EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-26802 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr3:42107830-42110780 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr3:42108964-42108975GGCTGTGATTT-6.02
MYBMA0100.3chr3:42109220-42109230GACAGTTGGT-6.02
ZfxMA0146.2chr3:42109423-42109437GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 37             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42100849-42110891Adipose_Nuclei
SE_01796chr3:42107500-42108712Aorta
SE_01796chr3:42109092-42110153Aorta
SE_01796chr3:42110302-42110973Aorta
SE_02512chr3:42107693-42109349Astrocytes
SE_10226chr3:42106599-42110790CD19_Primary
SE_10922chr3:42092287-42111479CD20
SE_23272chr3:42107670-42108644Colon_Crypt_1
SE_25861chr3:42107133-42111127Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42107524-42108704Esophagus
SE_26989chr3:42109083-42109921Esophagus
SE_29565chr3:42100077-42111501Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42106842-42110399HSMMtube
SE_38230chr3:42107270-42109387HUVEC
SE_40683chr3:42107119-42111735Left_Ventricle
SE_42248chr3:42107042-42108780Lung
SE_42248chr3:42108856-42110067Lung
SE_42248chr3:42110205-42111043Lung
SE_44342chr3:42106594-42111258NHDF-Ad
SE_44918chr3:42107494-42109983NHLF
SE_45733chr3:42107376-42110682Osteoblasts
SE_48185chr3:42107501-42110318Psoas_Muscle
SE_48185chr3:42110424-42111247Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42107259-42108605Right_Atrium
SE_48670chr3:42109042-42110194Right_Atrium
SE_48670chr3:42110339-42111017Right_Atrium
SE_50309chr3:42107626-42108800Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42106777-42110646Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42107508-42109617Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42107631-42108719Small_Intestine
SE_52625chr3:42108869-42110167Small_Intestine
SE_53513chr3:42107038-42110206Spleen
SE_54717chr3:42107391-42110552Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42107501-42109696HSMM
SE_65044chr3:42108016-42109547NHEK
SE_65769chr3:42106990-42110247Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr34210786942109410
chr34210804942108561
chr34210887542109165
chr34210900042110000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042057chr34209869342111283
Enhancer Sequence
GTTTTAGTTG TGAAGGGGAA GCTCTGAAGT GTGTTAGAAC CCCTAAGTCC ATGGAGGGAT 60
TCACTTGCTC TGAAATGGGA TGGTCATGGA GAGAGAGAGA GAGAGAGCAC CCAGCGTGGG 120
AAGGCTGGGT GTGGACATCG ACCCCCACCC CCACCCCAAG CAGCAAGGTC ATGAGCCGTG 180
CAGAAGTGGG ACCTTCCGCC GTTGGTGCTT CTGGAAGTAG TGCCCAGCAA GGACCAGTGA 240
GGAGCTAGTA TTCCTTAGCT TAGGCACGGC TCAGTCCTCC CTGCCTACCA TGCATGCAGT 300
TTGTAGCCTG TGTGTTTCCT GTTTTCATTT CCTATCTTGC TATTACTTTT ATGCATTGGC 360
TTATCACAGC CCACTCACTC TAAGGCCATC TTGCCATCCC ATGACATGGT CACTGAAGGC 420
CCAGCTGTCA CTGTTTATTC ACTTGGTGTG TACATGACTG TTTGGACCCG TTTCCTAGTA 480
ACGGCCCTGT TAATTTCAAT GAGAAAGGCT AATGGGGTGC CTTTTTCAGG GGCTGGGGGG 540
