EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00176 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:8454570-8459230 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:8457948-8457959TAATTCAATCA+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8455317-8455332AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
POU2F2MA0507.1chr1:8459035-8459048TTAATTTGCATTT+6.25
SNAI2MA0745.2chr1:8458908-8458918AACAGGTGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 42             
IDCoordinateTissue/cell
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SE_02022chr1:8455562-8457961Aorta
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SE_03947chr1:8455648-8458563Brain_Anterior_Caudate
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SE_11329chr1:8446106-8460302CD20
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SE_52016chr1:8454055-8455308Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52016chr1:8455374-8458830Skeletal_Muscle_Myoblast
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SE_53408chr1:8455166-8459067Spleen
SE_54752chr1:8455534-8458192Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
SE_63725chr1:8453894-8455322HSMM
SE_63725chr1:8455410-8458900HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr184555358455974
chr184560118457893
chr184546558455368
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008393chr184539948459064
Enhancer Sequence
TTTGTCCAAG GACAGCGGGA GTGGAAAAGG AATTCACACA CATTTCCGTT TTCCAGTAAT 60
TTAACTTAAG AAAGGAGCTA CTGCAGAGAA CAAACTTATC AGTCATGGAA TCCCACATCA 120
CTCAGTGCTG GAGAGGGGGA ATGAGCAACA AAAAAGTGAC AAATCATAAG GTCTGAGTCC 180
CAACTCTCAG CCAGAGTCAC CCAATTGCTT CAGAAGACTG TTACCCCAAG GAAATAAGAA 240
AAAAATACGT TAACTTGCTC TGTAAACCAT AAAATCCACT ACTAGTATAT ATATATATTA 300
TATCTCCATG AAGCACTTAC CACAGTTACA CTTGGTTTTT GTTTGCATTT CTTAGCAGGT 360
GATTAATACT TTAAGGGGAG AGAAACTGTA TTACTCATTT TTATATCCTC AGCATCTATC 420
TAAAATGTCT TTCCCATAGA AACTCAAACG TCTGTTGAGT GGTTGAGTGA GTAAATAAAT 480
GTAAATAAAA TAAAAAAGAA AACATATTTT AAGGGCCAAA CAGCCCAAAG GCATTCCATG 540
AGGGAAGTTT GTTACTAAAC TTTCAGATAA GGTGTCTAGT ATTTCCTGTA ATAAGATATT 600
GTATATTCCC CTTCTCCTGC CCACAGAATA AATCAAGTAC AAAGAAACTA AAAATAATAA 660
TACCAAAGAA TGAGCAATTT CCGGGTCGGG TGCAGTGGCT CATGCTTGTA ATCTGAGCAC 720
TTTGGGAAGC CGAGGCGGGT GGATCACAAG GTCAGGAGTT CAAGACCGGC CTCGCCAATA 780
