EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-32264 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr3:58024550-58028730 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1623879chr358027197hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:58028617-58028629GAATGTTTGTTT+7.22
IRF1MA0050.2chr3:58026946-58026967TTTTGCTTTCAGTATCACTTT+6.7
KLF4MA0039.3chr3:58025590-58025601GCAGGGTGTGG-6.62
MEOX2MA0706.1chr3:58025001-58025011GTTAATTACT-6.02
NFAT5MA0606.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr3:58024970-58024980AATGGAAAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:58027242-58027262CTCCCCACCAACCACCACCA+6.33
RREB1MA0073.1chr3:58027246-58027266CCACCAACCACCACCACCAC+7.32
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58026357-58028180Adipose_Nuclei
SE_23194chr3:58026684-58027587Colon_Crypt_1
SE_27681chr3:58025564-58026354Fetal_Intestine
SE_27681chr3:58026398-58027802Fetal_Intestine
SE_29426chr3:58025684-58027847Fetal_Intestine_Large
SE_30574chr3:58026442-58027846Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58026477-58028276HMEC
SE_37989chr3:58024154-58025648HUVEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58024913-58026383LNCaP
SE_41579chr3:58026680-58028166LNCaP
SE_45969chr3:58026358-58032250Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58026661-58028194u87
SE_64106chr3:58026703-58027892HSMM
SE_65730chr3:58025436-58027838Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr35802500058026400
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058034chr35802017558032048
Enhancer Sequence
TGCTGACTGT CAGCTGGCAC CCAGTGCATA GAAGAGATAG TTCTCTGTAG ATGATGTTGA 60
ACAATGTGGT ACTATAATCC CAACCTGTTG TATCTTTGTT TACTCTCAAA AGCAACAATT 120
GGGCTGGGCA TGGTGGCTCA TGCCTGTAAT CGCAGCACTT TGGGAGGCTA AGGTGGGAGG 180
GTTGCTTGAA GTTAGTTCCT TTTTTTTTTT TTTTTTAAAA AAAAGACAAG ATCTCGCTCT 240
GTCACCCCGG CTGGAATGCA GTGGCATGAT CATAGCTCAC TGCAGCCTTG ACCACGTGGG 300
CTCAAGGAAT GAACCATTGT GCCAGGAGTT CAACACCAGC CTGGATAACA TAGCGAGACC 360
CTGTCTCTAC AGGAAAAAAA AAAAAAAAGA AGAATTGCAT AAGTATCATC AGAACTGTTG 420
AATGGAAAAT CAGACTTTGT GGGTTTGGTT TGTTAATTAC TTCTCGTTGG ATTAGAATTT 480
GATAGGTAAA AAAAAAAAAA AAGGTGTAGA AAAGTGATTC CAGTCTTGAG CAAATTTTTA 540
