EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-35568 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr4:113199590-113203330 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr4:113200688-113200704TTTTGTTTACATAACC-7.22
FOXP2MA0593.1chr4:113200689-113200700TTTGTTTACAT-6.14
Foxd3MA0041.1chr4:113200108-113200120AAACAAACAATT-6.22
IRF1MA0050.2chr4:113201465-113201486ATTTTCTTTCCCTTTCTATCT+6.02
PHOX2AMA0713.1chr4:113199596-113199607TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:113199596-113199607TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:113199596-113199607TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:113199596-113199607TAATTAAATTA-6.62
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11583chr4:113191075-113212252CD20
SE_19781chr4:113200090-113201321CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_32608chr4:113199087-113203313GM12878
SE_59601chr4:113199394-113212010Ly3
SE_61648chr4:113189421-113212165Toledo
SE_62823chr4:113199229-113234814Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr4113199616113199774
chr4113200369113200436
chr4113200631113200841
chr4113201272113201525
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH04I112276chr4113197798113199843
GH04I112279chr4113200267113201756
Enhancer Sequence
CTGCAATAAT TAAATTACCA TGTTAGTTTC TGCTTATGCT TGAGGCATTG AGAACTTTGA 60
TTCTAACGTT TTGATGAACA TCATCTGATA GGCAATTTAT CTGGACTTTA AGAAAACAGT 120
ACATAGACAA TACTTTCAGT GAACTAGTAG ATATGTGAAA TCTTATACCA AGCCCTATAA 180
AATTGCTACA CTAGCTTCTC CTATCTTTTT CATTTCTAGT TTGACTATAA CACCATACAT 240
AAAATGCAGA CAATAACAAA GAATGATTTT TGATAATAAA ATGATTTGAG GGAAGCATAA 300
AGAAACCTCA GTTCCTCTTT CACCTAAATA GAGTGACTTG AGCCCAGAGA AAATATGACA 360
GGTGTACTTT AAAAAGAAAA TTAGGAAATA AAAAATCTCT TTGGTTTGAA TACCTTCAGA 420
GGATATATAC ATAAAGCAAA CATAGTTTAT TAACTGGATT ATAATTAAAT ATATTATGAA 480
TTGTGAAACC TGGTTAAAGA AAAAAACTTA ATAGTTATAA ACAAACAATT GTAACATTTA 540
TCCTTTATAT CCTCACTTTG ATTTCTAACA GGTAAATGAT TAAAAATAGT AAATGCTTTA 600
AATGGTTATT TTATTCTATA ATTTCAAATT TTAGACATTA CTTTTAAGAA TATAAGTCTC 660
CATGAGTTGG TTCTAATTAT CACAGCCTGC ACTGGTATCA GAATTATTTA TTTTTGTCAG 720
TGGTACTCAA TGACTGGATG GACAAACTGT CATTAACTAC AAATAGCACA GTCCAACTGT 780
TGTTAACCAC ATCCCTTGAG AGCCGATGGC CCGAGGTGCC CTCCACCTAC ACTTCACTTC 840
ATATATCTTT GGTAATTAGT ACAGTACTTA AAAGCAGTAT AACAGGACAG GAGAAATAGC 900
TACTAAAATT TTTGTGAAGT TACTTCAACA GAGAATTGCC ATTTTAAAAC TAATTTTTTA 960
AAAGTACATG TACATGATTT TAAAATTCAA ACACTAACAA AGGATTTAAA AAAAAGAGTA 1020
TTTCTCCCCC ACCTGAACTC TTTGTCTTTC TCTCCTAGAG TACAACCACT GTAAAAGCTA 1080
CTTTTATCCT TAGAGAAATT TTGTTTACAT AACCAGCATA ACTATATGTG TGCACTCTCA 1140
CACACACAAA CACACATACG AGCACATTTC TCCACAGAGA AAAAAATTTC TTACACAAAT 1200
AGAAACATGC TATATTTAGT TCTGAACCTT TCTTTGTTCC TCTTTTTTTT TTTTTGAGAC 1260
AGGTCTCTGT CGCCCAGGCT GGAGTGCAAT GGCGCAATCT CAGCTCACTG CAAACTCCAC 1320