TGGTGAAACC CCATCTCTAC TAAAAATATA AAAAATTAGC CGGGCGTGGT GGCACACGCC 840
TGTAGTCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC AGGAGAATAG CTTGAACCCG GGAGGCAGAG 900
GTTGCAGTGA GCTGAGATCA CGCCACTACA CTCCAGCCTG AGCAACAGAG TGAGGCTCTG 960
TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA GAATGAACAA TTTCCTCTTT GGTCTTGTCT GCATAAAAAA 1020
GGAACCTCTC CTGCTCAGCT ATGCAGGCAC CTGGAGACAT TTGAAGCTGG AGGTAGGAAA 1080
AAAAAAAGGT GAAGGTGAGC TTGACCTAGA AGGGCAACTG TGAACAAGGT GCTTTGAGGA 1140
AGCAATGTCA AACCTGTGTG GACCTTTTTG TAAACAGGTT AATTTCCTAA ATTCTTTTGT 1200
GGGAATATAA GACATCCGTG TTTCTAAAAC GGGAGAGGAG AGGAAACAAA AACCAAAACC 1260
AAAACCACCA CCATGCACTG AAGGCCTGCA GTGGGGGCAC AGGAGGAAGT ATGAGAGGTT 1320
CCATGCCTGA GTTGTGATGT TTGCAGAGAA TTAGCCAGTG AGAGTGCCCA AGGAACACGG 1380
GAGCACAAAT CTGAGAAGGA ACACTCGAAC GAGGACCAAT TCTATTATTA TTATTCTGCT 1440
CTGTAAGGCA TAGGTGACAC CACCCCTCTC TCTGTGCTTA AAGGACAGCC ATTCCATTAA 1500
CTACCCACCT TGAATGGATT CCAGAGAAAG ACTTTGTTCC CCAAGAAATA TTAGCAAAAG 1560
CCTTCAAGCC AGGGCTAAGA GCCTTAGTGA CAAGTGAGAA GGCACAGAAC AACTGAGCAG 1620
AGATCATCTC TTGAAAACCT ATGCTAATTA TCCTGTTTCT ACCATCAGGA AAGTGGGAGG 1680
GGGGAAGGGC TGCTGTGCTA TCACTTGGGG TCCATTCTGG GGTCAAATTT GAATCCCAGC 1740
TTCTAGAGCT GAATTCAATG TGGAGTTTGT TGTCCATGCC AAAATTCAAA GGCTGATCAA 1800
GTTGAAGAAC GTGACATGGA CATAATGTGA AGTACATGAA AACTCACATA CAAAGTACCT 1860
GCCCTCCTGG AACCAGTCCC CAGTTATCAC AGAGCCGAGA GGAAACCAGT CCCCTATTAT 1920
CAAATCCTCT TACTCTTGAC TAGAGTGATG GAATTTGGGA AGAATGCAGC AGACTTCTAA 1980
AGACTGCTCA GCTACAAGCA GGATCTTCAT CTCCTTTTCA GCTGTGGATA ACAACGGAAG 2040
CAGTCAGCCG TCTAATAAAT CAAGTTTAAT TTTAACAGCA TGAAGTATTG CCCGCTTTGT 2100
AATTATACTT CCAAAGGTAA AACCCAACTC GAATTAACTT AAAAAAATTG TTATTGAGGT 2160
AAAATTCACA TAACATAAAA TTAATCATTT TAAAGTTTAC AATTCAGAGG CAGTTAATAC 2220
ATCTACAATG CGTGCAGCCC TCAGATCTAA TTCCAAAACG CTTTCATCAT CCCCCAAAGG 2280
AGACCCCTCC CCCTCATTAA GCAGTCAAAG TGAACTTTTT CCACAATGGC ATTCTTTGTG 2340
ATATATCATG CTTTCTCCAC AGTATCAGTT TATTCACTTT CAACAGCATC TTTGCATTTT 2400
AAAGGTAAGG GAAAACTCAA AGGACCATGA GAACTAACAC TCACAAATGT GCTTTCCAGT 2460
CTACCACGTG ACTGTATACA CATCTGGTGA GACAGTTATC TCAGGCAAAA TGTACTGTGT 2520
GTCTTCCCTG GGAGGAGAAA CAGGAGCTGA TTCTAATGGA ATGTTTACTA TGTGACAGAT 2580
ACTGAGTCAG AAACAGCACA GCAGCTAAGA CTGGGTGCTC TGCAACCACA CTGCCCAAGT 2640
TCCAGTTCCA ATTCAGTGTG AACTCTGTGT TCTTTGGGCA AGTCATCATA ATCTCTCTGC 2700
