EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-02854 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:155943960-155947850 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:155945882-155945900GGAATGAGGCAAGGAATG+6.3
KLF4MA0039.3chr1:155944110-155944121CCACACCCTCT+6.02
Myod1MA0499.1chr1:155944747-155944760GGGGGCAGCTGCT-6.03
PLAG1MA0163.1chr1:155947698-155947712GGGGACAAAGGGGG+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155947633-155947653GGGGTGGTGGTGGTGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr1:155947542-155947562ACCCCAGCCACCCGCCCACC+6.3
ZNF263MA0528.1chr1:155947307-155947328GGAGGAGGAGGAAGGGCAGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr1:155945257-155945278TCCTCACTTCTCCCCTCCCCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr1:155947310-155947331GGAGGAGGAAGGGCAGGGAAC+7.1
ZNF263MA0528.1chr1:155947304-155947325GGGGGAGGAGGAGGAAGGGCA+7.39
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155943468-155954747Aorta
SE_02626chr1:155944686-155950278Astrocytes
SE_03231chr1:155943838-155950206Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155943981-155947946Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155944922-155954549CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155943238-155950634CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155943527-155950426CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155943689-155952043CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155944387-155954735CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155943880-155954619Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155943540-155954349Esophagus
SE_29653chr1:155943497-155954685Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155943835-155950402Gastric
SE_34744chr1:155944639-155954826HeLa
SE_36575chr1:155944054-155950067HMEC
SE_37367chr1:155943411-155954717HSMMtube
SE_39002chr1:155943945-155954683IMR90
SE_40164chr1:155944018-155954524K562
SE_40938chr1:155943868-155954680Left_Ventricle
SE_42293chr1:155943432-155954731Lung
SE_43728chr1:155943835-155954686MM1S
SE_45406chr1:155945111-155946504NHLF
SE_45406chr1:155946520-155950447NHLF
SE_47089chr1:155944170-155950162Ovary
SE_48803chr1:155943444-155951076Right_Atrium
SE_50236chr1:155943456-155954539Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155944861-155946413Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155946616-155947212Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155943486-155954414Small_Intestine
SE_53512chr1:155943435-155954278Spleen
SE_55468chr1:155943829-155945106Thymus
SE_55468chr1:155945161-155949969Thymus
