EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03297 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:173299560-173303340 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs61828284chr1173299743hg19
rs17346536chr1173300840hg19
rs1342038chr1173301516hg19
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr1:173300016-173300027TTCTTATCTTT+6.62
Gata4MA0482.1chr1:173302720-173302731AGGAGATAAGA-6.14
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Lhx3MA0135.1chr1:173303178-173303191TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:173303182-173303195TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:173301679-173301692AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:173303179-173303192AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:173303183-173303196AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:173301678-173301691AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:173301682-173301695TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr1:173303186-173303199TAATTAATTAATC+7.34
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:173301776-173301791GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
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POU6F1MA0628.1chr1:173303184-173303194ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:173303188-173303198ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:173301680-173301690ATTAATTAAT-6.02
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POU6F1MA0628.1chr1:173303184-173303194ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:173303188-173303198ATTAATTAAT-6.02
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I173329chr1173298773173302010
Enhancer Sequence
CACAAAATAA TTAATACCTA ATTTTATAAG TGATAAAACT GAGGTTCAAA GAGGCTACAT 60
AATTTGCAAA ATGTCCAGCA TCTGGAAAAG GTCAAAGCAT TTTCTAACAG AAAAAGCAGA 120
TGTTGCCAAC TTGCTTAGTC ATATCCTGTG CTTCAGCACT CTGCCTCCCT GAAAAACTGA 180
AGCTCCTGAA ATACAGTAGA GCACAAAGTA GGTCCTAACT GGATATTAAT AATTATAATT 240
ATGACTAGCA ATGTGGTTCC AAAATTATAA ATTTTAAATC TGATATCTAA GCATAGTGAA 300
AGTGCATTGC AAAGGAGAAG AAATATAGAT AGAAAAAATG TATTTTAATC TAGTTAAAAT 360
GTCAAACTTC AGTATATTCT TACCCCTATT TAGCAAATTT TACTTCTTTA CCTTCAGATG 420
CCAATTTAAA ATAATATGCT TCTTTCTTCT TTTCTTTTCT TATCTTTTTT TTTTTTTTTT 480
GAGACAGAGT TTCGCTCTTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGCGCGATC TCGGCTCACT 540
GCAACCTCCA CCTCCCAGGT TCAAGCAATT CTCCTGCTGC AGCCTCCTGA GTAGCTGGGA 600
TTACAGGCGC CCACCACCAT GCCAGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTGGAG ACGGGGTTTC 660
ACCATGTTGG CCAGGCTGAT CTCGAACTCC TGACCTCAGG TGATCCACCC GCCTTGGCCT 720
CCCAAAGTGC TAGGATTACA GGCATCGGCC ACTGCACCCA GCCTTCTTTC CTCTTTTCAA 780
AACCCAGAAA GTAAAAGATG TATAGTCTCA GAATGTTGTG CCTTTCGAAT TCGTATTTCA 840
GTACTTCCAG TTTTCTGATC GAGTCTCAGT AACAATTACT GCAAACTTCT GTTTTTAAAA 900
GCAGTATTGT ATTTTGGTTT TCTTGGAAAA CACCACTGGG AAGGTACATA CACACTGTTA 960
TCACAATGAC GCATCTTCAA GAGGAAGTGA ACACATTTAA TTAGGACATG AAAGATTTGG 1020
AAACCTTAGT AGTCAAAAAT AAAACTAGAC ACTTCAGAAA GGAAATCTAA ACTACTTTCC 1080
TTTCAAAAGG ACTAAATGAA AGTTCATCAA AATAAAGTTA AGAGCCAACA CATGAAAAGA 1140
