EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS059-00065 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM12878 
Coordinate
chr1:1776860-1783260 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:1779804-1779825AAAAAAAAAGAAAAAGAAAAA-6.09
IRF1MA0050.2chr1:1779827-1779848AAAACGAAAAAGAAAGAAGTC-6.09
LMX1BMA0703.2chr1:1783005-1783016TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:1782999-1783012AACTAATTAATTA-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:1783002-1783015TAATTAATTAAAT+6
ZNF263MA0528.1chr1:1779891-1779912TCTCCTACCTCCCCTTCCACC-6.04
ZNF263MA0528.1chr1:1779939-1779960CCCATCTCTTTCTCCTCCTCA-6.29
Znf423MA0116.1chr1:1777175-1777190GGCCCCCTGGGGTTC+6.05
mix-aMA0621.1chr1:1783000-1783011ACTAATTAATT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_05682chr1:1777654-1779699Brain_Cingulate_Gyrus
SE_09353chr1:1776991-1777946CD14
SE_09353chr1:1778042-1779840CD14
SE_09353chr1:1779899-1781671CD14
SE_11548chr1:1775764-1782854CD20
SE_23324chr1:1777926-1779592Colon_Crypt_1
SE_58439chr1:1751668-1840814Ly1
SE_61696chr1:1751792-1802253Toledo
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr117812031781254
chr117779611778126
chr117784821779200
chr117785291779605
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I001845chr117771781779972
Enhancer Sequence
AATTAGCCAG GTGGGATGGC GGGCGCCTGT AGTCCCAGCT ACTCAGGAGG CTGAGGCAGG 60
AGAATGGCGT GAACCCAGGA GGCGGAGCTT GCAGTGAGCC GAGATCGTGC CACTGCACTC 120
CAGCCTGGGT GACAGTGCGA GACTCCGTCT CAAAAAAAAT AATAATAAAA TAAAATAAAA 180
ATAATAATAA TAATGCTTAA AATATTAATA TGGATATGTA TGCCAGAGCG AAATAAGCGA 240
AGATATGGTT ATTTGGGGAG CAAGGCTCAC ACTGGAGAAG GGAGGCACAA CACGGACTAT 300
CTGAAAGCAA GGAATGGCCC CCTGGGGTTC AATCTGAATT TGGAGACAAT GGAAATTCTC 360
TATACATTTA TTCCGCTGTA GAATCATTTG TGTGTAAGTC CATACACACA CACACACACA 420
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CGTATATCTC CTATCTCTTG TCAACTGAAA 480
GGTCTGGAAG CAACGACCTC TCCACACACA AAGCCCAAAT CTTGGTTTTA TAAAAACGGT 540
TCCCTTTAAA AGGAGCTTCA GGGTTCCTCT GAGAAATCAC TCCCTCAAGG TCTGGCACAG 600
GAACCCTCTT GCTATGGCAG AAAGGAAGGG CTCCAAAACT AAAAAGAACA TGTCAAAAAC 660
ACACCAGCTT GAAGGAAGTC TGCTGGCCAA ATTTAGGACA ATCTGAGGGT CAACATGACG 720
AACAATGGTA ATGGAATATA CCTTACTGGA TCTAAAAAAA GAACACACAA GCACATGGTA 780
