EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-02067 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr10:126420710-126423160 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr10:126422710-126422726CCTTGTGTAAACACAC+6.1
IRF1MA0050.2chr10:126421579-126421600ATCCTCTTTTACTTTCTTTTC+6.39
MEF2AMA0052.3chr10:126422243-126422255TCTAAAAATAAA+6.07
RARA(var.2)MA0730.1chr10:126422329-126422346AGGTCACTCCAAGGTCA+7.74
Number of super-enhancer constituents: 69             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00122chr10:126420286-126432669Adipose_Nuclei
SE_00867chr10:126420175-126421144Adrenal_Gland
SE_00867chr10:126421327-126423670Adrenal_Gland
SE_03059chr10:126421567-126422657Bladder
SE_03136chr10:126420072-126421178Brain_Angular_Gyrus
SE_03136chr10:126421346-126422370Brain_Angular_Gyrus
SE_03136chr10:126422428-126423132Brain_Angular_Gyrus
SE_03854chr10:126400742-126421281Brain_Anterior_Caudate
SE_03854chr10:126421348-126432824Brain_Anterior_Caudate
SE_04762chr10:126400883-126432892Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05766chr10:126349634-126432936Brain_Hippocampus_Middle
SE_06675chr10:126400903-126434597Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07833chr10:126400866-126432679Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09159chr10:126415769-126421332CD14
SE_09159chr10:126421686-126423146CD14
SE_10231chr10:126419608-126424708CD19_Primary
SE_11826chr10:126420491-126424122CD3
SE_14406chr10:126419928-126424140CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15467chr10:126421013-126423811CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16286chr10:126420858-126424238CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16956chr10:126421066-126423055CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17772chr10:126419368-126434629CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18306chr10:126419113-126424667CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19113chr10:126419661-126425107CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19980chr10:126420416-126423994CD56
SE_20757chr10:126420380-126424051CD8_Memory_7pool
SE_22300chr10:126415836-126427028CD8_primiary
SE_23226chr10:126419720-126421046Colon_Crypt_1
SE_23226chr10:126421402-126423679Colon_Crypt_1
SE_23768chr10:126420443-126421070Colon_Crypt_2
SE_23768chr10:126421674-126422197Colon_Crypt_2
SE_23768chr10:126422220-126422767Colon_Crypt_2
SE_23768chr10:126422802-126423761Colon_Crypt_2
SE_25345chr10:126415835-126421276DND41
SE_25345chr10:126421297-126434389DND41
SE_25897chr10:126419527-126426939Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26558chr10:126419833-126433784Esophagus
SE_27648chr10:126421342-126422678Fetal_Intestine
SE_28609chr10:126421264-126422733Fetal_Intestine_Large
SE_29582chr10:126421402-126422955Fetal_Muscle
SE_30910chr10:126420522-126421264Fetal_Thymus
SE_30910chr10:126421304-126432559Fetal_Thymus
SE_31435chr10:126420082-126422764Gastric
SE_36797chr10:126421068-126422665HMEC
SE_36994chr10:126420290-126423472HSMMtube
SE_39370chr10:126422122-126423448Jurkat
SE_40602chr10:126415564-126427340Left_Ventricle
SE_42109chr10:126419696-126427334Lung
SE_44061chr10:126420402-126424678MM1S
SE_46776chr10:126421404-126422756Ovary
SE_46776chr10:126422791-126423912Ovary
SE_48059chr10:126415530-126433768Psoas_Muscle
SE_48558chr10:126419690-126421246Right_Atrium
SE_48558chr10:126421296-126427182Right_Atrium
SE_49774chr10:126421412-126423743Right_Ventricle
SE_50103chr10:126419626-126423973Sigmoid_Colon