SE_56150chr1:155944721-155954706u87
SE_57594chr1:155947238-155949021VACO_503
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_60754chr1:155943974-155952549DHL6
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155944167-155946550HSMM
SE_64071chr1:155946602-155947446HSMM
SE_66797chr1:155943888-155945154Jurkat
SE_66797chr1:155945231-155946165Jurkat
SE_66797chr1:155946303-155950580Jurkat
SE_67350chr1:155943835-155954686MM1S
SE_69165chr1:155944816-155949957H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1155946363155946660
chr1155945743155946196
chr1155945200155946600
chr1155944562155945214
Enhancer Sequence
GCCACTGTGC CCAGCTCTCT CAGCTGCCTT TGCTTCTCTC TCAGGTATGT CCAAATCAAG 60
ACTTCTGGGA GAGTCACAGA GTACTCAGAA TCACCTCTCC TCCAGCTGTA CCTGGCAGCA 120
GCCCCTTCCC CAAGATGGTG ACACCTCTGT CCACACCCTC TGTAATAGTG ACCGGAGAGC 180
CTGTGGAGCA TTCCACCAGG ATTCGAGTCA CCTGTGGCTC AGCCCCTGTA CAGCAGAGGC 240
GCCGTTGGCT ATGAAGGGCA CTGAGTCCTG GAGGAGGAGC TATAGGGCTG GGAAATGAAG 300
AGGTGAGGGA TTGCTGGGGG TGGGACTGAG AAGAGGGCTT GGGGTGGTCT CAGCCGGGCC 360
CTGCTCCTTT ATGAGCTTCC AGGGACAAGA TGAAGACAGG AGGCAGAGGG GAAGGCAGCC 420
AAGTGGAAAC ACTAATGCCA AAGCCAGAAA CAACACAGAA AGACATCACT GCACACACAA 480
AGGCACTTAA TAAATGCTTG CTTAGTGAAT GAAGATGAGA CACTGGCAAT GGGAGTGGGT 540
ACGGGTGAAA CGGAAGAGGA TTGCTAAGGG CCACAAGGAA TAAATCAGGT TAGGGACCCT 600
GAGACCCAAG CATCCTGGAA CCCAGCCTGC CCCCTACGCG GCCACACCTG TCAGGCCAGG 660
AGAGAGAGAC AAGCAGAAAG AGAGGGGGGG TAAGCGATGC AAACAGACAG GCATTTGTGC 720
AAGTGAACAA TAGCTGTGCC AGGACTCCCT GCCCTCCTGG CACAAGGCAG GCCGGCTGGG 780
TTGGGAGGGG GGCAGCTGCT GCCTGCAACC CCACCCCCAC CCTCTCCCAA AGAGACATAA 840
ACAAACCCGG AAGGGTCCAG CCAGCTCCTC TCAGCCTTTT CTCTTACCAG CTTCAGAAAT 900
CCTAACCAAT CCGCTCACTC AGCTCCTAGA TGATATTTCC AACCAGAAAC TGAAGCTAAG 960
GATGAAGCTA CTTCCTCGTG GCCAGAGAGC ACGAACCCCC TACTTTGCTG ACCACTGTTC 1020
AAAACAGTAG CCCAGAGCAT CTGGGTACAG AATAGGAGGG CAGGCAGGCA GACAGACACA 1080
CTGACACACC AGCACACCAG TAACATGCAC ACAGGGGATG CACACATTCA CATCTGTCCC 1140
CTCCTTGATT CCAAGGTCAA ATTCCACAGC CAGAGTGGCT AAGATCAGAC CCCACTGTAA 1200
CTCCTCTGGT CGGCCTCAGT AGGTCCTTCT CTAGGCCCCA TCTAACCTCC TGCAAGTCAC 1260
TCAGTGACTT CCCTAAGCTT TAGACTCCCT TCCCCTATCC TCACTTCTCC CCTCCCCCTC 1320
AACTCTCTCC CTAACCTCCA CGACCCCTAG AATTTTTGTC TATGTCCCCA GAAGCCTCAG 1380
CCACCAGGAG GACCCCCCAT TCTTCCACTC TCCTCCAACA CCGTCAGCCC TCTCAGCTCC 1440
CTCCTGGGCT CCCCCAGCTC TCCTCTCCAC TGCACTCCTA GTCCTGCACA CAAAGCCAGC 1500
CACCTCTCCA TTCCTCAGAA CAAAGAAATA GTCGCTCTGC ACACTCCCCA CTCCACCTGC 1560
CCACCACAGA GATTCCAAGG GGACCCCCAG CCTCCACAGC CATCCCTGGA CCTCTGGTCC 1620
CTGCTTGGCA GAAAAGGACC CTTTGTTCTA AGGGATATGA TGGTTGGGGT TTGGGAAAGG 1680
