EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-02172 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:94166560-94171640 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:94171058-94171070AATTGTTTGTTT+6.22
ZIC3MA0697.1chr1:94171618-94171633GAGCAGCAGGGGGCC-6
ZIC4MA0751.1chr1:94171618-94171633GAGCAGCAGGGGGCC-6.02
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02579chr1:94165987-94168821Astrocytes
SE_34666chr1:94164569-94172559HeLa
SE_35914chr1:94163832-94170339HMEC
SE_37201chr1:94166142-94169121HSMMtube
SE_38161chr1:94166584-94168153HUVEC
SE_51729chr1:94166279-94169046Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_57679chr1:94166334-94167408VACO_503
SE_57679chr1:94167416-94168725VACO_503
SE_59776chr1:94145101-94182733Ly4
SE_63513chr1:94166265-94169060HSMM
SE_64440chr1:94166267-94168928NHEK
SE_64440chr1:94169006-94170214NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr19416717594167520
chr19417103894171130
chr19416934194169462
chr19416967094169961
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I093698chr19416398794170769
GH01I093706chr19417155794171910
Enhancer Sequence
GGCAGCCAAA CCTGGGTTTT GAGCAGTGGC TCTGCTGCTT GAAGCTGTGT GACCTTGGGC 60
AAATTCCTTC ACCTCTCTGC TCCTGTTTCC CCACTGTAAA ATGGGCGTAA TGAGAATATT 120
TGCCTCTTGG ACTGGCCCTT GAGAATTAGA CCCAATGATG TCAAAGGAGC ATGGAGCACA 180
GGGCCTGCCA CACGCAGGCA CTGAATAACC ACAGCGGTCA TCGTGAGGTC CCCACTTGCC 240
TTGAAGGGAG CTGTGTGGCT GAGTTCTCCG CTGTCACTGG TTCCCTTATT GAGCTTGCCT 300
TAGGGGGCCC AAGGCCTCCT TCCAACCCAA AACGTGCCTT CGAGAGGGGC AGAGACCGGC 360
CACCCCACGT GTCTTCCATT GGAATGGAAG TCAGGGTTCA CCAGGCTGGG GGAGGGCATT 420
GATGCCCTCA TGTGCATCGG TCTGTTGGGC CCTGAGAAAA GCCCTAAAGA TGCCTGGCAG 480
GGGACATCTC TTCACAATGA CATATTATTA TTTTGAAAAA GATGAAGCCG AATTAGCAAG 540
CATTTATAAA AAGTGGAAAC AAAATGAAGC CACTGGGACA AAAGAGACAC TGCACAGACC 600
AACCACCGTG TGTGATGAGG GGCTGGGCAG GCCCACAGGG GCCTGTTTTA TGTGGTGGCC 660
CTCTTTGTCC CCACTCTGCC TGCTTCCCAG GCCTGCCCCT GGGCCTCTCT CCAAGGATGA 720
TTCTGTCTCC ATTTTTGGTA TCTACAGGCC TTGTGGGACT GGGAGGACTG AACTGGGCCC 780
AGCATTCTCC AGGTGACTCA CCAGGCAGGC CATGCAGAAA AGCCACTTCC TGCATCCCTG 840
AGTGGCCAGT CATCCTCCTG GTACCTGCCT TAAGAACATG TGAGCCACCC TCAGGGGCAG 900
GGTGGGACTG GGCTGTGCTC CAGGCATGGG CACCACATAG AGAAGGGCTG AGTGAGTGTA 960
GTGGAAGAAC CCAGGCCATC CAGGAGCCTG TGGCTTGGGG TGGGGTTGGG GGTGGACACA 1020
GTGTTCCTGG TGCTTTCTCC ACAAAAGAAA CCTCACCTTC CTAAAGCTAT CGATCCACCC 1080
