EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03016 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:160590690-160593880 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs164283chr1160590765hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr1:160591006-160591017AAATCACAGCC+6.02
RESTMA0138.2chr1:160591771-160591792AGCACTCTCCTAGGTGCTGTA-6.76
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11148chr1:160587458-160597883CD20
SE_11987chr1:160591567-160592329CD3
SE_11987chr1:160592349-160594427CD3
SE_14605chr1:160592524-160594622CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15558chr1:160592682-160594593CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16992chr1:160592686-160594066CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17914chr1:160590964-160618183CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18278chr1:160590659-160619197CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19140chr1:160590733-160597709CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_25548chr1:160591270-160602519DND41
SE_30951chr1:160591362-160605178Fetal_Thymus
SE_32518chr1:160591029-160598347GM12878
SE_53267chr1:160591360-160592050Small_Intestine
SE_53267chr1:160592531-160594139Small_Intestine
SE_55114chr1:160593174-160593627Thymus
SE_60518chr1:160576136-160655079DHL6
SE_62055chr1:160575586-160612324Toledo
SE_62257chr1:160575404-160656474Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1160592866160593252
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I160621chr1160591446160605374
Enhancer Sequence
GCCACATGTG GCTAGTGACT ACCATATTAG ACAATGCAGT TTTGGATATT TGCTATACTT 60
ATATAGACTT TTTTCCACAC AAGAGGTGTC ATTCTGCACA CACTTCTCTG TAACTTGATC 120
TTTTCACTTA AAATGTATTG AGGACATTTT TCATGTTAGC ACAGTAGACC TATCTCATTC 180
TTTCTAAAGT TGCACAGTAT CCTTTGTATA CATCATGCAG CAGTAAGGAT GGTGGGAAAG 240
TGGCAGACTG AAGGATGGAG GTTTATTATG GGATTATTGC AAAGTCCAGG CAGAGGCAAT 300
GGAGGCTGGA CCCAGAAAAT CACAGCCTTT AAGGTAGACT TATTTTAACA CCAGTTAATT 360
TATTCTCTTA AAAAACTGGG CTGGGTGCAG TGGCTCACGC CTATAATCAC AGCACTATGG 420
GAGGCTGAGG TGGGCAGATC ACGAGGTCAG GAGTTTGAGA CCAGCCTGGC CAACATGGGG 480
AAACCCTGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAT TAGCCAGGCA TGGTGGCACG CGCTTATAAT 540
TTCAGCTACT CAGGAGGCTG AGACAGAAGA ACTGCTTGAG CCCAGGAGAC AGAGGTTGCA 600
GTGAGCCGAG ATCATGCCAT TGCACTCCAG CCTGAGTGAC AGAGCAAGAA TCTATCTCAA 660
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGGCACATCT CTGAGGAAAT AGCATTTTTA GGAGAGGCAC 720
ATTTTTCTTT GGAAGGGAAA GGCCCAGTGT GTATGTGGTG AGCATGGTGG AATGTGCTGC 780
GTGAGGGTGT GAGTCTTGGG GAGGAAATGT GGGGCAGACA CTGATGAAGT TCCAGGAATT 840
CAAGGAAAGT CAACATGGGA TTTTTTGTGT GTGGGTATGA GCACGGTGTG CCTAGTGGTT 900
