EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-25148 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr2:54814590-54819290 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr2:54816765-54816780TTCTATTTTTATACA-6.2
NFE2L1MA0089.2chr2:54817536-54817551TTTGCTGACTCATTG-6.41
ONECUT3MA0757.1chr2:54816257-54816271ATTATTGATTAATT-6.01
RARA(var.2)MA0730.1chr2:54816608-54816625AGGTCATAGAGAGCTCA+6.04
ZNF263MA0528.1chr2:54815323-54815344TCCCCTTCCTCTTCCTCCTCC-10.18
ZNF263MA0528.1chr2:54815317-54815338GCCTCCTCCCCTTCCTCTTCC-7.15
ZNF263MA0528.1chr2:54815326-54815347CCTTCCTCTTCCTCCTCCTTT-8.33
ZNF263MA0528.1chr2:54815320-54815341TCCTCCCCTTCCTCTTCCTCC-8.78
Number of super-enhancer constituents: 70             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54811575-54819309Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54814579-54815214Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54816252-54816814Adrenal_Gland
SE_04102chr2:54814941-54816073Brain_Anterior_Caudate
SE_07789chr2:54813346-54816182Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07789chr2:54817129-54819221Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10400chr2:54816091-54818335CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54815334-54816100CD3
SE_11903chr2:54816161-54819079CD3
SE_12885chr2:54814124-54818971CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54812274-54819355CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54814276-54819273CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54815487-54818959CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54816054-54817245CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54815876-54818061CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16936chr2:54816201-54817676CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54814925-54818752CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54815499-54818365CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54815127-54817586CD56
SE_20822chr2:54816241-54817869CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54816159-54819303CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54805854-54819252CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54814371-54819185CD8_primiary
SE_23128chr2:54815488-54816009Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54816282-54816797Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54816303-54816784Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54816175-54816858Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54817070-54818113Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54816242-54816827Esophagus
SE_27627chr2:54814586-54819090Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54814445-54819018Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54816185-54817593Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54815014-54818854Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54815469-54815973Gastric
SE_31545chr2:54816117-54816901Gastric
SE_32493chr2:54815176-54816073GM12878
SE_32493chr2:54816110-54818206GM12878
SE_35301chr2:54815908-54818232HeLa
SE_38000chr2:54811565-54818799HUVEC
SE_39396chr2:54811057-54819524Jurkat
SE_40773chr2:54814413-54816146Left_Ventricle
SE_40773chr2:54816224-54817045Left_Ventricle
SE_40773chr2:54817130-54818249Left_Ventricle
SE_42137chr2:54814409-54816036Lung
SE_42137chr2:54816119-54816971Lung