ATGGAAAACG GTGTCTTGGT TCTCTGTTCA CTACAACTTG TATCTAAGGG AAAGCCTAGT 600
GATGCAGACA TTTCATTTCG TGATGGGAAA ACTGATGCCC AGAGGTTCAC AGCTGACCAG 660
GGGCTAGTCT GACTGGGGGG ATCTAGGTCA CCACCCCCCT TGCCTTGTTT TCCCAGCTAG 720
TGCATTTCCT ACTAGACTTG ACTCTACTGT AATTCAAGTT GCTGAGTAGC AAACAAGAAC 780
TACAATGACT AGAAGGAACA GAACTAGCTT TTTTGTGCTC TGAAAGTGGA AACTTATTGA 840
GGGTTCTTTT CCTCCCAGAG AATGCAGAAG TGCCCTGATT TGCTTTTGGA AGGACACCAT 900
TCACTTTATT GCCTCTTTTC ATTGTTGCCC AGAATATCAC CATGATTTAT TCATGGGTGG 960
TGGGGAGGGT AGCACTAGTG TATGCTCCCA GCAAAGAGGA ACATCTCACG TTGTGAAGAG 1020
ATGCGCAAAA CTAAGCCAGG GCAGGGTGTG GTGGCTCATG CCTGTAATCC CAGCACTTTG 1080
GGAAGCTGAG GTGGGCAGAT CACCTGAGGT CAAGAGTTGA AGACCACCCT GGCCAACATG 1140
GTGAAACTCT GTCTGTACTA AAAATACAAA AATTAGCTGG GTCTGATTGC AGGTGCCTCT 1200
AATTGCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATTTCTT GAACCTGGGA GGCAGAGGTT 1260
GCAGTGAGCT GAGACTGTGC CGTTGTACTC TAGCCTGGGC AACAAGAGCC ATCTCAAAAA 1320
AAGAAGCAAG CCAGATCTTT GGGGTGCTGT GACGGCAAAT CCCCCAGCGC TGGCCTCTCA 1380
GGTTCTCTTG CGGGATTAGT GTTTGTTGAA TAATAAGCAA TACACCCTGA CCCAGCGAGC 1440
CAAAGCAAAC AGGACAGTAA CTGAAACTGC AGGGGAGTGT GAGTAAACAG TTACCTTCTA 1500
CCCTCATGGA GCTGGCCTCT GGCCAGCAAC ATGATAGCTG TTTGCATCTT ACTCTTATGG 1560
AGCCATTGGC CCTCTCATTA AGGTGGGGGC AGCTTCTGGT CCATGCCTGC AAGTCCTCAT 1620
GGGAGTGGGT ACCTGACAGG GTGTAAAGGG TAGGTCTGAG GACATGGTTT CTTTTTTTTA 1680
TTGTTGTTGA GATGGAATCC TGCTCTTGTC ACACAGTCTG GAGTGCAGTG GCCTGATCTC 1740
GGCTCACTGC AACCTCCGTC TCACTGGTTC AAGCGATTCT CCTGCCTAAG CCTCCTGAGT 1800
AGCTGGGACT ATAGGCGCAT CCTGCCATGC CTGGCTAAGT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC 1860
GGGGTTTCAC CACGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAACTCCTG ACCTCAGGTG ATCCACCCAC 1920
CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC CGTCCCCAGC CAACATGGTT 1980
TCTTTAAAAT ATACTCCCCG CTCCATCCCA TTCATGTGTG GGAGTTGAGC TGCATCTGGG 2040
TTTTTCTTTT CTCTTTTTCT GTAAATCTTT ATTGTATTTT TTTTGGATCA TAGAATGGAT 2100
ACATGTTTCT TAAAGTTTGA TCATTATAGA AACTTAATTA GACTATTATT TGAGTGCTAA 2160
CCATAGTGAG TGAGTGCTTA CTGTGTGCTA GGTGGCTTTT TATGCCTCAT GTCACTTACA 2220
TGAGGTCTGA GGAACGGTGT TAATCCCGTT TTGCAGCTGA GGAAACTGAG GCTACATTTA 2280
CGGTCACCTA GCTGGCAAGC AAGTGGCTGA GCCTGGAGCA GCAGCAGATC TGGGGAACTC 2340