ACATATAAAT TAAAAAAAAA AAGAGGAAAA GCGAAGCTCT TCTTTACAGA GGAATGCCAA 840
TACACATAGA AGGAGTAAGA TTTAGCCGGG TGCAGTGGCT CATGTCTGTA ATCTCAGCAG 900
TTTGGGAGGC CAAGGCAGGC GGATCACCTA AGCTCAGGAG TTCGAAACCA GCCAGGCCAA 960
CGTGGTGAAA CTCCATCTCT GCTAAAAACA AAAAAATTAG CCAGGCGTGG TGGCTGGCAC 1020
CTGTAATCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAGG CAGAAGGATC GCTTGAACCC AGGAGACGGA 1080
GGTTGCAGTG AGCAGAGATC ATGCCACTGC ACTCCAGGCT GTGAGACAAA GTGAGACTCC 1140
ATCTCAAAAT CAATCAATCA ATCAATCAGA GTCTCACTGT CACCCAAGTG GGTGACAGCC 1200
TTGAACAGCT CACTGAAACC TTGAACTCCT AGGCACAGCC ATCCTCTTGC CTCAGCCCCC 1260
TAAGTAGCAA GGATTCAGGC ATGTGCCACA CTGCACGTGA CTAAATTTTT TGTTTCTTTA 1320
TGGAGAGAGG GTCTCACTAT GTGGCCCAGG CTGGTCTTCA ACTCCTGGTC TCAAGCAATC 1380
CTCCTCCCTT GGCCTCCCAA AGTGCTCAGA TTATAGGAAT GAGCCACTGG TTCTAGCTGA 1440
AAGTGAAGGA CTTAAAGCTA GAGAATTTAA TGCCAGCAAA AGGGTGGCTT GATCAGTTTA 1500
GAAAGAGGGT TGGCTTAAAA AATGTTAAGA TAACAGGAGA AGCAGTTTCT GCCAACCAAG 1560
AGGCACCAGG GTTCCCAGAT GCCATGAAGA AAATCATTGA GGAAAAGAAA ATCTTCCTGA 1620
ATAGGTTTTT AATGCAGACA AAAGTGCCCT ATTCTGGAAA AAACTGCCAC AAAGGACACT 1680
TATTAGTAAG GAAGAAAAGT GAGCCCCAGC ACTGAAGGCA GGCAGGGAGA GGCCAACTCT 1740
ACTGCTTTGT GCAAATGCAG CCGGGTTTAT GATCAGGACT GCTCTTATCT ACAAAGCTGC 1800
TAACCCCTGA GCCTTGAAGG GGAAGAGATA AACACCAGTT GCCAGTCTCT TGGTTGTGGA 1860
ACAAGACTGG GACAACAAAA TCCCTTTTTC TGGACTGGTT CCATCGATGT TCTTTGTCTG 1920
CAGTCAGGAA GTACACTTTG CCAGTAAGGG ATTGCCTTTT AAAGTTCTTT AGATATTGGA 1980
CAAGGCCCCT GGCCACTCAG AACCCCATGA GTTCAATACT GACGGCAATG AAGTGGTCTA 2040
CTTACCCCCA AACACAGCAC CTCTCCTTCA GCCTCTAGAT TAGGGGGTCA TAAGGACCTT 2100
TAAGGCTCAT AACACACAGT ACTCTATGGA AAGAATTGTC AATGCTATGG AAGAGAATCC 2160
CAATAGACAG AACATTGTTT AAGTCTGGAA GGATTATCCT GCTGAAGATG CCAAGGTTGT 2220
TACAGAAAAA GCTGTGAAGG CCATGAGCCT GAAACAATCA ACTCCTGCTG GAGAGGACGA 2280
CGTCCAGATG CTGCGCCTGA CCTCACAGGA TTTACGAGAG CCAGACGAGG AAATCATGAA 2340
AAGACTGTGC ATATGCTTTT AAAAGGGTAG GGGGGTGGGT AAGGACTTCA ACATGTGGAT 2400
CTTAGAGAAA TTCAAGAGCT ATTAGACACC ACACCAGAGG AATTAACAGA ACACACCTTG 2460
ACAGATGTCA GTACTTCCAA CGTGGTGCCA AACGATGAGA AAGAAGCAGT GCCAAAAACA 2520
CGTGGACACT GGGCAATCTG GCAGAAGGTC CCCATTCCCC AAGACTGCAC TTGACTTCTT 2580
TAGGACACAG AGCTTTTATG GCACAGGAAC TAAAACTAAA GCATACAACA GAAGGTTGCT 2640
ATCATACAGA AACTTTTTTA GAGAAATGAA AAAGCAGGCC GGGTGCGGTG GCTCAGGCCT 2700
