EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-04189 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:221880760-221883830 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr1:221883308-221883323TAAGAGCAAAGGTCA+6.02
Stat6MA0520.1chr1:221883041-221883056TTTTTCCAGAGAAGT+6.39
ZEB1MA0103.3chr1:221882463-221882474CCCACCTGCCC+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:221882798-221882819GGAGGTGGGAGGGGTGGGGGT+6.17
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04249chr1:221879916-221887014Brain_Anterior_Caudate
SE_05268chr1:221878604-221887069Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07639chr1:221879961-221893689Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08233chr1:221879013-221887264Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09465chr1:221874588-221887471CD14
SE_12905chr1:221880205-221884421CD34_Primary_RO01480
SE_13404chr1:221878901-221887413CD34_Primary_RO01536
SE_14214chr1:221880235-221887122CD34_Primary_RO01549
SE_20410chr1:221879948-221887157CD56
SE_26005chr1:221879909-221886983Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29951chr1:221881012-221885845Fetal_Muscle
SE_32563chr1:221880785-221882774GM12878
SE_36211chr1:221881262-221883601HMEC
SE_37566chr1:221880685-221883632HSMMtube
SE_48429chr1:221881330-221881946Psoas_Muscle
SE_48429chr1:221882148-221883690Psoas_Muscle
SE_51295chr1:221880793-221886889Skeletal_Muscle
SE_52175chr1:221881287-221883316Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54816chr1:221879956-221886079Stomach_Smooth_Muscle
SE_64034chr1:221881181-221883722HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1221881394221881826
chr1221882292221882723
chr1221881280221883173
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I221706chr1221880043221887540
Enhancer Sequence
ACCCATCAAG AAACCTCTTT TGGATGTGTG AATGCATGCT TTTGAGCTTA CGGCTCTGCT 60
CTGCCTCCCA CGAGTTATGG GTCTAGTATA AAAAGCTTAT AAACTGTGCT TATTTCTCCA 120
TTTTTAAAAT GCAAACCTTC CCCTGAACAA GTGCAATCTC ACTTTTGGGA ATGGATCTTA 180
GGGAAATCAT CTAACCAAAG ATAGTTAGCT AGATATATGG AGATGTTCAC TACAATGTTA 240
TCTGTTTTAT ATATATTTTA AAAAGGCCAA GTAAAACACA AAAATAAAAG AAAAAAAGTT 300
ATTACATTCA TTCCACGGAG TATTATGTAG CCTTTAAAAG AGTAGTTGCA AAAAGGATGT 360
GAAAATAAAT AAAACATTTT GGTTTAATAT TAAATTTTTT AAAAGCTAAG TAAAAAACAT 420
TGACCAAAAG CTGAAGAACT GTACAAAAAA CGAACAATTG TTTAAATTAG GGAATTTACG 480
GATCATAGTT TATTGTTTAA ATTTTCTGCT AATATTTTTA CACACAATGG CATGCACAGA 540
TAAACCCAAA GGATTATTAC AAAGCTCAAA TTATAATAAT ATACATGTAA GTGCTATAAA 600
ATCTGGATTG ACATTATTAG TGCCAACTGA GCTCTAACCC TACTCAAACA GAACTAGATA 660
CACTCTGGCT TTCCCTTTGA AAAGAGGGGG AAGTGGAAAA GTCCTATTAG CTGAAAGCCA 720
CCAGAACACA ACATCTACCC TCAAAGACAG ATGGCTTGTG GCTGTCTTGA TAGTTCCAGG 780
