EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-01066 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:32013030-32016890 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:32014650-32014669TACTGCCACCTACTGGCCA-8.52
Gata4MA0482.1chr1:32014747-32014758TCTTATCTCTT+6.02
KLF16MA0741.1chr1:32014281-32014292GGGGGCGTGGC-6.62
Myod1MA0499.1chr1:32015598-32015611TGCAGCTGTCACC+6.5
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:32016452-32016467GAGGTCACGAGTTCA+6.12
Nr2f6MA0677.1chr1:32015525-32015539AGTGTCAAAGGTCA+6.74
RREB1MA0073.1chr1:32013941-32013961TGGGTGGTGCTGGTTGGTGG-6.78
RxraMA0512.2chr1:32015525-32015539AGTGTCAAAGGTCA+6.27
SP1MA0079.4chr1:32014280-32014295GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr1:32014280-32014293GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr1:32014278-32014295GCGGGGGGCGTGGCTTG-6.93
SP8MA0747.1chr1:32014280-32014292GGGGGGCGTGGC-6.44
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23348chr1:32013983-32015757Colon_Crypt_1
SE_23348chr1:32015765-32016194Colon_Crypt_1
SE_28118chr1:32013906-32016515Fetal_Intestine
SE_52749chr1:32014053-32016265Small_Intestine
SE_57549chr1:32014832-32015308VACO_503
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr13201420032015894
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I031548chr13201388232016385
Enhancer Sequence
AGGGCCAGAT AGAAGAATCT GGTTTCCAGG GAGAGGTCAG GATGAGAGAT ACACACGTGG 60
GAATGATTGG CATTGGGTGG ACTTTATATT CTCTGGGTCA GTGAGACAGC TGGGAAGTGA 120
CCACGGATAG AGAAGAGACA AAGTCACAGA AACCAAGAGA GGTAATGTTG CAAGGACGGA 180
ACACTCAACT CTCAAATGCT GCTGAGACGT GGGCTGAGGG CTGAGAATGG AATTGGGAAG 240
AACCGAGGTC ACTGGTGATC CTGAGGGTTT CAGTGGCAAG GGCAGGTGGA CTGCAGTGGG 300
GCCCGGTGGG GATGGGTGGA GCATGGGCCC CTCTCCCGGA GAGTTGCACT GTAAACGAGG 360
GCAGACATAT GGGAGTGCAG CTAGAGGGAG GGAACGTAGG GTCAAGGGAG AGTTTATTCT 420
GAATGAGAGA GATCACAGCT TGTTTTTAGG CTGACGGGCA TGATCCATAG AGGGGAAAGT 480
AATTAAGATG CAGAAGAGAG GCCGGGGGTG GTGGCTCACG CCTGTAATCT CAGCACTTTG 540
GGAGGCTGAG GTGGGTGGAT CATTTGAGGA CAGGAGTTCG AGACCATCCT GGCCAGCATG 600
GTGAAAACTC GCCTCTACTA AAAATAAAAA TAAAAAAAAA TTAGCTGGGT GTGGTGGAGG 660
GCACCTGTAG TACCAGCTAC TTGGGAGGCT GAGGTAACAG AATCGCTTGA ACCCTGGAGG 720
CAGGGGTTGC AGTGAGCTGA GATTGTGCCA CTGCACTCTA GCCTGGGCAA CAAATTGAGA 780
CTCCATCTCA AAAAAAAAAA AATGCAGAAG AGAAAGGTGA GACTTGCCAG GGCAAAACCC 840
AGGGTGGTGA AAGGGCTTGG CACCCTGTGC ATGAGGGAGG ATGTGCCCTC AGTGTGTACC 900
TCTGTGGTAC CTGGGTGGTG CTGGTTGGTG GAAGATTTGG CATCCTGAGA ATGCGGCATT 960
TTCGTCTGAT TCTCTTTTCT CAGTGAGATA AGAACCAAGG TCACAGCCAA TAGCCAGGGG 1020
GCAGGAGGGG GTCTTGGTGA GGACTCGAGG AGAAGAGGGA TGGGGGTGGG AGAGTTAATG 1080
GGCCGGTGAA GCCTGGTTGG GTTGCCGGAA GCACAGGGGC CCATTCCAGG TTTGTGGGGT 1140
CACCTTGGAG TGAGGCCAGT CATCTGATGT ACCTTGTCCT CAGCCACATG CAGCTGCGTG 1200
GGTGCAGCAG CAGAATGGGT GGAGGGCTTT GGGGAAGAGC CAACGTGGGC GGGGGGCGTG 1260
GCTTGGAGTA TGAGGTGGCC GTGGGCTCCC TGCAGGCCCA GGCTCCATTT ACGGCCAGCT 1320
GCCTGCTGTC CTCGCCCTGC TCCGGCATGC TGTCTTTCCA CATCCGTTAC CCACTGCGCG 1380
CTCATAATGC TCCCACTTTA CAGAGGCCAT TTACTCTGGC CACCTAGTAG TTGGTGGCAG 1440
