EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00345 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:12044150-12048920 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2336384chr112046063hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:12044927-12044938TCCTTATCTGT+6.14
NR2F1MA0017.2chr1:12046934-12046947CTTTTGACCTTTG-6.87
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:12048380-12048395TGAACTCCTGACCTT-6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:12047470-12047485GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:12045743-12045758TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6MA0677.1chr1:12046938-12046952TGACCTTTGACCAA-6.16
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_28500chr1:12037809-12046747Fetal_Intestine
SE_29466chr1:12037756-12047000Fetal_Intestine_Large
SE_40992chr1:12038203-12047280Left_Ventricle
SE_40992chr1:12048297-12051846Left_Ventricle
SE_42819chr1:12043301-12045523Lung
SE_42819chr1:12045532-12046902Lung
SE_49145chr1:12043306-12045482Right_Atrium
SE_49145chr1:12045709-12046770Right_Atrium
SE_49145chr1:12048367-12051817Right_Atrium
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr11204595912046248
chr11204629912046451
chr11204602312046196
chr11204520012046695
Enhancer Sequence
GTGTACACGC TGTCGAGTCT TGCAGTTAGT GAGCACTAAT GCTTTTGGTT TTATATCTCC 60
TGGGCTTGCA AACATTGACC AGAACTTAAA AGCACCTGCT TCTGATGGCA GGGAACTTGC 120
TTCCTGCAGC AAGTCACTTC TGGAGTGGGG TATCGCTGAT CCTTCCCCAG CTGACCTGTT 180
TATTTGATCT CCGTGATAGC GGGTAAGGGA GTGGTGTGTG TGGTGTGAGT TGGCGGAGTT 240
GCCTCTGCCC TCCCTGAAGG CTGGGTGTTC ATGGAGAGAG TCTTGTGATC TTGCTGGTAG 300
AGTTTGTTGT TATTGTTTTA TAACATGTAA AGCTGCCTTT AGCTCTTACT GTAGTGAAGC 360
ATGTTGCTTG CGTCATCAAC TTTAGTCTTC TCACAGTTTA GATGGTATTG TGGTATTAGG 420
ATATTGGTTT TCATCCACGG ATCCAGGCTC ATAACTCCTA TCCACAGCCC TTGTTATGGT 480
TTTTTGATAT AATGTTAGAT GTGTTAGGCC TCAGGGGCAG GCCTCTGACC TTCTGCTCTC 540
CTTCCACCCT AATCTTTCCC CACCTGATTG TGGGCCTTAA AACCCTCCCC TGAGAGGGGT 600
GGACCCTGTA TCCTGGGGGA AGGAATGCTG ATGTCATGAA GCTTCCATAA AAATCCAAGA 660
GGACAGAGTT CAGGGAGCTT GTGGATAGCT GAACACACGG AGGTTCCTAG AGAGAGGCCT 720
GCTCAGGGAG GGCACAGAAA CTACACGCCT CTTCCCCCAT ACCTCGCCCT AAGCGTCTCC 780
TTATCTGTAT CCTTTGCGAT ATCCCTCATA ATAACCTGGT AAACGTAAGT AAGTGTTTCC 840
CTGGGCTAGG TAGGCTGCTC CATCAAATTA ATTGAACTCA AAGAGGGGGT CATGGGAACC 900