SE_42137chr2:54817415-54818240Lung
SE_47832chr2:54816285-54816759Pancreas
SE_49296chr2:54815259-54816007Right_Atrium
SE_49296chr2:54816123-54816962Right_Atrium
SE_49296chr2:54817612-54818194Right_Atrium
SE_49907chr2:54809659-54819600RPMI-8402
SE_50115chr2:54814479-54816047Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54816208-54817004Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54817065-54818427Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54815289-54815982Small_Intestine
SE_52386chr2:54816241-54817008Small_Intestine
SE_52386chr2:54817085-54818259Small_Intestine
SE_53342chr2:54814421-54816087Spleen
SE_53342chr2:54816141-54818248Spleen
SE_53342chr2:54818516-54819105Spleen
SE_55277chr2:54816248-54816810Thymus
SE_55277chr2:54817364-54817991Thymus
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_66257chr2:54811057-54819524Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr25481528954815330
chr25481660954817000
chr25481680054818302
chr25481740154817794
chr25481866754818978
chr25481907254819137
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054584chr25481156454820841
Enhancer Sequence
TGTTAAGTTC TGCCGTTCTG TGTTGTTTAG TAATTAAGTG TATGGTATCT ATTTAGTTCT 60
AAGTTTTTCC TAACTTTTAA GGGCATTGCA AGTTACCCTC AGCCCACCTT GGATTGAAGT 120
CCCCTTCCAT GGAGGACTGG AGGAGAAGAG GTGATGGTGT ATGAAGTGTC CATCAAAATA 180
AGAGCTGAAG AGCCTTCAGC TTGTGGGGAG GGCTGGAAAG TTGGAAGATC AGGCCTCAAG 240
CTGTTCCACC CTTCTCATCC TTTGAAGGTG AGGGTGCAGC CTTGAGGTCT AGCCTGTGGT 300
GATTACCATA GTTTGTCCCT CCTGCCAAAT GGGGTGGCAC ACTCCATCCC GTAAGTGAAG 360
GTAACCAGAT AAATACCCAC TCCGCTGGGG AGTGGAAGGG GCCCCGAGTT CACCCTGTGA 420
CTGACCTGAC ATGTGGATAT CACTTACCAG AAAATGCTTG TGGCTACTGA GCATTAACCT 480
GGCAACATAT TCAATAGCAA AATTTAAAAT AGTACCCAGT GTGGTGCCTT GCTCATAGCA 540
AGCACTTAGT ACCTATTTGC TAAGCTGATT TTAATTTGAA GTGGAGTCTA ACAAATGGGA 600
TGTGGGATCA ACAGTATTAT TATATTGAAA TGTTTTAAAC CAGGACATGC CAAACTTTTT 660
CTATAAAGGA CCAGATAATA ACTGTTAGGC TTTGTGGGCC ACATGGAGTC TCTATGGGGT 720
ATCATCAGCC TCCTCCCCTT CCTCTTCCTC CTCCTTTTAA CCACCCTCTT AAAATGTAAA 780
ACCTGTGTGT CTCCCAGGCT ACATAAAAAG AGGCTACTGG CTGAAGTTTG CTGACTCCTA 840
TTTTATATTA ATCTTTTAAC TCAGTCTGAA GGAACTGACC AGACATGGAT GGTTATGAGT 900
TTTTTCTTCT TGTTTTGGGG AGGTGATGTC TTGTTTTCCT CAGGCAGTGT GGGATGGTGG 960
TTGGAACTAA ATAGATACCA TCCCACACTC CCTGTGTGGG ATGGAGTGCC TCAGGTGCTT 1020
TGGGATTCTG TAGGGTTCAG ATAAATGTGG GCTCTAATTC TGGGTGTTTA TTTGCTAGCA 1080
GCATGCCCTC GGGGGGATCC CAAAACCAGT CTGTGCCTCA GCCACCTCAG TTAGTTAGAA 1140
ATCACAGGCT GTAATGAAGG AGGGAAAGTG AGTGAAGATC CTAATGCAGC ATCACTAGTG 1200
CACACCTGGG CTTACTTCAG CCTTTGCCCT AACTGATCAG TCACCCTGAC TGCAGTTCCC 1260
ATCCTGTAGA GATGGAGAGT AGCAGGTTAA TGGGCTCAGG ATATGACTTC CTGTATGTGA 1320
AAGCAGTTTG GAAGCATGCT ACCCATTTTT AGTCAAACAC AGTGAACAGT TACTGAGAAT 1380
TTTATCACAA GGTCCTAATT CTGTTTTTTT ACATTTGCTT TTTCCACCTG GTTTTGGCAC 1440
CTTACACTAT TGGTTTTTTT TGTTTTGTTT TTTAAAAAAT ATTTTTAACT TTTGTGGATA 1500
CATAGTAGAT GTATATATTT ATGGGGTATG TGATGTTTTA ATATAGGTAT GTGATGCTTA 1560
ATAATCACAT CGTGGAGAAT GGGATATCCA TCCCCTCAAG CATTTATCTT TTGTGTTACA 1620
AACAATCCAA TTATACTCTT AGTTATCTTT AAATGTACAA TTAACTTATT ATTGATTAAT 1680
TCACACTGGT TCCCACCTTA GCTCTCATCT TAGAAGAGGT AGTTGTGTTG CTTTGCCTCT 1740
TATTTTCGGA GAAAGCCCCC ATCATAACCT CAGCTCCCTC CAGAGTCTTG GCTTCTTATG 1800
GATTGTGACT TTATGCGGCT CACCTTGACG TACGACTGTG ACAGAGGCAG GACCCTGGTG 1860
