EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-02675 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:150583110-150587170 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4970966chr1150584103hg19
rs12045807chr1150584834hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSL2MA0478.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150583437-150583449GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150585737-150585749AAACAAACAAAC-6.32
HLTFMA0109.1chr1:150583115-150583125ATATAAGGTT-6.02
HLTFMA0109.1chr1:150583421-150583431ATATAAGGTT-6.02
HNF1AMA0046.2chr1:150584460-150584475AGTTAATTTTTAATT-6.49
JUNBMA0490.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:150583674-150583689TGAACTCCTGACCTC-6.22
Rhox11MA0629.1chr1:150585292-150585309AAGATGCTGTTAAACAT+6.59
SRFMA0083.3chr1:150583416-150583432AGCCCATATAAGGTTT+6.05
ZfxMA0146.2chr1:150585135-150585149CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10034chr1:150581598-150589095CD14
SE_13034chr1:150582882-150587632CD34_Primary_RO01480
SE_13478chr1:150581835-150589003CD34_Primary_RO01536
SE_14186chr1:150582566-150587408CD34_Primary_RO01549
SE_14726chr1:150581631-150589008CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18894chr1:150581637-150590010CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19754chr1:150581754-150587333CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26372chr1:150581394-150588445Duodenum_Smooth_Muscle
SE_34907chr1:150581681-150588976HeLa
SE_36278chr1:150581656-150587296HMEC
SE_38345chr1:150581689-150588426HUVEC
SE_40500chr1:150583737-150584877K562
SE_40500chr1:150585014-150587099K562
SE_45206chr1:150582750-150587242NHLF
SE_56524chr1:150582934-150583594u87
SE_56524chr1:150583609-150588921u87
SE_64527chr1:150582922-150587080NHEK
SE_67845chr1:150582934-150583594u87
SE_67845chr1:150583609-150588921u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1150585611150586454
chr1150585815150586394
chr1150583722150584851
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I150609chr1150581478150588958
Enhancer Sequence
AAAACATATA AGGTTTTTAG TTTAGTTTTT GAGACAGGCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA 60
GTGGTGTAGA TATGGCTCAC TGCAGCCTTG ACCTCCTGGG CTCAAGGGAT CCTCCTGCTT 120
CAGCCTCTGG TACAGCTGGG ACCACAGTGC GTGCCACCAC ACCTGGCTAA TTTTTAAGGT 180
TTTTTTGTAG AGATGGGGCC TTACTCTGTA GCCTAGGCTG GTCTCAAACT TCTGGGCTCA 240
AGTGATCCTC CCATCTTGGC CTCCCAAAAT GCTGGGATTG TGGGCATAAG GCACCACGCC 300
CAGCCCAGCC CATATAAGGT TTTTTTTGTT TGTTTGTTTG GTTTTTTTGT TTTTTTTTTT 360
TTAAAGACAG AGTTTTGCTC TGTTGCCCAA GCTGGGGTGC AGTGGCACGA TCTCAGCTCA 420
CTACAACCTC TGCCTCCTGG GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGCGTCTC GAGTAGCTGA 480
GATTACAGGT GTGCACCACC ACGCCCAGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGTTT 540
TCACCACATT GGCCAGGCTG GTCCTGAACT CCTGACCTCA AGTGATCCAC CTGTCTTGGC 600
CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CATGCTTGAG CCACTGCACC TGGCCCCATA TAGAGTTTTT 660
ATTGTCATTA TTCCCATATT ACAGATGAAG GGACTAAGGC TCAAAGGGTA AATAAGTCTG 720
TTCTTAAATA GTGACTTCCT GAGACACAGG AGATGTTTAA GAACAGTACT GGTAGGTGGG 780
AAGTGGCATT TTGGAGCAGG AGTGAGAAGC ATGAAAATGT AGCAAGAATA GAAAAGGGTG 840
GGAAAACAGC AAATTAAGAG GAAGAAAAAT GCAGGTCCTA GCAAGAATTG CTACTCACCA 900
CTGCCAGAGT CTGGGCCATG TTCTAGGTGT GTATTTAAAC AAATCTCCAT AGCAACCATC 960
TGGTTTCTGT TTTTCTATGA CAACACGGGC TTGCATTTCT AAATACAAGC ACTGGTGAGG 1020
ACAAGTGTGG GCTGGGGAAG GGAAGTGGGA CCGCTGAGTC AAGGGGAAAT TGCGCAAAAA 1080
AGGCAAAGGT TCTCTTGGTA TGCCCTCATC TATCCCCTCC CAGCACACCC TCAAGGAAGG 1140
GGTCTTTCCT TGACTCACAG CAGTCATTGT TAAGAGCTGA GCCTTGTATG CACTTTGTCT 1200
