EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-01121 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr1:169648840-169651760 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs16862512chr1169649691hg19
rs7531806chr1169651044hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:169650332-169650342TCTAATTAAA+6.02
STAT1MA0137.3chr1:169650178-169650189TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr1:169650178-169650189TTTCCCAGAAA-6.32
TCF7L2MA0523.1chr1:169649001-169649015AAACTTCAAAGGGA+6.74
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10569chr1:169647849-169652512CD19_Primary
SE_11089chr1:169642623-169653758CD20
SE_18548chr1:169647785-169652059CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_58649chr1:169639952-169681619Ly1
SE_58866chr1:169645496-169682054Ly3
SE_62308chr1:169636484-169681753Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1169648926169649106
chr1169649404169651723
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I169679chr1169648865169651709
Enhancer Sequence
AAATTCTTTA CATGTATTAT ACAACTGCCA TATAACTGCC ATATGAGGGA TGTACCCTCA 60
TTGTCACCAT TTTACCGATG AGAAAACTGG CATAAAACGT TTAAGTAACT TGTCCAAGTT 120
ACAGAGCTTA GTGAAGCCAC AATGTTGCTC AATTTGCTCT CAAACTTCAA AGGGATGGGA 180
AGGACACCTA AGTCATAGAG TCTTTAAGAA TCAGAGCTAG AAGGAATCTT AGATGTTATC 240
TAGTCAGCCT CCTCCCATTA CAGTCCAAGA GAAGATGGCC CTGAGTTACT TGTAGCTATT 300
TTTGCATGTG AATTGCAAGT GAATATACAT TCTACTGAAG ATAAAAGATA TTTAAAGATA 360
TCGCTGGATA TAGGAACAGT GGTTTTAAAT CTCTAGGCTT TAACTTTTCT CAGAACAAGA 420
AATCCTTTTT GGTTTTAATC TATATGCACA TCTGTATTTT TCTCAATTAT CGGGTAGTAA 480
AATATAACTT TTCTTCTGTA ATATTTTTTA ACTTTAATGA GTGTTCCTCA TAATAGAAAA 540
GTTTGGAAAC CATTGCTATG GGTATATACT TTCTAAAGGG ATAGTAATTT CTCTAGAATA 600
TTCATTTAAT GCTCCAGAAG TAATTAGCAC AATTGTGCAA GTCTGTGCAT CATCAACTAT 660
ACATTCTGCC TGTTTACTCC AAATCCACAT GAAACTGATT ATACAGTCAA AGGCGAGCCC 720
AGTGGAGAGG CATTTTTGGA GACTTCCTGG TACATTGAGA CAGGGTCGGC CAGTCTGCGT 780
TAGGGTCTTG GTCAAAACTG CATTTCTGAA ACTAAACTCA GATTGCTTTC TTTTAAGGGG 840
TCAGAACTGA TTCAAATCTA CATTTTTAAA AGCCTTAGAT GTGGGGCTTT TCCTATTCCC 900
AGTCTCCGCT ATTGGTCTTT GTGAATCCAC AGGCAATTTG GCCACATCCT TGACTCTCTC 960
TTATATTAAG AATTAAACAG CTAAGTTCAT GCAGAGGAAA TATAACAAAG GAGGGACTTT 1020
