EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS055-00500 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
FT33 
Coordinate
chr1:154390060-154397370 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6689306chr1154395946hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:154390884-154390902GGATGGGAGGAAGGCAAG+6.39
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:154394034-154394052TCTTCCTTCCCTCCTTAC-7.33
IRF2MA0051.1chr1:154394441-154394459GATAGAGTTTCACTTTTG-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:154390963-154390984GGGGGAGGAGGGAGCAGGGGC+6.21
ZNF263MA0528.1chr1:154391457-154391478GGGAGAGGGGGAGAGAGAGGG+6.21
ZNF263MA0528.1chr1:154391432-154391453AGAGCAGGGAAGAGGAGAGGA+6.23
ZfxMA0146.2chr1:154394661-154394675CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 52             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00437chr1:154390273-154397370Adipose_Nuclei
SE_01040chr1:154390266-154394476Adrenal_Gland
SE_01040chr1:154395089-154396159Adrenal_Gland
SE_01040chr1:154396167-154397057Adrenal_Gland
SE_06653chr1:154390374-154394420Brain_Hippocampus_Middle
SE_06653chr1:154394457-154397543Brain_Hippocampus_Middle
SE_09189chr1:154388527-154398657CD14
SE_14719chr1:154390449-154393846CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16173chr1:154390869-154392998CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16173chr1:154393319-154394073CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17632chr1:154390245-154394418CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17632chr1:154395162-154397013CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18405chr1:154389059-154394421CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18405chr1:154394565-154397419CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19165chr1:154390146-154394423CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19165chr1:154394817-154396790CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_24531chr1:154390928-154392675Colon_Crypt_2
SE_26130chr1:154390648-154394176Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26877chr1:154390381-154397107Esophagus
SE_32086chr1:154390256-154393099Gastric
SE_32086chr1:154393209-154394222Gastric
SE_36673chr1:154390756-154393680HMEC
SE_36673chr1:154394402-154396551HMEC
SE_41139chr1:154390423-154394426Left_Ventricle
SE_41139chr1:154394811-154397130Left_Ventricle
SE_41647chr1:154390541-154393000LNCaP
SE_41647chr1:154393206-154394159LNCaP
SE_42431chr1:154390433-154394432Lung
SE_42431chr1:154394877-154395745Lung
SE_42431chr1:154395793-154397326Lung
