EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-04394 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:230238670-230243250 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3811489chr1230239259hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:230242907-230242918AGAGATAAGGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:230239421-230239442AAACAGAAAATGAAAGAACCC-6.65
PLAG1MA0163.1chr1:230241093-230241107GGGGCCCACTGGGG+6.86
RREB1MA0073.1chr1:230239920-230239940GGTTCTGGGGTGGTGGGGGG-6.25
TFAP2AMA0003.3chr1:230242926-230242937AGCCTCAGGCA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01245chr1:230239641-230243336Adrenal_Gland
SE_01785chr1:230239049-230240587Aorta
SE_01785chr1:230240637-230243187Aorta
SE_02496chr1:230239508-230241945Astrocytes
SE_25348chr1:230236453-230250730DND41
SE_31112chr1:230238334-230250198Fetal_Thymus
SE_34791chr1:230238329-230243364HeLa
SE_36634chr1:230239950-230242005HMEC
SE_37247chr1:230239177-230242475HSMMtube
SE_39241chr1:230238979-230242188IMR90
SE_39366chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_39366chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_43672chr1:230238380-230242897MM1S
SE_45047chr1:230239152-230242696NHLF
SE_45719chr1:230236856-230242994Osteoblasts
SE_49908chr1:230237167-230243238RPMI-8402
SE_50426chr1:230239072-230243127Sigmoid_Colon
SE_51846chr1:230239549-230242044Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_63637chr1:230239456-230242241HSMM
SE_65792chr1:230239400-230241648Pancreatic_islets
SE_65792chr1:230242407-230243231Pancreatic_islets
SE_66256chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_66256chr1:230239361-230243263Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1230239370230239686
chr1230240136230242131
chr1230242543230242593
chr1230242784230243065
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230101chr1230237569230243904
Enhancer Sequence
CATGGACGAG AGTGTTGTTT GATGACTCTG CATGTGACCA GTAGTGACAT TTTACTCACT 60
GAGGCTCATA TTGAGGTTAA GCCCGAGGTC CATTGGCCTT GCTGAGATCG TGTTTAGAAC 120
ACAGCACTGT GCAGTAAGAG ACTCCTATAA CTCTATCAAA TTTGCATTTG GAGGAATTGT 180
AAAGAGCCTC TGTTACCTCC TAGGTGAGGC AGTCCAGGAA AACAGTTGCT AGAAGGAGCT 240
ATCTGCAGAA ATAGACAGTT GTGGTCCTTT CATGTTTTAA TAATTGTTCC CTGGATTTCA 300
AGGAGTCAGT CCAAAATCCC CGTAATAGAT TTTAGTAACG TTCATGGAAT CTCAGTTTGC 360
ACATCATGAG ACCTTTAGTG TGGTGTTTAC TGTCTTCACC TTAATATACT TTGTATCCAT 420
GAGCAACCTT GCTACAGTCA TGCAAAGATG ATTATTTTTT ATTCAGCAAT AATTAGCCAC 480
