EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00102 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:3580260-3585150 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:3580405-3580416TTTTATGGCCT-6.02
EGR1MA0162.3chr1:3583119-3583133GGTGCGTGGGCGGG-6.24
EGR2MA0472.2chr1:3583121-3583132TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr1:3583119-3583134GGTGCGTGGGCGGGG-7.05
EGR4MA0733.1chr1:3583118-3583134GGGTGCGTGGGCGGGG-6.3
HES2MA0616.2chr1:3584179-3584189GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:3584179-3584189GGCACGTGCC-6.02
IRF1MA0050.2chr1:3580263-3580284AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.25
IRF1MA0050.2chr1:3584317-3584338AAAAAAAAAAAGAAAGAAAAA-6.59
KLF5MA0599.1chr1:3584983-3584993GGGGCGGGGC-6.02
MEF2CMA0497.1chr1:3581948-3581963CTGATAAAAATAGCA+6.01
NR2C2MA0504.1chr1:3583211-3583226TGCCCTTTGACCTCA-6.86
Nr2f6MA0677.1chr1:3583211-3583225TGCCCTTTGACCTC-6.65
PHOX2AMA0713.1chr1:3581919-3581930TAATTGGATTA-6.02
Phox2bMA0681.1chr1:3581919-3581930TAATTGGATTA-6.02
RxraMA0512.2chr1:3583211-3583225TGCCCTTTGACCTC-6.62
ZfxMA0146.2chr1:3584074-3584088GAGGCCGAGGCGGG-6.01
ZfxMA0146.2chr1:3581312-3581326GAGGCCTCGGCTGG-6
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr135812693581645
chr135820353582407
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I003663chr135802603580610
GH01I003664chr135807403584717
GH01I003668chr135851243585867
Enhancer Sequence
AAAAAAAAAA AAAAGAAAGA AAGAAAGGAT ACAGACATCC TGAACCGGGG GCTGGGGCCA 60
GGTCTGAAGG CTCTGATCTT CCTTTCTTCT GGGTCTAGGG CACATGAGGG TCTGTGACCT 120
AATTCAGAGG AAGGCCAGAG AACTCTTTTA TGGCCTGCCT CAGGGTGACA GGGAGCAGGA 180
GAGAGCATAC CTGCTTTCCC TGGCTTCTCA GATGCCACCG TGCCAGGTTT TGGGGTAGTG 240
GTATGTCTTG AGCCCAATCA GTACCCTGGG GGTCGTGGCC GGCCCCCCTC CCTCCATGCC 300
ACAGGCTCTC TGGAGAGGCC ACTGCTGTAT CCCCACTGTG AGCTCGATCT GAGCTGCCTA 360
TGGGACCACA CCTGAGAACC CCCAAGGGTG GCACTGGCAG ACTTGAGGTG CCCAAGTGAG 420
GCTGGTGCAG CCCCTCTGCC CTGCCAGTCT GGGCACGGGC CCCTGGGCAT CGCGACTCCT 480
ACCTTCCTAC CAGCCCAGAT GCAGGGCCTG AGCCGGCAGG GCTTCCACCC AGCCCAGGGT 540
GTGTCCCCCT ACCAGAGGCG CTGCATTGGA TAGGAAGGAC CCACCTGTTT CCCTGCCCAG 600
TACCAGCTGG CAGGCCCCCC GTGGCTCAGG GTGCCTGTGA GGAGGGGTGG GGGCTCTAAT 660
TGCTCACCTG CTGCTCTGAG GTGTCAGGCA GGGTTGGGGG TGGCACCTGG GGAAGGCTGG 720
GCTGAGGGGG CAGGCTGCCC CTCCTGCAGG AGAGGTGCAG TATTTCACTG GGTCCTTTGG 780
AAAGGGCAGG GAAGCTCCTG CTCGCCCGTA CTGCACCATT TCCTGTGATC TTAGCAATGA 840
CTTCCTGGCT CCATTTTCTC CACCAGTCCG AATACATGAG CCAGACCCGC AGCTTTCTCT 900
