EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-31815 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr3:42065590-42068610 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:42067595-42067613CCCTCCATCCCTCCTTTC-6.17
HES2MA0616.2chr3:42068158-42068168GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr3:42068158-42068168GGCACGTGCC-6.02
MyogMA0500.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.02
SOX10MA0442.2chr3:42065867-42065878TTCTTTGTTTT-6.62
Tcf12MA0521.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr3:42067591-42067612CTCTCCCTCCATCCCTCCTTT-6.38
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42060660-42068971Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42066131-42066552Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42066556-42067516Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42067617-42068091Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42066168-42066949Aorta
SE_02512chr3:42065459-42068129Astrocytes
SE_10226chr3:42065877-42068137CD19_Primary
SE_10922chr3:42060609-42068638CD20
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SE_24262chr3:42066235-42066832Colon_Crypt_2
SE_24991chr3:42066143-42066941Colon_Crypt_3
SE_24991chr3:42067525-42067991Colon_Crypt_3
SE_25861chr3:42065366-42068715Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42066043-42067298Esophagus
SE_29565chr3:42065389-42069132Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42065344-42069055HSMMtube
SE_38230chr3:42065373-42068528HUVEC
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SE_40683chr3:42066021-42068361Left_Ventricle
SE_42248chr3:42064544-42066038Lung
SE_42248chr3:42066070-42068146Lung
SE_44658chr3:42065460-42068844NHDF-Ad
SE_44918chr3:42065870-42068385NHLF
SE_45733chr3:42065416-42068758Osteoblasts
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SE_48185chr3:42066028-42068146Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42065428-42065902Right_Atrium
SE_48670chr3:42066166-42067443Right_Atrium
SE_48670chr3:42067563-42068128Right_Atrium
SE_49555chr3:42066577-42066889Right_Ventricle
SE_50309chr3:42066089-42067441Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42060817-42068845Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42065989-42068136Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42066102-42067523Small_Intestine
SE_52625chr3:42067553-42068124Small_Intestine
SE_53513chr3:42065347-42065894Spleen
SE_53513chr3:42066102-42068146Spleen
SE_54717chr3:42065389-42068637Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42065927-42068150HSMM
SE_65769chr3:42064935-42066082Pancreatic_islets
SE_65769chr3:42066166-42068375Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr34206596042068007
chr34206711042067525
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042019chr34206049442069114
Enhancer Sequence
CTGGGCCTGA CACTTCGAAG AGGGATAGGA GTTTGAGGCA AGGGTTTGGG GACCATTCCT 60
GTGTAGTGAT ATCCATGTGT AGGAGAACTC ACAGAGGAGT AGTGACTAGA GATTGGGAGA 120
AGACCAGAAT TGCTGGGGGA GGGAGTGTTC TTTTGGTGAA GGGTAGGGTT CACAGGGTTA 180
CTCTGCTGTG AGAGGCCAAG TGAGATAGAA GCTAAAATAT CTTTTGGGTT TGTTTATACA 240
TAGTAGGTAT GCAGATATTT CTAGTTGTAT CATTTGGTTC TTTGTTTTTC AGAAGAGATG 300
CTGGCTTAGC CTTGTAAACA TCGCAGTTGC ATAAAAGTAT TTATGATAGT CCTTAAAATG 360
