EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-03011 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:160536770-160539320 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2AMA0052.3chr1:160538414-160538426TTTATTTTTAGA-6.07
NFYAMA0060.3chr1:160536858-160536869GACCAATCAGA+6.14
NFYBMA0502.1chr1:160536853-160536868GCCTTGACCAATCAG+6.19
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:160538629-160538644TGAACTCCTGACCTC-6.22
TFAP4MA0691.1chr1:160537139-160537149AACAGCTGAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10005chr1:160536907-160538458CD14
SE_10005chr1:160539031-160551048CD14
SE_12204chr1:160533910-160543479CD3
SE_14592chr1:160534566-160542076CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16639chr1:160535164-160539766CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18505chr1:160533926-160551498CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19857chr1:160535636-160542014CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20900chr1:160536381-160538653CD8_Memory_7pool
SE_22621chr1:160533246-160552335CD8_primiary
SE_39746chr1:160535581-160538559Jurkat
SE_39746chr1:160538581-160541347Jurkat
SE_62435chr1:160508390-160552171Tonsil
SE_66367chr1:160535581-160538559Jurkat
SE_66367chr1:160538581-160541347Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1160537046160538964
chr1160537909160538272
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I160565chr1160535191160540204
Enhancer Sequence
TCAATGAGGG CTCTTTAGTG AGAAACACTG TTTGGGGCAA GCATAGATGA TATCCAAAGT 60
ATTTAATAAC CAATATGACG TGGGCCTTGA CCAATCAGAA AGGGTGTTAG CCATAAACAA 120
ACTAGTTGAG CGGTTCTGGT GTGTACTGGT TGCATGTAGG CTCTGATGAC CAGACATCAG 180
TTTTCCACAT AAGTGGGTTC AGGTTGACCC TAAAGTTTAT CCAAGGCTTG GTATACGGAA 240
GAATAAGGAT CATAAAGTAT ACACGTCCCT TGAAAGTGGC ACAAAAAAAG CGATTTCTTA 300
ACCTGATGGT GTTGTCTCAC TATGGCTACC CTTGCTCTTC AGCTCAGCAA CCACTGAAAG 360
AGCCCCAGGA ACAGCTGATG TAAAGCTCTT TCCTTTCTGA CCAACAGAGA TTTTCCCGTA 420
GGAGCAGTAT CCGGGACAAG GCCTGAGGAT TTAGTTGGGG GTTGGCTAAG TACAGAAGAT 480
ACAACAGGGT GGGGAGTATG TGGAGTGGGA GTAGGAAGGG GGAAATTGGG AACCCTTATC 540
TGCAAACATT TATTAACTGC TAATTATGTG TCAGATGCTG TGTTAGGGAC ACAGGGATAA 600
ACAGGACATC GTTGCAGCCC TGAGGAGCTC ACAGCCTAGA AAATAAGACA GATGTGGTCA 660
CAAGTGAAAG ACAATACAAC ACGATGAGTG CTAAATGGTA AAAGCAATAG AAATAAGCCA 720
TTGGGGTAGC GGGTCAGAAA GAGGCTAATG CTGCCTTTGG TGGTAAGAGT CATAGTTTGC 780
CAAAATTTAA GAACATTAAT TCTTCCCAGA TAAACTGTTT TTCTGGGCTG ACGGGTTCTA 840
GGAGAGGGGT ATTTGGAGTG TCCCAGCGTG AATCCCTGGA TGGTCCAGGC ATGGGCATGT 900
GATCTATGCA GTTGCACAGA ACCCTGAATT CAAAAGGACC CTGAACTGGA CTTAAGGCTG 960
CGTTGCCACC TTTAAATTCT ACATACTATT TAAACAAGGG GCCCTCCATT TTCGTTTTGC 1020
ACTGGGCCTC GCAAATTATC TAGCCAGTCC TGGTCTCAGA TCTCCCACGT CTCAAGTCTT 1080
TTTTGAAGTC AGGCCCTAGT GCTTAATTGC CACACCACTC TGTGGATTGA GATTAGGTGT 1140
GAGGAGAGAG ACAGAACATA GATTCCACAG ACTCGTAATT TTGCTGGGTT CTCTCACTAA 1200
ACCCCAGGAA GTATGTAGGT AGATTGTTAA GGCTGAGACC TTCTTAATAT TAGGGCCGTT 1260
GAGCAGCCAC AGTGGTTGGT GTGTGGTGCA GTTTTAAAAG TATGTCTCAT CTCCTGTAGC 1320
AAGTCATTCA GGAAGTGTTG GTGGGGTATC AAAGAGCAAT CAGGCAGTGG GGGTGGTGGG 1380
TAGGCAAAGC TGGGGGAAGC TGTTATTTGT GCTGCTGGTG TTGTTGGCAA GAATACTTTG 1440
CTTGCTGGAA AAGGCAAAGG GGTTGCACAT GTTTAAGATG AAGATTCTGC CACCTTCAAA 1500
CACTCCAACT GTGCTCTGAG AGAAGCAGCT GCAAAACCAT TGCATGCAGT GGAAAGATAG 1560
GGAGGCAGAA GGTGTAGGTG CAAGTACTTC TACTTATGAA CTGGACAACC TTAACGAGGT 1620
CACAAAACCT TTCTTATTTA TTTATTTATT TTTAGACAAA GTCTCACTCT CTCACTGTCA 1680
CCCACGCTGG AGTGCAGTGG AGTGATCTTG GCTCACTGCA ACCTCCACCT CCCGGGTTCA 1740
GGCAGTTCTC CTGCCTCAGC CACCCAAGTA GCTGGGATTA CAGGTGCATG CCATCACGGC 1800
TAGCTAGTTT TTGTATTTTT AGTAGAGACG GGGTTTCACC ATGTTGGCCA GGCTGATCTT 1860
GAACTCCTGA CCTCAAATGC TCTGCCCGCC TCAGCCTCCC AAAATGCTGG GATTACAGGT 1920
CACAAAACCT TTCTGAACCT CAGTTTCTTC ATCCATAGAA TGAAAATAAT AATTATGCTA 1980
TTTGTCCTGT TTGGTGAGCA GCAAATGATG TAATATGAGT AGAAATGCTT TGCTGATCAT 2040
CAAGGTAAAA TAAATGTTAG TTATTTCTGG AGTTGATACT GATATATTAA CATTCATCGT 2100
ATGTTCTTTA TCATCACTTC AACAATTGGT ACATGCCCTT TGGGCCTGCC CTAGGCCACC 2160
CTTATGATGG CGTTGGTGAT GCCGGGGCCA TACTGGAGCA TATATCAAAA GCCATTTTTA 2220
AGGGCTAATT CAAGTAAAGC CTGGAGGGAC AGTTTCAGGT ACCCTGGATA GACTTTATTC 2280
TGCTCTTAAA AGATTTTAAG ATTTAAAAGA AAGAGTGTCC ATATCAATCA ATCCCAATAT 2340
TTATTTTTCT GGGTGCTAAA GGGACTCTAA CATTATGTTA TCACTGGAAG TGACCTTAGT 2400
AAAATCTAAT TTCAGAGATA ACTTGTGGCA CAAAAACATC TTGAGGACTT ACCATGAAAT 2460
GCACTATGCT AGTCTATGGC AAAGACAGAT TCTCTGCCTT TCGGGGGGAA TTTGATACCC 2520
GGTTAGGGAA ATAAGATACA CACACACACA 2550