ACTGGCGCTG TGGCAATGAA ATTCTCACGG GGGAAAGTCT CAGGGCCAGC ATACCTACCC 1140
CTGCACACTT CATGCCCCCA AGCACAGCAC GCCATTGCAG CAGGCCCCTT CCTGAAGCTG 1200
CGCCCCCATG AATACGCCCT GTACCCATTC TGAGAATCAG GTCTGATATT ATGGGAAGAA 1260
AATGTGTGCC TAGGCATGGC GGGGAGGGGC AAGTTAGGCA GGTCAGGAGG GAGAGTTTTG 1320
ACAAGAAATC CAAGCACATG GGCCACAGAG GAGTCTTAAA AACAACCTCA GCCCAACTGT 1380
CTCCTGACTG TTCCCCCAAC TTATCAGCTC AGGCCCAGGT CAGAGGAGGT CCAGGCTGGC 1440
CTGGCACAGC AAGTTGAGCC TGGTTCCCAG ACCCTGCAGC TGGTTTTGAG CAATGGAAGT 1500
GGCAGTGAGT CTGTGCTCAT GGAGTTCCTG GGCTCAGGCC CAGGTGGGGG TGGGGATGGG 1560
GGTTGGGGGG ATGTCCCCTG TCTTCGATTT GACTCTGCTG CTCCAGTCAC AGAGCTCTCT 1620
CAGAGGCAGA CATGAAGCCA AAGCACTTCA TTAAGACAGG AGGTCAGATA ACAGCCCCAG 1680
CCCTCTTTGG AAACCGCACA CCGCCCAGTG GCATGGAACA GGCCAGGTCC CAGCCCTCCC 1740
AGGAGTGCCA GGCATTGTAT TTCAGAACTG AGCTTCAGCT ACTCCCACAG GAAGGAGACG 1800
ACTTGCTCCT ACCTTGTTTT TAATTTCCAG AATACTGCAA TCCCCTTAGG AAAACTCATG 1860
TTTTCATGAT AGAATGGCAG CTGCCCACGC ATGTCAGAGG CTTCAGACCT GATCCTGATC 1920
CTGATCAAGC CTGGAACAGT GATCTCTGGG CAGCAGATGA ACAGCCCAGG GACCAGCAAA 1980
GAGAGCCTGC CCTCTGTGGT CCAAGGCTGG CCACCGCGGC CTGTGCTAGG CAGAAGAGCT 2040
CACAGGTGTG TCCTGCTTTA CTTAACTCAA AGACAGCTGC TCAGAAGTTG CCTGGAATTG 2100
GAACTGTGAT CAGGCCAGGC CCTCCTTAGG TTTCCAGAGG GACTGCTTAT CATATATACT 2160
ACCTGTGTGG TGAGGGGTCT CACTTGAAGA CATAAAAAAT GCACTCCAAA CAGGAAAACA 2220
ACTTTTAAAA ATTATTGACA TTTAACGATC AGCTGTGTGT GTATTAGGGA TTTTTAAAAA 2280
GTGAAACACA GCCAGGCACA GTGGCTCACA CCTGTAATCC CAGTACTTTG GGAGGCTGAA 2340
GCAGAAGGAT GCTTGAAGCA GGAGTTCAAG ACCAGCCTGG GAAACAAAGC AAGACTCTGT 2400
CTCTATTTAA AAAATTAGCA GGTGTCGTGG TACACTCCTG TAGTCCTACC TACTCGGGAG 2460
GCTAAGGCCA GCGGATTGCT TGAGCCTAGG AGTTTGAGGC TGCAGCAAGC TATAATCTTG 2520
CCACCACACT CCAGCCTGTG ACAGAGCAAA ACCCTGTCTC TTAAAAAGAA AAAAAAAAAA 2580
AAGAGATAAC CCTGCAGGCT TTCAAATTAT ATACACATAT AATGATAATA TACTACATTT 2640
ATATTATGTA ATTTGGTTTA CAGAGTGCTT CTATATGCCC ATTCATTTAT TTATCCAACA 2700
ATATTATTGA GCCCCACAAA GACCCAGATA TTCTCCTAGG CACAGGGAGA TACAGCGGTG 2760
AGCAAGGTGC ATAAGGCCCT CTGCCACTTC TGTTGACCTT ACTGTCTGGT TGGGGGAGGC 2820
AGACAAATGA CAAACAACAG ACAAATGAAT CAGCAAGACA AGTCCAGGGA GTGACGAGTG 2880
CACGAGTCAG GTAATGGCTA CAGCCAGACT ATCTAATACA GGAGCCACAT GTGGTTATTT 2940
ACATTTAAGT CTAAATGAAT TAAAATTAAG TGAAATTAAA CATTCAGTTA TTCACACTAG 3000
CCACATTTCA GGTGCTGAAT AGCCAATGTG GCTAGTGGTT AGTGGTATAT AGGACATTTC 3060
