EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03927 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:206845340-206847680 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:206847320-206847331TTTTATGGCTT-6.62
IRF1MA0050.2chr1:206847243-206847264GCAAAGAAAGAGAAAGAAAGA-6.1
IRF1MA0050.2chr1:206846377-206846398AAACAGGAAGTGAAACTGACT-6.75
MEF2AMA0052.3chr1:206846059-206846071TTTATTTTTAGA-6.07
PHOX2AMA0713.1chr1:206845362-206845373TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr1:206845362-206845373TAATTCAATTA+6.14
RELAMA0107.1chr1:206845879-206845889GGAAATTCCC-6.02
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00569chr1:206845430-206847366Adipose_Nuclei
SE_26063chr1:206845203-206849485Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27575chr1:206846160-206847114Esophagus
SE_27575chr1:206847359-206849345Esophagus
SE_28475chr1:206844512-206849593Fetal_Intestine
SE_29888chr1:206844751-206846991Fetal_Muscle
SE_40319chr1:206844654-206848703K562
SE_40628chr1:206844652-206849539Left_Ventricle
SE_42239chr1:206844942-206849550Lung
SE_45992chr1:206845606-206849606Osteoblasts
SE_48619chr1:206844750-206847180Right_Atrium
SE_50514chr1:206845185-206847147Sigmoid_Colon
SE_52589chr1:206844796-206847319Small_Intestine
SE_54245chr1:206845387-206847187Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1206845391206846936
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I206671chr1206844732206849398
Enhancer Sequence
TTTTTTTTTT TTCATTTAAT TTTAATTCAA TTAATTAGAG GCTCTCTCTG GTGGTTTCAT 60
TTTGTTTTTC TTTACCTGCC TTTTTGGTTC ATATAGCGAG GACCCTGGAA CCACCTGCTT 120
CCTCCCTGCC ACCGCTTCTC CTCAGGTCCC CAGGGGAAGC CAGGATCTAA AGGATGACTG 180
TGTCACCATT GTCCTCAAGA TAATGGCTCC CTCCCCCGCT TCCCTCCACT CCTATCTCAT 240
TCTCTTGAGC CTGTGGAGTG TTCAACCTTT GTCCTTCGAG TATAACCCTT TACTGGCGAT 300
AAAAAATTAA AATACTGGCT CAACACCTCT ACTCCACGAA GCTGTTGTCT TGACCAAAGT 360
CTGAAAGCTG CCCCTCCTAC CCCTATTCTA ATCTTAGACA TTCCCAGCAC ATTCTTAGTA 420
AGAGGGAACT CTCTCTCATT GTCCTAGGAT TTTAAGTCTG CAAGAACTAC GCATTTTTTT 480
TTCCTTAGCA GAAGCAGTTG TACTTTTTCC TGACAACTTT GCAAGTTCCC CATAAAGTTG 540
GAAATTCCCT TCCTCGTTAC AGCTCTTGAT AGATGCAGAA GAAGCCTAGT CTGGACCTGT 600
CTTCTCTCCT GACCTGCTGT GTAACTCTTG GGAAGTTAGT TTAAATGTTT TTGGGCCTCA 660
GATCACAGAG ATTAACTTGA CTGGGGACAG ACTGAAGGCT GAAAAGTGTT TGGGAATGAT 720
TTATTTTTAG AGGACCTTGG GAGAAGGGTT TTACAAATGT CTCTAAGGTA AGAATAGCCA 780
TTTGGGGAGT TACCAAGACA CTTAGATTCC CCCTCCTGAA AAAATGAGTT TAATAATTTC 840
CATTGCTAAT TTCTATGTCC CCACCCTTTC CTCCAAGCCT GCCTCCACCC TCAGCTGTTG 900
ATTGATGGAG TAGATGTGCT CTACTCCCCC TCCCACTGAT GCACACACTT CTGGGAGGCC 960
CTATATAAAT AGAAGCCAGA GGCAAGGCTG CAGAATTATT ATTATCATTA TGATGATGAT 1020
TATGTTTTCA GCATGAGAAA CAGGAAGTGA AACTGACTAA AATGCCCAGT GATATGTGGC 1080
TGACCCTGTC TCCTCAGCTG GACCTAAAGG CAAAGGAGAA ACTGGCCAAA GAAAACTGTA 1140
GCCCTGCCAC AAGCTTTAAC AACTTCTGGT GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG 1200
TGCGTGTGTG TGTGTTACAA GGAGTGTCTT TAAATAAGCA GCTTCTAGAA CTTGTGATCT 1260
TTCAACCTTA TTTTTATGCC CAAGCTTCCC TCTTCATGTG ATATCCTCAG AGTTCTTCCT 1320
TACTACTTCC TTCCCCATTT CCTAGAGAGA GCTTCTCACG GCTGTCAGAA GATGTTAAAG 1380
GAGAAGTCCA ATGATTAATT ACTTCCCACT ACACATGCCT TATCTGCCCA GGCCAGGTCT 1440
GAGCTGTGTG CCTTTCTTGA TCACCGGGTC TGTCTCCAGG GCAGACATAT TCCCTGGGCC 1500
CCCAAGGCCT TTCTTCCCTC TCCCTTCAGG GGGCCATGTT TTCTCTTCTG CCTCACTGCT 1560
TGAGGCTCCA TCTGCTTGGT TGATTATTCA TGTCCTTTGT CTTTTTCAGG AATCGATTAT 1620
GGATAAATGG TAGTTAGAAA ACAGGGCTTC AGGGCCGATG TAATTATCCC ACTTTGACAT 1680
TTCCATTTTC AGCACCATGG CCTCTGGAAA CACTGACACA GTGAAAATGA CCTGATTTTC 1740
ATACTACCTT GTTAGTTCAA CTTCCTAGGG AGAAAAAAGC AGGCAGCTAT GTGGAGAGTA 1800
AATGAACCAA GTTGGTGTTT CAGAAACGCC TCCTCATTTG GACAATATTC TGAAAAAAAA 1860
AATGCATAGG AAACAGAAGA GAAAAAGGCA TCTGCGGGGG ATAGCAAAGA AAGAGAAAGA 1920
AAGAGCATTT CAGCTGTGCA GGGCATTGGG CTCACATTCT GGTCCCTGGG CCCACACCTT 1980
TTTTATGGCT TTCATACCAA GATCTCGAGC TAGATTAATA GATTATTGGA ATTTTGGGTT 2040
GGGAAAAACA TAACTGTCTT ATTCTCGCTA TAATTTTTTC TGAGCCTAGA ATAGGGGGTC 2100
CAGCGAAGTC CACCCAGGAG CTGGGATGGA GGATGAGGAT CATAACAAGG TACTTGATTG 2160
AGGAAGAACA ACTCTAGTAT GGAGCTTTAT GCCCCAAATT GCAGCAGTTA TGAGTCTTAC 2220
TCCCTGCATA GGAGAACATG GTGGCTGAGA AGACAGGTGT TAGTTAGGTC CCGGCTTTCT 2280
GCATTCAAAT CCCCACTCCA GACCTTACTT TAAGTTGCTT AAATTCAATG GGCCTCAGTT 2340