SE_43544chr1:154384840-154394484MM1S
SE_44716chr1:154390741-154394024NHDF-Ad
SE_44716chr1:154394952-154397278NHDF-Ad
SE_47983chr1:154390623-154393036Pancreas
SE_48261chr1:154388323-154397557Psoas_Muscle
SE_48934chr1:154390514-154394206Right_Atrium
SE_48934chr1:154395791-154397087Right_Atrium
SE_50453chr1:154390541-154394239Sigmoid_Colon
SE_50453chr1:154394901-154397519Sigmoid_Colon
SE_51380chr1:154389216-154394408Skeletal_Muscle
SE_51380chr1:154394475-154397322Skeletal_Muscle
SE_52880chr1:154390698-154393024Small_Intestine
SE_52880chr1:154393210-154394221Small_Intestine
SE_52880chr1:154395805-154396974Small_Intestine
SE_54278chr1:154390562-154394244Spleen
SE_54618chr1:154390203-154397361Stomach_Smooth_Muscle
SE_59139chr1:154375857-154394038Ly3
SE_62668chr1:154357227-154415486Tonsil
SE_64458chr1:154390429-154393143NHEK
SE_64458chr1:154393145-154396883NHEK
SE_65390chr1:154390491-154396964Pancreatic_islets
SE_67236chr1:154384840-154394484MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 9             
ChromosomeStartEnd
chr1154390409154391113
chr1154392646154393050
chr1154394967154395363
chr1154391539154392211
chr1154394684154394789
chr1154395885154396482
chr1154391445154393753
chr1154395894154396284
chr1154395096154395640
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I154416chr1154388767154390150
GH01I154417chr1154390221154396888
Enhancer Sequence
CCTTTCTTTT TTTGAGACAG GGTTGCCCAG GGTGGAGTGC AGTGGTGCGA TCTCGGCTCA 60
CTGCAAACTC CATCTCCGGG GTTCAAGTGA TTCTCCTACC TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG 120
GATTACAGGC ATGCACCACT ATGCCCAGCT AATTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGAGATGG 180
AGTTTCACTC TTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT 240
TCCGGTTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAGTA GCTGGGATTA CAGGCACCCG 300
CCACCATACC CGGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGACA GGATTTCACC ATGTTGGCCA 360
AGCTGATCTC AAACTCCTGA CCTTGTGATC CGACCTTCTC TGTCTCCCAA AGTGCTGGGA 420
TTACAGGCGT GAGCCACTTC ACCCGGCCTA ATTTTTGTAT TTTTTGGTAT GGATGGGGTT 480
TCACCATTTT GGCTAGGCTG GTCTTGAACT CCTGATCTCA GGTGATCCGC CAGCCTCAGC 540
CTCCCAAAGT GCTGAGATTA CAGGCGTGAG CTGCCGCACA TGGCCTTAGA TATCTTTTCC 600
TCTAATTAGT TTATAATCTC TGAGAGTTGA CCCAGGTTGT ACCTTCTTGG ACTGGAGCCA 660
GGTGGTTATC TCTGATGCTG CCAGAGGAGG ATTAGATGTT TTATCTCCTG AGTTGGTCAC 720
ACGCGCACGT GGGTCTCTGA GTCAGCATTG AGCATTACCT GTTTATGGGT CCAAAGGAGC 780
CTCCCTCCCA GACCCTCTCT CCAGCAGTGT ACAGTCCATC GTGTGGATGG GAGGAAGGCA 840
AGGCCAAGGT AAATACTGAC TCAGACAAAT ACAAGCAGGT ACAAGAAGTA CAAATACATA 900
