EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00678 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:23900140-23906480 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:23902982-23902993ACAGATAAGGA-6.14
HOXA13MA0650.2chr1:23905153-23905164GTTTTATTGGT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:23905146-23905159ATTAAGTGTTTTA-6.16
POU6F1MA0628.1chr1:23905444-23905454ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23905444-23905454ATTAATTAAT-6.02
SREBF1MA0595.1chr1:23905859-23905869ATCACCCCAC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01721chr1:23900657-23905229Aorta
SE_01721chr1:23905312-23906115Aorta
SE_02313chr1:23901876-23905526Astrocytes
SE_04396chr1:23902891-23904726Brain_Anterior_Caudate
SE_05716chr1:23903816-23905335Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06239chr1:23900696-23905116Brain_Hippocampus_Middle
SE_07293chr1:23902637-23904795Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08579chr1:23902794-23905344Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10300chr1:23899372-23906111CD19_Primary
SE_11050chr1:23898822-23908436CD20
SE_18996chr1:23902922-23905455CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26335chr1:23902515-23905797Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27258chr1:23902880-23904675Esophagus
SE_27884chr1:23903017-23904621Fetal_Intestine
SE_28880chr1:23903194-23904813Fetal_Intestine_Large
SE_29676chr1:23901788-23905238Fetal_Muscle
SE_31953chr1:23902060-23902911Gastric
SE_31953chr1:23902935-23903813Gastric
SE_31953chr1:23903835-23904596Gastric
SE_34689chr1:23902272-23905407HeLa
SE_37153chr1:23901250-23906299HSMMtube
SE_38016chr1:23903113-23904896HUVEC
SE_38999chr1:23901867-23905446IMR90
SE_41075chr1:23901556-23905295Left_Ventricle
SE_41075chr1:23905308-23906073Left_Ventricle
SE_42328chr1:23901634-23904721Lung
SE_42328chr1:23905280-23906072Lung
SE_44435chr1:23902863-23905477NHDF-Ad
SE_45797chr1:23901058-23906146Osteoblasts
SE_48755chr1:23901793-23902643Right_Atrium
SE_48755chr1:23902917-23904674Right_Atrium
SE_50077chr1:23902728-23906171Sigmoid_Colon
SE_51741chr1:23901781-23905632Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52549chr1:23902842-23905170Small_Intestine
SE_52549chr1:23905280-23906163Small_Intestine
SE_53706chr1:23901906-23902658Spleen
SE_53706chr1:23902697-23905306Spleen
SE_54840chr1:23900793-23905744Stomach_Smooth_Muscle
SE_56054chr1:23901526-23905401u87
SE_58372chr1:23873313-23964782Ly1
SE_63528chr1:23901642-23905713HSMM
SE_68324chr1:23879596-23905390TC32
SE_68325chr1:23879596-23905390TC32
SE_68477chr1:23874949-23904689TC71
