EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03986 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:208055890-208058060 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6671850chr1208057800hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:208056935-208056956TCTGAGTTTCAGTTTCTTTTT+7.9
IRF8MA0652.1chr1:208056939-208056953AGTTTCAGTTTCTT-6.03
IRF9MA0653.1chr1:208056939-208056954AGTTTCAGTTTCTTT-7.05
RUNX1MA0002.2chr1:208056449-208056460CTCTGTGGTTT+6.14
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03907chr1:208056217-208057280Brain_Anterior_Caudate
SE_03907chr1:208057743-208060627Brain_Anterior_Caudate
SE_12436chr1:208055742-208058024CD3
SE_13353chr1:208056372-208058013CD34_Primary_RO01536
SE_17929chr1:208055299-208058870CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_25552chr1:208055764-208062029DND41
SE_30242chr1:208057632-208059935Fetal_Muscle
SE_31189chr1:208055513-208062336Fetal_Thymus
SE_37661chr1:208057286-208068282HSMMtube
SE_39422chr1:208055123-208061722Jurkat
SE_41337chr1:208057654-208067896Left_Ventricle
SE_42838chr1:208057100-208066737Lung
SE_48845chr1:208057584-208063141Right_Atrium
SE_49854chr1:208055043-208065799RPMI-8402
SE_52485chr1:208055851-208056951Small_Intestine
SE_52485chr1:208056965-208057771Small_Intestine
SE_53314chr1:208055859-208060469Spleen
SE_55308chr1:208055966-208056385Thymus
SE_55308chr1:208056409-208057042Thymus
SE_55308chr1:208057094-208058064Thymus
SE_66285chr1:208055123-208061722Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1208056200208056291
chr1208056600208057564
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I207882chr1208055729208059920
Enhancer Sequence
TGACAAGAAT TTTAAAACAG ACAGCCATCA TAAACATGCT TTAATGAGCA ATTGCAGCAT 60
GCTTGAAACA AAAGAACAGA AACACTCAGC AAAGAAATAG AAGGTATAAA GAAGAATCAC 120
ATGCTTTGCT TGAGCCTTAA AAGAATCACT CACATTTCTG GAACAATCAC CCTCACTTTG 180
CTCCTGGGAC AAGGCTTCTT CCTCTCTCGG GAACACCCAT ATCTCTCCTT TTCTCCTCTT 240
TAACTCCTGC TTGACCAAAG GATCAGTCCA GACGTCACTT CTCCTGGGAA GCCTTCCATG 300
GTCTTCCACG GCTTCCATGC CCCTCCCACT CAGAGCTTCC TATACCATAG CACTTACACT 360
CAATGCATAT TGTTCTGTCA TCTGTCCCTC CCACATCCAC CCAATGTAAA GACTTGACAG 420
AAGGGACTAT GTCTTATCCC AGGTGCCTGG CATAGTACCT GGCTTATAAT AAGCACTCAA 480
ATATTTTTTG AATAAATGAA TAAATTAATG AATAAATGGA AACTCTTCTG TGGCTCCTCT 540
TCTATTGGAT AAAATTAAAC TCTGTGGTTT AGCTTTAAAC ACCCTACACA AACTGTGACA 600
CCCGGATCTT TCTGGTACTC GGCTTCCCTT AACACATTCT ACTTCTCTGT CATACCAGAA 660
AACACATTGT CCTTTGACAG TACCTTATCT TTCCCCATCA CTACATATTG TATGTACTCT 720
TCTATCAGTC TCAAATGTCC TTACTCATTA CTATCATCAA AATCGTATTC ATTTTTACAG 780
GACCCACTCA GAAACCACCT GTTCATGACC CAGTCTCAGA TCTTCTCAGC TGGAAAGGGT 840
CCTGCCCACA TCTAGATACA AAGCACTTCA TTTAGTCTTT CCTCGTGTTA TTTCTCACTT 900
TCTGTTGTGC ATTTTTTTTC TTGCTTCTTT GTTTAAATGT GTGTTGTATT ATCCCCAAGA 960
TTTAAACATT TGGGGTTCAA ATAAACTCAC ATCCTATTCA TCTTTGCCTC TGCCACTGTG 1020
CACGTAACAC AGTCCCTTGT TATTCTCTGA GTTTCAGTTT CTTTTTCTGA GATAATAGAA 1080
CCTACTTCAC AGGGTTTCTG TGAATGTTAA GTAAAATATG CTATTTAAAT ATTGGCACCA 1140
TATCTCAATT TTCATACAGT AAGCACTCAA AAACTGTTAG CTACTATCAT TGTAAATATG 1200
ATTATTATTT GAAGAAATAA ATAGACTGAG CAAGTCCTGT TACCTCTACT TTGAAACCAC 1260
TTTTTGAATT CTGCTTGATC TCATCACTGC CAATATGATC ACCTGCTCCC AGCCATGATC 1320
GTTCTTCTTG CTACGGTCTC CTTCTACTTT CTTATCCCTC AACCTCTATT CTCTACTCAG 1380
CAGCCAGCAT GATCCTTTTA AAACATAAAG CAGATGATAT GACTTCTCTG CTCAAAACCC 1440
TCCAGTGGCT TCCCAATCTA CAACTAAAAA GGCCCCATGT AGTCTGACCT CCTGCCTCTC 1500
CCCACCCCCA CTCACTGACA CAACCTCATG GCCATCTTGC CCCCTGCCAT CTGAGGCTTT 1560
CTGCACTTGG CAGCTTTTCA TCATAGGGCT TTGCACTTGT CCTTTCCCCT GTGTGGGATA 1620
ATCTCTCCCA GCTTGGCATA CAACCTGCTT CTCCACTTCA TTCAAGTGAA GCTGTGCTCT 1680
CCACTGTTAT TTTTCTAAAA GTAACCACCA TATGTAAAAT ACCAACCATT ATTCTCAATA 1740
TATTTTATGT TTTTCATAGC TCTCAATCCT GAAAACACAT GTATATACTT ACTGAGATGA 1800
CATTGTTTAC TGTCCTCTTC TGCTAGAATT ATAAGCTTCA TGAGTGTTTG CTGTATCCCC 1860
AGTCTCAAGA ACAGTGTCTG GCACATAACA GATGTTCTGG CACATTTCGC GCAGTGTCTG 1920
GCACATCATA AGACTTGATG AATGATTGAA TGGTGGCTGG AAGCCTCTTC GATGGGGGCT 1980
TTAGGAAGAG AAGCAGCATC CTGTTGCACA AAATCGATGA CCTATTACTG GTTTTGTGTG 2040
AAGAGGAAGT GTGGGATTAA TCTACCTAGA AGGGATGAGA TGGAAGTGAT CTATTTATCT 2100
GGACTTAGAT GGTATTCCCA TTTATCCATT CAGATGAAAA TCTGGCTGAA GATAATTCCA 2160
GATATGCTCT 2170