TGTGGGGGAG GAGGGAGCAG GGGCCTGCCA GCCAAAGCTA GTCATCTGAG AAGAGGGGGT 960
TGCGGACAGG TGGGGCTGGG AGCTGAGTCA GAGAAGGTTG CTGGGCCTCC CATTAGAGCC 1020
TGGGAGCCTT GACTTGCCGT AGCCTGCGGC CTTGCCTCTT CCTGGACAGT GGCCGAGGGT 1080
GCCCTCTGAA ATGTTAAGGA GAAATGAATG GGCCCAGATG GTGGGGTGAC TTGGGGAGGA 1140
CGCGAGATTT GGAGTCCAAG GGGAGGCAGT TTTAGGCTCT AACTCATCCT ATACACGCTG 1200
CGGCTGTGGG GGAAGGGAGA GAAAGGCCAA GGGCACGACT CCTGGCTCCT GAGAGTCCCC 1260
AGTGCCCCAT TAGGTTGGCA GCTGCAGTGA TGGCGCTGAC CCCCCCTTGT GCACACCCCT 1320
CAAGCCTCAG CATTCCCTTC CCTGGGCCTC TGAAGGGTGG AAAGATGTGA GAAGAGCAGG 1380
GAAGAGGAGA GGAAATTGGG AGAGGGGGAG AGAGAGGGTG GTGGGGAGCC CAGAGAAGGG 1440
AGCTGGGGGT GGAGCATGGA GAGGTACCTG GGCCAAGTAG AGAGAGGCTT TGGCCAGGCT 1500
CATCTGGGTC CAGCGTGGAT TCCCTCATGC ATGAGCTGTG TGAATTTGGG CAAGTTCCCT 1560
AACTTCTCTG ATCTCTTGTT GCCTCAACAA TGAAATGGGG ACAAGACTTC CTCCCTGGCA 1620
GACTTTTTGT GAGTAGTGTG CTCTTAGGGA AAGCCCAGGG CGCAGGGTAA GTGTCCCAGT 1680
TGCTAATGAT TGTTATGGTT ATTATCACAT CAAAGCCAGG AGCCAGTCTC AGTCCAAAGA 1740
TGGAGAATGC AAGAACAGGT GACCAAGAGC ACTGGGACTT GTCCTAGCCC TCGTGGGACC 1800
AAATTCTATA CTTGTTTCCA TGTGGACACA AGGTGTCCAC AGGCTTCTCC TGGAGGCTTC 1860
TCAGCACCCA CCTACTTTTA GATCAAGACC ATTATTGCTG ACAGGGGACC TTTGTTTCCT 1920
CTGTAGCCCC TTCTGAAATC CTATGCCTTT GCAACCCAAG AAGCTGGGTT AGGCTGGGGG 1980
CCTCCTGTGC TGCCAGCTGG CCTGGGCAGC GGGGACCTGC GTCTCTGCTC AGAAACTGGG 2040
GTGGTGAGAT GGGATTAGCA GGCACGAGCC AAGCCTGTGT CCTCGGTGGC AGGCCAGGCA 2100
GCTGGTTCAC CGCTTACATA AACGGGGCCA GGAAGCTGAA CTTGTTTTTG CTGGCAAGAG 2160
CTGCGGCAAG CTGCAAGAGA GTTGAGAAAT ATGTGTCTCC GTGTGCGTGT TTTTCTCTGG 2220
TTATTGACAT TTGCAAGTTT ACTTGAAGAG GGGGAAAAAG TAGAAAAACA ACAAAGCTGT 2280
TTGGATTCCT GGCACCCAAA CTTAGGTCCC AACTGGGGAG GAACCCCACT TTCCCAGAGC 2340
TGTGCTGCAG GGTCCCCAGA CCAAAGGGTG TCTGGGCCAT GGTGGGGGTC CCAGTGTCCC 2400
TGGGAGGGGG AATCCTAGGC CACCGGGGCA GGGAGATATG GGCTTGCTTG TTGGGAGTTA 2460
CTAGGACCTA AACTCTCTTT CCCTTGAGGA ATGGGAGGCA AGGGAGGTTG TGGGAATTTT 2520
CCCTCCCCTA GAGCTCTCCA GGGAGAAAGA AGCATTTTTC TGAGGGCACT GGGATGATCT 2580
GGTCATCATC CTTCTCCCAA AGCCATCAAC TATTAAATAA TAAATCCATA GATTCATTAT 2640
GTGTTTTCAA GCTGAGTATT GTTTGCTTCC TGCCCTCTGA GAGCTAATGA TTGGGCGCCA 2700
TGGGATGCTA GACCGCAGGA GTGGGGGCCT GTGGGGGATC TACAGGTCAC AGTCTGAATC 2760
CTCATTTCAC AGAGAAGGCC AGTGGGCTCT GCCAGGGGCG GTGACGTGCC CATGGCTGCC 2820
TGTGAGTCAT CACAAGACCA GGAATAGAAC TCAGGTCACC TGACAGCACA GAGCTGTTTC 2880
CTCTACACCA AGGGGCCTCC TGCTTGTGGA GATGTACTTT ATTTTATTTT ATTTATTTAT 2940
TTATTTATTT ATTTATTTTC AAGAAGGAGT CTCGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCAAT 3000
CTCAGCTCAC TGCAGCCTTC GACTCACTGC AGCCTCTGCC TCCCGGATTC AAGCGATTCT 3060
