EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS060-17818 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12891 
Coordinate
chr19:39172990-39175410 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs973009chr1939174332hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA-6.43
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA+7.04
STAT1MA0137.3chr19:39175026-39175037TTTCCTAGAAA-6.14
Number of super-enhancer constituents: 65             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39172709-39178176Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39172839-39177657Aorta
SE_02408chr19:39172990-39177649Astrocytes
SE_02946chr19:39173560-39175782Bladder
SE_03166chr19:39174301-39175014Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39172941-39177792Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39173279-39175506Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39172836-39178090Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39173207-39177647Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39173597-39177838Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08790chr19:39174651-39174897Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13194chr19:39173530-39174621CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39171584-39177811CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39172843-39178692CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39173158-39178239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39169957-39177919CD8_primiary
SE_23062chr19:39172808-39177650Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39172948-39175688Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39172745-39175747Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39172863-39178234Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39173105-39177586Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39172828-39178145Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35430chr19:39173018-39177757HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39172846-39178074HUVEC
SE_38896chr19:39172978-39177574IMR90
SE_40018chr19:39173109-39177708K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39173026-39175372LNCaP
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_44161chr19:39172957-39177683NHDF-Ad
SE_44797chr19:39173417-39177160NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_46686chr19:39173697-39175316Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39172966-39175743Pancreas
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39172970-39178180Right_Atrium
SE_49449chr19:39173064-39175397Right_Ventricle
SE_50056chr19:39172842-39178237Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39172773-39177883Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39173163-39177229Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39172716-39177734Spleen
SE_54534chr19:39172958-39177716Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39173251-39174352Thymus
SE_55638chr19:39174378-39175365Thymus
SE_56725chr19:39172594-39175708VACO_400
SE_57359chr19:39173016-39175736VACO_503
