EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-33533 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr3:152018350-152021450 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr3:152021115-152021126TATAAACAATA-6.32
Foxq1MA0040.1chr3:152018797-152018808TATTGTTTATT+6.62
MEF2AMA0052.3chr3:152020651-152020663ACTATTTTTAGA-6.02
MEF2CMA0497.1chr3:152020650-152020665TACTATTTTTAGAAA-6.35
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00090chr3:152015145-152029241Adipose_Nuclei
SE_04148chr3:152018778-152020098Brain_Anterior_Caudate
SE_11923chr3:152019115-152020098CD3
SE_13321chr3:152018472-152019826CD34_Primary_RO01536
SE_13321chr3:152019935-152021115CD34_Primary_RO01536
SE_14391chr3:152019256-152021228CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17840chr3:152015476-152023886CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19211chr3:152019036-152020159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19211chr3:152020169-152021152CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20191chr3:152019027-152021166CD56
SE_25790chr3:152015439-152028750Duodenum_Smooth_Muscle
SE_41065chr3:152019325-152020044Left_Ventricle
SE_41065chr3:152020306-152020987Left_Ventricle
SE_42608chr3:152019253-152020062Lung
SE_42608chr3:152020252-152020924Lung
SE_45721chr3:152013223-152028956Osteoblasts
SE_49122chr3:152019279-152019923Right_Atrium
SE_52702chr3:152019400-152020022Small_Intestine
SE_58341chr3:151941277-152022461Ly1
SE_59872chr3:151959817-152042932Ly4
SE_60773chr3:151960393-152021075DHL6
SE_61399chr3:151985218-152021418HBL1
SE_61480chr3:151938720-152020942Toledo
SE_62311chr3:151957212-152047090Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I152301chr3152018832152021508
Enhancer Sequence
TTATCAGTCC TTTCACTGCA TGTTTTTTTT TGCTAGGGCA GAAAGTGTTG ACATATTTTT 60
CACTTAGTAA TGGCAAAGTG TCTGTCTGTC CCTGGAAATG GTAAATGTAG CTACCTGTGA 120
GTGTTTAGCA TATGCATATA TTATATATAA GGCCATGGCA ATAGCTGAAT GAGGATGATT 180
TTTATTTGTT GGTAAAGGCA TTGTACAGTT GCAAAAGAGA AGCAGATTTA AAATCAGCTA 240
AACTTGGATA GACTTTTTAC TCTTTTAATA TTTTGACATT TTAGATTTTC TTTTTATTTT 300
GTGGGCATTT TATTTTCAGG CCAGAGCCAC GCATTTTATG GAAAATGTAA CTAGAAGTAA 360
GGTGCTGAAC TGCTGCTACA GCACCTTACC TGAGGCACAA ACTTTGTTGC ATGTGAGTTA 420
TATAAATAAG TAGAAACTCA TAAGTACTAT TGTTTATTGG ATTTTTCCAG CTTCAAAAAT 480
TCTAATGTGA ATTAGCAGTT TATTTTCTGT TAGATCATGA TTTTTTTTTA TTTGTAATAG 540
TCTTAGCTAG AAATGTTAAA AGTTAGCTTT TGTGGGCACC ATAATACTAA AATATTTACT 600
TTAGTGTTTC TTGACATTCA AAAATGTCAT TGGATTTGTA ATTCAGGTAT CATATTTGAA 660
AATGAGTCTT TTAAAAGATA ACATAAATAT CTTTATTTTG ACACACAAGG TCAAGACTAG 720
AAATGTGTTC CTGGGTACTT TCAGCCTACT TGGTTTAATC AAATTGCTTT TGAATATGAA 780
TGTCCTAATT TAATTCTTTG GACCTTTGAG GGGAGGACAC TATCACTTCT ACATATGTAG 840