TCAACTTCGC TTTTTTGGTC AGAGTTGATC CTGACTGAGG AGTGTGCGTG AGTGCGTGTG 960
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAAA ATGGAGGGGA GGACTCAAGA AGCAGTTGGA 1020
GGTAGCAGAG GAGGTTCAAG TTAGTCCCCA CGAGTGTTTG CAAAGTAAGA CATGCCTGCC 1080
CAGCACTCTC CTAGGTGCTG TAGTGGCTAC AAATAGAGTA GAGAACAGAC TACAGTCCTC 1140
AAAGACTTTC AGTCTTGCAG GTCAGCTCAG AGTCAAATGT AGAACTGGAA GGACAGTCCT 1200
AAATGGTCAG ACAGATGGAA GAGGTGAGGT TGATTGTTGC TGCTTAAAAG GACCATTGGA 1260
CCAAGATAAT TTAGTCTCAG GTTATTTTCC CCAGTGCAAG AACAGGTTTT TAGGAGTAAG 1320
CTTAACTCGG CTCCAAGTCA GCAAGGTCTT AGGCTCTAAG GAAAAAGTCT TGGCCTTAAA 1380
ATTAGGACAT CTACATTGTA GCCATCATTA GCTGTGTGGC ATTGGACAAA TCACGTCATC 1440
TCAATGGGTC TTTTCTCTTA CCATAACTGT AAAATGAGGG CATAGAGTAT CTAATATCCT 1500
TTTCAGCTTT TACCTGAAGC ATAAAGTCTT ATGTTACCAT GACTTAAAAT ATTTTCAATC 1560
TGTTCTAGGT ATTGTTTCCA GATGCTTCCA GTGCAGCTTC TCCTGGCCAT AGCACTTACA 1620
CATTGCCATT TTAATTCATC TACACTAAGA GATCTGTCTA TCTGTCTATG TATCTATCTG 1680
TCTATGTATC TATCTATCTA TCACCCATCG ATGGGAACCA CTGTGTTCAG TGTTTTCTGT 1740
GTATTGATAC CAATCTCCAC CACAATACCA TGAAGTACAT AGTATTACCC CTGTTTTGCA 1800
GACGAGAAGT TAAGTCATTT GATCACACAG CTTGTCAGTA GCAAAATCTG CATCTGAATG 1860
TAAGTTTGTC TAATGCCTAT ACCCACATTC TTTATCAGTG TATTCTCCTG GACATGAAAT 1920
TGCCAAAGAG TCATGAAATT GAAAAGCCTT CAGCGTCAGG CTGCATTCTG ATGATTATAG 1980
CATTAGAAGC TGCCAATATA ATTTCTTTAG CAAGGTTTTA TGAAAGGTGC AGCAACTAAA 2040
TATAAATTTT ACCGCAAGTT TGAGGCAGTT TTGTGTGTTG CTAACTTACA AGGGACAAAT 2100
GGTGAATGGG GTTGAGGTGA GGATGGGTAT GTGTGTTGGG GAAGGTAGTG GGGAATTGTG 2160
GGATGGGGAG CACTATTCCC TTAGAGCACA ACCATGTGAT AAGCCAAGTG TGGTTGAGGA 2220
AAGAGTATGG CGTAGGATCC CAGCAATTTT ACTAGGTAGG TTAATGTGGA TAAGTTAAGT 2280
TCAGTTTTCT CATCCTGGGT CATCTCACTA TTTCCTTATA GTATGAGCTA AATGTGATTG 2340
CCCTACCCCG AGCCCCATAG GCTGTCAACC TAATTTCTAT CTGAATCACC CATCCCTCCT 2400
ACCTGGCTAA CTCTTAGATG GAGGAAATGA GACACAAGTA GGTCGCTGTG CTATGATCTA 2460
GATTTTTTTA TATATGCAAA ACCAACATCA GAGTGCTGAG GTAAGGGCTT TTCTAAGAAG 2520
GTTGTGTGTA GATGACACTG ATCTACTTGA GAATGAAATC AGTCATCAGC TCAGTGTTAT 2580
GAGGATCAAG TTCTATCCTT ACCATGGGAA GGCAGCCGGG GCATCTCTCC TGGTCTTGGG 2640
TCAGGACATT TTGACTCCAG TATTGGTTGG TAGTAGTCAA GGTGGCTGAG GGGAGCACAA 2700
TGCCCTGAGA TATTGTATCA TAGGGAAATT TGGAAGAGAG GACAGGGGAT GGTACCTCTA 2760
GGCACTTCAA CTGCAGGGGA ATAATTGTGC CTTATTGGTT TCATTCTAAC CCTGGTGACT 2820
TTTTGGATGA GATCCAATAA TTTTCTGAAT TCTGTTCCCA GTGAATACTC TTAAACCTCT 2880
TGTTCACTTC TTCAGCATCC TGTGTTTACC CTGATGGCAG TGCTAGTCAC ACTAAACTGA 2940
AATTATCTGA ATAATGTCTC TCACATTAGA AACCTGTGGC TCTTCTATTT CTTTCCACAG 3000
CCTAGTAGAG GGGATCAAGA CATGTTGAAT TAGACTGAAT TAAGCAAGGT CCCAGGATAT 3060
GTTTATCTAC TATTTTTGCA AAGGTGGCCC CATGCAGAAA GCCAGAGTTG TGAGAGCAAG 3120
TCCGAGCCTG TGGAGAGAGG TCCCCTGCTT ACCACAGAGA GTGTGATAAG AATCTATTTA 3180
TTGCCAGACA 3190