SE_68478chr1:23874949-23904689TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12390460023905142
chr12390371423904323
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023572chr12389942723906089
Enhancer Sequence
TAATAATAAG TGTCAACATT TATGGGCACT GATTTTGTGC TGTTTCAAGT GCTTTATACA 60
CATTAACTCA TTTATCTTCA TAAAAAGCCT ATGAAGCCAT TATACAGATG AGGAAACAGG 120
CTCAGAGAGG CTAAGCATGT TGTTCAAGGT CACACAGCAT GGAAGAGGCA AGCCGACTGA 180
CTCCAGAGCC TTAGCTTTGT GCCAGTCAGA ATGGAAAAGA ACTCCAAAAG ACACCAACCT 240
GGTTTATTCA AGTGCTGGCA TGTAAGGATA AGGAAAAGCA GCCATCAGTT TGAATGACAG 300
GCGATGGGTC CGGAGTAATT AGCCAAATGT ATGAAGATTT CACCATTTCT AAACCATCCT 360
GTTATATGAC CACACATACC ATCTTCATGG AAGTGCAGTA GCATCACCAT GACAACTACT 420
TTTGTGTTTT TACCTCTAAT GTAATCGATT GTATTTTAAA ATATTTTTAA ATGAATAAAA 480
GCTTTTGAAT TTAATGTTTT AAGTAGGTAA TACTTTCACC TGGTTAAAAA CTCAAAAAGC 540
TCGAGAGGCA TAAAGTGAAA GGCCTCCTTC TCACCCCGGC CCCTGCCATC CTCTTCTCAC 600
AGTCAGCCAA TGTTGCTAGT TTTGTGGGGA GGGGAAGAAC TGATACTTTT TGAAAGTAGA 660
AAGAGTGTGC TTGATTTGTT CTGAGGTCAC AAGCCATAAA GCCCACCTTA CTCTGGTTGA 720
TTTCTTCAGG TCGGCCTCAG CCTGATTTCC TGTACCCTTT GAGGCACTGC TGCTTCCTGC 780
AGGTGATGGT TAGTCCCTTA GGGAGATGGT CAGTCCCTTC TCCCTCTGAA CTTTCCCCTG 840
AGGCACCCCC TTCAGTACCC GCTATGCTCC TGACCACATT CTCTCTGGCC TCTAGGCCTG 900
ACTGGTTCTC CATCCCCCAG AACCTGCAGA GCCTGTAAAT GCCAGAGAAA TCTCATCATC 960
TCACACAGCT GATGTGGTAG AGGTGGACCC AGAGGTCACA CCTGGGTGGC TTCAGGCTAT 1020
ATCTAGCCTA TGAGATTTTT TGTTCTTTTT TGGTCTGCAC AGTGATGTCA GAATTGGAAA 1080
TCTTCACCTG AAAGTCCAAT TTTCTGATTT CACTTGAAAT ATTGGCAGAC TCAGCCACAC 1140
TGAACCCATA CTGATGCATG ATGATGACAG CTGGAGCTGA GCAGCAGTTG CTCCCTTGAG 1200
AAGGAGCACA AGCTCTCTGG GTTGTATGGT CCCCGCCACT CTGGGTTGGT TAACATGGTA 1260
GGCAGGATCA TAGTCACCTC CAAAGATGTC TGTGTCCTAA TCCCTATAAT TTGTGAATGT 1320
ACTGTTACAC GGCAAGTGGG AATTAAGTTT GCAGATGGAA TGAAGGTTGC TATGCAGGAT 1380
TATCTAGGTG GGTCCAATGG AATCAGAAGG GTCCTTAAAA GTGGGAGAGG GCAGCAGAAA 1440
AGAGTCAGAG AAAGAGAGGC AACCACGAAA ACAGGGTCAG AGAGATGCCA TGTTGCTGGC 1500
TTTGAAAATG AAGGAAGGGG TCACAACCCA AGGAATGTTG GCAGCCTCCA GAAGCTGGAA 1560
AAGGCAAGGA AATCAATTAT CTTCCAGATT CTCCGAAAGG GAAGTCCCTG CAAACACCCT 1620
GATTTTAGCC CAGTGAGATC AGGTTGGTTT GAGAGCATAA ACTTAAGTTG TTTTAAGTGA 1680
CTAAGTTTGT AGTCATTTTG TTATAGCAGC AATAGAGAAG TAATACAGTT AATATGGGCC 1740
CTTGTAGGTC TCCAGGGATG GGGGAGTGGG GCACAGCTGT GAGAGCTGTT GTAAGTGTGC 1800
AAGACTCATA GCTTAAAGAG CTCGGTAAAT GGCCATGAAT GTTCTAATGA ATAGGCGTAG 1860
CAGGCGGGTT CTGGGCAGAG TAGAGATATG GGTGACCCTT GCTTTGGTTT TTTCTCCCTC 1920
CACTCTTGTG ACACCCTCTG CCCAGTTTCC TTCACAGCCC TGGGGCTTGC TGAGAGAGCC 1980
GGGCTGATAT GTCAGGCCTT CAGCATTGAG TAGGGCAATC ACTTAGCAAG TTGGCAGGTC 2040