TCCACAGCCT CCTGGCCTCC GGGTCCACCT GGGTGGTGCC CACCCGCCAG ACTGGGGCCT 960
GGTGGTTGTA GGGGACGGGG AGCAGCCTTG CTTCAGTGTG GGTCATTCCT GACTGTGAGA 1020
TGGTTGGGGG GCAGGGGTTG TAGAGTCTGT GGGAGGCCTC GGCTGGGCCT CAGAGAGGGG 1080
TATCTCTTCT GCAGAAAACC CAGCCACCCT TACCAGATGC GGTCAGGCTA CAAAGGGAAG 1140
ATGTGCTCCC TCTTTAGAGG CAGGTGATTC CTGTGAATCC GATGACCGAG ATAAGGTGCA 1200
CGATTCAGTG GGCAAGGCAA CTCACCATCC TCTCTTTATG GTCCTCGCAA TTTGCACCAT 1260
GCACAATGCA GGGTGAAGTC AGCCCCCAAA TTACAGAGGA AAGACTCTGC GGTCTTTGTC 1320
AGTTAAACAG GAGATGCAAA CTCCAAGCTA GTTAATGAGC TGTGATCGGC CACGCTCACG 1380
ATTCAGTGCA GGTCTCTCCT TCCTGCTATC ACAGTCTTTG CCGGCTGCAT CATGACTACC 1440
AACCAGTCCC CTCATAATTA CAAGAGTCTC CTGTCATGTT TTCTTCTGGA GCGAGGCATG 1500
CTCCAACTTG CTTCTGGGTT CTTAATTTTT GATCAGGGAC GGCTCCTTGA CTAATTATTT 1560
GGCAGTAATG AGGGAGGACA GATCGAGTTG TGAAAGTCCC CCCCAAGCTT TTAGAAGGAA 1620
GCTGCAAATT AAAAAATGAG GTATTGGTAA ACAGGATGCT AATTGGATTA ATATGAAAAT 1680
GATGAATTCT GATAAAAATA GCAAAATACA CCGTTGTAAG ATTGAGGCCA GTATAACTCC 1740
AAGAATTCAT TGTCTAATGT TCAGCTGGTC AGTCTGGTCT TTGAAAGTAT TAGAATAACA 1800
GAAAGAGTCT ACTCTTGACG ATGAAGTATA CGGTTAGTAA TTTATGCAAA ACAGAACTTT 1860
AAAACCGGAA GGACTTGATA TGAGTGGGGT GCATGGAAAT CATTCGTATT TTGAAGTTTC 1920
ATAACTCTGA CCCCTAGGTC CTTTGGTTTG TCTCTCTTTT CTTTTTTTTT TTTTTTTAGA 1980
CAATTTCTCT CTCTGTCACC CAGGCTGGAG TGCAGTGGCA TGATCTTGGC TCACTGAAAC 2040
CTCCACCTCC CAGGTTCAAG CGATTCTCCT GCCTCAGCCT CCTGAGTGGC TGGGATTACA 2100
GGCATGAACC ACCGTGCCCG GCCTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTAAGAGA CAGAATCACC 2160
AGGCAAGGTG GCTCACACCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCAAGGCA GGTGGATCAC 2220
CAGGTCAGGA GTTTGAGACC AACCTGGCCA ACATACAGTG AAACCCCATC TCTACTAAAA 2280
ATACAAAAAT TAGCTGGGTA TAGTAATTCC AGCTACTTGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC 2340
GCTTTTGAAG CCAGGAGGCG GAGTTTGTGG TGAGCTGAGA TCGCACCATT GTACTCCAGC 2400
CTGGGCAACA AGAGCAAAAC TCTGTCTCAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGAGAG 2460
AGAGAGAGAG AGAATCTCAC TCTGCAGCCT AGGCTGGTGT GCAGTGGTGC AGTCACAGCT 2520
GACCACAGCC TCCAACTGCT GGGCTCAGGC CATCCTCTTG CCTGTGTCCT GAGTAGCTGT 2580
GACCATAGAC ACACACCACC ACATCCAGTT AATTTAGTTT TGTTGTTTCT TGCTTTTAGA 2640
GACAGGGTCT TGCTATGTAT CCCACACTAA TGAATGTAAA ATCTTAAAAT GGTGCCTGGT 2700
GCAGAGTAAG CTGTGTGTTG GTGGGGTGTA ATTATGGGTC ATATTGACAG TTTCACTTCT 2760
GCGGCATGCC CTCAGGAACT CACTGATGCA CACAGAGGGA CCTGCTGGCA AATACTGAAG 2820
AGCTGTGGGG AGAAAGGAAG GGGTCTGACA GTGAAGGTGG GTGCGTGGGC GGGGGGCTTT 2880
