EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03430 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:181059980-181063830 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs61809230chr1181061916hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:181060936-181060951AAGGTTTAAAGGTCA+6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:181062659-181062674GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
RxraMA0512.2chr1:181060937-181060951AGGTTTAAAGGTCA+6.39
ZBTB18MA0698.1chr1:181062529-181062542AAGCCAGATGTTT+6.18
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15105chr1:181056193-181061697CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19769chr1:181057169-181060947CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21103chr1:181056102-181061155CD8_Memory_7pool
SE_26480chr1:181056179-181065825Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26792chr1:181057131-181060428Esophagus
SE_33995chr1:181058700-181060405HCC1954
SE_35128chr1:181055937-181060802HeLa
SE_36287chr1:181055984-181061603HMEC
SE_37490chr1:181055943-181060902HSMMtube
SE_37490chr1:181062754-181067645HSMMtube
SE_42499chr1:181057134-181060395Lung
SE_45106chr1:181063374-181064310NHLF
SE_51949chr1:181063387-181065765Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56661chr1:181063299-181064260u87
SE_59136chr1:181055404-181075537Ly3
SE_62708chr1:181056001-181122958Tonsil
SE_63411chr1:181057191-181103433NCI-H69
SE_63744chr1:181063301-181067532HSMM
SE_65054chr1:181056101-181060988NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1181060502181060611
Enhancer Sequence
TGCCTGCTTG TCTGTAATAA CCTGCCTGGG TTGGGAGGGA AGTGGGAGGA GGGAAACCAG 60
GGCCTGAGCT AGAAAATTGA AGGTGTGGTT CTTAGTATCA GTCATTCGCA GACTGAGGAC 120
ATTGTTTACT GACTCCACTA AGTATCAAGA GAGACACGTT TAATTTTTCC TCCTAGATCA 180
GAGGACTGCT ATTAGATACT AATATCGGCG ACCTGTCAGG TTCTAGAAAC CTGCCACTAC 240
AACTGCCTTT TCTAAGGTCA GTTTAGACCA ATTTGTCACC CAATATGTGG GTGTCTAATA 300
CTAAGTAATT TAACCAACTT TTGAAGCCCC GCTTATCCAC AAAAATGTTT TTCAGCAAAA 360
CTTTGTTTCC TGTTAAGCTA TTAATACGGG TCATCTTTTA GCTTTGTAAT TGAAAAAAAA 420
AAAGTTTAGA TAGTAGTTTA CCTTAAAAGC CCATTCGAAC TGACATAGGA AGATGAAAGA 480
GACTGACTTG TCCAAATTGT CAGGTCCACC TCTGCATCAC AGTGGATGTC AGGATGTAAA 540
TTTTCAGTTT TTCTCTTACA TCTAGAAAGT AAATATATTG CTGAGAGGGA AATTGTTTGC 600
ATCAAACCAG ATAAGGAAGG AGGGCTAGGC AAATTTAGTT CTCATTTAGC AAAACTTCCT 660
GATTTGTTTT GTTACTTAAA TGGTGACATC AGTGTTTGGT CATGGTAGAC ACTTAGGTGA 720
TGATAGCCAA AACATCCATC GATTTTACTA AAATCACTGC CATTAAGAGA GTTTTTTGTC 780
TCTTCATGTT CAATGTTTGA AAGGTATTCA GTAATCTATT TCAGAAGCAA ATCAATTAGG 840
GAATGGTGTT TATTAAAATA CGGTACAGTT GCCAGGACTT TAAAAGATGG TACTGGTTTC 900
TAACAACTTA CGAGTATATA GGGTATTTAA AAGATGGGAG AGATTGAAGA AAGACAAAGG 960
TTTAAAGGTC ATAGCCTTCG AGCATAAGAG GCATATGAAT GGTGTCTTGG CCTTAACTCC 1020
CAATTATACG AACTTCTGTT TTAGCTGAAT AGGCCAGTGC CTCGTGCCTT GATATTTCGG 1080
CAAATCTATT AGTGGTTCCT TAAGCATAGG GAACTTTGTA CTTTATGCTC TGTCGCCATA 1140
ATAATGTATT TATAGAATTA AACATTCTCA AATTAGGGTC TTGTTAAACT GACTTTTTCT 1200
TTCAGAAAGT AGCTACTTAA ATTCTGTTAC AGCTACAAAA GATCCATCAA GTGCTGACTG 1260
CTTAAACTGA AGAAGGTGTC CAGGGCCTTA ATTCTGCAAA CATTTCCTGT TGTTAGAAAG 1320