GCAAAGTGAT TAATGGTGTC CCTTCATCAA AACTTTTGGA ATTTAACAAA GATTTTTGTT 1200
CTTCAACTCA AAATTGGCAT CTCCTTCAGG GGGCAAGTTA CTATCACTTT TACTTACTTA 1260
TCTCTAGGAG CCTTAAGATA AAGAGAAAAA GTTTGCAGTC AGAAGACATG AGTTCTATTT 1320
CTTTTCCTGC AACTTGTCCA GCTGTGTAAA ATAGAGAAAA GAACAGATTT CTGCCTGATT 1380
TACAGAGCTA TAATGCCTCT CAGACATGAT AACATAGGTG AAACTTCTTT GCAAATAACA 1440
AAGCTCAAGA TCAGTGGTTC TCAAATGCTT TTGTTCCCAG GACATATTGG CCAATATCTG 1500
GAGACATTTT TGGTTGTCAT ATCTCAGAGT GCAGGTGCTA CTTGGCATCT AGTAAGTGGT 1560
CCAGGCCAGG GGTGCTGCCA AACATCCTAC AATGTACAGG ACAGCTTCTT ACAACAAAAA 1620
AATTACCCAG CCCAAATGCC AATAGTGATA AGGTTAAGAA ACCCTGCCTC AGACAAATGT 1680
AAGCTACTCC CAGCTTCTCA AGCAATGTCT GGGGCCTAGG GACATCTCCT AGGTATGCCT 1740
GAATGACTGT AATCCTGAGC AGACGTTCAC TGTCCTCTGA TCCAGCTGCT CTCACTCAGC 1800
AAGAGTGAGG AAGCAAAGTA GTCCTTCCCT TTCTGTCATG GCCCACAGCC CGAGGAGTGA 1860
GTTGCTGCAC AAGGGCTGAG GGGAAGACTA ACAAACCCTT GTCTGACTCA AACTTACTAA 1920
CACTCACTTT CCCTAGCTGC CTTCCAGGGA AACCAGCTGG TTGAAAACAT ACTCTCCAAA 1980
TGGATTGAAC ATGTAGCTAC TCAGGAGGCT GAGGCAGGAG AATTGCTTGA ACCCAGGAGG 2040
CGGAGGATGC AGTGAGCTGA GACTGTGCCA TTGCACTCCA GCCTGGGTGA TAGAGCAAGA 2100
CTCTGTCTCA AAATAAATAA ATTAATTAAT TAAATAAAAT AAACATCTGT TGGGCCAGGT 2160
GCGGTGGCTC ATGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC AAGGCGGGTG GATCACGAGG 2220
TCAGGAGTTC AAGACTTGCC TGACCAATAT GGTGAAATCC CATCTCTACT AAAAATACAA 2280
AAAATTAACC ATGCGTGGTG GCACGCACCT GCAGTCCCAG CTACTCAGGA GGCTGAGGCA 2340
GGAGAATCAC TTGAACCCGG GAGGCAGTAA GCCAAGATCA GGCCACTGCA CTCCAGCCTG 2400
GGTGACAGAG CAAGACTCCA TCTCAAAAAA ATAAATAAAT ACATAAATAA ACATTTGTTG 2460
CACATCCACC TGCTTTCCAT TGAGGAGGAT ATAGAAAATA TACATCTCCT GTTTAGTAAA 2520
TAAAATCTCT GCCATCACCA TATACAAGTT TAGAATTTAG TAAATGACAC AACACAAACA 2580
ACCAGTAAAG AATCCCAGAC AATTCTGTTC ATTCAAAATT ACATGCGATA TCACGCAGTG 2640
GCCAGGATAA AGACATGGAT CAGAAGAAAT GGAAAGGCCT TCAGGACACA AGGGGCAACA 2700
AAGGAAGGGT GGCTAGGATA GGTGTAGTTA ACTGTATGTT TCAATATGAC TTGACACAGG 2760
GTACACAGGC ATTTTGGCAA GCCTTATTCT GGGTGTGTCT GTGAGGGTGT TTCTGGATGA 2820
ATTAACACTT GAGTTAGTAA TCTGAATAAA GCAAATTGCC CTCCCTAATG TGGACGGGCC 2880
CCATCCAATC AGCTGAAGGC CTGAAAAAAA AACATAAAAG CTGACCCTCT TGCAAGTCAG 2940
AAGGAATTCC TCCTACCTGC TGCCTTCACG TTGAGACATC GGTTTTTCCT GTTTCCAGAC 3000
TCTGCTATAG ACTGAATGTT GGTATCCCCC AAAACTCATA TGCTGAAGCC CTAGCCCATA 3060
ATGTGATGGT CTTTGGAGGT GGGGCCTTTG AGAGGTTATT AAATGAGATC ATGAGGATGG 3120
GGCCCCCGTG ATGGGAATAG AACACTATTC CCATCATAAG AGGAGATAAG AAGAGGAGAA 3180
ACCAGAACCC CTCTCCCTCC AACTCCTGAG GACACAGCCA GAAGGCAGCT ACCTACAAGC 3240
CAAAAAGAGG GCTCTCAGCA GAACTCTACC ATTCAGGAAC CCTGTTCTCA GACTTTCAGC 3300
CACCAGAACA GTGAGAAAAA ATTTCTGTTG TCTAAACCAC ACAGTCTATG GTATTTTGTT 3360
ATGACAGCAT GCGCTGACTA AGATAGACTC AAACTGAAAC ACAGGCTTTT CCTGTGTCTT 3420
AAGTCTGCTG GCCACTGGAC TCCAGCTACA TCAGCTCTCC TGGTTTTCTG ACCTTCAGAC 3480
TCATATTGGA ACTATATCAG CAGGGTTCAG GGTTCTCCAG GGTTTCAGGG TTCTCCAGGG 3540
TCTTCAGCTT GCTAACTCAC CCACCTTCCA GATCTTGAGA CTTGTCAGCC TCCATAATCA 3600
TGTGAGCAAA ATTTCTATTA ATTAATTAAT TAATTAATCC TACTAGTTCT GTTTCTCTGG 3660
TGAACCCTGA GAAATGAATT CTGGTACTAA GATTGGTTCT AAGGAAACAG AATGCTAAGG 3720
ATTCGTGTTC TTAATTGGTT GTGGGTTTCT AGAATTGGCT CTCTAATCTG ATTATATTTA 3780