EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS060-04257 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12891 
Coordinate
chr10:82230690-82234270 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10788639chr1082233225hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr10:82232550-82232561TATTGTTTATT+6.62
TP63MA0525.2chr10:82230982-82231000AACATGTAGAAACAAGTC+6.14
ZNF263MA0528.1chr10:82234219-82234240AGGGGAGTGAGGGGAGGGGAG+6.17
ZNF263MA0528.1chr10:82234214-82234235AGGGGAGGGGAGTGAGGGGAG+6.22
ZNF263MA0528.1chr10:82233998-82234019GGAGAATGAGAGGGAAGGAGA+6.3
Number of super-enhancer constituents: 53             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00012chr10:82211895-82238814Adipose_Nuclei
SE_03133chr10:82233554-82234319Bladder
SE_03722chr10:82231107-82231504Brain_Angular_Gyrus
SE_04012chr10:82230555-82232069Brain_Anterior_Caudate
SE_04012chr10:82232412-82233504Brain_Anterior_Caudate
SE_05643chr10:82230303-82231484Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06016chr10:82230402-82232079Brain_Hippocampus_Middle
SE_06016chr10:82232402-82234764Brain_Hippocampus_Middle
SE_08270chr10:82230129-82233057Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09209chr10:82229932-82235735CD14
SE_12039chr10:82229990-82234392CD3
SE_14580chr10:82229955-82234989CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15608chr10:82231206-82233215CD4_Memory_Primary_8pool
SE_17018chr10:82230423-82233756CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17363chr10:82212715-82235520CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17861chr10:82212598-82235299CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18324chr10:82213958-82235661CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19180chr10:82229982-82235429CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20438chr10:82229998-82234467CD56
SE_20998chr10:82230763-82234536CD8_Memory_7pool
SE_21854chr10:82231383-82233412CD8_Naive_7pool
SE_22113chr10:82229957-82234520CD8_Naive_8pool
SE_22394chr10:82214028-82235411CD8_primiary
SE_23676chr10:82230918-82231729Colon_Crypt_1
SE_23916chr10:82230638-82231921Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82232609-82233391Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82233506-82233960Colon_Crypt_2
SE_26561chr10:82217136-82235180Esophagus
SE_31654chr10:82230322-82232049Gastric
SE_31654chr10:82232885-82234295Gastric
SE_36281chr10:82230016-82234949HMEC
SE_38806chr10:82230322-82234505HUVEC
SE_39636chr10:82232391-82234235Jurkat
SE_40835chr10:82230258-82232219Left_Ventricle
