EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-01352 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:40466650-40470770 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:40467363-40467374ATATTAATTAC+6.02
IRF1MA0050.2chr1:40470351-40470372ATTTTCTTTCTCTTTTCTCTT+6.13
IRF1MA0050.2chr1:40469808-40469829AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.25
IRF1MA0050.2chr1:40468640-40468661AAAAAAAAAGAGAAAGAATAA-6.58
PPARGMA0066.1chr1:40468979-40468999CTAGGTCAGCATAACCAAAT+6.16
RORA(var.2)MA0072.1chr1:40468974-40468988TATAACTAGGTCAG+7.25
RREB1MA0073.1chr1:40468239-40468259GTGAGGTGGGTGGGGTGGGG-6.5
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
SE_64654chr1:40469818-40471969NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr14046668440466875
chr14047004140470207
chr14046781540470326
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I040004chr14046993640471720
Enhancer Sequence
GATGGTTAGG ACAGAAGATT TCTCATCCCG TAAGCAACCT GATAACCTCG TACCAGCCAA 60
ATGGAAGGCC ACAGGAGCTT TGCATTTGCT GCTCCCTTCC CCTAGTTCTT CATGTCTCCT 120
ATTCCTGGTA ATTGTCATAA AACCTAGGAA GAGGAACTGA AAGCTTGCTT TCAAACAGGT 180
GGAGTCCTTT AAGAAAAAGA ATACAACCGG GCACGGTGGC TCACGCCTGT AATCCCAGCA 240
CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG TGGATCATCT GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGCCTGGCCA 300
ACATGGTGAA ACCCCATCTC TACTAAAAAA TACAAAAATT AGCCAGGCGT GTTGGCAGGC 360
GCCTTAATCC CAGCTACTTG GGAGGCAGAG ACAGGAGAAT CATTTGAACT CGGGAGGCAG 420
AGGTTGCAGT GAGCCAAGAT AAAGCCATTG CACTCAAACC TGGGGGACAA GAGCAAGACT 480
TCTCTCAAAA AAGAAGAGAA AAGAAAAAGA ATACAAAAGT ATGAATACAA AATTAGGTAC 540
AAGTTCTTGG AAAAGTGTTT TGCAAGTAAG GGTTCTTAAA TTTTAAGCTT CCTTAGCTTC 600
ATGGTAAATA TGCCTCTAAG CCTGCCTGAG ATTTGGGAAA CTTCTTTCTG CCTGCTTTAT 660
TTCTGGCCAT CAGTCCTTCT GGAAGGCAAT GTGGAAAAGG ACCAAATTCC ACCATATTAA 720
TTACTGCTGA ATGGGTAGCA TAACATCAGA GCAGGAAGCC TGGATCATCA CAGAAACCAG 780
CCTTTCACTA GCTCATTAAA GGTCAACTTT GAAATGAGAG AAACAAGTAG AAATAGCAAG 840
AATCTATCCG GAAAACATCC GGGTTATTAT GACTATTTTC TCAGCATTAT GCTGATTGTT 900
CAGAGGTTGT TTGTACTGTA TTATGAAGTG TGGAAAAGAG CCAAGATGAT TAGGCCAACC 960
TCTGTTATTT ATAAGTTCCC TTGGCAGTAA GATCTCCCTC CTTTTTTTAA AAAAAAAAAT 1020
TAATTTGCTA GGGATGGAAT ATCACACCAT TTTTAATGAG ATGGCCCCTG GCTTGCTATA 1080
GTATAGCCAG GGATGACACA GAAGCTATGT TTTCCAGCTA TCTTTTTTTT TTTTTGAGAT 1140
GGAGTCTCGC TCTGTCACCC AGGCTAGATT GCAGTGGCTG ATTTTGGCTC ACTGCAACCT 1200
CGGCCTCCAG GGTTTAAGCA ATTCTTCTGT CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG 1260
CGCTGGCCAT CACACCCAAC TAAATTTCAT ATTTTTAGTA GAGACAAGGT TTTGCCATGT 1320
TGGCCAGGCT GGAAGCTGTC TTTTAAATTG ACCTGTGACT ATATATCTGA TGTGATCTGA 1380
TTTGTATTTT GAAAAGTTCC CCTAGCTGTT GTGTGGAGAG CTGATAGTGG GGACAAGAGT 1440
AAAAGCAGGC AAATGAGTTA AGGGGGTATT GCAGTGGTGT AGGCAGGAGA TGATGTGGGT 1500
TTAGCGTTGG TAGGTGGGAC TTCTGATAAG TGGTTGGATC CTGGATATCT TTTGAAGGGA 1560
GAGACAACAG GACTGCTAAA GAATTGAACG TGAGGTGGGT GGGGTGGGGG TTGAGAGATG 1620
GGAGGAAAAG AGGATTGAAG GTTGCTTCCT AGAGTTTGGC CTGACCTAGT AGATGAAATT 1680
