EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00512 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:17436540-17440330 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:17437352-17437364GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:17437356-17437368GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:17437360-17437372GTTTGTTTGTTT+6.32
NEUROG2MA0669.1chr1:17437196-17437206GACATATGTT-6.02
Stat4MA0518.1chr1:17439540-17439554CTTCCAGGAAGTCA+6
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03367chr1:17436102-17437584Brain_Angular_Gyrus
SE_03367chr1:17438114-17438822Brain_Angular_Gyrus
SE_03367chr1:17439031-17439587Brain_Angular_Gyrus
SE_04134chr1:17433080-17437779Brain_Anterior_Caudate
SE_04134chr1:17437794-17439700Brain_Anterior_Caudate
SE_04134chr1:17439785-17446749Brain_Anterior_Caudate
SE_04910chr1:17432021-17447377Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05888chr1:17431053-17450566Brain_Hippocampus_Middle
SE_06853chr1:17433106-17447264Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07916chr1:17432125-17447315Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09858chr1:17438312-17439682CD14
SE_51266chr1:17437671-17446553Skeletal_Muscle
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I017108chr11743472917437578
GH01I017111chr11743779517439700
GH01I017113chr11743993717440478
Enhancer Sequence
GAGCTGAGCA AACAGCTATT CTTGGAGTGG CCCTGGGCAA AGCAATAAAG GGGCCCATTG 60
TGCCCCTGCA GATCCTGTTG GCTGCCTTCC TCCTCAGGAA GAACCCTTTA GAATCTCTCT 120
CGCAGAAACC CGAGAGCCAG GGGCTTCAGG CACCTGGATT GTCCCTGGAG GCTGCAGGGA 180
GGGGCCCAGG ACAGTATTGA GGGAAAGGGA GGGGGCTTGG GGGTGGTTAT GACCTTCTTG 240
CTTATTAGAG AGAGGCTAAG GAGAGCATGG ATGGAGGGAC AGGCTGCCAA TCACTGTGGC 300
CATGTCTCCT GCCTACCATG GAATCCCAGA ACCCAGGACA TGGATATGCT CAGTGTAGTC 360
TTTGGCAATA CATGAATGAA TGCACCTGCC CTTCTTGGCT TTCCAAGCTG TATTACACAA 420
GTGATTTAAA AAACAAACGA ACAAACAAAA AAAACCCAGA AATCAGGTCA TGGGCTTTCT 480
TGAAAATATT CACTGGCTCC TCAGTGCCTA CCCATACAAG AATATCCAAA CTCTTCATCC 540
TGGTGTTGAA CTAGGCACAT TTGGCCATTG CAACTCAGCT TGACTCTCTG GTTTCATTTT 600
CTGCGGTTCC TTCCACCACT TCAGCTCCCT GCATTGTTCC ATCTACTGTG CATTTTGACA 660
TATGTTGTTC CTTTTACCAG CAAGACTTTC CCCTGACTTC TCTGCCTGGC AAATGTCCAT 720
CTCTCCTTGA AGACCTAACT CCATCCATTT GCCCCCACAG TTACTGGCCC TTTTGGCAGT 780
TCACTCCTTG AAGGTAGGGA TTGGATCTTC TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTCAGCACCT 840
GGCCTAGTAT GGGCACACCG TAAGTATAAA TGTTTGCTGC AGGAGGGCTG GAGGAGGCGG 900
GCTTACTTAT ATGGTCGTTC ATTCACTCAA CATGTATTTA CTGAGCACTT ACAATGTGCC 960
AGGCACAGTT CTAGGCATTG AGGGGTAGAT TAGTGAAAAA GCAAACACAT TCCCTGGGCC 1020
CATGGAAAAG ACAGACCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GGGACGGAGT CTTCCTCTGT 1080
TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCATGATCT TGGCTCACTG CAATCTCTAC CTCCTGGGTT 1140
CAAGCGATTC TCCTGCCTCA GCCTCCTGAG TAGCCGGGAT TATAGGAGCC CACCACCACG 1200
CCTGGCTATT TTTAATTTTT GTATTTTTTA GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTTGTCCAG 1260
