EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS062-01029 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM18486 
Coordinate
chr1:156453940-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
Gfi1bMA0483.1chr1:156455391-156455402AAATCACAGCT+6.14
IRF1MA0050.2chr1:156455632-156455653TTTGACTTTTTTTTTCTTTTT+6.07
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF263MA0528.1chr1:156455131-156455152GAAGGAGGAGAGGGAAGGCAA+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:156455128-156455149AGGGAAGGAGGAGAGGGAAGG+6.27
ZNF263MA0528.1chr1:156455127-156455148GAGGGAAGGAGGAGAGGGAAG+6.2
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 83             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156454182-156455162Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156454294-156454946Brain_Angular_Gyrus
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156452870-156455319Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156448622-156455242CD14
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156454079-156455440CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156449989-156454873CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156453361-156455475CD8_primiary
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156444648-156455540Left_Ventricle
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156452559-156454976Skeletal_Muscle
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156454045-156455158Pancreatic_islets
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156455896156455956
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I156482chr1156452419156455475
Enhancer Sequence
AGTTCGATCT GTAACTGACT GTGAACAATC AATTGAGCTA ACTCACTACC TTTGGACATG 60
CCCAGCCTAA GATTTTTGTT TGAGGAAAGA GTTGTGCTGC TTAAAACAAT GAAACCATTC 120
CTCTAGACCA GGAGATGGAA ATTTTTGGGC CAGATAGTAA TATTTCAGGC TTTGCAGACC 180
ATACAGTCTC TGTTGTAACT ACTCAACTCT GTCACTGTAC CATGAAAGCA ACAGACAGCA 240
ACACATAAAC GAATGAGTGT AAGCATGGCT GTGATCCAAT ACAACTATAT TTACAAAAAT 300
GGGCATGGGC CAGATTTGGT CCACGGGCCA TAGTTTGCTG ATTCCTGCCC TAGAGGTATG 360
GACCACATCT AGAACCCAAG CTCAGTCTAA GAGTAGTGCT TCCCAACCTT GTACATCTTG 420
AAGCAGACAG AGAAAATACA GGAACAAATG ACATACACTG GGGAGGCCAC TGGCAGCCAG 480
GCGGATGCAG GCACCAGGCA GAGAACCTGC TGTCTCAGGA CACCTGTAAC CCCCTCACAG 540
CCCACTAGTT GAACAGCTCC ATGCTAAAGC CAGGATGAGA AACAGCCCCT GCACTGAACA 600
ACTCCAGGAG GCACCATAGG ATAAGAGGGG GCTCAAGGAT GGCAGCACAG CCTGGGCCAG 660
AAAAGGCGCA TTCTCTCCGG TATGGGCAGT GCCTACATAG GCTGGGTGAG TCCTTGGGGA 720
CTGGAAGGGC CCAAGATGGG ACGGAGGCAC GGAATGACTT CAGGGCCCCC TCTAGCTCTG 780
ATTCCAGGAG TCCTTGCATC AAAAGTGGAG CTTTCTGGAA GATGTTGGAA GAGGATAGTG 840
AACTGGGGCC CATGCTTTCT AAAGCCACTC TATTTGGGTC CTGGGAGGAG CCTGGACCAG 900
AGAAGGCCCG CCCTCCCCTC CAGAGCTCCC CTTCCATAGA GCCCCATGCC CAGAGACCCT 960
ACTGTAGAGT CTAGGGATGT AGACCCCCAG CCACTGTCTG ATCCTCTGCA CCCACTGCAC 1020
ACTACCTGGG GAGAGGTGTT TGATGACAGA GAACAACTCT TACCCCTACC CCCCAGCTCC 1080
CACTGCCAAT GGCTGCTGAG TTTCCCTGGA GCCTTTCCAG CCCAACTCTA CATGGCCCCT 1140
ACGGTACCAC AGTAGATGCT AAAGTTCAGC CTTGGTCTCT TGCTCATGAG GGAAGGAGGA 1200
GAGGGAAGGC AAGGAATCTA TCAATTTGGG AGGAGCTGGG ATACTGGCCC CATCCCATTA 1260
CCAAGACTGC TCCCCAGCCT AGCTGGAGAG CTTCTGCTTT GCCTGGATAT CTACAGAAAA 1320
CAATGCAGAT AAATGCATTG CGCTTCAAAC GACTCCCTAC CCTTCTCCTT CTTCTTTTTT 1380
TTTTTTTTTT TTGGTGGTGG TTGTTGTTTT TTAAGATAGG GTCTTGCTCT GTTGTCCAGG 1440
CTGGAGTGTA CAAATCACAG CTCACTGCAG CTTCAACCTT CCAGCCTCAG CCTCCCAAGT 1500
AGATGAGAAT ACAGGTGTAT GCCACCACAC CCAGGTAATT TATTAATAAT TTCTTTTTTT 1560
TTTTTTTGGT AGATACAGGG TGTTGCTTTG TTGCTTAGGC TGGTTCAAAC TCCTGGGCTT 1620
AAGTGATCCT CCTACCTCGG CCTTCCAAGT AGCTGGGACC ATGAGTGTGT ACCACCATGC 1680
CAAGCTAATT TTTTTGACTT TTTTTTTCTT TTTTTTTGTG AGACAGAGTC TCACTCTGTC 1740
ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCTT GGCTCACCGC AACCTCTGCC TCCCGGGTTC 1800
AAGCGATTCT CCTGCCTCGG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT ACAGGTGTCT GCCACCACAC 1860
CTGGCTAACT TTTGTATTTT CAGTACAGAC AGGATTTCAC CATGTTGGAC AGGTTGGTCT 1920
CGAACTCCTG ACCTTGTGAT CCACCCACCT CGACCTCGTG CTCCATGGGC CCTGGGCCTC 1980
CTACTGGTAC CCTGGGACAA GAGCAACACC AGCCCAGCCA GCCCTGAGTG GCCCAGCAGA 2040
CACCTGAGCC CCAAACCAGC TCCAGACACC CCATTCCTCA CCTGTGACCC CAGTGTCTGC 2100
CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA 2160
TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA 2220
GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC 2280
TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG 2340
GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT 2400
CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC 2460
CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC 2520
AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC 2580
CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT 2640
ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT 2700
TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG 2760
CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC 2820
CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC 2880
TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC 2940
CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG 3000
CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG 3060
ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC 3120
TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG 3180
GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC 3240
CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC 3300
CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC 3360
TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC 3420
AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT 3480
GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA 3540
GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG 3600
GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA 3660
CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT 3720
CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC 3780
CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC 3840
TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG 3900
GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA 3960
TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG 4020
GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA 4080
AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG 4140
GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG 4200
GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG 4260
AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA 4320
CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC 4380
CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA 4440
TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG 4500
GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC 4560
AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG 4620
CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG 4680
CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC 4740
TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT 4800
TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT 4860
GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG 4920
TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG 4980
GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT 5040
GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT 5100
TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA 5160
ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG 5220
GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG 5280
ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG 5340
GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA 5400
GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA 5460
CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT 5520
TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG 5580
AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT 5640
CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG 5700
ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC 5760
AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG 5820
ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA 5880
CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA 5940
AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC 6000
CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC 6060
ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC 6120
TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG 6180
GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA 6240
CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC 6300
CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 6360