AGTGTTGAGC ACCCAGATGC CTTCCTGCAG CAGCCCCCCT TTTCTCCCCA GCCAACATCT 540
GCAACTGTGA ACAGATTTCC ATCTTCAGCC TTGGTGGTTG GAAAGAAATG TAAGTCACCT 600
TTTTTTCTGG TTGGTTCTGG GGCAGATGCC ACCAGGCTGC AGAGGCAGTC TGTGTCTGTG 660
GGGCTCACCA GGGCATGAGT TCTGCTCCCA GGAAAGAGAT TCTTGCAGGA TTTTGTCTGT 720
GGTTCTAAGG AGACAAGTAG GTGGCACACA AAAACAGAAA ATGAAAGAAC CCATCCCTCC 780
AAAACCACAC ACACAAAGCC AAAAGGAAAA AAAAAAAGCA CATAATTATC ATGTAGGCAC 840
TGTTGCAGCT AACCCTGATT TTGGCCTCAA TTCTGAAACA AGTTAGCTGG TTTAGACAAA 900
CCCCTTATTA GGTAATGGAT TGTTATTCAT TCCTCCCCTT CTCCTAGTCA TTTACTCCGT 960
GAGAGCTGCT CCTACCTGAC CTTCCACTGA TTTTGGTAGC AGCATCTCCC AGAGCGACTG 1020
TTTCCTTCTT CAGCAGTGTT CCTTACTCAG GGTGTAAGAT CTTAACCCCA CAGAGCCCCG 1080
TATCAGGTTT AATTAACTAA TTGATTCAGC TTGTGCTTAC TGAGTGCGAG GCAGTCATGT 1140
GCTTCTGTTT GGTAAATGGC TTCATTTTCC CTCTAACTCC TGAGCGTCCT GAAGCTTCTC 1200
TTATGGTTCT CTCCAAAGGA GTCAGCAGGC TGGCTCTGCA AGGGTCAGTA GGTTCTGGGG 1260
TGGTGGGGGG CCGAGGGAGG CAGGGAGGTT GGCTCTGTCT TTATTTGGCA TAGAGCTCCC 1320
CGAACAGGGT CTCTCCTCCT TTCTCCAAAG GTTAATGGAA CCACTATCTT AAAAAGCTGA 1380
AATCTTATCT TCTGGGGTAT TTGGGTAGAG AAGGCTAGGG AATCCCTTTT CCATGGTGGT 1440
GCAGTAGGTT CTCAGAACCA GCTGGTGGGC CTCAAAGAGA GGCGGCTGTA TTTTAGCCTG 1500
ATAATCTTGA TTCCTGGTTT CCTGGCTCTG TAGCATCAGA AATGGGAAGC TTTAAAAGCC 1560
GTGCCTTGTT GGATGCACCG AGTCATAAAA TAAATGTGAT GTGCTGGGTG GGGGAAATGC 1620
GGGAGGAGGG AAACAGGTGG TTGGAGCTGC TTCGTGATGG CCGCCCACCC TGGCTCTCCT 1680
TTCTTAATAG GCTTCAGAAA TCCTGGAATG CGTAATTCAC CAGCTCACAG AGTTCCACCC 1740
ATGTCCCCAG TGGCTTCAAA ATGTAAATGA CATTTGCAGT GCTGGGAGGT AGGAGGGCGA 1800
TCCCGTTCCT TCCCTGGATC TCAGTCGCAG AGGTGCTGGC TCATGTGCCT GAGTGCAGCG 1860
GCTGGCCCGT CATTACTGGT CTTTGCAGGA AGCCACTCTG AAGGCACCTG GGCCCTTGCC 1920
AGGCTGAGTC ACAGCTGACT TAGGGAAATG CCACACAGGA CGCTTGCAGT CCCCCCGTTC 1980
TAAGCGTAGG TTTTGCAACT GCATACTCGG AAAATGAATC AGAGTGGGGG AAAGTGTCAG 2040
AGAAACAGCA GAAATGGAAT GTAGGCAGGA GGGCCACAGT GGCGCTGTGG ATTCAGACCA 2100
CACCTTCGGC TCTGTTTGGG GCCCTTCCTG TAAGGAGCGT ACTGATGCCA GAGGCTGGGG 2160
GTGTGGAAGG GAAGCTGCTG TGCTGTTAGA TCCATTCTGC TATTTAGCCA GCCTTCCTTT 2220
TCCCAGCTGG CACAGACAGG ATGTGTTAGA GAGGTGCTCA GACCTCCTTT CAGAGCAACT 2280
GAATCATTCT CCAGGAGGGA CAGGGAGTCT GAAATGCAAA CAGGTTCCCA GGGTTATTGA 2340
AGAGCAGCCA AACTGAACAC CCACTGCTCT GTGGACTCAA GCTGGTTTTA GACATTGTTT 2400
GGTCAGGACC AGAGCCGAGC TCTGGGGCCC ACTGGGGGCT CTTGTCGCAC CATATCATTG 2460
ATTCTACAAT GCACATTTCC CCCGCCTCTC ATGTTTTAAC ATGTCTGAAA TCAGGATGCA 2520
