EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS064-00973 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM18507 
Coordinate
chr1:160673210-160675940 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12124234chr1160675269hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:160675073-160675084TCTGATTGGTC-6.14
NFYBMA0502.1chr1:160675074-160675089CTGATTGGTCCAGCC-6.24
PRDM1MA0508.2chr1:160673950-160673960GTGAAAGTGA-6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr1:160673538-160673552GATAAGTAGGTCAC+6.38
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09701chr1:160672926-160683886CD14
SE_11636chr1:160672469-160685202CD20
SE_18460chr1:160673072-160685206CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20696chr1:160673299-160685056CD56
SE_23023chr1:160673113-160685600CD8_primiary
SE_32482chr1:160673705-160674759GM12878
SE_61553chr1:160673445-160704936Toledo
SE_62813chr1:160673121-160684191Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr1160674845160675222
chr1160674146160674391
chr1160675234160675449
chr1160675582160675655
chr1160675691160675844
Enhancer Sequence
GACAGGAGGG TGAGGGGCTG TAGTGGATGG GGGATGGCCT GGAGAATGAT AGGTAAAGTG 60
TAGTTTGGTC CTGGAGCCAT TAGCTGATGC TGGAGGTTTG AAGAGAGAAG AATTAGCATA 120
TCTATGGTAC ATGCAGCAAA GATCCCTACC TTAACAGAGC TTGCATTAGA GTGGGGTGAA 180
AAAACGTAAG CAATCAACAC ACTAACAGAA CACACTGTAT AGTATGTAAG GAGATGATAA 240
CTGCCATGAC AGAGGAGAAA ACCTAGAATA AGGTAAGGGG AGTCACAAGT ACTGGTAGGG 300
GCAAAAGGGT GAACTTCATT TATAAGGTGA TAAGTAGGTC ACATCTGAGT AAAGACTTGG 360
AGGAGAGAGG TGGCCAAGAG GGTATCTGGG GTAGGAGGGA CCCAGACAGA GGAAAGAGCC 420
AGAGCAAAGG CCCTGGGGCA GGGATTTGCC TGCCATACAT AAACAACAGC AAGGAGGTGG 480
CGAGTGGGTA GTGTGGAGTG AACAAGGGGA TTGGGTGTTG AGAGACACAG TCAGAGAGGG 540
AGTGAGATTG GAGAGAGTAG ATACATTTTA GCTTTATTAA TAATGTCTTG TCCTGTAAAA 600
AAAAAATGCT TTCCTGTAAA AGTGGCTCAT GTCTTGTGTG TGCATTTACA ATGTATTTAG 660
AAGCAAGTTA TTAGAAGGTA ACAAAGTGGA GACTGTATAA ACCATTGTTT CACAAAGTTT 720
GGATCAGAGG CAGATTTCCC GTGAAAGTGA TGAAGCTGAA GCTTCAGGGC TTCTTGGATG 780
GCCCTGGAGG AGCCCTAGCA GTATTCATGT AATCCATTTT ACAAAACATA TCTTAAACAT 840
TAATTAGACC ACAGCCTCTG TCTACTCTAA CATCCCCTTC ATCACATTTC TGTTTTTGTT 900
GGGTGGCATC TCAGTTATGG GCATTTTGAG GTCTGGCCAA GGGGAAGTAG AAATGGGAAG 960
TACTTAGTTG GGGTTAGCGG GATACATGTA TGAGGGTTGC AAACTCTTGT GTGTGAAGTT 1020
CCCGCTACCC ACTTCAGTGA AGAAATGGCA TCCAGGAATA TTCTTGCTGC CCTCTGCACT 1080
GACTCACTGG CAATGGCCAT GGACATGTTG CAATCGGGCT GCAGGTGGGA AGCAGAGGAG 1140
AAAGCAGGTT GGAAGTGAAC AACAGCCAGA GCTATTCAGT AGCAAAGTAT TGTGGAAGCA 1200
CGAAGGCATT TAATTAACTA AAATTATGCT GCTATTTTTT ATGCTGTCAT GTTCTTTGTA 1260
GTATTTGTAT TTTTTTAACC TGAACTAATT CCCTGGGATT TCTTTTTTTT TATTCTAATT 1320
GAATTTATTT TTGTTCCTAT TTGTATTTCC AGTTTTGTTC TTTTATTATT TTTCTTTTTC 1380
ATGAGAATAC TCCAAATTAT ATAAGCCTCA GGTCATTTTT AAAAACCTGG TTTGGTTAAG 1440
ATAAGGAGAA AGAAAAGATG ATAAGGACAA AGTACAAGAT GAAGGGAGGT CCATTGGTCC 1500
TTTTTGTGGA GGGAGAACTT AGAATATGTA TACAAAGGCT AAACAAGAGC TGTGGAATAA 1560
AAGCTAAAGG TAGAAGAAGA GGAAATATGT CCTATATCAC TCTGGTGTCA TATGCTGCCG 1620
CACAAAAACT CAGTTGTACT CTTCAACATG ATATATACTA GCTGTTCACT TTCCACATAT 1680
CCATCATTTC CAAAAACATT CTCAACCACT AAAAGATAAA AATGTCTGTG ACCCCAGGGC 1740
TTTCAAGTTC CTGTTCATTC AGCCTTCCAA CCATTCATCC ATCTATTCAA CAAATGTTTA 1800
TTAAGCACTT ACCCTGTCCT GGTTTGTACA CGGAAATACC TAGGCATTCA TTTCTACAGT 1860
GCTTCTGATT GGTCCAGCCC ATGCCCTATA ATCCCTCTGA CAGAATAAGT TCAACCCTCA 1920
TACATGTATC CCACTAACCC CAACTAAGTA CTTCCCATTT CTACTTCCCC TTGGCCAGAC 1980
CTCAAAATGC CCATAACTGA GATGCCACCC AACAAAAACA GAAATGTGAT GAAGGGGATG 2040
TTAGAGAAGA CAGAGGCTGT GGTCTAATTA ATGTTTAAGA TATGTTTTGT AAAATGGATT 2100
ACATGAATAC AGTCATCGCA CAACCACAAC ATGCCTGGCG CTGTGCTAGA CTCTGCTGTC 2160
AGCAAGGCAG ATACAGTCTC TGGCCTCTTG GAGCATACAG CCTAGGAGGA CATTCTTTCT 2220
AGGAGTTTAA AATCACTAGA CATATTCCAG ATTTGTTCTC CTTCTGTTAG TTGTTTCCAC 2280
ATGAATTAAT AGAAGCGGTC ATAATAGGCA GTCTAGATCA ATGTTTTTCA GTCTTGACAT 2340
TATTGACATT TTGGGCCACA TAATTCTTTT TTGTAGGGGG CTGTTCTGTG CATTGTAAGA 2400
TGTTTGCCAG CATTCCTGGT ATCTGCCCAC TAGGTGCCAG TAACACTTGT CCAGTTGTGA 2460
CAGCCAAAAA TGTATCCAGA TATTGCCAAA TGTCCCTTGA GGGACAAAAT TCTCCCACAT 2520
TCACCCTGGT TGAGAAGTAC TGAGCTAGGT CATCTTTGGC AGACTCCCCA GGATGTCTCA 2580
GACTTACACT CAGGAAGATA GCACAATCCA CTGTCTGATG ACAGAGGCAG GTAGTAACAC 2640
CAGACAGATC ACTTATATAT ATATAATTTT TTTTATGGAG TTTCACTTTT GTCACCCAGG 2700
CTGGAGTGCA GTGGTGCAAT CTCAGCTCAC 2730