EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-02884 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:156455910-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 78             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
CCTGGGCCTC CTACTGGTAC CCTGGGACAA GAGCAACACC AGCCCAGCCA GCCCTGAGTG 60
GCCCAGCAGA CACCTGAGCC CCAAACCAGC TCCAGACACC CCATTCCTCA CCTGTGACCC 120
CAGTGTCTGC CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG GGATTTCAGC TCCCCTGCTT 180
CCCAGTGCAA TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA 240
AGGTAGGGGA GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA CAAATAGTTG GCTTTTTAAA 300
TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA GGAACTGCTG 360
AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT CCCTCTCACC 420
ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG ATGACCAATA 480
CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC CTCAGAAAAG 540
TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT TCTGTGCTTC 600
TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA TCACATCTGT 660
CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT TGAAAAGAAG 720
AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT AACCTCCAAC 780
AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC 840
TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT GGTATCCCAG 900
TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT AAAGTCTTCT 960
AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC AACTGTCGCC 1020
TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC CTCATGCTGG 1080
GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA GAGATTCACT 1140
GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC TATCCCCACT 1200
CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC 1260
ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA 1320
GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT 1380
TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA 1440
ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT 1500
ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC 1560
CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC 1620
TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC 1680
TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT 1740
CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG 1800
TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG 1860
ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA 1920
TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG 1980
CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT 2040
GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG 2100
GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG 2160
TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA 2220
GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA 2280
AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC 2340
CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC 2400
CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT 2460
TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA 2520
GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG 2580
AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG 2640
TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC 2700
TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT 2760
AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC 2820
CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA 2880
CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG 2940
AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT 3000
GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG 3060
GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC 3120
TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA 3180
GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT 3240
CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC 3300
AGACACACAG ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA GAAGGCATTA 3360
TGGGGCAGAG GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG CAGGAGACCA 3420
CAGAGACAAA GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA GACAGGTTCA ACAACGGCTT 3480
CCAGGACTGA CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA ACAGGACACC ATCCCTGCCC 3540
TCTGAGAACT TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG GGGCAGGTCC CACCCAGGGC 3600
AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC TGGACCCAGA CACAGCCCCA 3660
GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG AGGACCGAGG 3720
ACCAAGGACG ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG CCTTATTACC CAGTCTACCC 3780
TCAGGTTCAC AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC 3840
TAGTACAGAG ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA 3900
TGCCCCCAAA CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT GTGGTTCACA CAGTGAGCTC 3960
TTCCTTCACA AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC 4020
TCACATTGTC CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC TCACAACCCC TCCTGCGAGG 4080
CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC 4140
CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG 4200
TGCTTCTAGG GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC AACCCTTCAA AGTTCTGTCT 4260
GGCAGGCTCA CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT CCCTCCCTCG GGGACTCCCC 4320
TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT TTTAGCCTGG GCACTGAGCT 4380
AATTTTAACT 4390