CATGCCTCAG CCTCCTGAGT AGCTGGGATT ACAGGCACAC ACCACCAAGC CTGGCTAATT 3120
TTTGTATTTT TAATAGAGAC AGGGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAACTCCTG 3180
ACCTCAAGTG ATCCACCCGT CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG AGATTACAGG CGTGAGCCAC 3240
TGCACCCTAC TGAGATGTAC TTTATATTAA AGAACAAATC AAGGCAGACT GTACGTTTGT 3300
GTCAGCCCAA CCCCACACAA TTAATAGTCA GTGATTAAAC TGACCAGACC AGACCAGACA 3360
CCAACACTGA CTGTTGAGGA GGAGCTTGGG GGTTTGTTTT CGGGAGGCAA TACTGCCTCC 3420
TTTTGTGATC TTAGTCCCAG GTGAGGTGCT TCCTTGTCCT CTCTGCAGAA TCCCATTCTT 3480
TCTTAGCCTG GGCTGAAGCT GCTCCCTCCC TGTATGTGAC CCTGGCCTTG GCGCAGTCCT 3540
TGGGTGCTCT TCCTCCCTCC TGCCTCTGCG CTGCTTCATG ATGCACAGGA GCCAAGGAGG 3600
GGCAGGGGAC AGTCGGTTTT TTCTCAGGGA GATTGGAAGA GAACAGAAAC AAGAAGCAAT 3660
GGAATGCTCC TGTCCTGGAG GTTGGTGGGG CAGTGGGGAG AGGTGGGGAA GCCATTGAGC 3720
CTGCACATAC TTTTGACAGG CTTGGCTCAT GCCTGCCAAC CCCATCCCAC CGCCTGGGTT 3780
TCTGAGCAGG GACATGGGTC CCCACTGCCC AGGCCAGCTG GCAGCACAGG ATGGCCTCCA 3840
ACCTAACCCA GGCTCTTGGG TTGCAAAGGC ATAGCATTTC AGAAGGGGCC ACAGAGGAAC 3900
CAAAAGTCCC CCTGCCTGTG GAGTCAGGCC TGATCTCTTT GAGGGTGCTC ACACCCTCCA 3960
TGTTCCCCTG TAGGTCTTCC TTCCCTCCTT ACTGCATTTC AGATACTCCA GACACCAGCC 4020
CTCCCCAGAA CTCTCACTGT TTTTTGTTTT TTTGAGACAC AGTCTTGCTC TGGGTCCCAG 4080
GCTGGAGTGC AGTGGCACAA TCACAGCTCA CTTCAGACTT GACCTCCTGG GCTCAAGTGA 4140
TCCTTCTGCC ACAGCCTCCC AGATAGCTGG GACCGCAGAC ATGTGTCACC ATGCCCAGCT 4200
AATTTTAGAG TTTTTTGGTA GAGATGGAGT TTTGCCGTGT TGCCCAGGCT GGTCTCAGCC 4260
ACCTGGGCAC AAACGATCCT CCCATCTCAG CCTCCCAATG TGCTGGGATG ACAGGCGTAA 4320
GCCACGATGC CTGGTGACTC TCAATTCTTT TTTTTTTAAT TATTATTATT ATTATTTTGG 4380
AGATAGAGTT TCACTTTTGT GGCCCAGGCT GGAGTGCAAT GGTGCAATCT CAGTTCACTG 4440
CAATCTCTGC CTCCTGGGTT CAAGTGATTC TCCTGCCTCA GCCTCCTGAG TAGCTGGGAT 4500
TACAGGTGTG TGCCACCACG CCCGGCTAAT TTTGTATTTT TAGTATGGGG TTTCTCCATG 4560
TTGGTCAGGC TGCTCTCAAA CTCCCGACCT CAGGTGATCT GCCCGCCTCG GCCTCCCACA 4620
GTGCTGGGAT TACAGGCGTG AGCCACGGCG CCTGGTGACT CAGTTCTTAA TGCCTTGCAT 4680
ATACTGTTCT CTCTTTATGG AATGTAACTC CCTGTGGCTC CACTTATCAA ACCCCCACTC 4740
ATTTATCAAG GCCCCAATAA AATCTCTCTT CCCCCTTTAG AATAATTGAT CCCTCTTCTT 4800
AGTTCCCTCA GTATGTTGGA GACATTTATA TCAGGTTGGC CTGTATTACA GATAGTTTTA 4860
AGTTCTAGGG CTTTGTGGGG TTTAAAGAAG ATTACGATAT GGAAATGATA GGAAGGAGTG 4920
CCAGTGCATT GTAGATGCTC AGTAGCTTCA ATATGGAGTT TTTTTTTTCC TGGATTAGGA 4980
ACTTCTGAAC TTGCACATCA TGGGTGCACA AAAATTATTG AATTCTTGAA GAAGGGACAG 5040
GCATAGGCTT GCAATCCTGG CTCTGAATGC TGAGCAATTG CTCACGGACA AATGCTCCGT 5100
TGATTGTGTG CTCTTTGCTA AATTTCAGTG TGTGCACCAG CCACGCCTTC GCCCCCGCGT 5160
