EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00653 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:23573700-23579530 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:23574121-23574133AAACAAACAATT-6.22
Foxd3MA0041.1chr1:23574117-23574129AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23577521-23577533AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23577525-23577537AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23577529-23577541AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23577533-23577545AAACAAACAAAC-6.32
HOXA13MA0650.2chr1:23575797-23575808ACCAATAAAAC+6.32
RFX1MA0509.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC-6.38
RFX1MA0509.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC+6.4
RFX2MA0600.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC+6.55
RFX2MA0600.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC-6.77
RFX5MA0510.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC+6.26
RFX5MA0510.2chr1:23576456-23576472CGTCTCCATGGCAACC-6.27
TCF3MA0522.2chr1:23575185-23575195AACACCTGCT+6.02
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12357523523575327
chr12357529023575411
Enhancer Sequence
CTGGGTGTGG TGACAAGCAC CTGTAATCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAGG TAGGAGAATC 60
GGTTGAACCT GGAAGACGGA GATTGCAGTG AGCCGAGATA GCACCATTGC ACTCCAGCCT 120
GGATGACAAA GTGAGACTCC GTCAAAAAAA TTAAAAAAAG AAAAAAGAAA AATGGGCTGG 180
CTTCTTTGGT TTCCTTGTTA AAAAAAAATT TTTTTTTAAA AAAGACAAAT GGGGATAATA 240
ATAGTACCTA TCTGATAAAG TTAGTGTGAA GTTTAAATGA GATAATACAC GTAAGTGCTT 300
CACCTGGTGC CAGGCCCATA ATAAGGGCTC AATATCTGTC TCCCCACTTA GAGTGCAAGC 360
TTGTTGAGGA CAAGGATCAT GTCTGTTTCG GACCTCGCAC ATAATGGACA CTAAAATAAA 420
CAAACAAACA ATTTAAATTT AAATTTGCTA GACCAGGCAG GGTGGCTCAC ATCTATAATC 480
CCAACACTTT GTGAGGCTGA GGCAGGCAGA CAGCTTGAGC CTAGGAGTTT AAGACCAGCC 540
TGGGCAACAT GGCAAAACCC CATCTCTACA AAAAAAATGC AGAAATTAGC TGGGCATGGT 600
GGTGTGCATA CCTGTAGTCC CAGCTACTCG GGGGGCTAAG GTGGGAGGAT TACCAGAGCC 660
CAAGAGGTCA AGTCTGCAGT GAGACATGAT CGTGCCATTG CACTCCAGCC TGGGTGACAA 720
AATGAGACCC TGTCTGAAAA AAAAAAAGCC AGGCATGGTG GCTCACGCCT GTAATCCCAG 780
CACTTTAGGA GACCGAGGCC AGTGGATCAC TTTGAGATCA GGAGTTTGAG ACCAGCCTGG 840
GCAACAGGGT GAAACCCAAT CTTTACAAAA AACACAAAAA TTAGCTGGGC ACGCCTGTGG 900
TCCCAGCTAC TCGGGAGGCT GAGGCACGAA AATCGCTTGA ACCTGGGAGG TGGAGGTTGG 960
AGTGAGCCAA GAGCGCGCCA CTGCACTCCA GCCTGGGTGA CAGAGTGAGA CCCTGTCTCA 1020
AAAATAAATA AATAAAAATA AATAAATAAA TGTGCAGAAT CGGAAAGCAT GTGCACAGGA 1080
TTCCAGTTCT TAGTTCTGAG ACTCACGTTT GGAATGAATG ATGTTTCATA CTTGCTTTTA 1140
GACTCATACT TCTCACATTC TGCTCGCACA AGATTGCGCA TCATTAGATT TGTGCTTTTT 1200
GGCCTTTACC ACAACTGTAA TACAATTATG TAATTTTTCA TCGACGATTT GCCTTCCTTT 1260