TTTGTTTTGG AGACAGAGTC TGGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCGGTG GTGTAATCTT 1260
TGCTTACTTA AACCTCTTCC TCCGAAGTTC AAGCAATTCT CTTGCCTCAG CCTCCCGAGT 1320
AGCTGGGACT ACAGGCGCCT GCCACCACTC AGTTAATTTT TAATTTTTTT GTAGAGACAA 1380
GGTCTCACTA CATCGCCCAG CCTGGTCTCA AACTCCTGGG CTGAAGAATT CCTCGTGCCT 1440
CGGCCTCTCA AAATGCTGGC ATTACAGGTG TGAGCCACTG TGGCCAGCCC ATGATATCTT 1500
ATTTTTACCA ATTATGTAAA TTCCTATCTA ATTAGGGTAT ACCCTTGGTG CAAGAGGGGG 1560
AAGGGTAGAT GCTTTTGCTT CTCATTTTCA ACCCAGGTGG CACTTTTGGA GATACTGAGG 1620
GTAGAGAGAG GTTGGAGGAT CTCATCTGAT AAAGGTGTGG TAGCCCCAGA AAGAAAGGTG 1680
AGAAAAAGGC AGCTAGGCAT GGAGATGCAG GAATAAGAAT AGATACTGCC ATGAGGACTA 1740
AGTGGGCCCA GACCTGAGTT AAAACAGCCC CCCATCCCCG CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 1800
GAAATGGAGC CTCTCTCTGT CACGCAGGCT GGAGTGCAGT GGCGCGATCT CGGCTCACTG 1860
CAAGCTCCAC CTCCCGGGGT TCATGCCATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA 1920
CTACAGACGC ATGCCACCAT GCCCAGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC 1980
ACTGTGTTAA CCAGGATGGT CTCGATCTCC TGACCTCGTG ATCCTCCCGC CTCGGCCTCC 2040
CAAAGTGCTG GGATTACAAC AAGAGCCCCT TTCTTAAGCA TAGTGATTCT CAACCAGGCA 2100
ACCAGGCAAC TCCAGGGGGC ATTTGGCAAT GTCTGGGGAC TTTTCTGATT ATTCTGACTA 2160
AGCAACTAAT GGGTAGAGGA CAAAGATGCT GTTAAACATC CTGAAATGCA CAGGACAGTC 2220
CCTGCAACAA AGAATTACTT GGCCCAAAAT GTCAGCAGTT CCAAGATTGA AAAACCTGAG 2280
TAAAGAGATG CTGGTCCTAC AGGAAACGTC TCCTTTGTCC ATTGCAGGAG CACCAGTGTG 2340
ACAGATAAAA CCATTTGAGG GGGGCCGGGC ATGGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAACACT 2400
TTGGGAGGCC AAGGTGGGTG GATCACCTGA GATCAGGAGT TCGAGACCAG CCTGGCCAAC 2460
ATGATGAAAC CCCATCTCTA CTAAAAATAC AAAAAATTAG CTGGGTGTGA TGGCTACCTG 2520
GGAGGCTGCG GCAGGAGAAT CGCTTGAATC TAGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT 2580
TGCGCCATTG CTCTCCAGCC TGGGAAACAA GAGCAACACT CTGTCTAAAA CAAACAAACA 2640
AAAAACTATT TGAGGGGGAT ATACCAGAGA TGCCTGCTTG TTCCCCTGGG CCCTGAGTCC 2700
CTCTCAGACT TTCAGACCAA GTATTTTTAG TTTACTTCTG ACAAAAATAA ATTCAAGCCA 2760
GAATCCAAAT TTGCTGTGAA ATCAGCTGGT TCTAGAGAAT AGGGTATTTT CCTATACCCT 2820
TCTTGGTATA GGCAAAACTG CCCCACAGAG GCTGTGCAAT CAGGCAAAGG CATGCTCCTC 2880
TTGGCCTTAG TTTCACCATT TGTAAAACGA GTACACTGAA CTCAATGATC TCGAATGTCC 2940
CTTTAGTTCC AAAACTCTGT ACTTTTGGAC ATTTAAGAAA TATCCTGGGC TGTACAGTTT 3000
GGGTCTGTAA AAAAGGAAAT GACTCAAATG CAATAGAGGA AGCCTAAGGA TGACTCAGAC 3060
TTCCCTAATC ATAAACGACA CTTCAGACAT GGACCTTAAC GTCAAACCAG GATTCATGAT 3120
CACTAAATGA CTTTCCTTTT GTACGTGTGA GCAGGTGGCG TTCACCAGGG GTGAGACTTT 3180
ATTGACAGTA AGTTGCCTCT GCCAAAAAAC GCCCTCATAT GTCTGCTGAT GTTTGAATTT 3240
CTCCTATGCA GAGTTTTGTC TCCAGTTAAA AATGTAAATA CTGTTGTTTC TTGTTGGAGC 3300
TCAGAGGAAA AAAAGATAAC TACTCTAGGA TATGTATCAA TTTGATGCTA CTTTATTTTA 3360
TTTATTGAGA CAGGGTCTTG CTCTGTTGCC CAGGCTGGAG TGCAGCAGTG CAATCACAGC 3420
TCACTGCAGC CTCAACCTCC TGTGCCCAAT CGATGCTCCC ACCTCAGCCT GCCATTGCTG 3480
GAACTACAGG CACATGACAA CACGCCTGGC TATTTTTTTT TAATTTTTCA GACAGGGTCT 3540
CCTTACATTG CCCAGGCTGG TCTCAAACTC CTGTACTCAA GTGATCCTCC CCCTTCAGCC 3600
TCCCAAAGTG ATGGCATTAC AGATGTGAGC CACCTCACCC CAGCAAGTTG ATTTTTAACA 3660
AAAGATAACA GCAAAACCCC AGATAAATTA GCAAACTACC TTCACAGCTC GATGTGAGAA 3720
CTCTCTTAGT TTTATTTATT TATACACAGA GTCTCATTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA 3780
GTGGTGCAAA CACAGCTCAC TGCAGCCTTC ACCTTCTGGA CTCAGGCTAT CCTCCAGCCT 3840
CAGCCTCCCA CGTAGCTGGG GCCACAGGTG CATGCCATCA TGCATGGCTA ATTTTTTAAT 3900
TTTTTTGTAG AGATGGGGGT CTCATTTTGT TGCCCAGGGT GGTCTCGAAC TCCTGGGCAC 3960
AAGCCATCTT CCCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCAT GAGCCACCAC CTGGCTCCAA 4020
TCTAAAATTT TATATTCTTG CTACAATGTT TTGAACTTCC 4060