AGATAAGGCA GAAAACCCAA AGCATGAACA AGAGACGGTT ATGTTGCAAT AAGGACAGGA 840
AGTCTATCTG TCCACTAGCC TCTGAGCCTG GCATATGTTC TTCTCCATTT CAAGTCTCAT 900
CTTTGACAAA CCACAGCGGG AAACTCCAGA CCATAACCTA GACCGAGTCT CATGACTTTT 960
CACAACCAAT GGACCCGGAG CTGGCTGTGT AAAAGAGAGA AATCATATTT TCCTTAAGGT 1020
ATGGTTATGA TCCAAAGAAA ACTCAAAGGG CAATATTATG TTCACTTTAC TCATTGAAAG 1080
TAAGAAGTCA AAACCTACCC TAGCTTTTTG AAAAGAAAAA CAAGAGCTAT ATACGAATTT 1140
CAGTTGATTT CTAGAATTAA CCTCTGCCCT TACATATGAT AGTTTATTCT GCTAGGCAAT 1200
TATGACAATA AAGTTTGAAC CTGAAGAGAT AATTCTGAAG TAGAAGAAAG AAAATATGGA 1260
AAATAACTTC ACCAGTGAAG ACTTAAAAAA TAAATAAGAT AAAAACTACC CATTGTCATC 1320
ATCACAGCCT CCACAAAAGG GATTCTGAAG AGTTAAAATC TGCTCAGCTT CGCCTCCACA 1380
AAAACCCAAA TTCCACACAG ATTCTGTGAT GGGAACCTAA TTCACTTTTT TCTTCAAAAA 1440
AGGCAGTTGT TACATTTTTC CATATAAGAT GAGAGGGAAG AACAATAAAA CAAATTCAAA 1500
AGAAGGCTCT AAAAGCAGGG GAAAAACCTC TCTGTTCTTA TTTAGGGTAC TCAAGCTGTA 1560
ATTTGTCTTA AAAGCAGCTA GTTTAAAAAA AAAAAAAAAA ACCAACACAT GCTAGAAAAC 1620
CCCACACACA GAAAAAAGCA GCGTCCAGCT TTTTAAAATT CTGCCTCTAC ACCTCCTTTC 1680
TCAATGACAT CAGCTGGAGG CTCCCCACCT GCCCAGTTGC CATAGCAGTT ACACAAAGAC 1740
ATACAATGAC ATCAGTTGGC ATGATATCAG CTCTTTGAGT GCAAACAATA CAAGAAGAAC 1800
TACTTTGTTT AAGGCCTTTG GTGCAACTGT GTTCTGGGGA GCCAATGATG TAATGCTAAC 1860
AGGTGGCATG GGCCTTCCAT TTGCCTAATG GGGGGAAAAA AACCCGTGGC GGAGTGGGGG 1920
GAGGAGGGAA TTTGAGACAG ACACACAGAA TGCTCCAAAT CACAGAGCAT GCTTATGTGC 1980
AAAAGTATGG GTGCATTGTA TGTTTAAGCC ATGTAGGAAC TCTGTTCTTA TAATATTTGG 2040
AGGTGGGAGG GGTGGGGGTG GAGAGAAAAG GAGATATTAC AATTTAAACA TATAAGGTAA 2100
ACAAGGAAAT TCTCCTTGAG GGGTCTGAAG AAATAGTCTC CTGTTCAACT GCCACTCTGC 2160
TAATCAACTT GGGCATCAGT TTTCCATAAG GCTTATGCAC AGCTCTGTAC TGCAGTTAAA 2220
AACTCTCTCT GTGGACGGTG CTTAAAGTAA AAAACAACGA GTGGAAGCTC ACAGTGGTGG 2280
CTTTTTCCAG AGAAGTCTGC AGGAAGGATT GTTTTCTTCT CTTGGGGAAG GGTTGAAATT 2340
GAAATCTGGA GGGGAGGGGG AAGAGTAAAG CTAATCTGGT TTTTCTTTTC CAGTTACTTT 2400
CCTCCGACCC TACCCCATCA AGTATCACCA GAGGCCAAAG TGACTGATCA CTTAATGAGG 2460
AACCCTGATG ATGTTATGTT TATTACTATT TAAGAATATT AGAACATGAT AATTAACAAA 2520
CAAAGCAGGA GCAGTGTAGC ATGGAGGTTA AGAGCAAAGG TCAGAGACAA ACCACACCTA 2580
GCTGCAGTTA TGATTCTGCC TCCTAGCAGC TGTGAGACCC TGTGCAAGTC AGGTTCCCTC 2640
ATTAAGCCTC AGTTTACCAA TCTATTAAGT GGATGTAATA TCATCTACCC ATCAGGGTCA 2700
TAGTTCAGGA AGCCTATGTA AAGGTTTTGA TACACGACCA GGTATTCGAT AAATAATGTC 2760
TTATTACCCC CAATATCATC ACCTTTGTTC TAAATTCCAA CAGATCTATG CACACGCATA 2820
GTCCATGAGA GCCCTAAGTG CAGTGCAGTG ATTCAGAGAA GGAGTATTGA GGCTGGACTT 2880
CTTGGGTTTG AATCCCCAGC ACAGCCAAAC ACTAGCTATG AGACCCTGGG CAGGTTTCTC 2940
ACCTGTCTGT TCCTCAGTTT CCCTGTATAC AAAACAGGGA TAACAATAGT ACCTACCTCA 3000
CTGTACTGTT GTAATGATTA AAGTGGTTAA TAAAGTACCT TAAAACAATG TCCAGCACAT 3060
TGTAAGTGCT 3070