CATCATCACA GAAATTGCCA TAGGGCAGCA CAGGGCTAGT GAGAGACTTA GGACTGATTT 3120
GGAATAGGTG GTCAGAGAAG GCCTCTTTGT GGAGGTGCCT TCATTTGGAA TCTGAAAATG 3180
AGAAGAAACC AGCAGCTCAC AGGCCTGAGT GGGAGTGGGT GTGGGCAGAC AGTTTCACTC 3240
ACTCTAGGGC AAAAGTCCAC ATTTAGACAT AAGTTTGGCA AATTTGAGGA ACAGAAAGAA 3300
GTCTGGTGTG ACTGGAGTGT AATGAGGTGG GGGTGGGGAA AGTAGAGACG ATGAGGTCAA 3360
AAGTAATAAT AAAAACAGCT GTGATGGCTG TTGGGTGCTC ATTACATGCA TCTATAAGGT 3420
AGGTACTGCT ATTCTCATTT TACGAATGAA AACACAGACA CAGAGAAGTA GAGATACTTG 3480
GCCAAAGTTA CACAGCTAGT GAGGGACAGA GCTAGGATTC CAGCTGGTGC CATAGCCATG 3540
GAGCACTTAG CTATTATACT ACACTTCACC ACATCTCCAG AGTCAGGGGT GCATTATGAA 3600
TGCCCTGTGA GGAGTGTGGA CCCCATCAGG GTGTGAAAGG AAGTCCTTGA AAGTTTTTAG 3660
GCAGGAGTGT GGCATGATCT ATTGTACTTT TAAGTGATCC ATCTGTTCAT GGTGGGGAGA 3720
ATAGATGGTA GAAGGCCAAG TCAGGGGACT GCCTCATTAT TCGAGGTAAT AACATTACTG 3780
TGGCTCCAAC TAGGAGAGCA GCAATTCTTC TTCTTTTTAA AAGCCTATCA GACATTGCAC 3840
TTCTATTTTT CATGGTTTAC TTACCTTCAA GGACTATGGC AGGTTTTGTC TTTTTCCTAA 3900
GACAAAAGTA CACACACATT CCTAAGAGTT AGTTGCTCCA AAACTCAATA GGTACATGTC 3960
AGCATGCATT TAGCTGCAGG AAAGCCAGTT TTTGCCAAGC CTTACCTAGT TCTGTTTAAA 4020
GCATCTTTTC TATACATTGT TATCAAGTTA GACCAATGAT CTTCCTAGAC TGGGAGGTCT 4080
GACTTGAGCT GGTTCTAGCT CCACCCGGGG TTGTTTCCAT GTTTAGGAGA AGGGGGTGGA 4140
GTCCTGATCC AGGTGGGAAC CCAACTTGTG GGGTTTCTGC GTGGAAAAGA ACTTCACGGG 4200
CTGGGTGGTA TGTAAGCATC TCCATCTCGT GCATTTAGAG TGGCAGGTCT TAGGACTGCA 4260
GTAATTGGTC CTCCCTGGAC CAATTTACCC TGTGACATTG ACTTTGAATG TAGGGTGTAT 4320
GTGTTCCGGG CTCCCTTGTA AATGCGGAAA TAAAGGAAAA CTGACAGACC TCCCAGGGAG 4380
AGAGCAGGAA TGTTATGCCA TATAAACCCA CTACCAGCCC TGCAAACAAC TGCCAAGGTG 4440
CTTCAATAAA ATATAACTTC CGACCACCTC CAGCCCTAAC ACTCCCCTGT CAAATGCCAA 4500
TTGTTTGTTT AGAACTTCTC CTCCCACTAG GGTTAAGAGG AGCAAGGTGG TTCAACTGCA 4560
GTTTCCCCTC CAGCCACTGC TCCCTTCTCA GGGTCTGTTT GGGATACAAG TCAAGGTCAC 4620
AACTCTGTGG TGCTCCCAGC ACCTGAAACC CTCCCCACCT TACGGCAGGT TATTCAGCCT 4680
CCCTGTGGCT GCCTTTCTTC ACCACTGAAA TGAGGATAAT TATGGTAACC ATCATTCTAC 4740
CTCATAGCAC TGTTGTGAGA ATTTAATGAG TTAGAATGAA TTAAATGTCA GACAGAACAA 4800
TTATGGTCAG CTATGATATC ATATTGTCAT TACTGGAAGG GAGAGGATAG GAAAGGAGGT 4860
GGCTGAAGCC AAAGCCCGGT CTCAAGGCTG CGATGAATAA GGATCCTAGA GTCACCCAGA 4920
AACAACTACG CTGGAGCTTC TGCAGGTTAA CAAGAGGATT CTCATACACT CCAGGTACTG 4980
CCCCAGAAGT CACTTTGTAG GCTGGATCAA CACCACCCCA CAGCTCCAGC TGCAGTTTCT 5040
GCCCTGCACT CTGGGGCAGA GCAGCAGGGG GCCAGGCCAC 5080