TCTTCCATGG ATGGTGTTTC AGGGTTTCAT TGATCGTGTT TTTCTTCCTG AGTGGCACAC 2580
AAAATTAATG GTGCTCCCTA GAGTTGATGG TCCCTGCGGT TCAGTGAACC GTGTTGCTCT 2640
TGTGTAAGCT CCTGTGGGAA CATAGAGTCT CTGTGTCCCA CCTTCTTCCT CGCAGTGGTC 2700
AGCACGGATG AGGTGGGAGT TGCATAAATG TCAGCATTCG AAAGTGAGGG CGTCTGTCGG 2760
TGCTGTCTCA CTGTGGGGCT TCAGAGAACG TGAGCACCTG TGTTTGCATT CTCCATCAAG 2820
GTTCATGTCC TGTTGGCTCA TAAGCATGAT TATATCCATT ATACAAACTG GGGCACAGGC 2880
ACCCAGAGAG AAGTCAAAAG ACTTGTTCAA GATGGACAAC TAGGAAGTGG TGGGGACAGA 2940
CCAGTCCTGT CTGATGCCAG ATCCAGCGCT GTATCTGCCA GTCAGCATGC ACACTTTCAT 3000
CTCTCCAGCC TCTTCCCACT CACCTTTACT CAACATTTCT GGGCCTCCAT AGTGATTGTA 3060
GTAATTCGGT AAAGATGATT CATTTCTTTA GTCCGGTCTT CGGACTTGAC TTCTTAGAAG 3120
CAGGTCTTGT GCAATAGTTG CATATTAACC ACTTGGTGAC ACAGTGCATG AGGGTATGCC 3180
AACTCTTTTT GCTCATGGCC GTGCAGTGCA GAATTTCCAG GCATTGTCCG CTCTGTTTCC 3240
TGGACTTCGG AGTGATAGCA AAGTTTTGTA TTCCCTGATC AGCTGTGTAT CTCTGAGCAG 3300
CAAGTTGATC TCTCTGTATA AGGGTGACTG TGCCCATGGA GGATGGCATG CAATTGCCTA 3360
AAGATTTCAG TCTGAGAATC TGAGAAACGA TACTGAATGG AGATGACAGG CTTAGTGCCT 3420
GCTTCCAGGA GCCATGCCTC CTCCTGGCCT GGAATGAATA CCTAAACACC TGAGGCTCTG 3480
AGTTCCGGCA GTGTGCTGAA ACTGCTGTTG GTCTGGCCCA CTGACCCGGA AACCCAGCCA 3540
CCTGAGGTTG TGACTTTAGG GCTTCTAGTT TTGTATTTAG CTTTAATTCC ATCTGTGAGG 3600
CAGTGGAGAC TGTTCATTTT ATTTTACATC AAAGGCTTTT GGAGGTTGAG ATGGGAACAG 3660
GATGATAGAA CAGTAATGCA TAATTATGGA GCATTTGCTG TATGGCAGGC ATTCGTAAGA 3720
GTGCATTTGT TGATATTATT GTTTGGCCTC TCCTGTCATT AGCCCTAAGC AGCTACACTT 3780
GCTAAGCTCT GTGCTAAGGC TGCAGTAAGC AGGCAGGCAG TGCGTGCTGG TGAGCTTGGG 3840
CAGTGCTGGA GTGTGTCTTG CCCAGTGTGG GGATGAACAT ACACCCTTTC ATGCTCACAG 3900
GTGCCTTAGC CTGGATGATA ATGTTTAAGT TCATTCTGTT TATATGCACC GTGTCATTAA 3960
ACAATGCTGT GAAAAGGGCA CTATTATTTC CCCCATATTT TCAGTGATAA GGCAGAGGCC 4020
CATGGGCTCC TTGTAGCAAT GGAGGCATTC CTTGAGGATC CAGGCAATCT GACTCCCGAG 4080
TCCCGGGGCT GGACAGAAGG AAGCTGGCTC CGAGAGCTAG ACTGCAGTGC AGAGGAATTC 4140
CACGCTCCGC AGGTGCTGTC TTCAGAAGTT GCATCTCGTC AGCAGGATGA GTGCTTTTGG 4200
AATAGACAAT CTTAAATGTC ATAGTGAGGT GACTTGCAGA GATAAGGAAG GACGCCAGCC 4260
TCAGGCACTG ACTGATGAAT CCAGATGGTG ACTTCCTCCT TGCAGGAGAA TCAGCCACTT 4320
ACACAGACTG GGAGGGATTC TACTGAGGGA AAAAATGAAT TCGCAGCCAG GGACAGTGGC 4380
TCATGCCTGT AATTCCAGCA CTTTAGGAGG CTGAGGAGGC AGGAGGATCA CTTGAGCCCA 4440
GGAGTTCGAG ACCAGCCTGG GCAACAGAGC AAGATCCTGT CTCTACAAAA ACAGAACAAA 4500
CCAACAATTA GCCAAGTGTG GTGGCACACA CCTGTAGTCC CACCTACTCG GGAGGCTGAG 4560
ACGGGAGCAT TGCTTAAGCC 4580