ACAGAGCCTC ATTTCTCAGT TATTGTGGGT CTCCTCTCAG AAGTTGTGCC TGCAGTGCCT 1920
TGGTCTCCAC ATTGGCAAAC TGGGGTTGTG CCGCTCAGAA GAAAGGCCCT CTGGAAGCTG 1980
CAGGAGGGAC TGCCCAGCAG ATGCAACCTG TAGGTGCCAG GTCATAGAGA GCTCATGGTG 2040
GGTTTTGTAG TCGGCCCATC AGACAGTTAC TAGCAGACAA TTGCATATTT GCTTCACATG 2100
CATTTAGAGC AAATATTTAC ATGTGTTTTG TCCATGATGC AAGTTAAACA GTTAAGGAAA 2160
CTATTGTAAC TCAAATTCTA TTTTTATACA AATCAGCAAA CATGAATTTA AGGCCTTCAG 2220
ACTAGTCCGT CACAGGGAGG ACTTCAGTCA AAAGATTAGT TTCCTTCCTG TTGCTGCCTC 2280
AAGATAACAG TTGGATTCTC TGTTATCAAT ACAGCCAGCT GCCTGTTTCC GGCTTCCTGC 2340
TCTGTGTATT TTGCATGTTA CTCATGGGAA ATGATTTATT TATTTTTTCA AGCTAAGGCA 2400
TATAGGGGGA CTCCACCCTA CCACTATTCT TTTGTTTTGA GTTAAGATCC TTTTTTATTC 2460
TTTATTTTAA AACAGTTCAA GAATTAAACT TTAATATATA AATTGTTAAA GTTGCAACAA 2520
ATTAAGTCTT GTGACAATTG ACCTGATTGG GTCATGTTTA AATAATGTTG TAATATGTTA 2580
CAATGATGTC CTAATCACAC CGTTGTGTAT TTTGCAACTT CACTTTACCG TACAGGTATG 2640
TGGTGGCAAT TGCCCAAAGA TAAAACAAGC AAACAAAAAA CAGAATTTGT CAAACATTTT 2700
AGTTTGGCTC TGGACCCATT TTAGTCTGAA TGACAGCACC ACAAAATTGC ATTTTTATCC 2760
GTATTTCAGA CATTGAGGAA TTGCAAGAAG CAGTTCACCT GTCATATATT TTTAGTGCTA 2820
TACAATGACA ACATTTAACT GCCTAGGGCC TGTCTTTGTG ATATGAAATT TCCCTCCTCA 2880
ACAATTTCAG TGAGACCACC ACCAACAATA AGATTTATCG AGAACCTAGT TGTTGGACAC 2940
TGGAGGTTTG CTGACTCATT GAACAAATGT TTATTGTGCA CCTCCTTTAT GTCATGTATA 3000
TGCTAAAGCT CTAAACATGA ATAGGATTGA GCCTTTGCCT CTGAGCCAAC TGCAAGTTAA 3060
TTGAAGAGAT AGGACACAAG ACGTATAATA AAAGATGAGA GACCACATCC CATCAAATGA 3120
TGATTGCTGA CATCTGATAG GAGAGGGCCT CTTGGTAGAA CTAATCTTGG CTGGATCTTA 3180
AAGGAAGGGT AAGAGAAAAC TGCCTTCTAG GTTAGAAGAA TGATAGAAGC AAAGATGGGA 3240
AAAAGCAGTG TGCAAGGTGA GAGTTCAGAG CATGAGAGTA AGACCTGTTA GGTTGGAACA 3300
AAAGACGGCA TGTCAGGGAA GTTCCCAGAT GAAGCTGATG CCTTAGGAGA GCCCGTTTGG 3360
GACCTTTAAA TGCCAGGTTC AGAGATTTGG ACTGTCTTCT GGATAGCTGG GGTCCGTTGA 3420
AGGTTTTGGT GCAGTGCTGC AACTTTGAAA AACCACTGAT TGAGGAACAT GGCTATGGTA 3480
GTGATGTTTA AGGTGGATTA GAATGCGGAG AGAGGCCCAA GGCAGGGGAG TTCAGTTGGG 3540
GTCTGAAACC ACCCAAATTG TGGTGAGCTT TGTTCAAAAC ACGCAAAAAT AGATTGTCAA 3600
AATTATTCTC TTAGCAACTG ATCTTGTACT TCTTTGTAAT GTCTTTTTGT TATTTTTTAA 3660
CTTTTTATTT TGTATCCCCA GCTAGATTTC TAGTTCATTG AGGGTAAGAG ACTTTATCTT 3720
AGACACAGAG TTCTAGGTAA AGTATGCACT TTGTAATATT GGAGCTCACT AATACTCTCA 3780
ATTTCAGATT AGTCAGCTAA CACAGTATTA TTGATTTAAA TAGTGGGGAT ATGTTCATGG 3840
GATGATTGCT TCCTCCCCTT TTGATTTCTT CTTAACTTCC ATCCCTGTAA TTCCTTTCTT 3900
TCTTACTTTG AACCCAAGAC TACACCTAAC TTAACTATAT GTCTGTGCAA AGCAAAAACT 3960
ACATGATTGC TGTCTCTTAC TTAGGGGGTA GGCCATTATC TTAGCACAAT TGAAGAGCCT 4020
GATAGAAAAT ATTACTGGGT TATACGTGCA GGTTCAGACT ACTTGAAAAG TAAAAGAAAG 4080
ATTCCTTCTC TTAAGCCAGG TATAAATTCA GTCTTTAGGG GAACAATGAA TAGGGTCTTT 4140
TGACAGTTCC TGATTCTATG TTTCCTTTTT TTTCCATCCG GAGATGTTCC ATGCCTTCAG 4200
GCTTTCCTTC ATTCCTGGCT CCCATCCCTT TCCATAACCA GAACTGTGGC ATATGGTGAA 4260
TATAGTTGTG TTTAGCACTC TGTGCTGAGG GTATTGCAGA AAGATGCCGT ACAATCATTT 4320
CCATCATGCA GTGCCCTTCT GCTCATCAAA GCTATTTCTG TATCCTAACT TGACTCACGC 4380
TAACACAGTG TTCATTTTTT CAGTTATAGC AAATTCTCTA GAGTAAATAA ATATGGGGCT 4440
GGGTGCAGTG GCCCACACCT GTAATTCACT TTGGGAGGCT AAGGTGGGAG GATCACTGGA 4500
GACCAGGAGT TTGAGGTCAG CCTGGGCAAT CTAATGAGAC CCTATTTCTA CAAAAAAAAA 4560
TGAAAAAGCC AGGTGTGATG GTGCATGCCT GTAATCCTAG TTACTCTGGA GGTTGAGGTG 4620
GGAAGATTGC TTCAGCCCAG GAGTCCAAAA TTACAGTGAG CTGTGATCAC ACCACTACAC 4680
TCTAGCTGGG GTGACAGACT 4700