13317chr11:65243305-65247514CD34_Primary_RO01536
SE_14049chr11:65243474-65246108CD34_Primary_RO01549
SE_14376chr11:65243250-65248236CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19912chr11:65243461-65246522CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20736chr11:65243345-65248112CD8_Memory_7pool
SE_23775chr11:65243752-65245648Colon_Crypt_2
SE_23775chr11:65245744-65247567Colon_Crypt_2
SE_24819chr11:65243713-65245815Colon_Crypt_3
SE_24819chr11:65245945-65247705Colon_Crypt_3
SE_25770chr11:65243454-65248568Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26547chr11:65243712-65247764Esophagus
SE_27634chr11:65243475-65248010Fetal_Intestine
SE_28555chr11:65243470-65247915Fetal_Intestine_Large
SE_29556chr11:65243690-65248034Fetal_Muscle
SE_30929chr11:65243697-65247190Fetal_Thymus
SE_31424chr11:65243704-65247822Gastric
SE_32522chr11:65243694-65245937GM12878
SE_33163chr11:65244384-65245646H1
SE_33445chr11:65243783-65246412H2171
SE_34266chr11:65243277-65248485HCT-116
SE_34617chr11:65237426-65277580HeLa
SE_35831chr11:65243480-65248037HMEC
SE_36925chr11:65243656-65250247HSMMtube
SE_37995chr11:65243474-65247266HUVEC
SE_38870chr11:65243701-65245815IMR90
SE_38870chr11:65245883-65248011IMR90
SE_39628chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_39628chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_39847chr11:65242346-65247990K562
SE_40612chr11:65243484-65248051Left_Ventricle
SE_41603chr11:65243830-65245629LNCaP
SE_42107chr11:65243459-65247905Lung
SE_43442chr11:65243703-65245696MCF-7
SE_43442chr11:65245821-65247985MCF-7
SE_44137chr11:65243645-65248494NHDF-Ad
SE_44750chr11:65243565-65248057NHLF
SE_45562chr11:65243454-65248511Osteoblasts
SE_46695chr11:65244339-65245629Ovary
SE_46695chr11:65245876-65247656Ovary
SE_47127chr11:65243490-65277571Panc1
SE_47538chr11:65243903-65245646Pancreas
SE_47538chr11:65245995-65247517Pancreas
SE_48070chr11:65241375-65248038Psoas_Muscle
SE_48581chr11:65243560-65245838Right_Atrium
SE_48581chr11:65245850-65247830Right_Atrium
SE_49457chr11:65243757-65245718Right_Ventricle
SE_49457chr11:65245877-65247582Right_Ventricle
SE_50062chr11:65243572-65247904Sigmoid_Colon
SE_51077chr11:65237462-65248280Skeletal_Muscle
SE_51697chr11:65243660-65245825Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51697chr11:65245863-65247937Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52357chr11:65243567-65248006Small_Intestine
SE_54467chr11:65243714-65247868Spleen
SE_54503chr11:65243495-65276614Stomach_Smooth_Muscle
SE_55162chr11:65243857-65245663Thymus
SE_55732chr11:65243661-65248051u87
SE_56764chr11:65243730-65245661VACO_400