CCAGCCTGAA GCCAGTCGGT GAGAAATTCT GGAGGCCCAG ACTTGCAACT GGTATGTTTG 960
AGGGGTGGTG GTGGAGAGGC GGGGCAGTCC TGGGGACTGA GCCCTCAACC TGTGGGATCT 1020
GACACTCTCT CCAGGTAGAC AGCATGGGAA CTGAATGAGA GGATACCCAG CTGCTGTCCG 1080
CTGGTTGGTG TGTGGGGAAG AAACCCCCTC ACATTTGGTC ACAGAAGTCT CTTGTGTTGA 1140
TGATTATGGT GTGAGAGTAG AGAAAAAAGA TAATTTGAGA CAGTTTCTCT CTCCAGTAGG 1200
TGTCTTGTTT GTTGTACACA TGAAGAAACC AAGGTTCTGT GATGAAATAA CTTGCTTAAG 1260
TTTAAGCAGC CCAGAAATAA TGTAGTCACA ATTTGAACCC AGCTCTGCCT GATTACAAAA 1320
CCTGTCATAG GTAGTGCTAT ATCATGCCCC ATCCTTGATC CCTTTTTTTT TTTTTTTTTT 1380
TTTTTTTTTA AAGAGAGAGA CTTCGCTCTG TCACCCAGGC TGGAGTACAG TGGCGAGATC 1440
TTGGCTCACT GCAAATTCTA CCTCCCAGGT TCAAGTGATT CTCCTGCCTT GGCCTCTGGA 1500
GTAGCTGGGA CTACAGGCAT GCGCCACCAC ACCCAGCTAA TTTTTTGTAT TTTTCATAGA 1560
GACGGGGTTT CACCATGTTG GCTAGACTGG TCTTGAACTC CTGACCTCAG GTGAGCTGCC 1620
TGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCATGAGC CACCGTGCCT GACCCCTGAT 1680
CCCTTTTCTA TTCCTTTTGG ATGGCTTTCC TCTTGTGCCT GCCACATCCC CTCTTTCTCG 1740
AACAGTCTGA TCTGCCAGGC CATGGCAAGC CTCATTTCAG CGCACTCTCC TTTGCTGCTT 1800
TGGAAGAGTG AGAGTAGCAT TTTCTTTGCA GTTTCCTTTC TCAGAGCTGT ACTGTCTTTA 1860
AGCCCTGGAC ATATGGCTTC CATGCTGAGA AAACATCTCT CATAGCTGTG GCGTCATGCT 1920
GAGGAGGAAT GTAGAAACGG AAGTGGGGTC ACTTCCTTCC CTTGTCTCCA GAGGAATCAT 1980
TAACATTGCA CAAGAACTTG TTGGTTTGGG CACACATGTG GGTCCCTATC CCGCTTTGGG 2040
TCGGTCTGTC TTCTGCCCAC TCTTTGGGAT GGTTAGTTAC TAAAAGTCCG TTTTGGCATT 2100
TGGTCTTCAT GTACCTCTTC CGGGTGTTCT TTCTGCTTTT CAGGACCTTG TGCAACATAC 2160
TTTGGCCCCA TTTGGAAGTT TTTCACGTGT GCTTGCTGGG GAGCAACACC TCATTTCCAA 2220
TCTAGAGAGA GTGAGCTTAC TGCTGGGTGG AGAACTGAGC AGTAAGATTA GGGTGGCTGG 2280
GGAGGCAGTG ACAGACCCAG GCACAGTCAG CTGTGCACAC ACCCCCTCAT CCAGGAGGGC 2340
CTTTGCCCTT TGACTTCCTG GGATTGGTGG GCTCTGCTCA AGAAGTAGCT TTCGCCGTGG 2400
TGGGAACTCT GAGGGACCTG GCAGGGGTCC ACTTTTGGGG TCGGAATTCC CAGTCTTACC 2460
CTGGGCACTC CTTCTGGTGT GTACGCCTCT TTTTGATCTT TTTTTTTTTT TTTTTGAGAT 2520
GGAGTCTTGC TCTATTGCTC AGGCTGGAGT GCAATGGCGC GATCTTAGCT CACTGCAACT 2580
TCCAGCTCCC AGGTTCAAGC AATTCTCGTG CCTCAGCCTC CCGAGTAGCT GGGATTACAG 2640
GTGCCTGCCA CCATGCCTGG CTAATTTTTG TATTTTTAGC AGAGAAGGGG TTTCACCATG 2700
TTGGCCAGGC TGGTCTCAAG TGATCCACCC GCCTGGGCCT CCCAAAGTGC AGGGATTATA 2760
GGTGTGAGCC ACCATGCCCA GCCTCTTTTG ACCTTTGACC AAAGACCTCT AGGACTTTGG 2820
AGTCAAGTCT CATGACCTCT AAAATGTTGT TATATGAAAA GATAAGCTAC AAAGATATGT 2880