CTCCCGGGTT CAAGCAATTC TCCTGCCTCA ACCTCCTGAG TAGCCGGGAT TACAGAAACG 1380
CACCACCACA CCCGGCTAAT TTTTGTATTT TTAGTAGAGA CGGAGTTTTG CCATGTTAGC 1440
CAAGCTGCTC TCAAAACTCC TGAGCTCAGG TGATTCACCC GCCTCGCCCT CCCAAAAGTG 1500
CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACTATGCCT GACCAATTTT TCAATTAATA ATACATATGG 1560
GTGATAATTT TCCCATATCT ACACTTACAA ATATACCTCA TTCTTTAACA GCTGCACAGA 1620
ATTCTGTAAC TGTAGCACGG CGAGAAGTTA CACCAGTACC CAGAGAGATG CTGAGTGCCG 1680
CCTGCATTCC TTGGATGACT CTCCCTTGCT GCAGCTACCG GACACTGTCT GCTTATACTG 1740
ATTTGGGGTT TGGAGATAAT CAGTCTTAAG TGAGATTGAT TTGTAGTTTT ATTGTTTTTT 1800
GTTTGCCATC TATATTAGAT GTTGGCATCA AAATTATGCT GGTTTGAAAT ATAAAAAACA 1860
AAAACCAGAA AGAATATTTT CTTTCCCTTT CTATCTTGCT GGCATTTCCT TTTTTTTTTT 1920
TTTTTTTTTT TTTGGAGACA GCGTCTTGCT GTCACTGGAG TGCAGTGTGC AGTGGCGTGA 1980
TCTTGGCTCA CTGCAACCTC TGCCTCCCAG GTTCAAGCAA TTCTCCTGTC TCAGCCTCCC 2040
GAGTAGGTGG GACTACAAGT GTGCGCCACC ACTCCCAGCT AATTTTTCAT ATTTTAGTAG 2100
AGACAGGGTT TTACCATGAT GCCCAGGCTG CTCTCAAACT CCTGAGCTTA GGCAATCCAC 2160
CCACCCTCGG TCTCTCAAAG TGCTAGGATT ACAGGCATGA GCCACCGTTC CCAGCCCTGC 2220
TATTTACTTT TAAAATATAA TCTTTCCTTC TGTTTTACAA AGTTTTGCTG CTGGGAATCA 2280
AACTCTCAAT TTATTCAATT ATCCAACAAA TGACATAGCT AAGCAATATT TCTTTTCTAT 2340
TGATTTGAAA ATGCATCTTC AATTTTATTT TCATAATATA TTTTTGAACA TTATTGCATC 2400
ATATTGCTCT ACCCAAGCAG GCCACAGATG TCCAGCTATA AGCAGAAAAA CTGAGAAAAA 2460
TCCTCAAAAT CCTGTGCTAG GGGTGGTAAA ACTTACTATG AAGCCAAAGT CAGCAAGAAT 2520
TAACACACAA TGGGTAAAAC TGGTTAATCC ATATTACACT GTGATTTGAA GACACTATAA 2580
TTATGATAAT AAAGTCTCAT TATTCAGGAA GCAGACAGCA TAAAAGAATA ATTATAAGTC 2640
ATGGGATGAT GCATTAGCAG TCGACAAGAA AAGCATTTGC TATTAACAAG AGCCTGAAAA 2700
GAAGTGTCAG AAATCTGTAA GTGATCTCCA GCTTTATTTA CAATATGCTG CCATCAATTT 2760
AGTTCATTCT TGGACTTCAG GCGATAAGAA TTCCAAAAGG AGAACTGTAT TAAAAACCAT 2820
GGTGTATTCT GGATCTAAAT AGTCTTTTGG TAACATCCAA ATTTTGTTTT TGTATGCTTT 2880
ATATAAGCTA TTACTTTATA ATTCAGTCTT CTGAGCAAAT CAACCACAAG AAAAGCTTAC 2940
CCCATATAGG TTCTTATACT CAGTCCCCAG GACAGATATA TTATCCACTG TTAGAGAGAA 3000
AAAATGGCAT TCTGGTTTAT ACATCAGTGG CTATGAGTGT CTTGGGGCAG ATCAATTGTC 3060
TGGGTTTGAT GAATCTCTGG GTTCACAATT GTGACTCCAT CCAACAAACA CTGAGGCAGA 3120
CTGCTTTAGT GTCAAATATT TGCTACCCCA TCCTTGCAGG CCTGTCCCTA CCAGTTCTGC 3180
CCCTTTAAAA TGATGATCCA CTTCATTAAC AACCATGTCA ATGAAACATG AATGGCAGTG 3240
ACTTACTTCC AAGCAGAAAC TTAAAAGCCA CTGTGTAGTT CCACCTTCCC TCTTTCTTTT 3300
GTCAAAACAT CAGCAGTTCC CACAAGGAGC AGCTCAGTCT GGGTCCCAGA GGGAAGAGCC 3360
GAAGACAGAT ACATAAAGGA CAGTTAATAT TAGCAAAAAA ACCAACCCTT CTTCCAATAA 3420
GCCACTGAGA TTTTTTAGGT CATTTGTTAC TGCACTATAT CAGAGCCTGA GCTGATGGAT 3480
GCATTCACCT ATCTTATGAA GGTATAAAAC CACAGCAAAC TCTGACAGTG ATATGGTTTG 3540
GCTGTGTCCC CACCCCAATC TCATCTTGAA TTATAGCTCC CACGAGTCCC ACATGTTGTG 3600
GAAGGGACCT GATAGGAGGT AATTGAATCA TGGGGATAGG TCTTTCCCAT GCTGTTCTTG 3660
TGATAGTGAA TAAGTATCAC AAGATCTGAT GGTTTTATAA GGGGGAGTTT CCATGCACAG 3720
GCTCTCTCTT TGCCTGCTGC 3740