TAATGGTCCC TCTGCTGGCT CCCTCCCCAC CACCTCCTGC CCACCTCCCT GGCCTTGGCT 2940
GCAGGCTAGG GTGCCCTTTG ACCTCAAAGA GGCCTGTCCT GTGTGTCTCA CTGAGCAGGA 3000
ACAAACCGTC CCAGAAGCCC TTCAGCTCGG AAGTGAGTAA GCATTGGCGG TGGGGATGGT 3060
GCTCTGAGCA GACGCGACTC AGTGCCATGC GGGCGTCTCT CCCAGGGCGG CTTTCAGACT 3120
GACCCCCAAA CAGAGGGCTC AGAAAAGATG TTTTTCAATG AGGGACATTT ATGGTTGGCA 3180
AAAAAAAGTG GCTCCCCAAA GGTCTTCACG TCCCAATCCC CAGAACCCGT GTCTATGTTA 3240
TTTCCCATGG CAAAGGGGAC CGTGATTCAG CTATTTTGAG ATGGGGAGGC CATCTGGCAG 3300
GATCCAGGTG GGTCCAGTGT CATCAGGGGG CCCCACAAGA GGGGTGAGAG AGGGAGCTGA 3360
TGATGGAGGC AGAGGTTGGA GGGATGCATT TCAGAGATGG AGGAAAGTGT CACATGCCAA 3420
GGAATATGCC TGCGGAAGCA GGAGAGGACG GGGAGGTAGG GATTGTCCCA GGGCCTCCAG 3480
AACCAAGAGA AGACAGGGGA GTAGGGATTC TCCCAGGGCC CCCCAAAGAC AGGAAGAGGG 3540
GGAAATGTAT TCTCCCGGGG TCTCCAGAAG CAGCCAGCCC TGCCCGCAGT TTGGCTTTAG 3600
CTCCCTGGTA CCCATCTCGG ACTCTGACCT ACAGAACTGT AAGAGAGTAA ATTTATCTCA 3660
TTCTGTGCTG CTCATTGTGT GGTCATTGGT TACGGCAGCC ACAGAAAACA GACAGTGCGC 3720
ACATCCGCAT GGTCCCCTCT CCAGCTCTTG CCTGATAGGC ATAAACGAGG GCAGCTGGGC 3780
GCGGTGGCTC ACGCTTGCAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC GAGGCGGGTG GATCATGAGG 3840
TCAGAAGATT GAAACTATCC TGGCCCACAT GGTGAAACCC CGTTTCTACT AAAAATACAA 3900
AAAATTAGCC AGGCGTGGTG GCACGTGCCT GTAGTCCCAG CTATTCAGGA GGCTGAGGCA 3960
TGAGAATCGC TTGAACCTGG GAGGCAAAGG TTGCAGTGAG CCAAGATGGA GCCACTGCAC 4020
TCCAGCCTGG GCGACAGAGA GAGATTCTGT CTCAAAAAAA AAAAAAAAGA AAGAAAAAAA 4080
GTAAAAAAGA AAAAAAGGAA ATAAACAAGG GCTTGCCCTG TAGTTCACAT CTGGACCACC 4140
CAGCTTAAAA TAGGGCAGGG GAGTTCAGGA ATAGCTTTGC AACCCTTGTG TTACGGTGCA 4200
CAGGTGTGCA AAAATTCTCC TTGAACTCCC CCTTCAGTGT CCCCCCAGGG CTCATGGCCA 4260
CTGTCACTCT GTGCTAGTTG CTCTTCAGAC CAGGGAACAG ACTTGGCCAT GGCTATGGCC 4320
AGGGTCCAGC TGCTATTGCT CCTCCTGTCA CCCACCCACC TTTTGTCTCC AACAAGGATG 4380
TTGAGAGGAG CCAGGCACCA GCCTCCCTGG GTTCAGGTCT TTCCTCTCCC CTCACTTTCC 4440
TATGAACTAG GGGTGGGGGA GGAGGAGTGC CTGCCAGGAG GTCACTGCAG CCAAGGAACC 4500
CAAATTGGTG TGCTTGAGAA TGACCCATGG ATACACTTTC CAAAGAGTCA CCCGGCTGCG 4560
ATGAGGGGCC ATCTCCCCTC CTGGAGCCAA CAGCCATGAG TAGCTGTCAC ACACATCCGT 4620
GCAGCACCTA GACACACATC CGTGCTGTCC ACTCCGTGCT GCTGCAATTG TGGGGGAGGA 4680
AGGTGGCACA GTGGCAGCGA CACACACTTC CCTCTCCAAA ATTGGGGCGG GGCTCCTCAA 4740
AATCCTCTGA CCAGCATTAA AGATTCAGAA TTTGATATTA TGGCTGCATA TAATGTTGAA 4800
TTATCTGAAC TTGCTGCACG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TATTGTTGGT 4860
AGGACCAAAA CGGTTAATTA TCAGCAATTT 4890