SE_56764chr11:65246058-65246660VACO_400
SE_57390chr11:65243794-65245665VACO_503
SE_57390chr11:65246011-65247348VACO_503
SE_57928chr11:65243807-65245743VACO_9m
SE_58932chr11:65238587-65276390Ly3
SE_59720chr11:65237780-65272476Ly4
SE_60674chr11:65238641-65271340DHL6
SE_61239chr11:65237836-65278618HBL1
SE_62240chr11:65238321-65275907Tonsil
SE_63249chr11:65244238-65267283GLC16
SE_63391chr11:65243820-65268347NCI-H69
SE_63485chr11:65243646-65248049HSMM
SE_64233chr11:65243668-65247416NHEK
SE_65811chr11:65242911-65247755Pancreatic_islets
SE_66427chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_66427chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_66874chr11:65243783-65246412H2171
SE_67468chr11:65243661-65248051u87
SE_68042chr11:65238458-65277023TC32
SE_68043chr11:65238458-65277023TC32
SE_68495chr11:65243635-65267694TC71
SE_68496chr11:65243635-65267694TC71
SE_68897chr11:65244262-65245818H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr116524463865245303
Enhancer Sequence
TCTCGCTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCAG TGGCGTGATC TCAGCTCACT GCAAGCTCCG 60
CCTCCCGGGT TCACACCATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCGA ATAGCTGGGA CTACAGGCGC 120
CAGCCACCAT GCCCAGCTAA TTTTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACGGGCTT TCACTGTTAG 180
CCAGGATGGT CTCGATCTCC TTACCTTGTG ATCCATCCGC CTCGGCCTCC CAAAGTGCTG 240
GGATTACAGA CATGAGCCAC CGCGCCCGGC CCACGCCCGG CTATTTTTTT TGTATTTTTA 300
GTAGAGACGG GTTTCACCAT GTTAGCCAGG ATGGTCTCGA TCTCCTGAGC TCGTGATCCA 360
CCCGCCACAG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCAACGCGC CCGGCCAATA 420
TGTTTTTCTT AATGGAGGAG TATCCGCAGG GCGCGGTGGC TCATGCCTGT AATCCCAGCA 480
CTTTGGGAGG CCAAGGCAGG TGGATCACGA GGTCAGGAGA TCGAGATCCT GGCCAACATG 540
GTGAAATCCC ATCTCTACTA AAAATACAAA AATTAGCTGG GCGTGGTGGC ACATGCCTGT 600
ACTCCCAGCT ACTTGGGAGG CTGCGGCAGG AGAATCGCTT GAACCCAGGA GGCGGAGGTT 660
GCAGTGAGCC GAGATCGCGC CTCTGCACTC CAGCCTGGGC GACAGAGCAA GACTCCGTCT 720
CAAAAAAACA AAAACAACAA CAAGAAAAAG AGGTGTGTTA TTTAACCTTT TCTTAGAAGC 780
TTCTCTGCTG CCCCCAATCT TTCTCAGCAA TCCTAAGCCT TGCTCCAGTT ACTGGTTAGA 840
GCTGGGCCAA TAGTGGTCTG ACCACACGTG GTGGCAGCAT TCTGAGCTCT GAGGAGACAA 900
CCTGGGCTCT TGTCTTGAGG CCTAAACTGG GCCTGAGAGA GCAGGAACAA ATCTGCCCTC 960
TCCCTAAGCT CAGGGAGTCC ACAGCGGGAC CCTCACACCC AGTCTAAGGA GACCACTGGG 1020
CAGAGCTGAG ATCTTAAGGA CAAGCTGGAG TTCCCTCAGT TTTGGGAAAG GAGTTCTGGG 1080
GTGAGCGAGG AACATCAGGA GAAGCTGGAA CAGAGAGGGG CAGCCAAGTC CTGAAGGGCC 1140
TGCTGTAACC CAAGAGAGAG GCCTGGCTTT ATCCAGCAAG GCCAGGGTGC GGTCGGAGCA 1200
AAGGTTGTTT TATTAAAAGC TTCCTATGGC TGGAGCCCAG GAGTTCGAGG TTACAGTGAG 1260