GTACTCCCAG CACTTTGGGA GGCCAAAGCG GGCAGACCAC GAGATCAGGT GTTCCAGACC 2760
ACCCTGGCCA ACACAGTGAA ACTCTGTCTC TACTAAAAAT AAAAAAAATT AGCCGGGCAT 2820
GGTGGCGGGC GCCTGTAATC CCAGCTACTT GGGAGGCTGA AGCAGGAAAA CCGCTTGAAC 2880
CCAGGAGGCG GAGGCTGCAG TGAGCCAAGA CTGAGCCATT GCACTCCAGC CCAGGCAAAA 2940
AAAAAAAAAA AAAGAAAAAG AAAAAATAAA ACGAAAAAGA AAGAAGTCAG AAATTATGTA 3000
TTTCAGTAAA GTTCCACCAA GTATGCCTGT CTCTCCTACC TCCCCTTCCA CCACCTCCAT 3060
CCAAGACAGC AAGACCAATC CCATCTCTTT CTCCTCCTCA GCCTCAACCT GAAAATGAGA 3120
AGGAAGACCT TTATGAGGGA TCCACTTCCA CTCATTAAAT AGTAAATACA TTTTTCTCTC 3180
CCTTATGATT TTCTTAATAT TTTCTCTAGC TTGATCACAA AAATATATAA TATATAAAAC 3240
ATAAAAACTG TCTTTTGACT GCTATCGGTA AGGCTTCCAG TCAATAGCAG GCTATTAGTA 3300
GTTCATGTTT TGGGAGTCAA GTGATAGAAG AATTTTGACT GCACAGCAGG TTAGCACTCC 3360
TAATCCCTGT GTTAAGGGTC ACGATATTCC TTCCCTTTCA CTCTTTGTAA CACAACTGTC 3420
TAGCATTTTA CTTCTACATG TTTTTTGAAG ACTCCTTCTG GGTCTTTGTT CCCAGTTCCT 3480
CAGAAGGAGC TTCAAAAACT ATTGGATGTT CCGGAGTGAT AGGCATGTCT TTGTTATTCA 3540
TGAGCCTCCA TGTTTTTGCT GAGATGAGCT GACTCAAGAT AGAGGCTGGT CACCAGAAAG 3600
ACAAACCATG ACATTAGACG GTTGGGGTTT GAAACCATTC TGACTGGGGT GGGAGAGGGG 3660
CTAGAGATTG TGCTCTATCA ATTGTGCCCA AGTAACAAAG CCCCAATAAA AACTCTCAAC 3720
ACCAAGGCTC AGGGGAGCTT CCTGGTTAGA AGCTCATTGA CCCCGATTTG TCAGGAGAGA 3780
CTCCATGGGG AGAGGGCTTG GAGGATGTGT GCTTGAGACT CTGCTAGGCC TTGCTGTATA 3840
TATCTCTTCA TTTGCCTGGT CTGATTTATA TTAAACTAGA TATAGCACCA GAAGATAACT 3900
GCAGTGTGAT GGGATACACT TCTGCCTGAA GAACTTCCTC CATCTCACAG GGCAGATCTA 3960
CTGGCAACAA ACCCCACAAC TTTTGTCTGA GGAAGTCTTT TGTGGGACTA GGTCTCATTC 4020
TATCACCCAG GCTACAGTGC AGTGGCACAA TCTTGGCTCA CTGCAGCCTC AACCTCCCAG 4080
GCTCAAGCGA TCCTCCCACT TCAGTCTCCT GAGTAGCTGA GACCACAGGC ACCGCCAGAG 4140
CACCTGGATA ATTTTTTTTT TGTAGAGATG AAGTCTCGCT ATGTTGCCCA GGCTGCTCTC 4200
AAACTCCTGG GCTCAAGTGA GTCTGCCACT CAGTCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGTA 4260
TGACCCACCA TGCCTGGCCT GTATGAAATA CTTTTTTTCT GGCTACATTC AAAACTTTCT 4320
CTTTGACTTT CAGCAGTTTG ACTATAATGT GCCTAGGTGT TGAGGGTTTT TTGTTTATAT 4380
TTATGGTGCT TGGAGTCCTC TGAACTTCAC AGACCTCTGG TTTGTTGTCT TTTACTAATG 4440
AAAAAATTCT CAACCATTAG CTCTTTGAAT ATTTCTTCTG CCCCGTTTTC TTCCTAGGGC 4500
TCCAATTATC TGTATATTTG ACAGTTTGCT ATAGTCTCAC AACTACTCAA CACTTTTTTT 4560
