EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS060-18016 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12891 
Coordinate
chr19:44256020-44258800 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr19:44257542-44257554TTCTGTTTACTG-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr19:44257365-44257379GGAAAATGACTCAT+6.76
KLF16MA0741.1chr19:44258732-44258743GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr19:44258733-44258743GGGGCGGGGC-6.02
SP1MA0079.4chr19:44258731-44258746CGGGGGCGGGGCCTG-6.11
SP4MA0685.1chr19:44258729-44258746GGCGGGGGCGGGGCCTG-6.26
ZfxMA0146.2chr19:44258732-44258746GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02767chr19:44256100-44260167Astrocytes
SE_09619chr19:44255368-44262466CD14
SE_10575chr19:44256833-44260060CD19_Primary
SE_11483chr19:44255253-44262275CD20
SE_13735chr19:44255931-44257680CD34_Primary_RO01536
SE_13735chr19:44257681-44261073CD34_Primary_RO01536
SE_14657chr19:44256014-44261046CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18182chr19:44255605-44260321CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18680chr19:44255276-44260362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19217chr19:44256242-44260273CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20985chr19:44256876-44261109CD8_Memory_7pool
SE_23510chr19:44257834-44261164Colon_Crypt_1
SE_23897chr19:44258182-44260089Colon_Crypt_2
SE_27247chr19:44256975-44262719Esophagus
SE_31804chr19:44257590-44260338Gastric
SE_32542chr19:44255365-44264271GM12878
SE_33868chr19:44256868-44261203HCC1954
SE_34298chr19:44255426-44256716HCT-116
SE_34298chr19:44256799-44272203HCT-116
SE_34813chr19:44256968-44262677HeLa
SE_36558chr19:44255760-44264581HMEC
SE_37675chr19:44254852-44262981HSMMtube
SE_39921chr19:44256960-44261248K562
SE_50403chr19:44256946-44260066Sigmoid_Colon
SE_53073chr19:44256976-44257621Small_Intestine
SE_53073chr19:44257665-44260035Small_Intestine
SE_53761chr19:44256508-44260208Spleen
SE_56117chr19:44257406-44262941u87
SE_59025chr19:44248893-44290143Ly3
SE_60730chr19:44257018-44289948DHL6
SE_62525chr19:44242576-44303622Tonsil
SE_64692chr19:44256932-44264220NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr194425638044256453
Enhancer Sequence
TCTATCTCTT ACTTGCAGCC AAAACTATTC CCAACTATTA AAATGCTCCA ACATAAATAA 60
ACTCACAGGG GCAAGTTCAC ATAAAAATAG GATATTCTCC TTACCAAAAT GCAGCAAGGC 120
ATTTGCTTAC AAACCAGCAA TGTGATCCTC AGTCCAACAG CTACTCTTGA TTAGTCATTA 180
CTAGTGTATG TCATGGTGGG GCTCCAGCCA CTTACTAGTG TATGTCATGG TGAGGTTCCA 240
ACACTCAAGG GCCTATTTTC ACCTGGTATC CCACTACATT TCAGTGTCTG TCTGTCTTCC 300
GTTCCTGACG GTCTGCCTTC CCTCACAGTG AATTTCATTT CAAGGTGTCT CCAGTGTTTA 360
TTCTATTTGA GATGTTATAT AATGTCTGGC TACCTATGCA ACCCACTCTC CACCATTTCA 420
GTATCTGTTT ACAGGTCCTT AGAGAGTTTT CCCAGCTGTT CACACATCAG TCTAGGGTGG 480