SE_58038chr19:39172904-39175754VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39172985-39177528HSMM
SE_64225chr19:39172977-39177763NHEK
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39172837-39175413H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr193917500039175365
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
TTGTTTTTTT TCCAAATTGA AACAGGGTCT CACTATGTTG CCCAGGCTGG ATTGAACTCC 60
TGGCCTCAAG CAGTCCTCTC GCCTTGGCCT CCCAAAGTGT TGAGATTAGA GGTGTGAGCC 120
ACCATACCTG GCCCTGTAGA GGGGAGGCAT TGATGAAGGT CAAGAAGTCC TGTTAGCTCT 180
GCCTTCAGAA TCTACCCCAG GTCCTTTTAG TTCTCTCCAG CCTCACTGCT GGAACCCTCA 240
CCCAAGCCAC CACCTTGCAG TCCACACACG GCCACTGGGA TTGGGGCGGC GTTCTCCGCG 300
CGAAATCTGG CTGTGCTCCT CCCCCATGAG GCCCTCCAAA GGCTTCCTCT TCTTAGGATG 360
AAACCCACAC TGCCAGCCGA AGCTCCTCAG GCTCCCACCC TCTACAAGCT CCTTCTGCTC 420
CAGCCACACT CACCAGGCCC GAGTTCCCAC CTAGCACCTT CCCTGGGAAT GATCTCCCCC 480
TGGTTGGCTC TTTCTACTTA TTCAGCCTCA AATGTCATCT CCACTGAGAG GCCTTTCCTG 540
ACCTGCTGAG CTTGATTCCC TCCCCTCCCC AGTCACATTA CTCCGTGTTA TGGTACCCAT 600
CCCTGTCTCC TTAGCTTGTT TTTGTCTGTA TTGGCTCTTC CACTAGACTG TAAGTTGCAT 660
GAGGGCAGGG ATGTCTGTTT AATCCCAGTG CTCAGGATAG TGTATGGCTC GTGATAGATG 720
CCTAGTACAT TTTAAAATGA GAACGAATGA AGTTTGGGAG AGGCTCAGAG CAGTGAGTCT 780
CCCCCTTGTT GGGGGACTGG GGAGTGCCTG GGAGGGGCTA TCTGGTGCCA GCGGTTTGGA 840
GTGGCTGGGA TGACTCTGGA ATCCTGTGAG GCCCAGTCAG TTTCTTTGGT TCTCATGCAG 900
TGCAGTGCCC TCAGACCTAA CCATTTTGTT CCGTGCTGGC TTGAAAGGGT CTGCCTCCCT 960
CCCAGTGCAG CCCCTGCCTC TCCTCTTTCT CGCCCCCCGC CCTCCTCCAG AGAAAGCAGG 1020
TGGTGAGGGC TCTCTAACCC AGACAGGACT TGCTGTTCAG CCCCAGCTTG AAATTGATTT 1080
CCTCCAGCCC TCCTTGAGCC AGGCCCCGTG AACAGAGGAG GGGTCTGAGC CAGGCCTCCT 1140
AGGCCATTGG TGGGAGGGAG AATGAGACAG CCATTTGGCC CACAGGCCAC CAACTTTTCC 1200
CCCCCTTCTC TAAAAGACAC ACAATGGCAG TTGGGCTGCA CCTTTGTGAG TCACCGGTGA 1260
TAGCCCATCA TAAATTGTTA TTTCCTATAT TTCCAGAGCA GCTTTATCGG GCGTTGCCTG 1320
TGCAGTCCGG GAACCGATTT GGTATGGGGT CAGTTAACAT GCTGTCTTGT TGAAATCTGT 1380
CATCATGCCC ATATAAGGCA AACTCCTTGG ATTACTTTTT ACCTTGGCAG AATCACAGGA 1440
ATGTCAAGGT AACCAGGCCA CCTCAGCATA GCTCTGATTC TCACCCGGTC ACCTGACTTG 1500
CCCGCCCTCC CCCATGACTC ACCCAGTGGC TCAGCATGGG GCCTGCTGCA CTGTGGCTGC 1560
TGGAATCTGC CAAGGACCTC CTGGGACTGC CCTTGGTTTT GTGTCTTCCT TAGAGTAGAT 1620
CAAATGAGAG GAACCATGTG AAGTAGCTCA CACAGGGCCT AACAGAGCAA ACACAAGACG 1680
TGGAAAGCAG ACTTGGTGAG GCTTGAGTTT AGTTTGGGGG TTGCGGGGGT CCCAGCTCTG 1740
CTGCTTAACA GCCCTGTGGC CATGGGTATA TCCCCCAGCA TTCAGAGCCT TATCTGTAAA 1800
ATTAGAGCAC GCAGAACAAA CCCTGGTACA CACTAAGTGC TCAATAAATG TGAGTCATTT 1860
GTGTAATTAT AGTAGGGTAG GCCTTATGCC CCACCCAGTC ATAAAAATGC CTCTTGCTGT 1920
TGTTGGTTCA GGCTCAGCCC CTTAGTGGCT TTCATGGGGC AGGTTGACAT GGTACCCAGA 1980
GTCCTCCTCG GTCCTCTTCC CATGGTGTAG TGAGAGCACT CAGGACCACC TAGGCCTTTC 2040
CTAGAAAACT GAACCCACAC CTTCCCAGTG CTGCCCCACC CTGGTCCCCC ACCCCCTGCA 2100
GGACAAACCA CTCCTCCCTT GTTTTGGGGC CAGGAGTCAG ATCTGCCCCT GAGAGCAGCA 2160
GGGGCCCCTT TGTCCTTTGA CGTCATACCC ACACCGCTCC TGGAGACAGC CACCCCTTCA 2220
TGCCAGCCCC AGGAAGGCTT GTAGGTGGGG CGAGCCAGGG TGAGAGTGTA GCCCTGTTCC 2280
TCGGCCAGGG CAGATGTTTC ACCATTTTTA ATGGAGCAAT TATGAGTCAG AGGTTTCAGT 2340
CTCTACTGGT TCCTCCCGAT CCTATAATTA CTCTTTGGCT ATAGAATCCT ATTTTGATCT 2400
CTTCTTTTCT TTTCTCTTCT 2420