EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03645 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:198130360-198132760 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROG1MA0623.2chr1:198132201-198132211GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr1:198132201-198132211GACATATGTC-6.02
NFAT5MA0606.1chr1:198131299-198131309AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:198131299-198131309AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:198131299-198131309AATGGAAAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12078chr1:198131168-198131837CD3
SE_13489chr1:198130753-198132534CD34_Primary_RO01536
SE_14152chr1:198130201-198132468CD34_Primary_RO01549
SE_18461chr1:198125001-198132435CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19334chr1:198130271-198132189CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20665chr1:198130820-198132174CD56
SE_22590chr1:198130358-198132465CD8_primiary
SE_22590chr1:198132517-198140223CD8_primiary
SE_25720chr1:198130364-198132102DND41
SE_39571chr1:198130378-198132030Jurkat
SE_43314chr1:198131012-198131944Lung
SE_49934chr1:198129479-198132235RPMI-8402
SE_54238chr1:198130997-198132100Spleen
SE_59976chr1:198125149-198149177Ly4
SE_61128chr1:198124885-198149566HBL1
SE_62565chr1:198125065-198159352Tonsil
SE_66295chr1:198130378-198132030Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1198131265198132098
chr1198132277198132600
chr1198132600198132601
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I198161chr1198130394198132893
Enhancer Sequence
GTTGGTAGTG GGTAAGGGCT ACTTTTTCAA TCCAGTCTGC TTTTTTATAG AATAGTGATT 60
CACAATTTTT TTCTCTGAAG GATCACATGG TAAATATTTC TGGCTTTGTG AGCCCTGTGA 120
TTGCATCTGC TGCCATTGTA GCCAAATACA GTATCTGACC AAGTGGGCAT AGGTGTGTTC 180
AAATAAAGCT TTATTTATAC AAATAGGTTG GTAGCTTTCC CCCACTCTAG AAAATAATAC 240
CAGAGGTCTA AATGTGGTGC TATGCCATTG ATGTTTGGGT TGATTCGGAA TTTTCCACAA 300
CAGCGTTTTA TAATTATTTT TGTGCTTAGA CTCTTGTGAC AATTTGTTGA TCTTCCACAG 360
TTCCCTCAGA ATAATACCCA GCTGTCCATT CCCAAATTTT GTGTTTCATT TCAGAGTTTG 420
TCAGCATAAG AACCTCTTTT AGGTTTATCC ATGTTTTCAG GTTTCTTCAC CATTCTTTGC 480
TTCTGGAGGA TCCCACTCCT ATCCTGTGAC ATTGAATGAA TGCCTGTCTG TGGCTCCCTG 540
CTTCTGACTA AAGCGACATA GAATCTAATG TCAGTCATTT GTCTTTACTA AATGAAAACT 600
ACTAGACAAA GAAACATACC AAAACTTACT CATATGTTTC TTTGTCTAGT AGTTTTTATT 660
TTAAGCCTAC TGGTATGACT ACCTTTGTCT ACTTTAGAGG GAATTTTTGA CATAAGCAAG 720
GGGTTGGGCA AATTTTTTTC TTTTTAGGAA ACATTAACTT AGTCTTTCAA AAAAGACTCT 780
CCCCCGCCCC AGTAAAAAAT ATTGGAAAGA GCCTGTGCTT TAGCAGAGGG CCTACAGTCA 840
AGGTATGTTT GGCCTGGGGT AGAGGTACTT CTGACCTTTG CTCTGAAAAG AATTAGCTGT 900
AGACTTACCT GGGTGTAGCT ACTGAGTAGC ATAGAGCAGA ATGGAAAATG CAACAGCTTT 960
GTGAAAAAAT TACACAGTAC ACTTTCTCAG CTCTAGTCAG GAGTGGGTTT TGTGTGTGCT 1020
GGACTTTTGA CCCCTTAGCC CTCGGGGAAG CCCAGGTAGG ACCTGGGACA ATCAGAATTC 1080
CTGGCTAGTT GCCACCAGCT ACAAGCAGTC TCTTCTCTTT ATCTGACCCT GCTGCACATA 1140
TATTATCATT ATCTGTGTTT ACCATGATGT GGAAAAGACT AGGCAGAAAA CTCCAGGGTT 1200
GTCATTGCCT ACTTTATGAC CTTGGTTGAG TTGCTCATTT TATTCAGACT GTAGTTGTCG 1260
CAACTCATAA AGTTGCCTTG AGGAGTAAAT GAAAATACCT TTGTAAATGT ATGGTAGCAG 1320
GCCCAGTGTT AGTTTCATTT CACTTACTTC TCTATTCTTA GGACCTTCAG GGGTGGGAAA 1380
CACATCTCCT GTTGTCAGTT TGTTCTGATG ACAGGCCCTG TCACCCACTC TGCCTTGGCC 1440
CAGTTTTGTC TTAATGGGCT GCTTCCCACT TCTGCCATTT CCACTTCCTC TGCTTGAATT 1500
CTCCTTTTCC TTTGCCCTGT GATTTCCATA TTCAAAATTT AATGGTTCCT ACATTTGAGT 1560
TAGTTTTTAT GACTTTCTTT GGAGTGTGGG GAGAGCCAGC AAGCCATAGT TTCTCAGGCA 1620
GAAAAAGGCA CAAGAGGCTT GGGGGGTTAT ATTATGGACT ACAAATAATG TGAGTTGCAA 1680
AAAGATCTTT AAATACAGAT TCAAAAAATT GGCAAAATTA AAAATGTTCT TCCTAGCATG 1740
CTTAAAATTG TTTTTTTAAA TTGTTGAAAT ATTTCCCCTA TATCCTTATA TTTACCTAGG 1800
TGAATTACTA TACATTTTAT TATGGTTATA ATCATAACAA AGACATATGT CCTTATATTA 1860
TGGTTGGAAA AGTTGAATAG ATGTGTTTAT GAAAAATTGT TATACTTCTA AAATGTAATG 1920
AATTCCTAAT CTTGTATTGC CTTTATATCT AACTGCTGGA CCATATAGTA AAGTGATATG 1980
ATACCGGCAC AGTGGCTCAT ACTTGTAGTC TCAGCACTTT GGGAGGCCAA GGTGGGAAGA 2040
TTGCTTGAGA CCTGGAGTTC AAGACCAGCC TGATCAATAT AGTGAGACCC TGTCACTACA 2100
AAAAATTTAA AAAAAATTAG TTGGGCTTGG TGGCACGCAC CTGTAATCCC AGCTACTTGG 2160
GAGGCTAAGG CAGGAGGATT GCTTGGGCCT GGAGGATGGC TTGAGTCTAG GATTTCGAGG 2220
CTGCAGTGAG CTGTGATGAT GCCACCGCAC TCCCACCTGG TGACAGAGTG AGACCCTGTC 2280
TCTAAAAAAA ATAAAAAAAA AATTAAAAAA AGAGACACCT AGAATAGGTC ATTTGTTTTA 2340
TGCAAATAGT ATATCTTTAT TCCAAACAGT TTATTTCTAG GTGTGGTTTG TTAGTCAATA 2400