AGAAGTAAAA GTCTCATAGA TCCATCTTGT CTTTAAAAAT ATATGGTGCT ATAATAATCT 900
TTTCTTTAAT AACATCAGGG TGAGTTATGA GTTAATTGTT TCAGTTCATT GTTTCCTGGT 960
CCATTTTAGG CTGTTCATTT TGCTAAAGTT TTTGCCAAAG ATTTCGAGAA TATGATCTTT 1020
AGAGTTGAAC AGAAAGGAGG TATTAACAAC AAAAATATTT TAAAATGTTA GATTCTTCTT 1080
AATGTCATAG TCCTAAAGAT CAATAAGCAA AAGTTATAAA CTCCCATTGA GACTTTCTTC 1140
ACCCTTTCCT TTGAGAGGCA TCAGTGAAGG GCACAGTGGT TGTACCTCCG TGAATGTGTA 1200
TTCCTAAATT CATGCTGGCT GAATTCAGGT GTAATTAGAG ACTGAGACCC ATAAAATGAG 1260
GGGCAAGGAG CTAATTACTC TTGTCGGTAA CCAGCTGTGG CCATAAGTAA CCCTGTTTTG 1320
ACCCAATTAA TAGTAAATCC AATTTTTAAT CCTACAGACA GTTGATGGTG CACTCGTAGC 1380
TGCAAAATGA AGGACATTAA ATTTGGCTGT GACATTGAGT GGTTACACAG AAGACCTGCT 1440
TCTACAACAT TTGGAAACAT TGTGAAACAT TACTATTCAG TTGCTATTTT TCCATCTCAA 1500
AATATTTTTT TTTAGTTGCT GCTCACTTAT GGCCACAGAA CAGTCCCTTT TTGAGTAAAG 1560
CAGCAAGGTT GCTTAATGAC ATGCTATGTG GTTAACAAGA TTCAACTGCC ACATCAAGGA 1620
CTTTAAATAA TTTCAAGATT TTAAATGTAT TTATGAAATG AACTCATTAC AGCAGCTAAT 1680
CAATGCAAAC TTTGTCCTTT TTCTTTGTCT TTCTAAGAGA AACTGAATTT AATTTAAATT 1740
TAAATTACAG TGTCTAAAAC TTGGTAAAAT ATTTTAAATT TGAATAAGAG GAAAAAAAAA 1800
ACATGAATTT ATTTATGATG GAGCTTCATA CCCAGGACAG TAGCTTCTTA AATGTTAGTA 1860
AAATAATTAT GTTAAGCATT AAAACAATTT TGAATATGTA ATTAAGCATT TATGTTAAAA 1920
AACATGTTTC TTACGTGTGT GTGTATATAT TTATAACTGA CACATGTGAT TCTTTGTACA 1980
GTATTTAGAA TCCTTCCCTT CAGATAGCAG TCCTCTTGTA TTCAGTCTTG TGGCTAAAAT 2040
AGATCAAAAA CATATTTTAA AACTGTTAAA GTAACTGTAT GACTCATGCT TGAAGTTCTG 2100
AAATTTGGGA GCGTTATGAG GTTTCCATGC CATTAACCGC TAGATCATTT GCATTCTCTC 2160
ACAGAGTAAA CGGAAAAAAA TTTAGAAAAC TTGTAATAAT CCTGACTTCT TTAATAAAAT 2220
GTGTCCTGTG TATTGCTTAA ATCCATAGTC CAGCCTTTTC TGAGTTCTTG AGCCATGAGA 2280
TGGAGGTGGC CTGTGTAATC TACTATTTTT AGAAAGTTAG GAAAGCAAAC CAAATACTCT 2340
CTGAGAGGAC CCTATGAAAT GGCTGTACCC TTCAGCTGTG CTGCTTCAGA CTTTGGCCAG 2400
GCTCCCAGGT GACTTACGTT AATAGCAGAC TTCTAGTTAG AAGAGGAGAA TTTATTTCAT 2460
TAAAAAAAAA AAAAATAAGT CAAACAGTTC AAGAAAGTAT TCATTTATGT AAAAGAAGTC 2520
AATTGGTATG TTACTAAAGA TAATAGGAAG AAAATTAGCT CACTATTTTA GTTGCATACT 2580
GATGATTTTA AGGTTTAAAT AATTAGATTT AAATATACCG TATGTAAATG TAGAAGTCTG 2640
TATCGTAATA AATCTGTTGC TAAGTAAAAT GGGAATACAT GACAACGAGG AATGTAGGTA 2700
TTAAGAATGT CAGAATTAGA ACGAGAACAG TAAAAGAGCA AAAGCTGTAA TAATGTGTGC 2760
TAGTATATAA ACAATACTCT AAATACTTAG TTTCTCTAAT TTTCCTTTTA CAATTGCAGT 2820
TTTAATTTAT AATAGTCTAA GAGCGTATTC AAGCTGAGAC TTAAATTGCT TACGTGCTAT 2880
AGATTTAGGT GTATTAGCTA TTTCAGAAAT CCAGAACATT TGCAAAGGTG CATTATTTTA 2940
TGCCAAAGAG GATTATGTTC CCCTATGGCT TGTGAAAGAG ATAGGAAAAA AGAAAAGAAA 3000
AATATTAACA CTGCAAGCCA CCATTAGAAA ATTATATTTC AAAAATGATG TTTCAAATCA 3060
ATGACAAATT GCCTATTCAG TCATGAGCTC TCAACTAAAA 3100