CTGTAATTAT CTTTGAAGTT TTATAATTTT GCAGTGTTTA ACTTATGGCA GCAATAGCAT 420
TGGTATTTTA AATCAAAACA GAACACTGTC AAGGGTTACA TAACTTATTC ATGATATTAA 480
CAAGATATAA AGCACCATGT TTTTGTGTGT AACTGTTTAA CAGTAGATGA AGTTAATGAT 540
TGCCCACTTT CAGCTAATCA TATGATTGCT ATTGAAATAA GTACTTGCTA GACAGGGATA 600
GAATCTAGTA ATTTGTTAGC TTCAGTACTT CATGCTTGCA TACACACCCA TGCTATTGTG 660
TTACCAAGCC TGAGTTTTGA AATGTGGCGT TCTTTGTCTT TTTCTGGTGA ATAAACCCCA 720
TACGTCTTAC CATAGCCATT TGACTCTTCC TGGCTGTCAG GATGTGTTGC CCTGGACTGA 780
GAGTGAGAGA TCCCAGATTT TTCAGCTTCT CTTCCAATTG CTAGGGATAC CACATCAGTG 840
CCAACGTGAG TCTCCTCTTG TCACTTTCTG CTAGGCTTCC CCTTAGAAGC TGAAATTCTT 900
TCCCTTCCTG ATGCTAAGTT GCAGTTTCTT AAAATGCTAG AGAGCTTTTA AAAGCATACC 960
GTGATGGGAA TTAGTTTCAA AAGATTATAC CAGAGGGGGT TAAAACTTGC CAACCTTGTA 1020
AAAACCTAAC TTCTTTGTTT ACGTCCTCCC TGCCCCGCTT TCTGCTGTGC TTGGTTTCCT 1080
CCTAGCAATA TGCCTTGGTC AGGGGGAGAG TCTTCCTGTC AGACATAACT TCCCAGACCA 1140
GCACTCCTGG AGGGGCCTGT ACCTCAGACC CTGGCAACGA GGCACGCTGG GGCACGCTGG 1200
CCTTTCGTTG TGGTGTAGAA AATTTTTCAT TTGGAATTCC ATTTTAAAAA TAAGTATAGG 1260
GTTATTTATA TCTTCTTACA TTAATTTTGA TAAGTTGTGT ATTTTAAGGG CTTTATCCAC 1320
TTTATCTAAG CTACTGAATT AATTGGCACA ATTATTACTC TTTCAATGTC CATAAGACCT 1380
GTAGTGATGT CCCCATATTT TATTTCTGGT ATTTGCCTTT CATGTTAAGA ATGTGTCTGT 1440
TCAAAGGGAG AGGGGAAGGA GAAAAGAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGACT GCTGGATCAG 1500
GGTAACTTAG CTCAAGAAAA TGAGAAGGGG TGGTTTCTGG AAGGGGAGAA TGAAAGCCGT 1560
GGAGGAAATA AAGCATGAAT GTGGGGGAGG GCGGGGGCGG GGACTGCTTC TCTTGCTGGC 1620
TGCCTTCTCT CTCTGGAGAA TCTGCTGGAG AAGGAGCAGT CACGTGGGTG GTGAGCTCAT 1680
TAGGCTGGGG ACACCAGCTG TGCTATTATT AGGGCTTTTA AAGTCCGTGG CAGATGTTCT 1740
TAGGCGGTGT TCCAGCCTTG TTCACTTCCC ACATATGGCA TGATACTGTA CACAGAAAAA 1800
AGAGGGACTC TTTAACAAAT AGCTTTTCCA TGAAATGCAT CACTATTTTT TTCCCATGAA 1860
CTTTTTTCTT TTCTTTCTTC CTCTGTCTCT GTTTCTTTGT TTCTCTCTCT GCTGTTTGTT 1920
CTTTCTTCTT TCTCCGTTTA TCTTTCTCCC TCTGTCTCTT TCTTGCTTTC CTCTATTTTT 1980
CTGTATTCTC ATTCTCCCTG TCTCTCCCTC CATCCCTCCT TTCTATACTT CCTTCTTTTG 2040
TCCTTTGAGG CCCTTTTTAT TTAATCCTTT GTGAAACTAG AAGAGGACTC AGAGGCACAT 2100
GAAGAAAGTT TGTCTATTTT AGATTAAAAG TGAGCCTTAG CATTTCATAG AAAGTATAAG 2160
AAATGTGGGT AAGTCTCAGG GTGATCATAT ACTAGAGAAT TTTTTTGACA AGAGCCTGTT 2220
TTGAATTGCG TGGTTAGCTT GCTGCCTCTT CACTCCTCTG GCACAGTGGT AGTTTTTGTA 2280
CAGGATCGCT TTTACCTCAA TGGACTGATA AGCTAGCCAG GGCACCGATT ATTTTTACAT 2340
ACCAATTTGT GTGTTGTTTG TTTGGCTAAT CACCTCTTCT GCAGCTGTTA TCCTGGATCT 2400
CAGTGATCAA AGAGATCAGT GATCTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGACA GAGTCTCACT 2460
CTGTTGCCCA GGCTAGAGTG CAGTGGCATG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCCA 2520
GGTTCAAGTG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC CGAGTAGCTG AGACTACAGG CACGTGCCAC 2580
CACGCCTGGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA GAGATGGAAT TTCACCATGT TGGCCAGGCT 2640
GGTCTTGAAC TCCCGACCTC AGGTGATCTG CCTGCCTCGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT 2700
ACAGGCGTGA GCCACTGCGC CTGGCCAGTG ATCAACTTTT GTCAGTAAGC TTCCATGTGT 2760
AGACCCTCCT TCTCCCCTCA TATTTATAGT AACCCATGTC TTAGCTTGGA GTTATAGGGT 2820
ATAATCAATA TCAAATTTAC TTAAATAACT GCTCTGGTAG ACTGACTTTC TACAGGAAAT 2880
GGGCTCTTAT GTGAATGTAA CCTCAATGTA TACTCTTTAA TAAAATCTCA GAATGATGCA 2940
AGCTTCATTA TAGTTGTTTC CTACTGTTTA TTTCAAATTT GATATTTTGA TATATTTACA 3000
CTAATTTTAT AGCTAAGCAC 3020