EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS054-00148 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
FT246 
Coordinate
chr1:28725010-28728510 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:28727805-28727826CTTTACTTTTTTTTTTTTTTT+6.01
LMX1BMA0703.2chr1:28725343-28725354AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr1:28725347-28725360TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr1:28725344-28725357ATTTAATTAATTA-6
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:28725606-28725621GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:28726667-28726682GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:28728036-28728051TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:28725113-28725128GAGGTCAAGAGTTCG+6.24
Nr5a2MA0505.1chr1:28728320-28728335GCTGGCCTTGAATTC-7.03
STAT1MA0137.3chr1:28726399-28726410TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:28726399-28726410TTTCTGGGAAA+6.32
TCF7L2MA0523.1chr1:28725973-28725987TTCCTTTGAAGTTA-6.18
ZfxMA0146.2chr1:28725582-28725596GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr12872694028726993
Enhancer Sequence
AACAGAGTAG ACAGACCCTG TCTCAAAAAA TAAAATAGGC CGAGCACGGT GGCTCATGCC 60
TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCTAAGGC AGGCGGATCG CTTGAGGTCA AGAGTTCGAG 120
ACCAGCCTGG TGAACATGGT GAAACCCTGT CTCTACCAAA AACACAAAAA TTAGCCGGGC 180
GTGGGGGCAC ATGCCTATAA TCCCAGCTAC TTGGGAGGCT GAGGCAGGAG AATTGCTTGA 240
ACCTGGGAGC TGGAGGTTGC AGTGAGCCAA GATCGCGCTA CTGCACTCCA GCCTGGGTGA 300
CAGAGCAAGA CTCTGTCTCA AAAAAGAAAA AAAAATTTAA TTAATTAAAT ACTGATATTC 360
AAAAAGAAGC ACTTTTGAGG CAATAGTTTT ATCAGATCTC AAATATGTAT GTTTTGTATC 420
CATCCTACTG GTTCTGTTTC TGAGAAGAAC CCTAATACAG AAGGTATTCC GGAAGACACG 480
TTAGCCAAGC TTGAGATTTA AAGGAATTAG CTGTGTAAAG AGGTAGGAAA GGCTGGGTGC 540
GGTGGCTCAC ATCTGTAATC TCTGCACTTT GGGAGGCCGA GGCGGGTGGA TCACCAGAGG 600
TCAGGAGTTC AAGACCAGCC TGGCCAACAT GGTGGAACCC CATCTCTACT AAAAATACAA 660
AAATTAGCTG GGTGTGGTGG CACATGCCGG TAATCTCAGC TACTGGGGAG GCTGAGGCAG 720
GAGAATCGCT TGAATCCAGG AGGCGGGGGT TATAGTAAGC CAAGGTCATG CCACTGCACT 780
CCAGCCTGGG CGACAGAGCA AGACTCTGTC TCAAAAAATA TATATATGAT GAATAATTTT 840
GTGTTGATGA AATTTCTGCT GTGTATAAAT ATTTTTTGAG TTTAGTATGT CTCTACTGTT 900
AAGTGATATG GCATGATTTA TTTCTTTTAC CACTTTTCGG TATTCACATT GCCAGGAAAC 960
TTGTTCCTTT GAAGTTATTT GGTTTTCTCA TGGCTCACAT ACGTCATGGA TACTTACCTA 1020
ATTCCATTTC TATTAATTTC TTGTTGGTCT CGGACTATGT AGTACTGTTT GGTGCTAGTG 1080
TTCATTTATT TATTCAGTAA GTATTTTCTT AGTACCTAGT GTATGCACCT TCTAAATGCA 1140
GGGATATAGT AGTGAACAGA ACAGATAAAG TATCTAATGA TACTTTCTAG ATTGGGAGAG 1200
ACACAATAAG AACTTAGGTA AGCATATCTA TAGATAAATT ACAGATAGTA TACCATCAGA 1260
TAGTGATACA TTAAAATAAA AATAAAACAG GGTAAATGGA TAGAATGTTT TGAAAAGGGG 1320