TATTTGACTA CTTAACTGTT TGTAGAACTC AGTGGGGCTA TCTGCTCAAG CTCAGAAGTC 540
AGGTTGACAA AGTGTGGCCT AGGGGCCAAA TCTGGTCTGC TTTCTGTTTT TGTAAATAGA 600
AAGTTTTATC GGAACATGGC CACATCCATC AATTTAGAAA CTGTCTGTGG CTGCCTTCTT 660
GATGCAATGG CAGAGCTGAG ACAGACAATA CAGTCTGCAG GGCCTAAAAT AATTATTCTC 720
TGGCCTTAAC AGAAAGTTTT ACTGAATGGC CGAGTATGGT GGCTCACACC TGTAATCCCG 780
ACACTTTGGG AGGCCGAGAC AGGAGGACTG CTTCAGCCCA GGAGTTCGAG ACCAGCTTGG 840
GCAACATAGC AAGATCCTGT CTCTATATAA CATTTAAAAA AGAAAAAAGT AGCTGGGCGT 900
GGTGACATGC ACCTGTAGTC CCAGCTACTT GGGAGGCTGA GGTGGTGGGA TCACTTGAGC 960
CTGGGAGGTC AAGGCTGCCA TGATCATGCT GCACCACTGC ACTCTAGCCT GGGTAACAAA 1020
GCAAGACCCT GTCTAAAAAA AAAAAAAAGC AGAACCCTGT CTCAAAAAAA CAGTTTGCTG 1080
ACCCTTGCTT AGCTTGGAAG TATCTGTTAA ATCCCTCCAT GAATCCTCCC CTGCCCCACC 1140
TCATAATGAC ATAAACAGGT CCCTCCGAGA CTCTCCAGAA TGGAAGGGTC TGTTTACAAG 1200
ATGCAGTCAT AATTTTGCTA GCCAGACAAG TGGCTTGTCT AGCTCCTCTC CTACTGTGCT 1260
ACATGACCTC TCCCAGAGCC ACAAGCCAGG CTGAAGACTG CTTTCCTAGA CAGAGGAGGA 1320
CAAGGGCCTG TTTACAGCTG CTTAGGGAAA ATGACTCATT CCATACCGAA ATGACTGCTT 1380
AGTCTGGGAT GGAGATTCTC CCCAGAATCT GAGACTCCTC CCTCACTTGC AATTAAGTGT 1440
CTTTACACAT TATTCTGAAA TCTACCCAGT GCTTAAGTAC TTGTCTTCAT GCCTCAATTG 1500
GGATACTGCC CAGCCCTGAG GTTTCTGTTT ACTGGCCTAT GAGGATGCCC TTTCCTGTGC 1560
AAAGTAAGCG CCCCTGTGTG AATGCTTTTC TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTGAGACGGT 1620
CTTGCTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCACGATCT CAGCTGGCTG CGGCCTCTGC 1680
CTCCCGGGTT CAGGCAATTC TCCTGCCTCA GCCTCCCAAG TAGGTGGGAT TACAGGTGCA 1740
TACCACCAGG CCGGGCTAAG TTTTGCATTT TCAGTAGAGA CGGGGTTTCG CCATGTTGGC 1800
CAGGCTGGTA TCGAACTCCT GGCCTCAAGT GATTCGCCAG CCTCGGTCTC CCAAAGTGAT 1860
CGGATTCCCC GGGTAAGCCA CCGCACCTGG CCTCCCTGTG CCCTTTATTC TGGGAGCTTC 1920
CACAGTATCT GAATGTGGGG AGTTCCTTGG AACTTAAAAG CCCACCTAAA CCAGGTGTGG 1980
AGGATACAGT GAGCCGAGAT CGTGCCACTG CACTCCAGCC TGGGCGACAG AGCGAGACTC 2040
TTGTCTCAAA GAAAAAAAAA AAAAACCCCA CCCACATGCA AGCTGGGGAC TTCCAATGCT 2100
GTTTCCGGGC TCCTTTGGGG ATTACCCCCA AACTTAGGAA AGCTGGTCTA TTTAAGTGTC 2160
TGCTGATGGA CTTCTAGGGT GACTTCCCGA AAATTAACAA ATCGAATTTA CATATTTTTG 2220
GGGAGTGTCT CCTCAGTATT TAGGCATCGC TTCACACACT CCCTTCGGGG ATCTCCCAGA 2280
ACCTCACTAT TTGCAAATAT TTGGGGAGAC TCTCCCGATT CCTGAGTATG TAAGCCCACT 2340
TCGTGGGGCA CTCCCCAGCC CAGAACTGTA GTCGATTTGC ACATTTTCCT AAGGACTCCC 2400
TAGGATTTAA ACTTCTCTCT ACGGGGTTCT AGAAGGGAGC CTCCCCCGGA TTTAGGCATT 2460
GCTTTACAAA GCTTCCCTCG GGGAACCCAA CTCAAGTTTC TCGTTACACG TTATTGGGGC 2520
GGCCTCCCCA GTACTTGACG GGCAGTTTGC AGGCTGTACT TGGATCTCGC AGAGCATAAG 2580
TTTCTCATTT ACACGTTATT TCCGTCCCCC GCCCCCATTC CTGCCAACCC AGTATCGAAT 2640
TGACGGTCGC CGGCCCCCTA CTCAGTGCCG CACCCCCGCC GGACGTCCCA GCGACCTTTC 2700
AATGGCCAAG GCGGGGGCGG GGCCTGCCGG AGCGCCCCGC CCGCCGCCGG TGCGCTAGCC 2760
TCGCGCGGGC TCGCGGCCCC 2780