AGGGATGATG TGCTCCCTTT AGCCCCTCTG TGTCTTTGGT CCTTGACCTC ACTGTTTCCT 600
GGGGGATTCT TATACAGAGG CTCTTGGCTT CTTCTCTCAA TACCACACAT TCCTAATTAT 660
TTGTGCTACT TCTTGAGTAA TCTTGAGGTC TGCTTTGGAT TACTTATCAA AAGTGGCTGA 720
TAAAATTTGA GCTGTCGTTT CCCAGATGTG TGTGTTAGTG CTTCGTAGAG AATTTCTTCT 780
TTGTACTCAA GTTGATTTAA GTCTAGAATC TGACTTTTAA TTGTGGACCA AGCAAAACCC 840
CCTTGCCTCT CTAGGGATTA TTTAGAATTA ATAAAATCAA GTACTTTTTC ACACGAGCCT 900
GAAGGAATTG TTAACTGAAG GAACTTTTAT GTGATACAGT TTGTTCTGAA AATTAGGTAT 960
TTAAGGACTT TGTCAATTAT GGTTAAGCAC ATTTTTTATT AAAAAGAACA AGATATGTAG 1020
CTAAGTGGCT GTGTCCGGGC TGAGATGTTT CTTCTCACTC GATCCTACAG TGAAGTCAAA 1080
ATATAGTGAC AGATTCAGTT TCCATAGCTG CAGAATCTGT TTTCAAAAAC ACAAGGCTGT 1140
GATTTCACTG TAGTTCAGTG CACATTGAGA AGCTAATATG GAAATAGAAA TGAAACTTTT 1200
CAAAATACAT GCCTTAAAAC AAAAACTTCC AGTTCCCCTT TAGTGCTTAG ATGAGATTTT 1260
TTTTTTTTTC AGGCTTTGTA AGTTTTGCAG ATTAATTTCA GAAGTTGACG GCAATGTGAT 1320
CCTGGTGGAC TGTCATTCTG TAGTGTTAGT CAGGAAGCCC CTCACACACT TTCTTCTCAT 1380
TTCCTAATGC GACAGTTGGT TCAGTGAATA TCCATTGTGC TTTATAGGTT GATATTGATA 1440
TGTTTGTAAT TGGCCTATCA CGTAGTTAGT TTTTTTTTCT TTTTTGGCAA TCACCTTTTT 1500
CCATGTGAAT TTTCAAAAAA TGTATTTATT TATTTAGAAG CAGGATCTTA TGGCCAGGCG 1560
CAGTGGGTCA CTCCTGTAAT CCCAGCACTT TGAGAGGCCG AGGCGGGCAG ATCATCTGAG 1620
GTCAGGAGTT CGAGACCAGC CTTGCCAACA TGGTGAAACT CCGTCTCTAC AGAAGTACAA 1680
AAATTAGCCG GGCGTGATGG TGGGTGCCTG TAATGGGAGG CTGAGGCGGA AGATCCCTTG 1740
AACCTGGGAG GCGGAGGTTG CAGTGAGCCA AGATCATAAT CACTGCACTC CAGCATGGGC 1800
AAGAGAGCGA GACTCTGTCT AAAAAAAAAA AAGAAGAAAC AGGATCTTAC TCTGCCACCC 1860
AGGCTGGAGA GCAGCAGTGG TGTGATCATA GCTCACTGCA GCCTTGAACT CCTAGGCTCA 1920
AGCGATCCTT CTACTTTAGC CTTTCAAGTA GCTGGGACTA CAGGTGTGCC ACCACGTCCA 1980
GCTAACTTTT TTTCTTTTTT AATCTTTTGT AGAGACTGAG TTTCACTATG TTGCCCAGGC 2040
TGGTCTCGAA CTTTTGGCCT TAAATGATCC TTCAGCCTTG GTCTCCCGAA GCACTGTGAT 2100
TACAGGCATG CCACTGCATG TGGTCCATTA GCTGTAGTTA AGAGAAAAGA GTTGGGTTGG 2160
TTATTTTCAG TGCCTTGGGC ATAAAGAGTG AATCATTAAG TTCATTTTGC ACTCTTTGAG 2220
TTTTACCGTG TTCCAGGCAC TGAGGACACA ACAGTGAACT AAAACAGGTA GAAGTGAGTC 2280
TTTAAGGAAT GAAATATAAT TCGTCTCTAC TTGAAATTTG CACATAGTCT GTTTGTAGGA 2340
CAATACCTAT TGAAATAGGG TCTCCATTTC GCCAACAAGT TAACCCTTAC TACTTATGGG 2400
AAATTACCTC AGTGGTAACT GTAGAGCAGT CATTTATTGA ACATTAACTG TATGCTTAGA 2460
GTGCATTTTT CTTTACATTA TTGTATTAGC TCGTTTAATC CTTGTAACAG CTTCCCATTT 2520
TATAGATGAG AAAACTGAGG GTTGTAGGGG TTAACTGATT TTAACTTGGC CAACATCATA 2580
CAGTGACCTA TTCTGACTGT GTCTTTCTGT CCCTACAGGA TTTGAACTTA TAGTGGAAGT 2640
ACTTTAGGAA ATGCATTTGT GTCTGTGTAG TCATGGTTAG GAAATGTGCT CATGTCAGGC 2700
TGTTTAAAAG TTGTGGAGGC TAGGCATGGT GGCTCATGTC TGTAATCCCA GCACTTTGGA 2760
AGCTGAGGTG GGTGCATTAC TTGAGCACAG GAGTTTGAAC AACATAGTGA GACCCTGACT 2820
GTGTATATAC ACACACACAC ACAATTAGCT GGGCGTGGTG GTGCATGCCT GTAGTCTCAG 2880
CTACAGGTGG GAGGATTGCT TTAGCCCGGG AGGTCAAGGC TGCAGTGAGA CTTGCTTGTG 2940
TCACTTTACT 2950