EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-42799 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr7:44661580-44663910 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr7:44662014-44662028CTTGTTTACCTTTA-6.96
Lhx3MA0135.1chr7:44663131-44663144AAATTAATTAATC+7.82
POU6F1MA0628.1chr7:44663133-44663143ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr7:44663133-44663143ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09293chr7:44656533-44664867CD14
SE_12002chr7:44661970-44664769CD3
SE_14587chr7:44661595-44666552CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15490chr7:44662284-44664805CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16434chr7:44661773-44664498CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16951chr7:44661854-44664820CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17851chr7:44660970-44667023CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18656chr7:44661057-44666341CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19294chr7:44661232-44666908CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20655chr7:44662135-44663196CD56
SE_21218chr7:44661809-44663212CD8_Memory_7pool
SE_22840chr7:44661619-44664737CD8_primiary
SE_24636chr7:44662278-44662951Colon_Crypt_2
SE_26120chr7:44660088-44663486Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27427chr7:44661906-44662995Esophagus
SE_27654chr7:44653619-44664659Fetal_Intestine
SE_28557chr7:44653546-44666729Fetal_Intestine_Large
SE_32407chr7:44662061-44663077Gastric
SE_34691chr7:44659818-44663107HeLa
SE_37328chr7:44659783-44663176HSMMtube
SE_40682chr7:44660511-44661823Left_Ventricle
SE_40682chr7:44661832-44663053Left_Ventricle
SE_42075chr7:44662099-44663009LNCaP
SE_42544chr7:44660490-44663115Lung
SE_43768chr7:44661678-44664721MM1S
SE_46384chr7:44661325-44663119Osteoblasts
SE_48519chr7:44661882-44663185Psoas_Muscle
SE_50531chr7:44661881-44663149Sigmoid_Colon
SE_52560chr7:44661291-44663148Small_Intestine
SE_52560chr7:44663429-44664614Small_Intestine
SE_53907chr7:44660114-44664683Spleen
SE_62947chr7:44653723-44680812Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr74466282444662939
chr74466354944663779
chr74466204844662924
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH07I044613chr74465347244666508
Enhancer Sequence
ATGTGGAAGG GGCCACTTTG GGAAGAACAG ATGAAATTGG TGTTTTACGA TTGTCAGTTC 60
AGTGCCTGTT AATTGGGCTA TTGCAGCAAC TGAATACTGA TAGTTAATGA GGTGATGCTA 120
TTGTTTTCTG GGAGAAAACC CAACTCAGAG GCAATTGGGT ATTTAATATT GCCTTAATAA 180
TGACATTAAA GGAAAAAAAT GAACATTTTC CTTTGAGCCT GAGAAATTAA AAAAAAAATA 240