CACAAACCAG ATTTCTGTGT GGTATCCCTG TGGACACAAG GATTTAACTT GATTCTTTTT 2400
GCTTTCAGTA TCACTTTATG ATATTACAAT GAGCTTGCAG TATTTATTTT CAGAAGAAAA 2460
GCCAGATTAT TCCCATTTAT GAGAGAAGCA GCCAGGTGGG CAGGGATTTC CAGCGCTGAA 2520
CCAGCCAGTG TGTGCATTGT CTCTTCCCGC TGAGCGGCCC TGGTGTGCTG GGTTAGTCTG 2580
TGAGCCACAG GAAATGTTGT CAGGGCCTCT GGGCTTTTGG ATGTCAGCAG GCCTTCAGTG 2640
GTGAGGAGGT TGTGGCTGGA CTCAGAGGAC TCCTTGCTTT TGCTGAACGA CCCTCCCCAC 2700
CAACCACCAC CACCACCACC AGTGGGACTA GCCCATGAGC TGTAAGCCAA CCTTTTCCTT 2760
CCTAACTTAA TTTTCCAAAG AATAGTAACT TACCCACCAC CACTGCAGTC ACTGGGCCGG 2820
GAAGACAAGC ACTCTTGCCT TGAATCCATG CCTTGAGCCA GTAGCCTTGA CCCAGGGTAA 2880
AGCAGTTATG TGCTTGGGTC ACCTGGGTCA TGTTTTTGAA ATTGCCTCAA GCCTACCTTA 2940
CAAATCCTTC CTGGAACCCT GCTTGGCTTT TCTTTGTGGG CTTCCCTTAG GAGGGAAGCT 3000
TCCCGAGCAG CTTGTCTTGA CTGTAGCCAG CTGGGTGGTC CCAGCCACAG AATTTAACTG 3060
TCAAACAGCA CCAGAAGGGT TCCTCATCCA GCTGTCTTGC CCCAAGTGCC CTCTTTGCTT 3120
TCTTTTTAGA GAGTTCTGAG ACTCATTAGA GAGTTTAGAG ATTTTAGCAT TCTTGAAGTT 3180
CTTTCTGTGG TCAGTTTGGT GAACCACTTC ATTTCTAAAG TTTCTCAGTT GACCCCATTC 3240
TTCCCCAGCT TTGCATTCTC CATGAAGCCA CCTGTGTTTG GTGTGTATGG GTTTTCTGCA 3300
ACCTAGGTTG AACAAGTCCT CTAGAATCCT GAACAATTGG TGATTCATGC TGGCCTGGTT 3360
TTTCTAATTG GCCTGGAAAT GTGGCTGTAG TGGACACAAG TGGACTTGGC CTCCTCTTTG 3420
ATGCGGGTAA ACTTTAGATT TGCATTAGCT CTGTTTGATT AGAGGATCTT ACTGGTTTTT 3480
GTTGTTATTT ATTTACCTTT TAGGAGCTTT AGTCTCTGTA GGTTTTTTTT TTTTTTTTTT 3540
TAAAGTCCGG GTCTTACTCT GTCACCCAGG CTAGGGTGCA GTGGCATGAT CACAGCTCAC 3600
TGCAGCCCCC ACCTTCCTGG GCTCAGGTGA TCCTGCCACC TTAGTTTCCT GAGTAGCTGG 3660
GACTACAGGC ATGTGCCACC ATGCCCAGCA AATTTATTTC TACTTTTTGA AAACAGGGTC 3720
TCACTTTGTC ACCCAGGCCA GAATGCAGTA GCACGATCAT GGCTCACTGC AGTCTCAACC 3780
TCCCAGGCTT AAGGGATTCT CCCACCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGAGG CTACTTGGCA 3840
TGCATCACAA GGCCCAGCTA ATTTGTGTTT TTTCTTGTAG AGGCGGGGTT TTGCCATGTT 3900
GCCCAGGCTG GTCTCGAACT CCTGGGGTCA AGTTATACTC TCTCCTTTGC CTCCAGCCAT 3960
GAGCCGTTCG TTGCGCCTGG GCTAGTCATT ATAGATTTAT CCCTTCTTTC ATCTCATGCT 4020
ACAAAAGCAG TTCTTGTATT TTTACCCGAC TTGTGATTTT CTACTGGGAA TGTTTGTTTG 4080
TGATGGTTAG CAGGGTGCTG AGAGGGAATT AATCCCAGGA GGCCCAATAT TGGGCCATGT 4140
CGTGCTGTTG AGCACAGTCA TTTGACACCT ATAACTTCTC 4180