GCCCCGTCTC CTAGGGCCTA CTATGCAAGG CCTGTGTCAG GCCGGGGTGG GAGCATGAGA 5220
ATGACTGGGC ATATCTCCCA GGACCAGGAA GGACTGCTCT CAGGAGCCCC CTCCTCACCT 5280
GGTTCCTCAT CGTGTCTCTT CCTTTTGGCC CTTCTCTTTG GTAGGGCCTA CTTAGGGAGG 5340
GCCCCAGCAG ATTCCCAGGG AACAGAAAAA CAGACAGATG GGAGGAATCA AGGCTGAGCC 5400
CAGGGATGGT GTCTTGTGTC CACCAGGGAA TCAGGCCTAC AGGGGAGGGC TGGGCTATGG 5460
GTGCAGAATT CAGTGACAGT GACAGTGAGA GAACTCAGCA GTGCAAGGGC AAAGTGGCAC 5520
TGTTTGGCCT GAAGGTGCTC GGAAGCTGCT TGTATTGAAA AATCCACCCT CATCCCCCGA 5580
CATCCCTCAG TGCCCACTGC GCTCTGCCGT GCCCTCTCCC TCCTTCCTAG AAATCCTAAC 5640
TCACACAGAC CCAGGCTATG TAGCTTGTTT AATTAAATAT ATATATATAT ATATATATAT 5700
GTATTCATTA TAAGAGCAAT ATAGGCAACT TATAGAAAAT TCAAAAACTA CAGAAAGACA 5760
CAGGGAAGAG AAAGAAATCA CCTCTAACAC CATCATTTGG AGAGGAGGGC AGAGGTAGGG 5820
AGAGGACACT TCTATGAATG TTACTTGTTC TGAGAGTCAC CCATGAGGCT TCCCCACTGC 5880
CACCCAGCTG TCAGGGGTAC TGAGTCAGAG ATTTGGGTCA GGAGGCAGAG GGCTGAGTGG 5940
GTGGGAGGGA AGGGGCGGTG CTGCCCACTC TGACTTTAGC AAGTATGTTT TCTTATAGTC 6000
TTTATGAGTA TTTCTTTGAT CATTCTGCAT ACAGTGCTTT TAAAAGCGTA GTTAACACAG 6060
TGTTGTTCGC AGGTTCTAGA GGAAATATAT TTTGAAGCAG GGCTGTGACA GGCAATACTT 6120
GCCAATGGGT GGTTTATAAT TAATCATTCC CTGTTTTAAA AAATAGTGAC TCAGTTTTAA 6180
AGATTCAGAA AGCCATTACT CAAGTTCCTT GGCAGAGGAA GTGGCCATTA TGTTGCTCCC 6240
TGCAGCTCTG CTTTTGTGGA AGAGGGAAAA AAAAGTATTT TTATTTGGTA TTTCTCTGAG 6300
CTGCTCAGAT ACTTTGGCCA TTGTTAGTGA GTGCAGGAGC AGAACAGCCC CTGCTATTGT 6360
TCAGGCTGGC CGCTAAACAT GGCAAGAGCT TCCCGCTGAA CTGGGGTAGG GGAAATGACC 6420
AGAAAGACAT TTACTGGATT TGGCAAAGGC AGAAGCAGAA AAGAGAGCTT CCTCTGGCTC 6480
CAGGAGTCTA TTTCTTGCCT CAGCGGGCTC CTCTGCCCCC CAGCCTGGGG CCTGCCCATC 6540
ACACAACACG AGAGGGCACC ACTTAGACCC CTTCACCTGC AAACCGTGCG CCTGGGAGTT 6600
TTTGGTGCCG AGACCCTGTC CCTGTGGGCA CCCCTAACAT GCCCTATATT CAACAAACAT 6660
GCATGAAGCA CCTACTAAGT TCTCTGATGA GTGACGACCA GGAGCTTCCA GTGTTGTCAC 6720
CATGGTCGGG GAAGGGACCT TTATATAGTT GAGGACTGTG CCATGTGAAA AGTGCCAGTG 6780
ATTGGATGAG CTGCAGTGGT CCTTGACCCC TACCTTAGAC CTTCATGCAT CCTGCACTTG 6840
TGTCTGTTGC ATGCCATGTG AATTCTGATT TCTGCTAATC AGCGAATCAG CTGAGGAAGG 6900
GATATTGCAA GCATTGCACT GGGAGCAGTT CTCTTTGGGC ACTGTTTCCA TCTTTGCTCC 6960
TGCAAGTTTG TCATTTGTGC AGGAACTTGA AATCCGTGTT AGGTTTTATC TTGACAGCTG 7020
CTTTATCCAG TGGAAAATGG AAAAGTGGAA ATATTGATGC ACTGATTAGA AGTGTCGTTG 7080
CATCTTCCAT ACGTAACCGC ATTCAGGCAC TGATGGACTT CAAGATGTGG GCTGGATGTG 7140
GTAAACTGCT GCCTCCATCA GGTGCTCATT GGAGTTCAAC GCACTGGACC GTGTGTTCAG 7200
TTGTGATGTA GCAGGACAAG CCACAGACAA AACCCCTCAG ACACCGAGTT AAAGAAGGAA 7260
GGGCTTCATT CGGCTGGGAG CTTCAGCAAG ACTCATGCCT CCAACAACCG 7310