EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00532 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:19250290-19252620 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:19251175-19251193GGAAGGAAGGCTGGAGTG+6.37
ZNF263MA0528.1chr1:19251733-19251754CCTCTTCCTCTCTCCTCCTCA-6.18
ZNF263MA0528.1chr1:19251739-19251760CCTCTCTCCTCCTCAGCCTCC-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:19251730-19251751TCCCCTCTTCCTCTCTCCTCC-7
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01018chr1:19248092-19251465Adrenal_Gland
SE_01970chr1:19247032-19252407Aorta
SE_05988chr1:19246801-19251768Brain_Hippocampus_Middle
SE_05988chr1:19252374-19255926Brain_Hippocampus_Middle
SE_08107chr1:19247233-19251717Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_14542chr1:19249621-19251996CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14542chr1:19252384-19255629CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17874chr1:19248896-19256964CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18508chr1:19248071-19257402CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19155chr1:19249074-19251617CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19155chr1:19252273-19256975CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26830chr1:19247945-19251474Esophagus
SE_30281chr1:19249947-19251083Fetal_Muscle
SE_33643chr1:19248059-19252156H2171
SE_35893chr1:19247868-19251482HMEC
SE_35893chr1:19252381-19255666HMEC
SE_38219chr1:19247806-19251800HUVEC
SE_38219chr1:19252084-19255853HUVEC
SE_42513chr1:19247474-19252218Lung
SE_42513chr1:19252368-19257164Lung
SE_53460chr1:19247615-19251818Spleen
SE_53460chr1:19252387-19255462Spleen
SE_64648chr1:19248145-19250578NHEK
SE_65885chr1:19248222-19251293Pancreatic_islets
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I018925chr11925209619256859
GH01I018921chr11924790119251893
Enhancer Sequence
CAGACAGCTC CCCAGTGATG CTGGGCTACA GATGGCACTG AGTGGCCAGG CTCTGAAGAC 60
CACACAACCC AGCCCCTCCA CCTCACCTCT CCCTTCCTGC CCCGAGTTCT GCACCCTCCC 120
AACCCCACAT CTCAATCGTG TTTCCTGACT GCACATACCA CACCCCCAGG ATGAGCTTGC 180
ACAAATGATT TCACGGGCTT TTTATTTCCA AAGCCAGACG GGGGAGGCAG CCGGCTGGCC 240
TGCTCCCAGG AGGTTGAGGA CAGACCCCGC ATGTGGACAG CAGCTGGCTT GACTGAAGAG 300
CCTGTCGCCC GCCCTGACAT CCCTCCCGGC GGTGGTGGAG AAAACCTGGC TCCGCCAGCT 360
CCAGTGTTGA CAATGCAGAA AAGCTCTGTC CTTGGATCGT TCTGAGGACT GGCATGAAGG 420
GCCAGGTGGG CGATGTGTTT CTTACGGCAC TCCAGACACC TGTATTCCCT GCCCACCCAC 480
CCAGAGCCAG GGAGCACTCA GCTTAACTGA GAACTGGTGA ACCAAGTTGC TGGCACAGAG 540
ATTTCAACAC CAGCTTCCCA AGCACAACCC TCCCTCTTCC CTGGGTCTGC CCACAAGAGT 600
AAGGTTTCAG TGGGGAGGGT GTTTCAGGCA GAGGGACCAA CAGAAACAAA GAGGGCAGCA 660
GGAAGGGACA GGCCAGGCGC TGTCTGCCAC CAAGAGGCGG GTGCACCTAC TTTGGATCAG 720
CGGTTTGCAG ACATCGTTTC CTTTCAGCCT GCACCATCCC CTCTCCCAGC CCCAGCCCAT 780
GGCTGAGCAA ACGACTTGCC CAAAGACTGC CTAGGAAGTG GCAGCGCCTG GATTCGAACC 840
CAGGTCTGAC AGAATCCTAC GCCCGGGCCC TTTAAGGCTG AAAGGGGAAG GAAGGCTGGA 900
GTGAACATAA AGAGATCACT TTTGGGGCAC AAAGGCCATT TTCCTCGAGT CTCCCTCAGC 960
AGTCCAGGAG CTGTTCTGTT GGCTGGGGAG GGGTCCTTTC TGGTCTTTTG AAGACTCCAG 1020
AATATTGACA GGCCTGCCAC TGGCAGAAAA TGAGGTGACA AACACATCCC AGTGCTCTCT 1080
GCAGGGCCTT TCCATAGATC CCCTCCATCA TACTGCACAT GCACTGGGCT GGAAAGCTAC 1140
CCTGTCCCCA CTTTACAAGT GGGAAAATGA AGACCCAGGG CCTATGGACA ACTCCAGCCA 1200
CGGCTGACAC GGCCTGAATC ACTGAGAGCC GCCCCTGCCC ACCCTGACCC AACAGCTCAT 1260
AAAACTTCCA AATCCTTCTC TTTTCTAGCG CTGGATGAGA GAAGGGACAT TTATTGATTA 1320
CCTTCTCGGT GGTATCCACC ACATTAGGCA CTCATACTTC CCTCTATAAA ATCCCGCTGA 1380
GCCCTCCCCT GGGGATCATC CCCATGTTGC AGATGAGGCT CAGAGGTCAG GTAACTCATT 1440
TCCCCTCTTC CTCTCTCCTC CTCAGCCTCC TGAAACCCTA GCCATTCTCC CAGGCTTGTC 1500
TCAAATGTCA TCTCTTCCCC AAGCCTCACA TCCACTTCCA TTGTTTGCCC CACAGCTTAA 1560
AGCAGTGGAG GCCCCAGGAT CTCCTCTTCC CCAGTGGCAT GGTTGTGGGA TCCCACGGCA 1620
CACAGCTCTT GCCCAAAGGA GCCAGTCCCG TGACGCCAGG GCCAGTGATG GCTCCATTGT 1680
GTGGTCACCG CCACTTCCAC CTTCCCCACC GCCACCGGGG GCTGGCACTC ATCTCGGGAG 1740
GTCTCAGGCA CAGAGATGGG GCAAAGAGGA AGCAAGAGGC AAGTTCCCTG GTCTAGGTGG 1800
GAAAACAGGC ACAGGAGCCG GGTCTCAGGT CGGGGGTCCA GTCCTTCTGC AGGCCCAGAG 1860
AGCTGGTTAT GATGATCATT CCTGTGCTTG CTACTGTATT CCCTGCACCT CAAACTGGCT 1920
GGGCACTTGC TAAGGAGTCA GACATTTATC GAATGGATTG GTTGGATGGA TGGATGGATG 1980
GATGGATTGG TTGGATGGAT GGATGGATTG GTTGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 2040
TGGATGGATG GATGGATTGG TTGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATTG 2100
GATGGATTGG TTGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGTT GGATGGATGG ATGGATGGAT 2160
TGGTTGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATTGGTT GGATGGATGG 2220
ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATTG GTTGGATGGA TGGATGGATG 2280
GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATTGG TTGGATGGAT AGATGGATGG 2330