EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS068-05764 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM18526 
Coordinate
chrX:12973940-12976520 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chrX:12976252-12976273AAGAGCTTTCACTTTTCTTTC+6.04
RREB1MA0073.1chrX:12974393-12974413CCCCCAACCACTACCCACGT+6.06
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09612chrX:12972105-12976925CD14
SE_10462chrX:12972222-12976871CD19_Primary
SE_11231chrX:12964480-12979243CD20
SE_11864chrX:12967020-12976869CD3
SE_14440chrX:12972408-12976633CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15419chrX:12972058-12976225CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15857chrX:12970491-12974846CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15857chrX:12975338-12976613CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16331chrX:12972355-12976701CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16908chrX:12970426-12975732CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16908chrX:12975756-12976642CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17382chrX:12964629-12977016CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17855chrX:12964647-12977052CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18339chrX:12964526-12976996CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19260chrX:12964787-12976630CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20114chrX:12964869-12976883CD56
SE_20864chrX:12972546-12976255CD8_Memory_7pool
SE_21563chrX:12973837-12976634CD8_Naive_7pool
SE_21967chrX:12967159-12977050CD8_Naive_8pool
SE_22410chrX:12965021-12976933CD8_primiary
SE_25447chrX:12972538-12976881DND41
SE_27537chrX:12973777-12975378Esophagus
SE_30940chrX:12972019-12976866Fetal_Thymus
SE_32462chrX:12972299-12977020GM12878
SE_38726chrX:12973561-12975965HUVEC
SE_39711chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_39711chrX:12975836-12976618Jurkat
SE_40111chrX:12973747-12976020K562
SE_49904chrX:12973747-12975687RPMI-8402
SE_49904chrX:12975780-12976706RPMI-8402
SE_50189chrX:12973698-12975396Sigmoid_Colon
SE_50189chrX:12975885-12976626Sigmoid_Colon
SE_52563chrX:12973689-12975337Small_Intestine
SE_52563chrX:12975401-12975694Small_Intestine
SE_52563chrX:12976051-12976611Small_Intestine
SE_53489chrX:12972019-12976836Spleen
SE_55209chrX:12973857-12975810Thymus
SE_55209chrX:12975986-12976589Thymus
SE_58417chrX:12964783-13034394Ly1
SE_58905chrX:12964721-13049077Ly3
SE_60593chrX:12964761-12998409DHL6
SE_61870chrX:12964787-12998403Toledo
SE_62231chrX:12964510-13049336Tonsil
SE_66386chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_66386chrX:12975836-12976618Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chrX1297418412974672
chrX1297485412975280
chrX1297615912976277
chrX1297619812976345
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH0XI012945chrX1296392512977022
Enhancer Sequence
TTTGTTATTT ACCTGAAATT CCCATTTAAA TTTGAGGGCG TCTTCCATTT TTATTGGCTA 60