CCTACAAGAT CTTTGAAAAA TGGAACATTT GCATAAGTCA TATTTAGCCA GAACTGTTGT 1080
TTTATATTTT CCTTTCTGAA TACTTTGTTA CACCTCCTCC CAGCCAACCC CCCCCCTCCC 1140
TGACCCCAAC TAGTCAGAGA CCAAAGCCTT CACAATGGTT TACACTTGAA CCTTCCTGGC 1200
CCCACCCTCA TCATCACGCC TGAATAATTA CATTCACTGA CTGGTCTCCC CTGCTTCCGT 1260
TTATCTCCAC TCCTAAACCC TCTGACACCT TAATCTTCCC AGAATACCAT TGTGATCCTG 1320
TTCCACTCTT GCTCAAGTTT TCCCAGAAAC TAGAGTACAA ACTTTATAAG CTTTAGAGTT 1380
GAAAGCCACT CTATCTCTTT TTCATCCCCA GGTCTCTGCC AAGGCAGTAT AACCTGTCCA 1440
ACATCTCTAA CTTCAATACC TTTGTCTTAG ATACTAGACT CTCCTCCTGG TTTCTAATTA 1500
AACCTGATCT AGGATCTAAT TTTGCCTCTG AATTCTGTTG CCCTTTGCCA AGTGATCTCT 1560
TCCTCCTCTG AGCCGCAGCA TCTCTGAGCT TGCACACTTA GCATAGCCAT AGCACACACA 1620
GCCTTAGCTT GCAGTTCAGG GTGTTTACCT TCCCTCCCCT TCCAGATGCT GGATCCCCAG 1680
GGATAGGAAC TCTGCCCTTA TGTGTCCATA GCCCCTGGTA GTATGTCTTG CAGTCGTACA 1740
TTTTCAGCAA ATGTTTAATT GGTTAATTGA AGACAACTGT CCCATGCCTT AAGCCTCTCT 1800
TTTTGCTAAA CATGCCTGTG TCCTTTGTCA TTGAACAACT ATTTTGATCT ATTTTCTTCC 1860
TGACATAGGG GTCAGTTCCG AGGATGCTGA AATCAAGAGA CATAGCTTAT TCTCTCAAAA 1920
TTGCTTTCAA GAGTGATTTT GTTGTGAATT GAGAACTGGC TGCCTACTTT TGGACTACCC 1980
ACTTCAGCAA GAGTGTTTGA AACCAAATCT ATTCTAAGTA ATTTTTTATT CCCTTTTCTC 2040
TATGGCATTA GACACACAGC TCTTTTAAAC TACCTTTCGT TATCTATTAA ACAGACATTC 2100
AGTAACTCTA TAGACACTGT CTAGCTATAT GAACTTAGAC AAACTAATAT CTCTGAGCTT 2160
CAGTTTCTTA AAATTTAAAA TGAGGACAAT ACCATCTATG GCCGGGGATT AAATGCTATG 2220
AGGAATGTAA ACCAGATGTC AGGTACCATC TCTCTAAAAT CCAGATAAAA TGAATTAAAA 2280
ATACTGGCCG CAAACCCTCT CTAAGAGTTC TCAAAATTCT CAGAGAGCTT AATTTTCATG 2340
CTCACCATAG CACCGATTTT CTTCTAAATA TTTTGTTTCT ACCAAAATAT TTTGTCCCAA 2400
TTTTGCCTTT TATGGCTATT TCTTCATATC CACTTTCCCA AACTAAAGAA GCAGCCCCTT 2460
CACCTTAAAC TCCTCCTTCA AAGCAACCTA AATACAGGTC TGGGTTTGTA TTCCTAGTGG 2520
GATGTTACAG AGGTTAGTGT GATGCAGAGG AGGAGTCATG CTGTTTAAAT CCATACTAGT 2580
CCCCAGAGGC CAGGCTGCTT CTGCCACCCC TACCCCTCCC GCCACAGAGC TCTTCAGCTT 2640
CTCACATTTC TAGTTCTTCT CTCTCTACTT TCATTACCTT CTCTCTTTTT TTTTTTCTTC 2700
TCATGTGCTC ACGGGAGCAG AGAAAATTAA CTCCTCTAAG TTTTCTTAAC ACAGAGTGCC 2760
TTAATTACAT ATTACTATTG TTTGAGTTCC TGCCAACACT ACGTCTGTAG GGTCACACCT 2820
GCTATATTAG AGGCTTATCA AAAAAAGATA GCTTTCTCCT AAAAAGGGAT TTGGATGCCT 2880
ACTAAGATAA CTGGATGCCA AGATAAGTTT AACCTAACAA 2920