CTATGATCAC ACTACTGCAC TCCGGCCTGG GCAACAGAGC CAGACCCTGT GTTTAAAAAA 1320
AATCCTAAAA AGCCACAAAA CTTCCTGAAT GCAGACAATG TAGGGGTTCA AGGAGCTAGG 1380
GAGTACAGCG GAGACAGTGT TTGAACAGGC CCAGGCCTGG GCAGGTGGCT GCCTTGGATG 1440
CCCGAAGGGA AAAACAGAAC AAAATCAGGA GGAATTGGAG CCTAAGTGAG GGAGCAGAGG 1500
ATGAAGGGCG AGAAGGGGGC ATGGGGCTGA CAAAGCCGGG GTGGCAGCCC GTCCCACCCC 1560
ACTCAGTGTG GGTTCCCGCG GTCTGTTCGG CGCAGCCACA GGGTCCTCCC ACCACCCTCG 1620
CGGCCCTTCG CCAGCCCAGA TACCGTTTTC CCGACTTTGG AACGGAGACC ACAACACCCG 1680
CCCCGGAACT ACTGAAGGCT CAAGTTAGGT CAACCCGGCA GGAAACCGGT TCCCAAATCC 1740
CAAGGCGGAC CCAGGCCCGC GGTTCCCTCC CTCAAGGCTG GAACAGCGCG CAGTGGCCAC 1800
CGCCGCCGGG TCTCCAGCCC CCAGGAGCGC GGCCTCCTCC CGGACTCTCT CCGATGCGGT 1860
CCTGCCCTGG GGACACGGCA GGAAGAAGGG ACCTGGCTGG GGGACGTGGC CCCGGCGCGG 1920
GGGCAGGGGA GGCAGCGCGG GACTCCCAGC GGCCCCTGCG CGGGTGCCCA CCCGCCGTCA 1980
CGTGACACGC CGGGCGCTGA GTCACCGGGA AGCATCTGGC TGGGCGGCCG GGATTGGCCA 2040
ATCTGCGGGA CCGTCTGGAG CGGAAGGGCG GTGGTAGCTG GCCCTGCTTC TCCCTCCCCA 2100
GGATCTCTGC ACTGGCCTTA CGAACTGGGG AGTCCAAGGG GTTCCAGGAC GGGAAGGGGA 2160
GTTTGAGACC AGCCTGGGCA ACCTGGCCAG ACCCGGTCTC TATTAAAAAT ACGCAAAACA 2220
CACACACCAC ACACCCCACC CCACACAGCC CACACACCCC ACACGGCCAG CAGCCCTTTC 2280
TGTCACCGAC TCCGTTCCCC TGGCCAGTGA GCTCTCCGTC CCCTTTTCCT CCCTTTTCGC 2340
ACACGTGCCT TTCCTGCCTG CTCCCACCTG GTGCCTGAGG CGTCTCTGCG CCTCAGCACT 2400
GGCTGTTCGG TTTGCACTAC GGAGGGCAGT GTAGGTTTGA AAAGGAAAGT TTCATTATAT 2460
AGAACACTAC CAAGGCAGGG CGCGGTGGCT CACGCCTGCA ATCCCAGCAC TTTGGGAGAC 2520
CGAGGCGGGT GGATCACTTG GGGACAGTAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA CATGGTGAAA 2580
CCCTGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAATTAG CTGGGAGTGG TGACACTTGC CTGTAGTCCC 2640
AGCTACTTGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC GCTTGAACCC AGGAGGCAGA GGTTGCAGTG 2700
AGCCGAGATC CGGCCACTGC ACTCCAGCCT GGGAGACAGA GTGAGGCAAG ACTCCATCTC 2760
AAAAAAAATA ATAATAATAA TTAATAAAAA AATAAAAATA ATTAAAAGAA AAAGAAAAAG 2820
CACTACAGAA GAGTGCAGAG GGGCGCCTCA GCTAGAGGAC TTAGGGATTT TCCTTAGGGG 2880
CATTTATGGA CCTTAAAGAG GGAGCTTAAG GGTAACTTGG ACCACACTAG CCACATAGGT 2940
CATGATAAAT GATTACATTT GTAGACATTT TGGTGCCTAA TGCCAGTCAG CAAGGGTTGT 3000
TGCACAATGA GTTTGGACAG GCATGCATTT GCAGAGATGT ATAGAAATTC TAATTACTTG 3060
GAAATTTTGT TGGACCGGAG CTAGGAACCA AATGGTATAG GGAAGTCTCA TTACTTCTGA 3120
ATTCCTCAGA TAAAGAGTTT TGCCTCTGCC TGGGCTGCTC GATGGCCACC AGGTGACCTT 3180
TGCTCTCCTC AGGGGCTGCT GTGGGTCCAG AGCTGGAAGG AGAATGGGCC GCATCCTTTC 3240
CTCCTTCCCT CCCCGCAGCA GCAGGGGCTC TGGCTGCGGG GGCGGGCTGA GCTCCGTCCG 3300
GGGTGATGCG AAGGGGGTCA TGCCGAGGGG GTGACTCCCA GCTTGCACTG 3350