TCAGCAGCTG GTGGAGGAAT CTGGGCTCTG ACTGAGGACA GGATTAGAGG TCAAAGTGGG 2100
AAAGTAGGGA ATAGGCCCCA GACTGAGTAA AAAGACCAGG AGAGCTGAAG GTGGGGGAGG 2160
GTCAGGAGCA GGTTCTGAAA GGGGGTGCAA AGCTAGGCAG GGCCCAGACT TGAGGCCTGT 2220
TCTAGGTGGT GCTGGCTGGT AGGGGAATGA CTGATGGTCT AGGATTGCTG AGGACAACTG 2280
TGCACCTGCC AGCACTGTCC TAAGCCTGCC TCTGAACACT AAGCTGTCAG CCTCTGTTTA 2340
CCTTCCACTC TCAGTATAAC CTGCATTCGG CCTATTTGTT GGGAGGCAAC TGAAAAACTA 2400
ATTTATCCTG AATTATTCTT AGTGACTGAT AGTGGCTTAC TGTGTCAGAT ACTTGCCAAG 2460
GAGATTCATG TTGAAGTGCA TATCATTTTA ACCTAAAAAG ATGAAGTGCA TTTAAGGTAG 2520
CAGTGTCTGA GAAGGAAAAC CTCATGGCTA CTGGTGGTGG GGGGTGGCAG GGAACATAGG 2580
ATGTCACACG GTGGACAGCC TTACCTGCTC ACAGGGCTGT ACACCCCCAG GAGGTCTCTC 2640
ATATTCCAGC CCCCATGTCC TTAAGTCTCT TTAGATTTTT TTCACCTGGG CTTTCATTAC 2700
AATTCTTTTA CTTTCCGTGT TTCCTGGGTA AGCTTGTTTA TATATTTTTA GCAAACATTC 2760
ATGTAACACT ATGTGCCAGG CACCATTCTA AGTGCTTTAC AAATGTTTAT TTAGGTAACA 2820
GAGGTACTGT TGCCTCCATT TTACAGATAA GGAAACTGAG ACACAGAGAG GCTAATTTGC 2880
CCAAGACCAC GTGGCTAGCG AGTGGCTACA CTTTCTGAGC CTCGGCTTTC TTGGCTGTTA 2940
AATTGATATG TATATACAAG CGCCCTCTGC ATAGCAGGGC TTCTCAGACC CAACACTATT 3000
GACATTTTGG GCTGGATAAT TCTTTGTTGT GAGGCTGTCC TGTGCATTGC AGGATGTTTA 3060
GCGGTATCCC TGGCCTCTAC CACATAGGGT ATTCACTGCC AAGAGATGCC AGTAGCAACT 3120
CCCACTCAAG CTGTGACAAA CCTAAAATGT CCCCTGATCT TGCCAAATGT CCTCTGGGGG 3180
CAAAATCAAC CCTAGTTTAG AACCACTGCC TAATAGGATC CTGGGGAGGA TTAAATGAGC 3240
TATTTCATAT AAAATACCTT CCGGCAATCC CTTCCCCATT CCTTCCATAA CTCTATGGTG 3300
AGTTCTAACT CCTCAGAACC CTCTTGTTCT TTCTGTTCCT CTACTGTTTG GAAAATGTGC 3360
CCACCTATGG AGACTGGGTG CTTGAGAGCT TCTTGCAAAT CCAAAGCTGT TCCAGGAGCT 3420
AGACCTGATT CCAGTCCTGT CATTTCCACA GACATGCTGT GGGACCTTGG CTGAAGTCCT 3480
TCCCCTCCTT GAGCCTCGGT TTCCCCATGT GTACGAGGGG GCTGACCCAG AAGCTTTCCG 3540
AAAGGTCTTC TCACTGCAGG AATCAGTGAC TGGGTGATTC ATACCAAGTG CAAATTCCCC 3600
TCACAAAGTC CAAATTCTTC CAGCGACTTA GTCATTCCAG GGTTTGAACT TTCTCGCAAA 3660
AACCATTTGA AAAATTCTTC CAGCTTAAAA AAAAAAAAAA AAAGCTATTA AAAGAAAGTA 3720
AAAGTTTCAA AACCAAATCC TAGGCAAACA ACCCTGAAAA CAATACACAC ACATACATAT 3780
ACATACAGCA CCCAAGGTAG CTCTGAGAAC AGGATATGAA ACCTTGCAGG CCGGCACTAA 3840
GAAATGATTC ACAGGCCTTT GAGATGCTTC TATTTCAAGA CACAGTCCAC CCACTGGATC 3900
TGGTGGCTCC AAAAACAAAC TTTCAGCTGC TGTTTCTTAT CGCAGTGTGG TTCGCCTGGC 3960
CAGTATCCTT GGGTCTCAAG AGCTCCAGAC AGAAGACAAG GTTGAGTCCT GTGAATTCCC 4020
TTTCTGTTCT ATTTCAAGCC TCAAGCTGCT GGCTTGTTTA AAGAAAGTCT TTTGCATCCA 4080
CCTTTTGGTT GGCTGACCCG AGTTTAAAGC AACATAGCCT AATGGGTTCG TAGCACAGCC 4140
TGCGAATTCA TAATTTTAGT TTAGCAAGGC CTCTGTGTGG CTCCAGCAAG TCCTACTGGA 4200