TTGTTTGAGA TGGAGTCTCG CTCTGTACAT AGGCTGAAGT ACAATGGCAC AATCTCAGCT 4620
CACTGCAATC TCCGCCTCCC AGGTTCAAGT GATTGTCCTG CCTCAGCCTG AGTAGCTGGG 4680
ATTACAGGTG CCCGCCACCA CACCCAGCTA ATTTTTTTTT TTTTTCCAGA TGGAGTTTCT 4740
CTCTTGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAATGGC GGGATCTTGG CTCACCACAA CCTCCGCCTC 4800
CCAGGTTCAA GCGATTCTCC TGCCTCAACC TCTCGAGTAG CTGGGATTCC AGGCATGTGC 4860
CATCACACCC TGCTAATTTT TTTTATTTTT AGTAGAGACG GGGTTTCTCC ATGTTGGTCA 4920
GGCTGGTCTC GAACTCCCGA CCTCAGGTGA TCTGCCCACC TCGGCCTCCC CAAAGTGCTG 4980
GGATTACAAG GGTGAGCCAC CGCGCCCAGC CTAAATGCTA TTTTTGTTCT GGTTTATTTT 5040
CTTCTGCTTG TTTCATTTTG GATTTCTATT GACCTATCTT CAGTTTCACT GATTCTTTCC 5100
TATCTGCTGA CAAACTCACT GAGAAAATTA TTCATCTATA ATGTTTTTAA AGAATCTCTA 5160
ACATTTCAAT TTAACTTTTT CTAGAGTTTC TGCCTCCTGA AATTCTCGAT CTTTTCACAT 5220
ATAATGCATG CTGTATACCT TTCTCACTCA ATCTTTTACC ACATCCATCA CAGTCATTTA 5280
AAGTCTCTGG CAGTTCCAAT ATCTGGGTCA TCTCTAAGTT GGCTTCCATT TATTTCTCTC 5340
TTAACAAGAA ATCGCTTTTT TGTGTATCTC ATAATTTTTT ATTGAATTAT CAGATGATAT 5400
TCAATAAAAC CAGAATTGGG TACACCTCTT TGTCTGAGCC ACTACTGTGT GGGGATGAGG 5460
GGTTAATTCA ATCTAGTCTT CAGTTGGGTT TGGATTTTAT AATCCTCAGG GGAAGGCTGC 5520
CTTCAACTTC GTGGCACCAT GTATTTTTCT CAAAAACATA CTGGCCGGCC AGGCGCGGTG 5580
GCTTACGCCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCAAGGCG GGCGGATCAC AAGGTCAGGA 5640
GTTTGAGACC AGCCTGACCA AGATGGTGAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAATTA 5700
GCAAGGCGCC AGGCGCGGAG GCTCATGCCT GCAATTCCCA GCACTTTGGG AGGCCGAGAC 5760
GTGTGGATCA CCTGAGGTCG GGAGTTTGAG ACCAGCCTGA CCAACATGGA GAAACCATAT 5820
CTCTACTAAA AATACAAAAT TAGCCAGGCG TGGTGGTGCA TGCCTGTAAT TCCAGCTACT 5880
CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATCGCTTGAA CCCGGGAGGC GGAGGTTGCA GTGAGCCGAG 5940
ATTGCACCAT TGCACTCCAG CCTGGGCAAC AAGAGTAAAA CTCCATCTCA AAGAAAAAAA 6000
AAAAAAAAAA TTAGCAGGGC ATGGTGGCAC ACACCTGTAA TCCCAGCTAC TCAGGAGGCT 6060
GAGGCAGGAG AATCGCTTGA ACCTGGGATA CCACTGCACT CCAGCCTGGG CGACACAGCA 6120
AGACTGTGTC TCAAAAATTA ACTAATTAAT TAAATTTAAT TTAAAAAAAT ATTGGCCAAA 6180
GAGGAAACCT CACTACTCAC ACCTAGAGGA GGACAGAACA AATGCAGAAA AGCAAGCCAT 6240
ACAACTTCAC ATGAAGATGC AAACAGTCTT GCAGGCTACC ATGAGGACAA GCCTTTACTT 6300
TATTTTGGCA GTAGACTGAA TGTCTGTTAA ACAGGCATTC GGCCGGGCAC AGCGGCTCAC 6360
GCCTATAATC CCAGCACTTT GGGAGGCTGA GGTGGGTGGA 6400