SE_51170chr10:126420625-126427185Skeletal_Muscle
SE_52350chr10:126419659-126423862Small_Intestine
SE_53300chr10:126419634-126433753Spleen
SE_55093chr10:126420296-126421208Thymus
SE_55093chr10:126421244-126424028Thymus
SE_58522chr10:126367014-126434794Ly1
SE_60556chr10:126404074-126434649DHL6
SE_61270chr10:126405484-126433849HBL1
SE_62212chr10:126285528-126438541Tonsil
SE_65502chr10:126421522-126422104Pancreatic_islets
SE_65502chr10:126422165-126422726Pancreatic_islets
SE_65502chr10:126422877-126423746Pancreatic_islets
SE_66255chr10:126422122-126423448Jurkat
Enhancer Sequence
AAGCTAAATC AGAGATGAGC AGCCAGCCAC ACAGGGAACA AGTGCCTGGG CTCCAGCTCT 60
CGCCTGTGCC TACACTCAGG GCTAAAAATT CAGCCCTGTC TCCAACAGCG CCCAAAGCCT 120
GGCCAGGCCA ATGGCTGCCT CCCATAAGGG ATTCTACCCT GGTTCCCCCA GGTTCCACTA 180
TCCACCCAGA AACCGGGCAG GATCAGCCAC GCTCAGTCGT CGTCTTACAA GTGCAGGGGA 240
AGGGCTTGGC CAGGCAGGAA GCTGGCAGAC CCAGGGAGCT CCTCAGGTGA GCAGACGGAC 300
ACCACCCTGG CCACGCTCCT CCATGGCAGA GGAGCACGCC ACCACGCCAT GTCTCAGAAC 360
AATGACTTCC TGAAATCATG TGTAACATAT AAGGACTCAC CTGAACCTCA CACATGCTTT 420
TAAAAATTGT TTTTTGGCCA GGGGCAGTGG CTCACACCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG 480
GCCCAGGCGG GGGCATCACC TGAGGTCCGG AGTTCAAGAC CAGTCTGGCC AACATGGTGA 540
AACCCCGTCT CTACTAAAAA TACAAAAATT AGCTGGGCAT AGTGGCACAC GCCCATAGTC 600
CCAGCTACTT GGGAGGCTGA GGTTGCACTG AGCAGAGATC ACGCCACTGC TGCACTCCAG 660
CCTGGGTGAC AGAGTGAGAC TCCATCACAA AAAAAAAAAA AAATCTTTTT TTCCCCAAAG 720
CAAGTTAGAA CTCATTTACC TGTGGACTAT CACGTACTCT CCTGAGCCCA AGGTGTCTGA 780
TCTCCTCTCT GCTCCTACTT CTGGTCATAA CGCTCTTTCA CTCCAGTTTG CTGCTCAACT 840
TTTGGCCTAT GCGGACGCAG CCAGGCCAGA TCCTCTTTTA CTTTCTTTTC TAACAGGTGA 900
AGGCATGTGC TAACCTCCCC GGGAATGAGA TGAACAGAGA GGTTTACTGT TAAAATCAAA 960
ACCATCTGTG GCTAACTTAC TCACTTTCTT CTTCCCTTAG GAGTAAATGC AGATGAGCAA 1020
AACCCTACCA GCCTTGGAAA ACACACCCCC CAAAGCTAAG ATGGGCTGCT AACTGCAGTT 1080
CCGCCTCCAC CTCTGCACAG GTTCAGTATT TTTCTTAATT CTCCTCTTCT GGGCCCAGGT 1140
CACATGCCAC ACAGTCAACG GGGCCTGGAA TCTGGGCTGG CATCTGAGGG CGGTGGAGGC 1200
CTCAGGCGCA CTGGCCGCCA AGAGTCAGGT GACTCAGGCC CGCCATTCTC GAGTGTCTGT 1260
GTCAGCAGCT TCCCCCTGCC TTTGAGAACA CTAGTGAGAA CAGGCTATGA CAGAGCCCAG 1320
GGGGCACCGA AGCTCCCTCT TCCATCGCAC CAACACGGTT AGGTGCCTGT TTTTCCCTTT 1380
AAAGAAAAAA AAAAGGTAGT TTTACACTGA ATCAGACTGT TTCAACTCAC ACAACGCCAG 1440
AACTTTGACT TCTTTAGTTC CAGCGCAGCA CAGACAAGAA GTTCTGGAAG CTCTTGGGAA 1500
TCCCAAGGGC GCCTGCTAAA TGCGAGAGTT TTGTCTAAAA ATAAACAAAG ACCACATCAC 1560
TCTGGCCAAG GCGGCACTTG ATGAAAATTC TCAGAGGCTA GTCTCATGCT TCTCCAGGAA 1620
GGTCACTCCA AGGTCAAAAG GCTGGGCCCC TGGGCAGTGT CACCCCGAAG GTGGGCTTTC 1680
TCCCAGCCCT TCGCCCTTCC CTTTACTGCC ATCCTGACCT AGATCAGCTC CGCTCCCCTC 1740
TGAAATCTAC ACTCGTCTCA CTCAGGCTCC AGGTCTCCCA GATTCCCTGA CACAGTCCCA 1800
TGGTGCTGTG ACTGGGGACA CCTGCTCTCC TGGTCTCGAA TGTCTCCTCC TCCCCGTTCT 1860
TCATCTGTCT AAACTCCTGC TCATTCTTCA AGACTCAGGT CAGCTGTCAC CCCCTCCAGG 1920
AAGCCTTCCC TGCCCTCCTC TCTTCAGCTC AGTTAGAGAG ACTTTCTATG ACTTCCAGAG 1980
GACGGTGTAA CTCACCAGTA CCTTGTGTAA ACACACTTTC ATTCATTTAT TACACTGTGT 2040
CTAGCACATA GTAGAACCTC AATAAAAACC TGCAGTCTGA CTGTCCATAA TACGAGCTAT 2100
GAGCTCCCTA AAATCAGACA TTCGGTAGAT CCATCTCTGA ATTCCTCAGG GCCTGACGAC 2160
TTGTCTGACA CACATAGTAG CTGTTACTCC ACATTGATTG AACTGCACTG AGCCTGGGGG 2220
CCACCACCAT GGCAGGTATG TTTTGTGCTC ATCACAGGAA CAGTGACACA CCCAAGGAGG 2280
ACACAGTGGG TGAGGATGAC ACGCTCCACC TGGCAGATGA GTTCTGTCAC ATCCATGAGA 2340
CCAGAGGCAG CCGAGACACC TCAGAGACCT CCCTTATGCA GCCCTCGCTC ACAAAGCTTC 2400
AGGATCTCAT TGTCCTAGCA GGTCTGCTTC AAGGCCACCC ATGCCCAGCC 2450