CTAGACTATA AAATCCATTC AGGAAAGGCC CCTGCCTACT TTGATTACCC CCTACTATAC 1320
CCATAGGCTT AGCACTGGCT CTGGCAAACA TTAAACACTC AACAAATATT TTTCAACTGA 1380
CTGATGGCTC AAAAGCTTAG CAGAAGATTA GTTAGTGAAT GGAGTGGTTA ATGAATAGAG 1440
AAAACTTGCT TTTTAAAAAG ACTAATGAGG CCGGGCGTGG TGGCTAACAC CTGCTGAGGC 1500
AGGAGAATGG CGTGAACCCG GGAGGCGGAG CTTGCAGTGA GCCGAGATAG AGCCACTGCA 1560
CTCCAGCCTG GGCGACAGAG CGAGACTCTG TCTCAAAAAA AAAAAAGACT AATGAGCTGG 1620
GTGTGGTCAC GTGTGCCTGC AGTCCCAGCT ACTTGGGAGG CTAAGGAGAC TGGATCCCTT 1680
GAGTCCAGGA GTTTGAGGCT AGCCTGGGTA ACACAGACAG ACCTCATCTC TAAAACATAA 1740
ATAAATAAAA AGCAAAAGAC TAGCCAGGTA CAGTGGCTCA CACCTGTAAT CCCAACACTT 1800
TGGGAGGCCA AGGTGGGAAG ATACTTGAGC TCAGGAGTTC AAGACCAGCC TGGGCAACAA 1860
ACACAGCAAA ACCCTGTCTT TACAAAAAAT TTTAAAAATT AGCCAGACAT AATGGTGCAC 1920
ACCTGTAGTT CCAGCTACTC AGGAGGCCGA GGTGAGAGGA TTGCTTGAGC CCAGGAATTT 1980
TAGGCGGCAG TGAGCTTTGA TCAACCGTGC CACTGCGCTC CAGCCTGGGT AACAAAATGA 2040
GACCCTGTCT CTAAAAAAAA AAAAATAAAA TAAATAAAGA ATAAAGAATT TTAAAAGACC 2100
AATAAAACAC TAGTAAAATG TTAATACTCT ATATAATAAT ATATTAAGAT ATATGCAGTT 2160
AGTGCAAGAA TTCATTTAAT ATAAATAGCC AGGTATCACT AATTCTTACG TATTATTTGT 2220
TACTGCTAGG CTTAACCTTG ACTTAGAGCT CTGGCTAGAA GAGAATATAT CTTTTAATCA 2280
ATTTTTCAAC TCTTAACAGT CTAAAACTTC CCGGGATGTA TATCTAAATA TCTCCGTGGG 2340
GCTTAAAAAC ACCTTAGCAA TAAAAGCCCT TATACATGGC TTTCCTTAGG AGCCAATGCT 2400
GTCCTATTCA TAGCCATAAA GACTACATCC TTTCAACTGG GAGTACTAAT CAGCTTTGCT 2460
GTTTCCTCTT CTTTCTCTAC TCCTATTTTC CCCCCTGTAT TTCAATCCAC AGAAAGAAGA 2520
AAAAAACAAG AAAGGAAAGA AAGTGCCAAA TCATGCAGTT TCTGCCCTTA CCAGAAGCGT 2580
GAACCTTTTA ATTGCCGTTC CCTGAGTGGA AAAAGATTTC TCTTCATCTG CTAGCTTTTC 2640
TCTAGTGATT TTTTTTTTCC TCTTCTTTTT TTGGAGGAAA TTGCTTGTAG CTTCTCCCCT 2700
TCCCTTCTGA CCAATTACTT AGCTGGGCAT GCTGTAAAAT AAAGTTTACA TTAAATCGTC 2760
TCCATGGCAA CCTCACACAC CAGATCTCTA GTTTTAAAGC AATCATATCC CTTTTCCCAT 2820
TCAAGCTTGC CAAAAAGTAA CTTTTCTTGA AAGTACACAG ACAGAACCTA ATAAGGTTTG 2880
TAAAGAGAGA TAAATTGGTT GCACAAGATA GGGGTCCCTT GATGGAGAAC ATGAGATGAA 2940
TTCCTGAAAA AATATCTCCT GTAAACCATG GTTATTTACA GTGTGCTCAA ACCATTTTAA 3000
GTCTCCATAA GAAAGCTTGT TGAATTGTAA ATATCAGGGG GAGCTCTCAT TTTTGGAGCA 3060
CCACCCAGTC CGTGCTAGAC ACTGGTCTGA GCACTTTCTA TCCATGAATT ACCTCATTTG 3120
ATTTAATCCT AGATGTATCC TGCAGAGATT TTTTTTTTTG CCCACAGATT GTCATTAGCG 3180
CCACTGGGCA TCTGCTCATG TCGAAAATGT TTCAGTCTCC AAATTAACTA CTTAGAGACG 3240
AAGTGTTCTT ACACATACCT CCTAATAACA ATAACAGCTG CCATTTACTG TGCTATGTCC 3300
ACTGCCTGGA GATGTGCCTA CCTCATCTCA GTTAATCATG AGAACAAGCT TAGGAGATCC 3360
TATTATCCCC TATTACAGAT GAAGTAATTG AGGTTCACGG AGGGAAGGCA ACTTGCTTAC 3420
ACAGCTAGGA AGTTGCAAAG TTGGGATTTG AACCAAGGTG GGTTTGGTCC CTGTCTTAGT 3480
TTGTTCTGGC TGCTATAACA AAAGACCATA GACTGGGTAG TTTGTAAACA ACAGAAGTTG 3540