ACAGAAAAAA GGAAGATGGC TGGGCGCAGT GGCTCATGCC TGTGATCCCA GCCCTTTGGG 1740
AGGCCGAGAC GGGAGGATCA CTTGAGGTCA GGAGTTCGAG ACCAGCCTGG CTAACATGGT 1800
AAAACCCCAT CTCTACTAAA AATACAAAAA ATTAGCTGAG TGTGGTGGCA CACGGCTGTA 1860
ATCCTAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGTAGGA GAATCGCTTG AACCCAGGAG GTGGAGGTTG 1920
CAGTGAGCCA AGATTGTGCC ATTTCACTCT AGCCTGGGCG ACAAGAGCAA AACTCCATCT 1980
CAAAAAAAAA AAAAAAAAAG AGAAAGAATA AAGAAAAATG GAAGATGAGG GTAAACACAT 2040
GTTTGAAAAA GACAATTGAG AATTCTTTTT TTTTAAAGTG AAATAGTTTA CTAAATTGAT 2100
TGAGTCTAAT TCAAGAATTC TTTTTTGATC ATGAAATTGA CCAGGTCTAT GACTCCACAG 2160
TCTAAGGGAT ACCTATTCTA AACAATGTAA ATTTTCAAGT CAATCACTAA AATAGTCATC 2220
AATTAAATAC TAAGCTCTAT AAATGCCAAT GCAAATGATA TATTCACAGA AATAAATTTT 2280
ATTTCTATTA CCCTGACATA GAGAAAGCCA TGTCGAGTCA GTGTTATAAC TAGGTCAGCA 2340
TAACCAAATT CCACTTCCTC TGGAGACTTT CAAGGCTTAA AAATAACATA TAAGAAGAAG 2400
TAAAACTCAA ATAACCACTG TATTTGTGGG CCAAGCAATA ATATGTAAAA TGCAACTCTT 2460
GAGGTTTCAT TATCAACAGT AGACAATTCT GAATGATAAT CTTAAATGGG CAAGTCTGAT 2520
ATATCTTCAT TAATCAATTA ATTTCTTTAT TTTTGTAACT ATCTCATATG CAAGCAAAAA 2580
ATGCACTCAA CTCCTTCCAA AAGGAGACAA TTCATGTCCG GTTATGGCAT TCATCCCTTC 2640
CCTGGTTACA TTCATTCATT CAACACACAT GTAATGAATG CCTACTATGT ACCAGCCACA 2700
GTGCTAGTTT ATGGGAACAC AATTATGAGC AAGACAATCT ATGAAGCTCG TAGTCTAGTT 2760
GGAGAGACAG AAAAGTAAAC ACACAGAACA TTCAATTCAA CATCTGCTGA CTATATAATC 2820
TGAAGATGTT CTTGTAATAA ATATTTAGAA ATGCTGGCCA GACTGGGCAC AGTGGCTCAC 2880
GTCTGTAATC CCAACACCTG GGGAGGCCAA GGCGGGTGGA TCGCCTGAGG TCACGAGTTT 2940
GAGACCAGCC TGGCCAATAT GGCGAAACCC CTTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCCG 3000
GATGTGGTGG CAGGTGCCTG TAATCTCAGC TACTTGGGAG GCTGAGGCAG GAGAGTTGGT 3060
TGAACCTGGG AGGTGGAGGT TGTGGTGAGC TGAGATGGCG CCACTGCACT CCAGCCTGGG 3120
CTACAAGAGT GAGACTCCAC CTCAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAG AAAGAAAGAA 3180
AGAAAAAGAA ATGCTGGCCA AAATTTAAAG AAATGTAGAA TGAAGTTGGA AGAAAAAAAA 3240
CATCTCCAGG GTCCAGAGTG AAGAAAGAGC TGAAACCAGA CAGATAAATA GTTTACTAAA 3300
GTGATAGAAA CTGATCAACT TAGAGCAGAA GATGTAGCTA TGCTGGGGAA GGGCTATAAT 3360
TCCAACAATC TAAAATATTC TAGGATATAC CTAATATGGG AGGGGACTAC ACAAAGGCAT 3420
GGATCAAGAG GTGAGAGTCA TTTGGTGCTA CCTTGAAGGC TGAGTTCCAC AACCTACCTG 3480
GCAAAGCGCT AAACCAACTG ATGTGCTGGC CAATCAATGG CAAGACAATG TGATTGGGTG 3540
GGGGATGAGA GAAGTCATAA GTACCATGAT CAGTTCCATG AATGAGGACT GTAGCTTCTA 3600
CCAGTATTCC TTCCTTGCTG TGTCATGGAT ATTTTTTCTC CTTTATTGAG GTATAACTTA 3660
CTTATAGTAA TATGCAGAAA GTCAGATATA TTTTTAAAGT AATTTTCTTT CTCTTTTCTC 3720
TTAGAATCGT GTGGTATGGG TTGATGATGG TTAAATTTGT AATTTAGTAC ACAAATTGTA 3780
AACTATAGAG AGGGGTCATG ATGGAACTAG GAAAGAAATA AATGAACATG GGTTGTCTCC 3840
TTTTAGAAGG AGTTGAGTGT ATCTTTTGTT TGCATCTGAG ATAATTATGT TAGGCAGAGG 3900
CATTTAAAAA ATTGTATATG GCATTTTAAA AAGTGGGAAG ACGTTGCTTG GCAACCCATG 3960
GTTGGAATGC AGAGGACATC TGTTGTTTTT CTCTATCAGC ATTCTACCTC TTTCTCTGGA 4020
GAACACCCCC TCCCCCACTA CACACTGGTT TGGTGGGGCT GTCAATCATT GTTCAATGCC 4080
CTTCCTTAGT CAGGGGATGA TACTCAATCC CAGCTAGATC 4120