GCTGGTTTGG GACTCCTGAC TTCAAGTGAT CTGCCCGCCT CAGCCTCCCA AAGTGCTGGG 1320
ATTACAGGTG TGAGCTACTG TGCCTGGACA GAAAAGACAG ACTTTCAATG GATTACATGA 1380
TTACAGCTGT GATAATTACT ATAAAGGAGG AGAGGGTGCC ATGAGGCCCC AGTCTGGGGT 1440
TCAAGGAGGG ATTCCCTGAG GAAGTGGCAT TTGAACTAAG GTTTAAACTT TATAATCTAA 1500
AGGACAGGCA GGAATTAATT ACACCATTGC AGTGCTGACT GTAAAAAAAA AAAATTAAAC 1560
CAGAGATTCT TAAATTTGAG TGTGCATTAC CACTACCTAC AGGGCCTACT AAAATACAGG 1620
TAAATGGGCC CAGCCCCTGA GTTTCTGATC TATCGACTGT GGGGTGGGAC CTGAGAAACT 1680
GCATTTCTAA CAAGCTCCCA GGTAATGTTG ATGCTGCTGG TCCCCCACAG TTTGACAACC 1740
ACTGAGTTGG ACAAGGAAGG AGAGGAAGAG GAGCAGAGAT TTCCAAGCAA CAGGACAGCT 1800
TGCGTGATGG CCTGAGGTGG GGGTTAGTCC TGCATGTTCG AGAAGCTGGA AAGAGGGGAG 1860
TGTGTCTGGA GTTTGTGAGC AAGGGGGAGG GAGAGTGGTG GGAGCAGGGA TTTTAGATAA 1920
TGGTGAGGAG CTGGCCTTCC TCTGATTGTA GAGGGAAGTC ACTGAAGGTT TCTAAGCAGG 1980
GGTGGCATGA TCAGTTTTGC ACTGTAGATA GATCATCCAG GGTGCAGGGT TGCCCAGAAT 2040
GCAGGGTGGG GGATGGATTT CAGGAAAGCA ACAGAGGAAG TGGGGAGGAG GTGGCTGCAG 2100
CTGCCCACGT GAGCGATTAT GGTGTCTTGG GACCAGATAG TGGCTGTGGA AATGGAGAGA 2160
AATGGCCACT AGGTTGGTGT CAAACAAACG ACACTTGCCC AGTCCCACAA ATGCTTTGTG 2220
GTCTCTAGGA GCCATGGTCC TCTCTGGTCT TGGCTCGGTC AGTGGGGAGG GTCACTGGCT 2280
TGGCCTTGCA GGGCTGGGGT GGCTCACCAG CCCCAGACTT GAGGGCATGA AGCGCCTGCT 2340
CCTTGCTGGC ATCTGGCTTT CTTAGCTTGC CCGCCTGGCC TGGGCCTCAT TAACACCAGC 2400
TGGGGCTCAT CCCCAGAGTG ACCCCAGCTC CTGGCAGCCT GGGTGTGACA TCCTGCTCTT 2460
GGGGCTTTAG AGGAGTCTGG GGGGGGGAGT CGTGGGTGCC AGCCTGTCAT GCAACCCCAT 2520
GGCGAGCAAG AGGCAGGCAA GGACCAGCGG GGAGAATGAC CTCAGTCCAG ACCTCACACC 2580
TGGTGCTCGG CATGGTGGTG GCTGGGGCCC TGTGGGTGGG CAGCTGCCCT GAACAGGGAT 2640
CAGTGGAGGC AAACAATGAC GTCTGCCTTC AGCCAGCTTC CCTCACCACC TGGTGCATCC 2700
AGCTGTCCCG GGCCTCTCCT TAGGGAAGAA ACAATCTGAT CTATAGCTAC TCCTCTCCTC 2760
AGAAACCTTC AGTGACTCCC TGCTACTTAC AGAACAAAGT CCAATGTCTG AACGATGTAT 2820
TCAAAGCCTG GTTAGAGCTC ATTGACCCTC CAGCCTTATA CTCCAGGCCT CTGAAGCTGT 2880
GCCCTTTCTG TCTCTGTGTG CCCCAACTTC CCTGCCAGTT ATCTCTGCCC CTGAGTGGCA 2940
TGTTCTTGGT CTCACTCTGA ACCCCAGTCC ATCCTTCAAG ACCCAGCTCA GTTGCCACCT 3000
CTTCCAGGAA GTCATCCCTG ATCTCATCAG CCAGAATATA TCTCTCCCTC CATTTATTGG 3060
TGTCTCAAAC AACACTTAAT AAATTCAGTT CTAGATTTCT TTCCCATAAG TGCTATGAAG 3120
TCTTTGAGGA GAGGGATCAG GTCTCATTAT TACTTGTTTT CAAAATAAAC TCAATACTAA 3180
TACATAACAA CTTACTGAGT ATTTACTATT ATTATTATTA TTATTATTAT TATTATTATT 3240
ATTTTTCTAA CCACTAGACC ACCAGGGAAC TGAGTATTCA TTATGTCTCA GGCACTGTAC 3300
CAAGCCCATG GCCCACATGA CCTCAGCCCA TTCTTTCGAT AACCCCATGA GGCCCATACC 3360
ACTGTGATTT CATTTTACAG ATGAGCACAT TGAGGCCCCT AGAGGGCAAG CACCCGCTTC 3420
AAATCTCAGG GACAGTCATG GCCGAGTGTG AGGGGAACTC AGGCTCTCTG AGACCTGGGC 3480
CTGGCTGTCC CCTCCCTGGG AGAGAATTCA AAGTCTGGAG TCTTTCCTGA GATCCCCCAG 3540
GTAGGTGTGC CTGGTGTGGG GCAGAGGGGA GGATCAGGCC TGGCTCTGAA GAGGACCAAA 3600
TGAGAGCCCC TTACTTATTT CACAGGTGGG AGTCTGAGAC ACAGAGAAGG GACACTAAAG 3660
ACTGGCTTCC TGTCCTGGGC TCTTGGGTCA ATGACAGAGA GAAGCAAGCC TGGGCCCATC 3720
AAAGCCTCTG GGTGCAAGGT CTGGCGTGGC TGGGCAGGAA AGAGCTGCCT TCAAAAGCTG 3780
CCTCCTCCAA 3790