GCATAAAATG AAGCAACAGT AGTATTTTTG CTGTCAATGT TAGGGCTGTT TGTCTTCCTT 300
AAATATATCA GTGGAAAAAC TTGGAGTGTA GTTGGAGGTA GGAAGAACTA CCGAATTAAC 360
TTAAAACTTT TGATTTCTAA AGTGAAAACC CAGGGGTAAA GATTGCATTC CCTAATTATA 420
TCCAGAATAT ATTGCTTGTT TACCTTTAAT TTGTAAGGAG CAAGTTTTTG TTTGTTGTTC 480
AGTTTGTTTT TAAAGAATAT GTTCTGCTGT TTACTTTTGC TGACCTATCT CTTCTCAGTG 540
GAGCAGGCCA GAGGTGAATG CAGGACACTC TAAGCCCTCT CTCTTGGTGT CCCTTAAGTG 600
TATTCTGAGC ATATTTGGGC CAAGAGGAAG TTTCTGATAA ATAATATAGA AGATATTTTT 660
ATGTAACAGT TATTTCTGGG TAATTCACAC TATGTTTCAG AGCTTGGATT TTCTTCGGGT 720
AGGTGTGGAC ATGGAGTGTA GTTCTAACTT TACAACCAGA GCACCTGCTT TGAGACAAAT 780
TCATGAGCAA CCATGTAGGC CAGCAAGCAC CTTTTTTTCC ACAGGCAGCG TCCTTGTGAA 840
CTTTCCGCTT GGATCCTGAC TCTGCTGTTA GTAGCCTATG ACCTTGGATG AAATGTAAGG 900
GAATAGAAAC TGAAGCTATC TGTAAAGTGA AAGAGCTGGT GCCTGCCTTA TTGGGAGCCT 960
CTGGGTTTAT GTATGAGTCA GATGCGTAGA GTTGCTCACC ATGGAGGGCC CAGGGTAGGC 1020
AGGCATTATT GAACAACTGC TCCATGTGCT CTTTTCAATC TTTGCAGACC CCACCCACGT 1080
CTCCCTTGCT CAGACCTGGC TCCCCATGGC TTATGAAAGG GGGCTGAGTG CAGAAGGTGG 1140
CAGGCAGGAC ACTGGACAAC CCTCTGTGGC TTTTCCTTAC CCTTCGTAGT ACCATGAGAT 1200
TCTGGCTCTT CCCGTCTCTG TGTTTCTGCC TATGGGTCCT TCCACATGCA GTGCCTCGTC 1260
TTCCCTCCTT CCCATCCATG TCCTTTTGTC TTCAGGCACA CCCACTTGGA AGGAGCCCAT 1320
CCTCTCACAG GGTCTGCTGG CATATTCTGC ACCTCTCAAG TACTCATATT TCCTCTGCAA 1380
TCTTTTCTAT GTTGTTTTTC CTCTGCTCAA GGGTAAATTG AGAGTAAGGA AAGTATTTTT 1440
CTAATTTCTT TGTATTTTCC ATAATATTGT AAGTACAGCA GGTACTCAGT AGTTTCTGGA 1500
CAGATTAGAA AATGTTTTAC TTATTCTCCA ATTAATCCTA ATCCTAATTC TAAATTAATT 1560
AATCCTTGTT GCCTTTCTTC TAATTGTTTT ATATATATGT AATATGTAAA TTTAAAGAAC 1620
ATCGTATGTT TATCATCTTA GCCCTTAAAC TAGATTTAAT GGTTTTTTGT TTTGTTTTGT 1680
TTTGAGACAG AGTCTCACTC TGTTGCTAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCAAT CTCGGCTCAC 1740
TGCAGCCTCC ACCTACCAGG TTCAAGCAAT TCTCCTGCCT CAGCCTCCCA AGTATCTGGG 1800
TCTACAGGCA TGCACCACCA CACCCAGCTA ATTTTTGTAT TTTTAGTAGA GATGTGGTTT 1860
CACCATGTTG GCCAGGATGG TCTTGATCTC CTGACCTCGT GATCCACCCG CCTTGGCCTC 1920
CCAAAGTGCT GGGATTACAG GTGTGAGCCA CCGAGTCTGG CCTAGATTTA AATTTTTAAG 1980
TGAAGATGGT AATATCTGCA ACTGTGCACT CACCTTCCTT GGGCTCGCAC AGGCATCCTG 2040
TGTTAGTAGG TGCAAGAGTG TGTTTCAGTT TCACACAGTC ACAGCTCTGT TGTGCTCTCA 2100
GGCACATGAA CTGGTGGCAC TGAGCAGGTA GCACTCTTGT GAATACATTT ATAGGCCAGG 2160
GTCTTTCTCC TCAACAATTA GAGTTGAACA TGTTTTGTTT TTGTTTTTGT TTTTCTAGTA 2220
GCTTTTAAAA AAAAATTATC CTTTCTCTAG AGCATCAGGA TCTAGTAGCC TTGTCTCCTA 2280
AATACTCATT TTTAAAACCT TTCTTTCTTG TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG 2330