AATCTGGCCA CCCTCCCTCA GGGTGTGACG GCAGGAAGCG GGAGAGAACA CAGATGTCCC 120
CTGTTATCTC CCTGGGCCCT GCGTGGCCCT CTCAGGGAAC CACAAGCCAG GGCCAAGCCC 180
ATCCAATCCT CCTGCACCAG GAGCAGCAGA AGCCATGCCG CTAATGGCAG TCACCTCGGT 240
GGAAGTAGAG CGGGCCTGTG GCGGCGTGAG GCTTTTCTGC TCTGCTTCTG TGGAAGTGAT 300
TATCCAATAA CTAGTAGGAA TCGGGCAGTT GGCAGACGCC TCCCATGCTA TAAAGCCACA 360
CAAGGCAGGC AAGTGTGGGC ACAGATGAGA GGCTGAGAGC GGAGGTAGGA TGTCACCCCT 420
GCCCTCGCCA GCCTCATCTG TTTTCCCAGG CGTCCCCCAA CCACTACCCA CGTGGATTCT 480
CCCTCGAAGA GCCCCCTTTC AGGGCCCCAT TGGCACTTCA CTCTTGAGGG AGGCCTAGGA 540
GAAGCTAGTG GAAAGTTACT TCCACATAAA CGGTCAGACA GACGGATGAT GAAACCACAG 600
GAAACCACAG CTCCTCCCCT GCCGGGGCAC CAGGCCAGAA GCCGACCTGC TAGGCTTGGG 660
GACCCCTTCT GGTCTTGCTA GGGGCTCAGA GACCCTGGGG AAGTCCCTTA CTGTGTGTCT 720
CATGTCTTCA CTTATGGATG GGATGCCAGC TGCCCTCTCA TGCCCTCACA GGGCTGTTGG 780
GAGGCAAGGG TGAGCTAGCA GATGCAAAAT AATGGCAAAA TTAAGAAACC AAGTACCTGT 840
ACAAATGTAC ACCTTTATAG TGGTTCAATT TGGCCACACG TGCTTCTACT TAGAGAAACA 900
CCATACATGA ATATTCAGGC ACATATACAT ATCACTATAT GATCCTACGA GCAACTTCCC 960
TACCTCACTG AAAATATGAT TCACTTCACC AAAATGTAAT GCTATGGTCA CATTCTACAA 1020
GGAAAACATC CAAAGCACAG CCACTGTAAG TGAGGATAGT TCTCAACTGG GCCTATGGTG 1080
GGCTGGCTGA CTACACTTGC AGTCTAGAAC GGGGCCTACT GCAGACTGGT CTGCAGTTAG 1140
TTTGATCTAG GGTTATGACA GCAGTTGACT TGAAAATAAC TTTCCTCCTG CCCCTTTAAG 1200
AACACGGGTT CCTTCCCTTG CAGATAAGCA GGAAGTCCCC CTCCCTCTGT CTTGGTGCTT 1260
GGTGGTGTGT TTCACTTCCT TTCAAAGGTG TTTTCTTACT AAAGAAACCC TAAGCCCAGG 1320
GTCACATTCT GTTTCTTTCA CAGGCATACT CAACTGCGTG TTGTTGATTC TGTGACAAGT 1380
TTCTTGAGCA AGAAAATACA CAGAAAAAAT GTTAAATGTA TAAAATATGA AAGTAAAACA 1440
TCAATAATGT TTTAAATATT TAAAATATAA AAGTAATGCA TGCTTCTGGT AAAAATGTAA 1500
ATGGTAGAGG TTTCTCTATT TCCTTTCCCC AGAGGTAAGC TCTTAAAATT CCCTTCCGGA 1560
AATGGTCTCT CTACACCTCA CTTTTTTATT GCACAGAAGG GATCAGACAC TATTTATGAG 1620
GCTCTTTATT TTCCACTTAA GAGTATTCTG GCTGGGCGCG GTGGCTCACA CCTGTAATCC 1680
TAGCACTTTG GGAGGCCGAG GTGGGTGGAT CACGAAGTCA GGAGTTGGAG ACCAGCCTGG 1740
CCAACATGGT GAAACCCCAT TTCTACTAAA AATACAAAAA GTAGCTGGTG TGGTGGTGGG 1800
TGCCTCTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATTGTTTGAA CCCAGGAGGC 1860
AGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGCGCCAC TGCACTCCAG CCTGGGTGAC AGAGCGAGAC 1920
TCTGTCTCGG GGGAAAAAAA AAAAGAGTAT TCTTTGGACA TCCTTCCACA GCATATCATG 1980
AATAAATCTG CCTCAATCTT TTTTTAACAG CTGCATAGTT TTCCATTGTT TGGGTACTCT 2040
ATCATGTATT TAATTAATCT CCCAATTAAT ATACACTTAG GTTGATTGTA GCTTTTACTC 2100
TTATCTACAA TGCTATGGGG GAAAGATCTA GATGTTTGTG CATGTGTATG TATATGTATA 2160
TGTAAGTGTG TTAGTATGGC TATAGAATGA GAGTCCTGTC ACTGGACTTA AACTGGAAAT 2220
GCTGGGTTCA ACTGGAAATG CTGTTTTAAT TGTGACAGCC ACCGGTGCCT CTGAAAAGTC 2280
CCTACGAATT GACCCTTCCA ACAACAGCAT ATAAGAGCTT TCACTTTTCT TTCCCTGCAT 2340
TCTGGCCAAC TGGAGCCACT ACTCAACCTT TTCATTTTTG TCAGTCTGAA ATGAGCAGAG 2400
AGGTCCTCAT TGTTTGATTT GCATTTGAAA GCCTACCATA CACGGGCATC TTCTCATGTT 2460
GTTCTTAGCT CAGTGAGGAG GGCCTTAGAG ACCAGACTTT GGAACCAGAT AGAGCTGGAT 2520
ACCGTCCCAG CTCAGCCACT TGCCAACTGT GATCTCTGGA GCCTCGGTTT ATCCATCTGT 2580