AGAAAGGGAA GAACAGGGGA CTAAAGAGAG AAAGGGGACC TGTGAGGTTT GGGGCTTGTG 1740
GAGGTAGGAA GTAGAGCAGA GAGAACAGAG GAGGTGGAGG ACTGAAGACA GCCTGGGAGA 1800
ACAGAAATGG AGTGAAAAGA AAAAGGAAGC ATGGAGGGGG CTACACAGAG AGATCCTGTG 1860
AGGATGGGAC AGAGAAAGGG GCAGGTTAAA CTTACATTCC TCCTCCTAGG AGGAGCTCCC 1920
AGGGAATGAG GCAAGGAATG GGGAGGGGCT GAGGTGTCAG GGCTTAGCTG TGACCCATCC 1980
CCCCAAGGAG GTAGCAGGGG ACACCATCTT CTTCAAATAA TGTCTTTTCC AGCGGGTGCC 2040
CCTCTACTTC CCACCACAGT ATAAAAAGAA AGGAGACAGC TGGTGTGCTG GGGGGAGGGG 2100
GAGAGGGGAT CCAGGGTTTG TTGGCTAAGA ACCAACTCCC CCTTCTGTAA CCACAGTTTT 2160
CCGGAGGTGG CCCTCCCCTT CCGACCGGCC CAAACTGACA ACCACCCTTC TCCGGTGGCC 2220
TCTTTGCCCT CTCAGATCCA CCCACTCAGC CCCCGACTCC CTGCTGCCAG CCAGATTCCC 2280
AAATTACCTG CCCCACACAG CCAGCCCCCA TAGTAGAAAG AAGAGCCAGT CCCCCCACCA 2340
CCAAAAACAA AAACAAAAAC AGAGCATGAA CACCCAGATG TCTGACGTCC CAGCTCCCCA 2400
CAATAATGGA AAAGGGATCC CAGTAGCTAC CTGCCCCCAC AGAACCGCTC TCTATACCCC 2460
CTAGCCAGGT CTTCCCCCAA CCAGCTCCCC CATGGCTTTC CTTTTTAGGG TGGAACCAAA 2520
TTTCTGCGGT TTCAAAAAAC CTCCCCCGCC CCCCTTGGCT CTACTCCAGG GTCTCAGCTC 2580
AAACGGTTGA AAAAATAAAC AGACTTTTGG AGCTGGGGCC TGGGCTGGCG CAGGCTGTGA 2640
AGAGCCTGTC TGCCACCCCA CTGTTCCACC ACACTTCAGC CACCTCACCC CGGCCCTCTG 2700
TTTGTCTTAG GCCCTACTCG AATCCCCAGT TGCTTTCCAG ATAGCAAAAT CTAATCCCAA 2760
CCCCCTAAGG AAAGTCCTTT TAAAGCTGCT TTCCCTGGCC CTCCACCCCC AACCCAGGAT 2820
GGAACCTCTG TCTCTCCCAG TTTAGCATCA AGACAGGTAG CCTGGCTAGG AACTACCAGG 2880
GAGGTGGAGG GGAGGGCTTT CCATCACCCT TAAGGACTCC TAAGGGGTAC TGCTCCCTTG 2940
GCTGAAGTTG GTGATCAGCA TAGGCTGGCA CCAGGGTAGT AGGGCACTCA GGTTGGAGAG 3000
AAGCCAGAGA TTAAACCAAC TCTGGGCTGG GACCTGTCCT TTCTGATAAT GGGTACAGTG 3060
CGGGGGCCCC AAAGGAGCTG GGAGGTGCTG TCTGCAGGCA CCACCTTCCT TTCAGCTCTG 3120
ACTTATTCAC CTGCAAGTCA GCTTCATCAT TTCCTGGGGT CTGGGTGTGG AAAGGTCAGG 3180
GCACTTGGGA ATGGGGCTGG GTACAAAGGC AGGGATAAAG GGTACTTGGA GAGGAGTGGC 3240
CAAGAGGTCA TGATGGGGGA GGCGTGTGGA TAATTATACA CCCAGACTCA TGAAATGCTA 3300
GGTGAAGGGA CCCCAAGACG AGCAGATAAG AGAATGAGAG CGCTGGGGGA GGAGGAGGAA 3360
GGGCAGGGAA CACAATGCAT AGTGCCAGGT GTGTCAGCCT AAGGGTTTCA GGTTGGGAGA 3420
AGGAAGAGCT AGGAGGCTGG CGGGGCAGAT AGGGATGGAG GCCCTATGTT CCAGGCAGAA 3480
GGGCTCAGGA TGGAGGAAAG GAGCCCAGCT ACACAAAGAC CTCTGCTCCC TTCACCTAGA 3540
GGTGATGGTT TGGGGGAAGT AAGCCGTCCC TCGGCCGTCC CGACCCCAGC CACCCGCCCA 3600
CCCAGAGGGG AGAACTGAAT CACAGCTGGA AAGTCCATTT GCGAGGAGAG GAGGAGCTGA 3660
CTTTTGTCTT GGAGGGGTGG TGGTGGTGGT GGGAGGAAGC CGGGAAACCA CCCCCTCCCG 3720
TCCCCTCCGC CGGATGGCGG GGACAAAGGG GGAACGACCA AGCCAGCGAT TGGGGAGTGA 3780
TGGGGGGTCG CCACGCCAAG CCCAAGCCGG TGGGGCCCGG GGTGAGAGGA GGTGCCGGAG 3840
CTTCCACCGC CCCCACCCGC GAGACACACA CCTCCCTCTT CCCGCTCCGT 3890