GCCAGGCGCG GTGGCTCACA CCTGTAATCC CAGCACTTTG GGAGGCCGAG GCAGGTGGAT 3600
CCTTACCTGA GGTAAGGAGT TTGAGACCAG CCTGACCAAC ATGGTGAAAC ACCGTCTCCA 3660
AATACAAAAA TTAGCCGGGC GTGGTGGCAA GAGCCTGTAA TTCCAGCTAC TTGGGAGGCT 3720
GAGGCAGGAG AATCACTTGA ACCCGGGAGG CAGAGGTTGC AATGAGCCGA GATTGTGCCA 3780
TTGCACTCCA GCCTAGGTGA CAAGAGTGAA ACTTTGTCTC AAAACAAACA AACAAACAAA 3840
CAAACAGCCA GAAATTTATT TCTCTCGCTT CTGGACACCG GGAAGTCCAA GACCAAAGCA 3900
CTGGCAGATT CAGTGTCTGG TGAGGGCCCA GATGGGAACA CAGCAAGGAG GCCCTGATCG 3960
TGCCTTCTTT ATATCTTCAG ATTAGACTTT ATGGCTATGA GGACACCATT GGCTCCTTAG 4020
GAAAGCCACG TATAAGGAGT TTCACTGCTA AGGTGCTTTT AATCCCCACA GAGATATTTA 4080
GAGATACATC TCAGGAAGTT TTAGACTGTT AAGAGGTGAA AAATGGGTTA AAAAATATTT 4140
TCTCTCCTAG CCAGAGCCCT AAGTCAAGGT TAAGCCTAGA AGTAATAAGT AATAATAATT 4200
ATGATACCTG GCTATTAACA TTAAACTAGT TCTTGCTCTA ACTGCACGTA TCTTAATATA 4260
TTATTAAATA GAGCATTAAC ATGCTCACAC ATGGTAGGAG TGAGGGGTCT CTCTTGGGTC 4320
TCTTTCATCA GGGCACTAAT CCCAGCCATG AGGGCTCCAT CCCCAAACCT AATCAGCTCC 4380
AAAAGGCCAC ACCTCCTAAT AGCATCATAT AGGGAGTGAG GATTTCAACA TAGGAATCGA 4440
GGGGGTGGGA CATAAACATT CAGACCATGG CTGTCCCAGA ACAGGTACTC TTGTCACTCT 4500
GCCTCCCAGA AATTCTCCCA GCTAGGGAAA CAAGGAAGAG AACATCCCTC TGCAGATGAC 4560
ATGGGTTTCC AGGTGTGGGT GTGAATGCCC TGGGCAGGCT CTGGACCAGG GGTGAGCAAC 4620
TCTGGACCAT GGGAGGTGAA GAAAAGAAGG AGTAGTCGCT CTCCCCTACT CCTTAAAGTT 4680
GCTGAGTTTT CATTGGTTCT CACCAACTGT AGTACTCATC TTTCTCTCTC CTCTCCCTCA 4740
ACTTTTTGAT CTGGCCACCT CCTACTCAAC CTCCAAGTCT CAATTTAAAA GCTACCTCCT 4800
CTATGAAGCT TCCCTGTCTT TTCAGACAGA GTTCAGCCTG ACAGATCTGG CTTAGTCACT 4860
TATGAGCTGT AGGACTTGTG CCAGATTTCT GTAGTTCTCA GAGCCCCAAT TTGCTCATGT 4920
GTAAAATGGG GGCTTCACAG GGTCATCATG AGGTTTCAAT GTGTTCATGG ATGATAAAAG 4980
TACATAGCAG AGCTCCCAGC CAAGGGAGTT CAGCAAATGT CAGTTCCTGT TATTGGCCTT 5040
CTGTGGCATT TTATTCCCTT TTCTATTATC ATAATTATCT TATTTGTAGC TTGCACATCT 5100
CCCCAATAAT TGGTGAGGCT TTGAGGGCAG GATCCTTATT TTCTCTTTTG TATCTCCAGC 5160
CCTGGCACCA GCAAACATTT GTTGATTGAA TGTATGAAAG ATTATCTGGT ACCATCTCCC 5220
AGAGCATTGG GCTCCTGGGA ACTGTGGCCT GGAAGGAGTG GGGTGCTGGG GCTTCCCATG 5280
CTTCTCAAAT GCAAATAGTT CTGAGAAAGA TCACTAGACC AGCCAACCCT CAGCTGGGCT 5340
TGGTTGGTGT GCAGCTGAGA GAGACCACCA TCTAGGGACC TGGGTTAGGA AGATGTATGC 5400
CCTGGGGGCA GGAAGATGGA AAACAACTTT GACCACTGCC AGCCTAGGCT AGGTCACTCT 5460
GAATAACCTT ATGGTGTTTT GAATCAATTT TTTTTTTAAA AAGCAGAGCA TATACAAATA 5520
AATAAAATAA CAACAATCAT CTTTTAGGCC TCCCAAATCT TGTGTGTTTC TGGTTCTCCA 5580
TCCATTGATG CCAGAGGTTC CTAAGACTGG TCCATGAAGG CAAAAATAAA AATAAAAAAG 5640
GTTGCAACCT GTGGGCAAAT GTGTGTGGGG AGGGACATGG GAGGGAGGGA ACTGCCCACT 5700
CACAGCAGAC TCCAGGTCTC CCTGCAAGGC TGCGGGCATT TTGTTTGGCC CAGCCTCTCT 5760
CCTCCTGTGT CTAACACTGT GGCCACCCGA GGAAACTGAA GAAAGGGCTT CCTCTGGGCT 5820
GGTCAGCTGC 5830