GTGCCAAGGA AAGGCCTCTC TGAGGGAGTC ACACTTGAGT GACCTGAAAT AATGGAGCAA 1380
ATCACGCAGT TTCTGGGAAA AGAGCATTCC AGGCTGACTG AATAACAACT GCAAACCCTA 1440
GGGTAAGAAT GTGCTTGTTA TGTTACAGAA ACAATAGTAA GCTCAGTATG GGTAAAACAG 1500
AGTGAGCAAG AGAAGTAGGA AATGTGGTCA GTGGAGCAGA CAGGGACCAG GACATGTAGG 1560
ATCTTATAGG CCGTGGTAAG AAATTTGCAG TTGTCAAGCA CAATGGCTCA TGCCTGTAAT 1620
CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGTGGGCAG ATCACTTGAG GTCAGGAGTT CAAGACCAGC 1680
CTGGCCAACA TGGTGAAACC CCATCTCTTC TAAAAATACA AAAATTAGCC GGGCGTCTTG 1740
GCGCACGCCT GTAATCCCAG CTACTTGGGA GGTTGAGGCA GGAGAATCGC TTGAACCTGG 1800
GAGTCGGAGG TTGCAGTGAG CCAAGATCGT GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GTGACAGAGC 1860
AAGACTCCAT CTCAATTAAA AAAAAAAAAA AAAAGAGAAA TCTGGAGTTA ATTTCAGATG 1920
TAATAATGTA GCCGGCTTAA GTCTGGCTGC TTGCCACTCA GAGGCCAAAA AAAAGAGAAG 1980
CCAGGTGCGG TTTAAGGAAA GCAGTTTTAT TAATCAAATG CTAGGAGCTG GGGAATGGCC 2040
AGGCTCATGC CTTCAAAAGA CCATTCCAGT TTTTTGGGCT GAGTGAAGGA TTTTTTTTGA 2100
GATGGAGTCT CACTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CGCAATCTCA GCTTAGTGCA 2160
ACCTCTGCCT CCCAGATTGA AGCGATTCTC CTGCCTCAAC CTCCAGAGTA GCCAGGACTA 2220
CAGGCGCGCG CCACCACGCC CTGCTAATTT TTGTAGTTTT AGTAGAGACG GGGTTTCCCT 2280
ATGTTGGCCA GGCTGGTCTC GAACTCCTGA CCTCAGGTGA TCTGCCTGCC TCGGCCTCCC 2340
ACAGTGCTGG GATTACAGGC ATGAGCCACC ACGCCCGGCC TGAGTGAAGG GTTTTAAGAA 2400
GGCAAAGATA TGGGAAATAT GTGATAGTGG TGCAGGAGGG GATAGGCCTT CAAATCTTGT 2460
TCCCATGGCT GTCTTGAGTA ATCACCTGTC TGGAGTTCTG GTTTTTTCAT CCTGATTTCT 2520
GCCTAATAGT GGTGAGCCAA CTGTTCAGAA CTCCCCTTAG GTGGGAGGAT TCTGCAACTG 2580
GCTCTCTCTG CCTGATTTGT TTCAAAATTG GCCCCTGGAA TTTGTAAGCA AGCACATAAT 2640
TAGATAAGTG AGCATTGTTC ATGGAAGTAC CTGGTAGGAA AGGGAAACAA AGAGTTTCAA 2700
AGTATGTTTC AAGGCTGAAA GCAAGAAAGG AAAAAAAAGT TTTAAAACGC ATTTTGAGGC 2760
TGAGATACTT GGCTACAACA GGGATATATG ACCTGCTTTA CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 2820
TGGGGGGGAT GGAGTCTCGC TCTGTCACCC AGGCTGGAGT GCAGTGGCAC GATCTTGGCT 2880
CACTGCAACC TCCACCTCCC GAGTTCAAGC CATTTTCCTG CCTCAGCCTC CCACGTAGCT 2940
GGGATTACAG GCGCCCGCCA CCATGCCCGG CTAATTTTTA TATTTTTAGT AGAGACGAGG 3000
TTTCACCATG TTGGCCAGGC TGGTTTTGAA CTCCTGACCT CAGGCGATCT GCCCGCCTTG 3060
GCCTCCCAAA ATGCTAGGAG TACAGGCATG AGCCACCATG CCCTTTTTTT TGTTGTTGTT 3120
AATAGAGGCA GGGTCTGGCT CTGTTGCCCA TGCTGGAGTG CCGTGGTGCA GTCATAGCTC 3180
ACTGTAACCT CAAATTTCTG GGCTCAAGCT GTCTTCCTGC CTCAGAGTAG CTAGGACTAC 3240
AGGCACGCAC CACCACGCTC ATCTAATTTT TAAATTTTTT TAGAGACAGG GATTTTACTA 3300
TGTTGCCCAA GCTGGCCTTG AATTCCTGGC CTCAAGTGAT CCTACCACTT CAGTATCTGA 3360
AAGTACTGCG ATTATAGCCA TCAGCCACTG CATCCAGCTC TGCTTTACTT TTTGAAAGGA 3420
TCACCCAGGC CAGTCTGAGG ATAACAGAAT ATAAGAGTCT GAGAAGAAGG GAGGTTAATT 3480
AGGGGTTGAT TGTACTAGTC 3500