SE_40835chr10:82232399-82235288Left_Ventricle
SE_42164chr10:82230274-82232167Lung
SE_42164chr10:82232412-82235182Lung
SE_48782chr10:82230277-82232015Right_Atrium
SE_48782chr10:82232543-82234223Right_Atrium
SE_50150chr10:82230256-82234172Sigmoid_Colon
SE_52532chr10:82230419-82233435Small_Intestine
SE_53353chr10:82230912-82232251Spleen
SE_53353chr10:82232428-82235111Spleen
SE_55160chr10:82230335-82231856Thymus
SE_55160chr10:82232514-82233439Thymus
SE_55160chr10:82233455-82234326Thymus
SE_56703chr10:82231482-82234541u87
SE_57601chr10:82230467-82231528VACO_503
SE_57601chr10:82231686-82232253VACO_503
SE_57601chr10:82232614-82233409VACO_503
SE_58559chr10:82213055-82265607Ly1
SE_62319chr10:82212748-82296810Tonsil
SE_64280chr10:82229986-82235045NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr108223297682233446
chr108223119482232549
Enhancer Sequence
GTTGCAGTGT GTCCCTCCCT ATCTTTAGGC ACAGCTCTCG ATCCCAAACT GGGGAGCTTC 60
TAGATGTGCT GCCCTCATCT AGTACAAATT TAAACTAGCT GCTTTAGGGA GCATTTCCTG 120
ACCAGCTTGC CACCACCACC ACCTCCTTCT CTCTGCCCTC CAGCACCTAC TTGACTGCAC 180
TTAGTGAAGG GAGTCATGTT CTGAGTTCCC TGAGTCAGGC ACAGGTCCCA CTCTGAGTTG 240
GTGTTTGTCT CCACGGCCTC ATTCTCGGTG TCTTACATGC AGCAGTGCCC TGAACATGTA 300
GAAACAAGTC TTTAGGTGTT TGTCTCCCAC AGCAAAAGTC TTTTCACCCC ATGGGCTTGG 360
CAGGCGAGCC TGTGCACTGA TGGATTGCTG GGTGGTTTGC TTCAACCTTG CTGATCTAGG 420
GAGGCCACAG GGCCCAGCCC AGTCCTCCTG AGGTCTGGAG GCACAGCACC TTGGACTCCC 480
TGGGTTCTTG TTCACATTGG GAATACTAGT GTAGACTGGG CCCAGACTCT CCACGTTTGT 540
TTGCAACTAG CTGAGGAAGA GGCTCTGATG TGCTCTTACC AGGGGCATAT AAAAGGATTC 600
TGTGTATAGA CATTTCATGT AGACTTAGAT TTTCAGAAAC AGGCCTGTCA TGATGATCAG 660
GGTATGGGTA TAGGACACGT GCACTATGCC TGCTTTGGCC TAGCATCCTC CCTTGAGTGG 720
GCAGCTTCAC CTTCAATGGC AGAGGGAAGT AGGTTGGGAC ATCAACTTGG AAGTCAAGGT 780
GCCAGGCCTC CTTTTGCCTA GCCATTTGAG AAGTGGGGGT GGGGTGGGTA GCAGGTGTGG 840
GGTGAGTGGC AGGTGTGGGT GACCAGGCCC TGCCTCACCT AGGTGGGCAG GTGTTGCCCT 900
GAGGCTGCTG GTGCAGTTGA ATGAGCTGCC TGATGAATCA TTCTGAAAAT CTCTCATGGG 960
TGCTGGGCGT GGTGGCTCAT GCCTGTGATC CTAGCACTTT GGGAGCCCGA GGCAGTAGGA 1020
TGGCTTAAGC AGGAGTTTGA GACCAGCCTG GGCAACATAG GGAGACCCCA TCTCCCTATG 1080
TAGCTGGGAC TGCAGGTGTG CACTGAGGTA GGAGGATCAC TTGAGCCCAG GAGGTCAAGG 1140
CTGCAGTGAG CTGTGACGGT GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GTCACAGAGT GAGGCCCTGT 1200
CTCAAAAACG TAAAAGTGAA AATCTCCAAT GGGGCCCAAG GCCTGAATGT TTTGTTTGCT 1260
TTTTTTTTGT TCCTCCAAGA AGGACCACAA ACTCTATGTT TCAGTTACTT GAAGCCAGTT 1320
ATTTTGTAGT ATCTCCCTTA ATTTAAGTTT GTTTGTTGTT TCCTCATGGT TAGCTGCAAG 1380
TTTTGCAGTT TTGTAAGGAA TACTGCGGAA ATGGTGAGTT CTAGGTGCAT CCCCTTGGGA 1440
