EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS061-00545 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12892 
Coordinate
chr1:28200950-28203090 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr1:28201011-28201022GCAGGGTGTGG-6.62
Lhx3MA0135.1chr1:28202191-28202204TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:28202192-28202205AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr1:28202193-28202203ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:28202193-28202203ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09233chr1:28198278-28207102CD14
SE_20343chr1:28199013-28203940CD56
SE_50884chr1:28199013-28201650Sigmoid_Colon
SE_50884chr1:28201667-28202339Sigmoid_Colon
SE_50884chr1:28202398-28203826Sigmoid_Colon
SE_53500chr1:28198475-28202256Spleen
SE_53500chr1:28202379-28203898Spleen
SE_62491chr1:28184415-28220281Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr12820180028202156
chr12820137828202229
chr12820127228202191
Enhancer Sequence
AGATCAGCCC TGGCAACATG GTGAGACATC ATGTCTACAA AAAATTTTAA AATAAAAAAT 60
TGCAGGGTGT GGTGGCTCAT GCTTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGGA 120
TCACTTGAAC TCAGGGGTTC AAGACCAACC TGGGTAACAT ACTGAGACCG TGTCTCTACA 180
CAAAATAAAA AAATTAGTCA GGTGTGATGG TGCATGCCTG TAGTCTCAGC AACTCAGGAG 240
GCTGAGGTGG GAGGATTGCT TGAGCCTGGG AGGTTGAGGT TGCAGTGAGC TATGATTGCA 300
CCACTGCACT CCAGTCTGGG CGACAGTGAG ACTCTGTCTC GAAAAAAAGG ACGAGGTCTG 360
TGTTGCCCAG GCTGGTCTTG AATTCCTGTC CTCAAGCAGT CCTCCCACTT TAGCCTCCCA 420
AAGTGTTGGG ATTACAAGCG TGAGCCACCG CACCCAGCCA TAACTTCCAG TTCTGCCTCC 480
TATTACCTGA TCATCATGTA CAACCTACTC AGCCCCTGAG AGGCTGTTTC TTTTTCTTCT 540
TCTTCTTTTT TTTTTTTGAG ATGGAGTCTC CCTCTGTCAC CCAGGCTGGA GTGCAGTAGC 600
CTGATTTCAG CTCACTGCAA CCTCCACCTC CTGGGTTCAA GCAATTCTCC TGCCTCAGCC 660
TCCTGAGTAG CTGGGATTAC AGGTGCCAAC CTCCACACTG GGCTAATTTT TGTATTTTTA 720
GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GCTGATCTCG AACTCCTGAT CTCAGGTGAT 780
CCCCCTGTCT TGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCA TGAGCCACCA TTCCTGGCCA 840
GCTGTTTCAT TATTTAGGAA ATTGAAACTG CCTGTCTCCG CAAGAGCAGT CATGGGTCTT 900
AAACACAATG ACGCATCAGT AGCCCTTGGC ACAGTGCCGG GTATCTGTAG TACCACAGCT 960
GCTGTTCTCA CCAGTCTGGA AGGCCCATGC TCTGACATTG TAAACAGACT GTGGTTTATG 1020
ACTGGTGGGC ATTTTCCTGG CAGTACGTGG GGAGGTTTTC ATCAGTTTCT CAGGGCTGAT 1080
GTTGGAGCTG CCCTGTGGGT GGGGCTGGGT TCAGGTGGCC TCAAGGTCCT GCCACGTAGT 1140
CTGTTGTCCT CCATTAGCTG GATGGAGAGA CTGTGCACTC GTGTGTGCGT GAGAGATCTT 1200
TATTGAGCAA CTTCTGTGTT CTCGACACCA CTTACACACT TTAATTAATT AATTTATTTT 1260
TATTTATTAT TTTTTTTTTG AGACGGAGTC TCACTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGAAGTG 1320
GCGTGATCTC GGCTCACTGC AAGCTCCGCC TCCCGGGTTC ACGCCATTCT CCTGCCTCAG 1380
CCTCCCGAGT AGCTGGAACT ACAGGTGCCC GCCACCATGC CTGGCTAATT TTTTTTGTAT 1440
TTTTAGTAGA GTCGGGGTTT CCCTGTGTTA GCCAGGATGG TCTCGATCTC CTGATCTCGT 1500
GATCCACCCA CCTTGGCCCC CCAAAGTGCT GGGATTACAG GCGTGAGCCA CCGCGCCCAA 1560
CCCTCACTTA CACACTTTAA ACCAGGAAAG CAGAACTTTG CCCATTGGGC CTCACTCTGT 1620
CAGTGCCCCT CTATTTTCCA GGGTGCTAGG AGGGCTGGGT ACCGGCCCTG GCTCCGGGTG 1680
ATCTCCAGGG AGCCACTGAC CCCTCTCTGA GCCTGATTTT GTAGCTGTAC ACTAAGGGAA 1740
TCCCAACTCC CTTAGTGTAC AGCTACAAAA TCAGGCTCAG AGAGGGGGAT TCACTGGGTT 1800
ATTTACTGAT TTGTGGACTT ACCACATACT CAGAGGCCAA GCCCTGTGCT GGCTGCAGTG 1860
ATGTTGAGAT GGATCAGCCC TGCCTGTGAA CTCAGTGGAG GAGGCACGGG GATGTGAAAA 1920
AGGCCAGAGA AGTGTGCCAC AGCGGGGTGC ACCGATGCCA GGAGGGGCAA GGACAGCTGA 1980
GGACGACTGA ACCTGTGGGC ATGAGGCAGG AACGACAGAG CAGGGCATGC CAGGCAGCAG 2040
GCACCATGTG CAAAGGCATG GCAGAGCAGA GCTTGTTGGG CACCAGGGCA CAGGCTGCCC 2100
AGCACTTGGC CCTTGTCCAA TGGGGAAATG GAGTCCTTGT 2140