CTCCTTTCTC TTCACACGTA TTGTGATGGC AACACCACCA CTTGCCTCAT GGAGATGCTA 2760
TGAAGGTTAA GTAAGTTCAA GTGCTTAGAA CAGTGCCTAG TGCATAATAA GAGCTCAATC 2820
ACTGCTGCCT TATTCGACTT TCACTACGAC TCTGAGGGAG GTTCTATTTG TGCCCCCATT 2880
TCATTACTGA GGAACTTAAA TTTTACAGCA TCTAAGAGAC TTACCCCAAA CCCCCAGAGA 2940
ATAAGTGGGA TAGCTGGGAT TTGAACTCAA TTCTGAGTTC TGTTGGCTTA GCAACCATTC 3000
TGTAAAATGT ACCAAGGAAC AAAACCTTTC TGATCCCAGT TACCAAACTC ATGTTGAGCA 3060
AAATCACACT CACACAGGAA AAAAAAAAAA AAACACATGA AACTGTCACC AAAATGGCAA 3120
TAACCCAACT GTGCTACAGT TTTATTTCCT GCTGGCTTCT CAGTTCTCTA AGCCTTGAGG 3180
ATCCACGCGC CTTAGACCAT TATTACCTCC TCCCCCATAT GCAGTAAGTT CCTGACTCTT 3240
CTGATCTTTC CTGTTCTTAC TGGGCACCAT CCCCCAAGAC CTTCTGCTAT TTGTACTTTC 3300
TGATTTCAGG CTCTTTATTC TCTGATACAC ACTGTTGCCA GAATAATCTT CAAAAAGATT 3360
GACTGCAACT TTCAACTTTA ATTCAATCAT ACAAATATTT CTTGAGCATC TAGGTGCAAG 3420
GCACCATGAT GAAGATAATG TGAGTAAGAC AGTCCTTGCC TTCAGGAGCT CAATCCAAAA 3480
AGGGAGGTGT AAGATAGAAT TTCATAAGAC AATGCAGAGC CAGAGAAAGG CCCTAAGAGA 3540
GGCATGATGT TCTACAGGGG TATTCAAAGG ACAGAGTTAT ATCCTCCTCA GATTAGAGAA 3600
AGATTAATGA AGGAAATTAA GTTTAAAAAT GTAGAGCATT TCCACATGGA GTAACAGAAG 3660
GGCAGGCATT CTGGGCAGAA CACTGCAGGA AGAAATGGCA GACAGGAAGC CTGAGTGTTT 3720
GGCAAGGGCC AGAGGTGCAG AAAGAAAAGC AGTAGGGAAG GGGCTTGGAG AAGCTGATTT 3780
GGACCACAGT ATAAAAGGTC TTGACTCTCA GGCAAGGGGG TTAGTACTGA GTGTGGCTGA 3840
TGAAATCTCC ATAGCTTTGC TCTCCTGTGT GCTTTGCTCA GGGTTGGTTC TCACCATCTC 3900
CCCATCACTC AAGGCCTAGT TCAAGTCTCA GCTTCTTCCT GACGTGTGTC TTGACCGCCC 3960
CAGTGTAAAA TAAGATCCTC TTCTATTAAC AACGACCATC TCTACAATTT ATTTGGCAAT 4020
TAATCACGTA GTGCTTCTAA CATCTGTTAT CAGTCTTAAA TGATTTTTCC TTTTTCTTAT 4080
TATTTATCAT GCGTATTTAT GTTTTGACTC CCCAGTGAAG TATTCACTGA ACTCTAGTGT 4140
GGGGGAGGAG TCTTCCCCAA CTCTGGAAGA TCACCAGAAA ATACGCAGCC TAAAAACAGA 4200
TTTTGTCAGG TGACTCTGAT GACCAGTTGG GTATGCAATC CACTACACCC ATGGAATCTG 4260
GCACAGGGCC TTGCTATACA TCGAAAAATT TGCTATTTTT ACAGGTATCT GTGATTTTCA 4320
CTTCATATCT CAACAACAAA CAGGTGCATC AATGTGCGCG GCCACTAGGA GTACATGAGA 4380
GTACCTGCTT TTCAACAACC TCACTTCTAC TTAGAACTGA TAAACTTTTT TGTAAATATA 4440
ACGGGTGTGA AGTAATATGT GTATTTTAAT TTGCATTTCC CTGTTAGTGA GGCTGCAAAA 4500
CTTTGCAGAC TTTTCAGATT TTCTCAGCTA AAACTACCTG TTCTCATCTT TCACCCATTT 4560
TTCTATTGAA CTGCTTGTGT CTATTATAGA TTTCTACAAG TTCTTCATGC ATTCTAGATA 4620
CTAATCCAGT TATGTTATAA ATATCTTCTC TCAGTCTGTC 4660