EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS060-00385 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12891 
Coordinate
chr1:16290260-16294030 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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Lhx3MA0135.1chr1:16293418-16293431AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293409-16293422AAATTAATTAATT+6.92
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Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:16291392-16291407GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
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Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01987chr1:16292569-16293307Aorta
SE_02709chr1:16291780-16293317Astrocytes
SE_03452chr1:16291596-16293383Brain_Angular_Gyrus
SE_04408chr1:16289595-16293617Brain_Anterior_Caudate
SE_05249chr1:16287827-16297050Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06124chr1:16286945-16296922Brain_Hippocampus_Middle
SE_07342chr1:16287975-16297074Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08131chr1:16288406-16296945Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18522chr1:16289418-16295180CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19255chr1:16289594-16294260CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_27189chr1:16292277-16293531Esophagus
SE_38820chr1:16291637-16293540HUVEC
SE_45001chr1:16292008-16293377NHLF
SE_45986chr1:16291429-16293624Osteoblasts
SE_55849chr1:16288535-16295464u87
SE_61132chr1:16274043-16303645HBL1
SE_67570chr1:16288535-16295464u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr11629178416292062
chr11629189116292149
chr11629237116293174
chr11629249316293407
chr11629256516293101
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I015961chr11628819916293984
Enhancer Sequence
TATAAGTGAG CAAACCTAAA CAAATGCTGA ACTAATGATG CTCATAAAAG TTGTAAAAGG 60
ACTGGCACAG TGGCTCACAC CTCTAATCCT AGCACTTTGG GAGGCCAAAG CAGGAGGAGT 120
GCTTGAGCCC AGGAGTTCAA GACCAGCCTG TCTTTACCAA AAGAGACCCT GTCTTTACCA 180
AAAAAAAAAA AGTAAAAAGT AAAAATTAGC AGGGTGTGGT GGCGAGTGCC TGTGATCCCA 240
GCTACTCGAG AAGCTGAGGC AGGAGGATTG CATAATCCTA GAAGGTCCAG GCTGCAGTAA 300
GCTGCGATTG TGCCACGGCA CTCCAGCCTG GACAACAGCG AGACCCTGTC TCTAGAGAGA 360
AAAAAAAAAA AAGGTTTAAA AAGAACTAAA ATGCACACCC ACAGAATAAA AGTGGAAGAG 420
AAAGTGATAG CAATTAAAGT GTTCTCAGGT CCTCACTGTT TGAGAGTAAG GTATAAAGAC 480
ACTGACTAAA TTTAGACTTT GATAAGTTAT GTAAATTGAA AGCTATACCA CATTTATGGA 540
TCAGATGACT CAACATCATA AAAATGTCAG CTCTACCCAA ATTTATATAT TATAAACTCA 600
ATGCAAATTC TAATAAAACA TACCAACAAT TTTTATGGCA TTTGACAAAT GTAATCTAAC 660
ATGACAATGG GGCCAGGCAA GATGGCTCAC GCCTGTAATC CCAACACGTT GGGAGGCTGA 720
GGTGGGAGGA TTGCTTGAGC CCAGGAATTC AAGACTAGCT TGGGCTACAT GGTGAAACCC 780
TGTCTCTACA AAAAAGACAA AAATAGCTGA GCGTGGTGGC GTGTGCCTCT AGTCTCAGCT 840
ACTTGGGAGG CTGAGGCGGA AGGATAGCTT AAGCCTGGGA GGTCAAGGCT GTAGTGAGCC 900
AAGATCACAC CACTGCACTA CAGCCTGGGT GACAGAGCGA GACCCTGTCT CAGAAAAAAA 960
TAAAATGAAA ATGGAAGAGC AATGGGCCAA GGATTTACTA GACACCAGTT CACCAGTTTT 1020
CTAAAATGAT GTATTTTACA AGTCAGTGTG GTATTTAAAC AGAGAACAGG CCGGGCACGG 1080
TGGCTCACGC CTATAATCCC AGCACTTTGG GAGGCCGAGA TGGGTGGATC ATGAGGTCAG 1140