TATGATGCTT GAACAGCGAT CTCAGTGTAT TTTATGTTTT AAAGGGGGTA ACGTTTGGTG 1380
TGTTTAAGAG AGCTGATGTG TTTTGGATGA GACTAAAGTT GATCCTTGGT TTTACATTAA 1440
GATGAACCTG GGTCCATGTG TCTGCTTAAA GAATGTAAAT TGGCATACTT GATAGGAGGA 1500
TAAAGCTTTG TAGGAATTAG AAAAGATCAT TCTCTTTTTT GTTGCAGAAG CAGTATAGTA 1560
TAGTAGTTAG AGCATGGGCC CTGGAGCCAG GCTGCTTGGT GTCTTCCTTT ATTTATTTAT 1620
TTATTTAATT ATAAAAAGTA AATATAAAGT GAGCTATGTT GACCAGGTTC GTCTTGAACT 1680
CCTGGCCTCA AGCAATCCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCATGAG 1740
CCACCACAAC CTGGCCTGCT TGGGTTTTTC TATCTTGGCT CTGCCACCTA GCTGTGGGTC 1800
CTTGGACAAG TTACTTCATC TCTCTGTGCC TCAGGTTTTT CAAATGTAAA ATTGGGATAA 1860
TTGGATCTGT CTCATAGGGT TGTGAAAATT AATGAGTTAA TGCTCTTAGA AGAGTACCTC 1920
ATATGTAATA AGCACGCAAC TGTTAATTAT TGTTAATGTA GAAGTTAATT CTGTGTATAA 1980
ATCAGATACA CTGTGGTCAA AGATTTGTGT GTATTTGTAA GAAAAGAGGA GAATGGAGAA 2040
TCTATTTTTA AGTGGTCCTA TGTGTGAATG CTGGGTTCTT TTATTCCTCT TTTTCTCTGG 2100
ACACTTGGCA GTCAGGAAGC TTTGTTCTAC CAACATAGTT TTGTTGCTGT GAATGTCTCA 2160
CACCAACCGG ATGATTTTTC CAATTGTATC AAACAACTCT ATTTTCAGGG AGGAGTAAGC 2220
TGAAGTGAAA ACAGGCAAGG AGCAAAGTTC TTGTTGACAT ACAAATGCTT TCTGTGGATG 2280
AGTAAAGAAA AAAGTAGCCC ATAAAGTTAT TTTTGCTTGA ATTATTGCGC ATGGAATGTT 2340
TAAAACATGC TTATTGATAG GTTCTGGACA AGAGCCTTCC CAATGCCAAC CTAGGGCTAT 2400
CACACAACCA AATCAGATGC AGTGTGACTA GAAACGATGC CATGGTTTTA GTACCTAACC 2460
ACTTCTTCAC CACTCTGGGA GGGACCTAGT CTCTTGATCA AATTAACCTT AGCTCTGGGG 2520
TGTAAAAAAA CCTTCTGACT GCTGCGTAAA AGCCAGATGT TTAAAGTGCT TTCCAACAAG 2580
TACTCCAAGA AGATCACATT AATAGGGAAT AAAGTCTGGG CGCGGTGGCT CACACCTGTA 2640
ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC CGAGGCAGGT GGATCACCTG AGGTCAGGAG TTCAAGACCA 2700
GCCTGGCCAA CATGGTGAAA CCCTGTCTCT ACTAAAAATA TAAAAATTAG CCAGGTGTGG 2760
TGGTGGGAAA AAAGAGAATA AAGGGATAAA TGTTAGTAAT GTATTTTTTT TTTTGAGACA 2820
GAGTCTTGCT CTGTCACCCA GGCTAGAGTG CAGTGGTGTG ATCTCAGCTC ACTGTAACCT 2880
CTGCCTCCCT AGTTCAAGCG ATTGTCCTGC TTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG 2940
CATGCACCAC CACGTCTGGC TAACTTTTGT ATTTTTAGTA GAGACGGGGT TTCACCATGT 3000
TGACCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGACCTC CGGTGATCCA CCTGCCTTGG CCTCCCAAAG 3060
TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCACTGCCC CCGGCCTAGT ATGTACTTCT CAACCATGTT 3120
GTTTTAACCC TGTCTTCCCT TTTAGAAACC ATCATTTGTT CTTGGCGATG GGAACTAATG 3180
ATGGAAAGCC TGAATTGCTC CTCCAAGGTG ACTGGGTTTT CTTTATGGCA CCAAATAACC 3240
TTTCCATTCC TTCTACTCAT CACTGATTGG ATTTGGGAGT GTGAAGTGAG AGGAAATGGG 3300
TCATTTGACA ACTTTGGTGG AAAGCTTCTC AGAATAAAGA TGTCAGAAAT ATTGGGAATG 3360
AAATTAATAA TTATAAAACT GTTCCATCTT ATCACTGGGT TAGTCTGAGT CTCTCTTACT 3420
GCAACTTACT AGGCATGATA ACCTAGCCTC AGATCCTGTG TGATGGGGTC GACAGGCTAA 3480
TCCCACTGTG ATATGGCATT TGATGGACAT TTATTTCCTT GTACTTTTTT AAAAAAAAGT 3540
AGAGTTAGTT CAGTTCACTG AATAACCAAA GGATTTCTGA TCTCTTGCCC TAAATATTTT 3600
ATTCTTCTCC TGTTTGTGAA TTTTTTATTC TTCTAGACTT CCTTTTATCC CAGCAGTCCC 3660
TGAAAAAAGA CAGGAATGAA AAGAAACGCT GATCCAACCT TTCCGTGACT ATGAAAGAGG 3720
CCATTACTAT GAGGTGCAGT GCTCCGGTGG GGAGGGAGGC CTGCTTCCCA GGATTCCTGG 3780
CACTCTTTCC AGTAATGAGC AGTTTGTCTC TCAGCCTTTG AACCATTGTT CAAATTTAAA 3840
ATTCAACCCA 3850