GGCACATGAT GTGGGTCTGA GTCATTACCG GTGATATTGA CAATGATCGC TTGCTTATGG 1500
TGATGTCTGC TGGGTTTCTC CCCTCTAAGT TACTATTTTG TTCTTTGTAA GTGTCCTGTG 1560
GGGAGATACT TTGAGATTAT GCAAATACAG TATGCTATTT CACATCAAAC TCATGACTGG 1620
TTTTAGGACC CATTGCAGAT TCTTGGCACA GTCGGTTGTT TCTGTCATGG GTGTTGAATG 1680
CGATGATTTA ATTCCATAAT TCCTTCTACA TTTATCATTT AACTATACAG AACTGCTGTA 1740
GCTATGTATC ATTGTGCTAC ACATAACTTT TCCTTCTTTC CTGTTTATTT ATCTCTGTGT 1800
GTGTATTAGA ATGGGCTCAT GAATTCTTAT TTTATTCAAT GAGTTAAAAT CCGTTGTTAT 1860
TATTGTTTAT TTTGCCGCTC AGATTGTTCC AGATTTGGCC AGTGGGGGCT TTTTCAAGCT 1920
GCTGTGAATG ACAGCTCTTC AAAACATGCA TTTCCAAGTC TATCACAGTT CTGTTGAACT 1980
AGTTGCCATA TGATTCTGGA GGCAGCTCCT GAGCCGTTCT GCTGTCCTGT GGAGCATGGC 2040
GTCAGTCACA GTAGGCCCAT GGTTTTTAGT GTGCACCTTG TGAAGCCTTC CTTTCCCCCA 2100
GCCACCTGAA GATAAAAGTG TCCTGCTCTG CCTGCTTCCA TGTTGGGTTT CTGGGTCAGA 2160
GTTTCTTTGA ACAAAGCCTC CTGTAGCTTA AAAAATAATA AAAATAGTAA GCTTGGAAGT 2220
CACTGGACTA GGTGACCTCC ATTCCAGGCC CAGTGCTTCT CCCACTGAGG ACTCCCCTGA 2280
CTCAAATCCA CCCACTCTGC TGCTTTCCTG ATGACAGCAC TGAGGTAGAC AGAGGCCTCC 2340
TCTCACCAGG TTAATGAGGA GGCCCCTCGG TGTCCTGAAA CTTGGCAGGT TTTGGGTTGT 2400
GAGTTTTTGG TGGTGGAAAT TCACAGTGTT TCAGTCACTA AGATCAGGGT TTTTACAGGA 2460
TGCCAGGCAC TGAGACCCTC AGACCCTTTG GAGAGCCTGG TGGAGCTCAG AGCTGGGGCC 2520
CAGCCTCTCC TGCACCTGCA TGTGGAGGCC ATCCAGGGCT GGCGGTCAGG GGCTTGATGG 2580
CCTTGGAAGC TGGGGGCCCA CCTTCCCCAC ACTGTGCCAG GGCAGTGTTT GTCACCCTGT 2640
GATAAAGGAG GGGATCCAGC CCCCCTGACG TTGTGCAGCT GTGTAGTGAC TTCCCACAGT 2700
AAAGAGTCAA ACTTCTTCAC TCCAGTGAGC GGTTGCTGCC ACCATGATGG GTTTTTTTTT 2760
TTTTTTTAAA TTAAAGTTTT TTTTTTTCTT TTTTGTTGGA AACCACAGGT TCACATGCCA 2820
CGGTGTCTGA TTTTGCAGTG TTTCTGGTGG CCCCTGGATT TGGCGTTTGG GTTAATGAGG 2880
GAATGGGTCA GGGATGTGCA TGGACAGTTC TGGCTCTAAG GGGTGAGTCA GAGAGAGCCG 2940
AGCCCCTCCT TCCATCCTCA GAGGGTGAGA TTGCTGTGGG CAGCTGAGCA GCCTGCCCTG 3000
GCCTGCCTTA GTGATTCTCT CTCCTACTGG GGCCCATTCC CTTTCATATT CGCCTGCCCC 3060
CTCCTAGGCT TCTCTCCCTG GGCCTGCCTG TTCCTTTGGC CTGTGAATGT TCCTCAGCAC 3120
CTAGTGGGCT CTAGAGACCC CCTTCTCAGA TGGTAGGAAT GTCTAGGCCC CAGGTGCTAC 3180
TAGAGGTGCA GCAGAAACTC CGCCTTCCTT GGGGGATGTG GCTGCCCTTC CTTGGGATGG 3240
GCCTGTGATC AGGTCAGAGG CCAGTTCTGG GAGCCTCAAA GGCCAGGTGG TGTTGAAGGA 3300
TTGGCTTCGG AGAATGAGAG GGAAGGAGAG ATAGTAAGGA TAATTTGGGG GCATGGGGTG 3360
TATGTAGCTC AGGATATGGG TGGTGGGTGT TGTCATTGTC ACTTGGGTCC TTAGGAAAAA 3420
GAGGGGCCAG AGGAGGGGTG GGGTTGAAGG TAGAGAGCCA GGTAAGAGAC CTTCAGACCT 3480
TCCCTGAGAG GTCATGAGGA ACTGACCTGT GCCCTCAGGA CGGGAGGGGA GGGGAGTGAG 3540
GGGAGGGGAG GTATTGGAGC GTGAGGAGTT TAGGAAAGCT 3580