TCCTGGGCTG GTCATTCTAG AAGCTGTCTC CAGCTAAACA ATCCTGCCTG GCTTTCCTTA 4260
TACATATCAA TATTATACTT GCCCTAGGCC AGGATTAAGA ATTTTAGCAC AAATTCAAAA 4320
TTTCATGCTT TTATGTAAAA TAGAAATATA AAAGTAATTC ATTCGATGAA ATGCTTACTG 4380
AGTGCTCACT ATATGCCAAG CACCAGCAAT GTACTGGCGA TAAAATACAG CCCCTGCCTT 4440
CAGGAGCCAC ATTGAACAGG AAAAGCAGAC AATCTAAATA TACATAGTAG AAACACATGG 4500
AACTATTCCC TATGGGAAAT GCCCTGCATA AAAAGTGATA CCAAAGTTGG AGCAAAATTG 4560
AAAGAAATGC AAATGCTTGT GATACGGTTA AGTACATTTT CATCTGTACT TACCCTTGAT 4620
TTTGTTTTAG ATTTAGAAAA TCTTGAACTT TCACTGTTGC TTCATTTGCC CTCCAAAAAT 4680
CCAGAATCTT ACAGAAAGGG TCAGTGTCTG GATCAAACAT GTTTCTTATC TAATTTCCTT 4740
GCCCCAGTTT TTGTTTATGC CATCATTGCT GCATGGAGTC CTCCCTCCTC TCCTTGTGTA 4800
TCCTCCAAGT TCTGATGCAA AGCCCACTTC CTCCAGGAAG CATTCGCAGA CCCATCTGGC 4860
CACATCCTCG CTGTTCTCTA AACACACATA TCTCATGCTC TTGACTTGGC CTTTAGCCTG 4920
TCCTGCCTTA TGATCTCTCT TGTACTTCTG TCCTGAAGTT TTATCTAACT TATGAATTGG 4980
GGGAAAGAGG ACAGGCACTG ACATTTATTA AGTGTTTTAT TGGTGACGGG CATTTTGCTA 5040
GCTCTTTACT GTATATAATG TGCCTGGTAT GTAGAAGATG TTCAATAAAT ATTTGTTCAA 5100
CGAATGCTTC AGTGATTTGG CTTAAACCTA ACAATAACCC TATGAGACCA ATTCTATTAG 5160
TATTCCCATT TTACAGATAA GAGAACTGAG GCACAGACAG GTAAAGTCTG CATTTGAGGG 5220
CTTTCTGTCT TAAAAGTTGA AGTTCAGACT TTCTCTTCTT CTCTGTTGCT TTTTTCTGCA 5280
AATAGATTTC CCTGAAGTGT CTTGATTAAT TAATAGGACA TATACTGTGC TCCCTGCTTT 5340
ATCCCATCTC AGGCAATATT ACCTGTTCTC TCCGTTGTGA GCCCATATTT GTATTTCTAC 5400
AGTTAGTTTA GAAACCACTC TGCATCAGGC GTGGTGACTC ACGCCTATAG TCCCAACACT 5460
TTGGGGAGGC TGAGGCGGGT AGATTGCTTG AACTCAGGAG TTCGACATCA GCCTGAGCAA 5520
CATGGCAAAA CCCCATCTCT ACAAAAAAAT GAAAAATTAG CCAGGCCTGG TAGTGCACAT 5580
CTGTGGTCTC AGCTACTGGG GAGGCTGAGG TGGGAGGATC ATTTGAGCCC AAAAGGTGGA 5640
GGCTGCATTG AGCGAAGATT GTGCCACTGT ACTCCAGCCT GGGTGACAGA GTGAGACCCC 5700
ATCTCAAATA AAAAAAATCA TCACCCCACC ATTACCTGTG CCTTGTCTAC CTTTCCCACT 5760
AGACCATAGG CAGCACTAAT GTAGTATGAC TGCTGTGCCC CTGGCTGGCA CACTGCTCAT 5820
GCTCAGTGAA GATTTGCTGA GCCAGGGTGG TAGTGGTGGT GGTGGTGGTG ATAACAATAG 5880
GTTGAGTAGT GATGTTCCCC AAAAGATATG TGTTAATTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 5940
TTTTTAGATA GAGTCTTGCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGTGCG ATCTCGGCTC 6000
ACTGCAAGCT CTGACTCCCG AGTTCACACC ATACTCCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG 6060
GGACTACAGG CGCCGGCCAC CATGCCTGGC TAAGTTTTTG TATTTTTAGT AGAGACGGGG 6120
TTTCACCGTG TTAGCCAGGA TGGTCTAGAT CTCCTGACCA TGTGATCCAC CTGCCTCGGC 6180
TTCCCAAAGT GTTGGGATTA CAGGCGTGAG CCACTGTGCC CGGCCAGATA TGTGTTAAAT 6240
TTTAATACCC AGTACCTGTG AATGGGACCT TATTTGGAAA TAGGGTATCT AAAGATAGAA 6300
TTAAGGATCT TGAAATGATA TCCTGTATTT TTGGTGGGAC 6340