Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS060-13172 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | GM12891 |
Coordinate | chr16:57421980-57423400 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
IRF1 | MA0050.2 | chr16:57422009-57422030 | GAAAGAAAAGAGAAAGAGAGA | - | 6.17 | IRF1 | MA0050.2 | chr16:57421998-57422019 | AGAAAGAAAGAGAAAGAAAAG | - | 6.95 | RELA | MA0107.1 | chr16:57422519-57422529 | GGGAATTTCC | + | 6.02 | ZNF263 | MA0528.1 | chr16:57422289-57422310 | CCTCCTTCTCTCTCCTCTTCC | - | 6.38 | ZNF263 | MA0528.1 | chr16:57422292-57422313 | CCTTCTCTCTCCTCTTCCTCA | - | 6.53 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 1 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_59519 | chr16:57408945-57424329 | Ly3 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 3 | Chromosome | Start | End |
chr16 | 57422451 | 57422745 | chr16 | 57422653 | 57423004 | chr16 | 57422399 | 57422604 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH16I057387 | chr16 | 57421483 | 57422745 |
|
Enhancer Sequence | AGAGAAAGAA AGGAAGAGAG AAAGAAAGAG AAAGAAAAGA GAAAGAGAGA AAGAAAGAAA 60 GAAAAAGAAA AGAGAAAGGC TCTCAAATGA CATGTGACTT GCTCAGGGTG AAGCAGCTTA 120 TAAGCAGCAG AGCAGGGATA GAACTCAAGG TCTTTCTCCA GAACTCAGCC TGAGCATTAC 180 AGAGAAAAGT GTGAGACACA GACTCTCAAA AGTGTAGGCT CCTGAGCCCC ACTTCTGACC 240 TGCTGAGTTC AGGCTTCAGG CGTGGGGGTC GCCCCTTCAA GCTGCACCAT TCTCCCACCC 300 CCGCCTCAGC CTCCTTCTCT CTCCTCTTCC TCAGTCCACC CTGCACTGCC TCCAAATTAG 360 GGGATTTGAT GCCTGTCCAA AGTTTTGGAG CCCACTGCAC CGGACCACCG GCTCCCACCC 420 CCCAAGGTTC TCAGGCCCTG AGCTTCTCAC CCTCTGATCT TTGCCATTGA GTCCCCTGTG 480 TCCTCTGTAC ATTCCCCAAA AGGGTGAGGC CAGACAGAAA AACACAGAAA TGAATGGCTG 540 GGAATTTCCT GCTTGAGGTT GAATAACAGG TGCCCGGAAG GCATGGTGTA TTTGTGTGTA 600 TTGCGTGTAT GTGTGTTGTG TGTGTGAGCA TTATGTGTAT CTGTGTAGTA TGTGTGTATA 660 TGTGTAATAT GTGTGTATAT GTGTATATGT GTATTGTGTG CATGAGTGTA ATATGTGTGT 720 ATATGTGTAT ATGTGTATCG TGTGTATGTG TGTAGTATGT GTGTATATGT GTATAGTGTA 780 TTGTGTAGTA TGTGTGTGTA TATGTGTGTG TGCATTGTGT GTATGTGTGT AGTATGTGTG 840 TATATGTGTG TGTAGTGTAT GTGTGTGGTA TGTTTGTATA TGTGTGTATG TGTATTGTGT 900 GAATGTGTGT AGTGTGTCTG TGCATTGTGT GTATGTGTGT AGCATGTATA TATGTGTGTA 960 TGTGTATTGT CTGTATGTGT GTAGTGTATG TATGCATGTG TTTATGCATA TACGTATATG 1020 TGTATGTGTG TGCTGTGCAT ATGTGTGCAT TGTACATATG TGTCGTGTAT ATATGTGTGT 1080 AGTGTATGTA TGTATGTTTA TATGTATGTG TGTATGTGTG TACTATGCAT GTGTGTGTAG 1140 TGTGTGTATG CATGTGTATG TGTGTATTGT GCATGTGTGT GCATTTTGTG TATGTGTCGT 1200 GTATATGTGT GTATTCATGT AGTGTATGTA TGCATGTGTT GTGTGTATGT GTGTATGCAT 1260 GCATATGTGT ATACTGTGCA TGTGTGTGCA TTGTGTGTAT GTGTAGTGCA TGTTTGTATG 1320 AGTGTGTGTA GTTTGCATAT GCGAGTGTTT ATGTGTATGT GTGTATATGT GTGTTCTGTG 1380 TGTATATGTG TCTGTGCTCT GCACATGTGT GTCTGTGTGT 1420
|