GAGTTCAAGA CCAGCCTGGC CAAGATGCTG AAACCCCGTC TACTAAAAAT AAAAAAAAAT 1200
TAGCCAGGCG TGGTGGCACG CATCTGTAAT CCCAGCTACT CAGGAGGCTG AGGCAGGAGA 1260
ATCGCTTGAA CCTGGGAGGC GGAGTTTGCA GTGAGCTGAG ATCGCGCCAC TGCACTCCAG 1320
CCGGGGCAAC AGAGTGAGAC TCCGTATCAA AAAAAAAAAA AAAAGAATTT CTGCTCATCA 1380
AAAACAAAAA ACAATATCCT ACAGTGAAAA GACAAGCCAC AAACTGGAAG TAGGTAGTTA 1440
TAACACATAT AACTGACAAA GAATTAGTAT CCAAAATAAG AAATAAAAAA CAAAAAACTA 1500
ACAAAATGTC TACAAACCAC CCAATAGAAA AATGAGCAAG ACAATCTGTT GTTTCCGAGA 1560
AGATGAAATC TGAATGATCA GTAAGCAACG AAAAGATGCC CAACTCAGAA CCAGGAAAAT 1620
GCAAATCAAA ACCACATGAG ATGTCATTGT ACGCCCACCA GATTAGTAAA AATGTTGAAG 1680
TCTGAAAATA CCATTGTTGA GAGGATATGA GGCAAACGGA ATTGTTGAAG GGTAAACTGG 1740
GGAAACAGTT TTGGCAACAA CTTGGCATTA TTTGTTAAGT TGAAGACGCA CATACCCTGT 1800
GACTCCACTC CCAGCTGCAG TCCCTGGAGA GGCTGTGCAT ACATGTCCCG GGAATGTGAA 1860
CAGTGGCACT GTTTGTCTCA GCAAAATACT GGAAACAACC CAAATGTCCA CCAGTAATAG 1920
AAAGGATAAA TAAATTCTCA TACAATGGAA CATTATTCAT CTGTGAAAAT GAAATACCAC 1980
TCTATGCAAC GTGGATTAAT GTCAAGGCAC TGAAGAAAAC AATATGATTA TATTAAGTTC 2040
AAAAACCTGC AGAATTAAAC GGTACATTGT TTAGCAATAC AAACACATGG TAAAACTATA 2100
AAGAAAAGCA AGAGTGATAA AAGCAAAACT CAGGGATGAC TTGGGCCGGG TGAGATCAGG 2160
GAGGGGACAC AGGGGACTCC AAAGGTAACA GTAAGTTCTT TTTGGAAACT GGGTAATGGG 2220
TACATGGAAG ATGTTTCTTG TATCCTTATT CTTTACACTG AACACATTCT TTTGTATGGA 2280
GTCAACATTT AACAAAAACG ATTTACAAAA TTAAACAAGT TCTTTCTTAC TTTAAATCAT 2340
TTGCCAAGCA TTAATTTGGG CTGCTGACTG AGTCACAGTA ACGGGGGAAA ATCCCTGAGG 2400
GGCCCACATG GCCCCGAGAC TACAGAAATG AGAAGTGCTT TGCTCTCTGA GCTCTGGTGA 2460
TACAGCTTCC CATGGGGCAG GCTGGCGAAA TTCGAGTGGA GCCTGCCACT CGGGACAGGA 2520
AAGTGACTGC TTAGGTTAAT AAGTTCCAGT ATAGGAAGTG GTGCGGCTGG GGTGGGGAGA 2580
ACAGATTCTA CTGCCAGACC TTTCAAGACC AGAAGCTGAG TAGATTTTTG ATGTTACAAT 2640
GAACCCACTA AGCCTGCTTT CTGGCCCGCT CTCCACTCGC AGCGGGAATT CCCACCTCTG 2700
AGCCTCTGTC CACACTGCTG TTTAGATATG AGTGAACAAC TCTCAGTTCT AACCATGCCC 2760
TTTGCTTCCT TCCTTTGAAG CCCAGCCCTA CGAACCATCT CTCTTCAATT CATAACAAGC 2820
ACGTTTGAAT CCAAGAGCCT AAGCCCCAGT TTTCTACACG TATCTGTGCT GACTGCATTA 2880
CTGAGGTCAA CCTTAATCAC CCTGGGACTG TCAAACTATT GATGTCCATA AGGATTCTCT 2940
GTGCTGGCAT TCCACACACA CGCAGCAAGG TTCAATGAGC CACAGTACTT ACTCTCTGAC 3000
CTCTATTATT TCAACCATTT AAAAATTGTG GCCACGGGAG GCTGAGGTGG GAGGATCGCT 3060
TGAGCCCTGG AGGTCGAGGC TGCAGTGAGC TATAATCCCA GCACTGCACT CCAACCTGGG 3120
CGAAAGAGCG AGACCCTGTC TCAAAAATTA AATTAATTAA TTAATTAATT AAAAAACAAA 3180
AAAAAAAGCC GTGGCCAGCA AAAGAAGTAG ATTATGATCT CCAGGACAAT ATGTTTTGTA 3240
CATAAAATGT ATTTGGAGTT TTTTGTTTTC ATTAAAGTTG AGGTCCCTCC CTACTGTGAT 3300
GTCAAACCCA ACAATGGGTC ACCCCACAGG ACACCACCCC TGCTCGCACC TGTAATCCCA 3360
GTCCTTTGGG ATGGCGCAGG TAGGTGGATC ACTTGAGCCC AGGAGTTCAA GACCAGCCTG 3420
GGCAACGTGG CGAAACCCTA TCTCCACAAA AAACAGAAAA ATTAGCTAGG TGTGGTGGTG 3480
TGTGCTAGTA GTCCCAGCTA CTTGGGGGGC TGAGTCAGGA AGATCGCTTG AGCCAGGGAG 3540
GTCGAGGCTG CAGTGAGCTA TGACAGCTCC ACTGCTCTCT AGCCTTGGCC ACAGAGCAAG 3600
GCCCTAATTA AAAAAAAAAA GTGTTATATG AGGCTGGGTT TGGTGGTTCA AGCCTATAAT 3660
ACCAGCACTT TGGAAGGCTG AGATAGATGG ATTGCTTGCG CCCAGGAGTT TGGGACCAGC 3720
CTGGGCAACA CGGCGAGATT CTGTCTCTAC CAAAAAAAAA AAAAGTTTCC 3770