AGTTGGGATT TGAATCCAAA TGGAGGTTCA TTGTTCTCCA TTCAGGGTAG CAGGGGCACG 1500
CGTGCTGTGT TTAAGAGAGA CTTGCATGCC TCGTGGTGGA AATAAACTTT GGTGGATTAA 1560
ACTTTAGGTA TTTTGCGCCC TGGTTGGGCC AGGCTTTGTC CCAGTTCGAC CACAGTGACT 1620
TACTGCCACC TACTGGCCAT TCTCAGTGTT GCACCCACGT AGGATTTGCT CACGGTCTGG 1680
GTCTAACCAT GCCTGGTTCA AAGGGGAGGA CCGGAGCTCT TATCTCTTTG ACAAATCAGA 1740
CAAACCAGGA AACAGAGGTC CAGAGAGGTG ACTTTAAGCT TTCATCTGCA CTTGCCTACC 1800
CCATCTATTC AGTTGTTCAT TCGTTCAATA AATATTTCTT GGAAACCTAC TATGTGCTAG 1860
GTGCTGGGGC TCTGCAGGGA ATGAGACAGC AGAGAGCGCT GCTCCGTATA GCTGACATGC 1920
CCTGTAGGGG AGCGGGAGGG AGGGACACAC CATCAACAAG TAAATCAGTG AGAGGATGAA 1980
AGATGGCGAT GGGTGCCGGG AAGGAACAAG GAGACAGCGA CTGGAGAGGG TGGTCAGGAG 2040
TTGCCAGTGG AGGGAAGACC TGAAGGGTGA GAGGGACGGG GAAAGACACC CTAGGAAGAG 2100
GGAGCAGCGT CACAAAGGCC CTGAGAGGCT GAAAGGTTTG GGCGGGTTCC AGGAACACAG 2160
GCGGCCAGGG AGGTGGAGCC CACACCTCAA CACACAACTA CCCGTGAAGA ACGTGGAGCG 2220
ATCCGTGTAG ATCCTTGTAG AAGGTTCTCT CAGAGGGCCA TGTCACTGAC CTGTCAGTCA 2280
GCCCACAGCC TCCTCCCAGT CCCCAGATAG CTGACCACTC CCTCCTTGAA ATTCTCTCCT 2340
CTCTCAGCTT GTGCAACACC AACCTCCGGT GGCAGGAAAA ACTATTATTA TTCTCTTGTG 2400
AAAATTAAAA CTTAACCATC AACATAGAGC TGTTACTGGT TTGAAGGAAG CCATTGACGC 2460
TGTGTCAAAG GCTAGAGCAG AAAACAGTGG CATGCAGTGT CAAAGGTCAA AGTCAACACT 2520
TCTCGGACTG GCACAGGGAA GGTAGGTCAG GACAGAGTCA GTCTTGCTTG CAGCTGTCAC 2580
CATGTTATAA GCGTGTTGAT GGCCCTGTCT GCTGCTAGTG GTGAGTCATT CTTGCAAATA 2640
AAGTGACTAT TTATAAGTTT ATAGATATGA GTATGCTTTG TTCAAATCCT ACGAGTAGTG 2700
TTCAAGAAAT AAGGTGTGGG AGTAAAATAA GTCTGTGATC CAGTAAGTCC ATTGGCAATT 2760
CCCATATGTT ACTCAAATGC TATCCAATTA GCTGGTATTT TCCAGTGTGT GAATATTTGC 2820
TATAGGCTAT GGTTCTTTGT AATGCAAAAT ATTTTCATCC TTAAAAAGGA GAAAGTTAAG 2880
CCTGGACAAC ATAGTGAGAC CCCATTTGTA CAAAAAATAA GAAAAAATTA GCCCAGCATA 2940
GTCACGCATG CCTGCTCTCA GCTACGCAGG AGGCTGAGGC AGGAACATCG TGATCCTGAG 3000
AGTTCAGAGG TTGGGGGGAG CCATGATTGC TCCACTGCAC TCCAGCCTGG GTAACAGAGC 3060
ATGACCCTGT CTCAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAGA GAGAGAAAGT TATATGAAGC 3120
AACATGTACC CTCATACCCA ACCTGAAGAT GTGATTAGAC ACAATCTTAT GAATTCAACT 3180
AACATCAATG CAAAATGAAA TAAAATTTCC TATGTTTGAA TTATTTGTCA TAAGAACAAA 3240
GATCAAGACT ATTGGATAGG GCAGTTAATA CTTTGAGTGT TTTAAATTTT CCTTGTAAGA 3300
ATAACACTTT TTTCTGATAG ATGTTCAAAA AAGAGTAACT TAAATAGCAA ACATTTGGCC 3360
AGGTGCAGTG GCTCATGCCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCTGGGGCG GGTGGATCAT 3420
CTGAGGTCAC GAGTTCAAGA CCAGCATAGC TAACATGGTG AAACCCCGTC CCTACTAAAA 3480
ATACAGTAAT TAGCCAGGTG TGGTGTCAGG TGCCTGTAAT CCCAGCTACT TGGGAGGCTG 3540
AGGCAGGAGA ATCACTTGAA CCCAGGAGGC AGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGTGCCAT 3600
TCCACTCCAG CCTGGGCGAC AACAGCGAGA CTCCATCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAGTAA 3660
ACATTTGTGA TACTATTGTT CCATTTTTAA AATAACTTTT ATTTGGCATT TACTTTGAGT 3720
TAATGTCTCC TTCTTTTAAT GTTTTCTATT ATTAAATGTC TGCATAAGGT AGAGATCATT 3780
TTTACATGTC CTTGAAATAC ATCACTGAGT CATGGTATAT TAAAACAAAA TAATAAAATA 3840
AATTAAAACC ATGCACTTTA 3860