AGGATTGAGT GAGAGCAAGA GAGACAGTCA CACAAAAATA GACTGTGATA ATATGGCTGG 2940
GTACGGTGGC TCACGCCTGT ATTCCCAGCA CTTCGGGAGG CCGAAGCAGA TGGATCACTT 3000
GAGGTCAGGA GTTTGAGACC AGCCTGGCCA ACATGGTGAA GCCCTGTCTA CGAAAAATAA 3060
AAAAATTAGC TGGGTGTGGT GGTACATGCC CGTACTCCAA GCTACTCAGG AGGCTGAGTG 3120
AGGCAGGAGG ATCGCTTGAA CCTGGGAGGT GGAGGTTGTA GTGAGCTGAG ATTGCACCAC 3180
TGCACCCAGC CTGGGTGACA AAAGTGAGAC TCTGTCTCAA AAAAAAAAAA AAAATTATAA 3240
TAAACAAAAT GTTGGGCCGG GCGTGGTGGC TCATGCCTGT AATCCCAGCA CTTTCGGAGG 3300
ACAAGGTGGG TGGATCATTT GAGGTCAGGA GTTCAAGACC TACCTGGCCA ACATGGTGAA 3360
ACCCCACCTC TACTGAAAAT ACAAAAATTA GCCGGGCATG GTGGCGAGTG CCTGTAGTCC 3420
CAGTTGCTTG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT AGCTTGAACT CGGGAGGTGG TGGTTGCAGT 3480
GAGCCGAGAT CATGCCACAG CACTCCAGCC TGAGCGATAG AGCAAGACTC TGTCTCAGAA 3540
AAAAAAAAAA AAAATGTTGG CTGGGCATGG TGGCTCACGC CTTTAATCCC AGCACTTTAA 3600
TCCCAACACT TTGGGAATCC AAAGTGAGAG GATCATTGGA GCCCAAGAGT TTGGGAGCAG 3660
CCTGGGCAAC ATAAGAAGAC CCTGTCTCTA CAAAAAATTT TAAAAAAATT AGTGGGGCGT 3720
GGTGGTGCAT GCCTGTGGTC TCATGTACTC AGGAGGCTGA GGTGGGAGGA TTGCTTGGAC 3780
CCAAGAGGTT GAGGCTGCAG TGAGCTGTGA TTGCGCCACT GCACTCCAGC CCAGGTAACA 3840
GCGAGATCTT GTCTCAAAAT AAAAAATAAA TAAGTAAATA AAATGTTAAC ATTGCTTATC 3900
ACAAAATGAT GGGGTTATGG GTTTTTTTCC CCTTCAGTTT CCAAATTTTC TGTAGCACAC 3960
CTGTGCTATA CTAAAATAGA CCAATAGTTT TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTTT 4020
CTTTGTTGAG ACTTGGTCTG GCTCTGTCAC CCAGGCTGGA GTACAGTGGT GCGATCTCGG 4080
CTCACTGCAA CCTCCGCCTC CCAGGTTCAA GCAATTCTCT GCCTCAGCCT CCCAAGTAGC 4140
TGGGATTATA GGCGGCCACC ACCACACCCG GCTATATTTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC 4200
GGGGTTTCAT CATGTTGGCC AGGCTGGTCT TGAACTCCTG ACCTTGTGAT CCACTTGCCT 4260
CAGCCTCCCA GAGTGCTGGG ATTACAGGCA TAACCCACCA TGCCTGGCTG TTTTTTTTTT 4320
TTTTTTTAAA TAGAGACGGG GTCCTACATT GCCTAGGCTT GTCTCGAACT CCAAAGTTCA 4380
AGTGATCTGC CTGCCTTGGC CTCTCAAAGT GCTGGGATTA TAGGTATGAG CCACTGAACC 4440
TGGCCCCTAA CCAATAGTGT TTTTATGTGG TCTTGCTCTG TCTCCCAGGC TAGAGTGCAG 4500
TGGACTGATC ATAGGTCACT GCAGCCGAAA CTCCTGGGCT CAAGTGACCC TCCCACCTCA 4560
GACTCCCAAG TAGCTAGGAC TGCAGATGCA TGCCACTGTG TCATGCTAAT TTTGTTTTAT 4620
TTTTTGAGAC AAAATCTCGC CCTGTCACCC AGGCTGGAGT ACAATGGCAT GATCTTGGTT 4680
CATTGCAGCC TCCATCTCCC AGGTTCAAGT GATTCTCCTG TCTCAGCCTC CCAAGTAGCT 4740
GGGATTACAG GTGTGTGCCA TTGGGTCTGG 4770